MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 47786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011027	TCG	2	6	145906	145911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211801
3002	NC_011027	CAG	2	6	145947	145952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211801
3003	NC_011027	TCG	2	6	146225	146230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211801
3004	NC_011027	GCC	2	6	146247	146252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211802
3005	NC_011027	GTT	2	6	146303	146308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211802
3006	NC_011027	CGAT	2	8	146434	146441	25 %	25 %	25 %	25 %	193211802
3007	NC_011027	ACG	2	6	146445	146450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211802
3008	NC_011027	CTT	2	6	146528	146533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211802
3009	NC_011027	CGTG	2	8	146578	146585	0 %	25 %	50 %	25 %	193211802
3010	NC_011027	GAG	2	6	146671	146676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211802
3011	NC_011027	CGG	2	6	146695	146700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211802
3012	NC_011027	CGCGC	2	10	146735	146744	0 %	0 %	40 %	60 %	193211802
3013	NC_011027	TGT	2	6	146837	146842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211802
3014	NC_011027	TCG	2	6	146847	146852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211802
3015	NC_011027	GCT	2	6	146910	146915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211802
3016	NC_011027	GCC	2	6	146921	146926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211802
3017	NC_011027	ATC	2	6	146961	146966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211802
3018	NC_011027	ATG	2	6	146976	146981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211802
3019	NC_011027	GAA	2	6	147089	147094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211802
3020	NC_011027	CTG	2	6	147137	147142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211802
3021	NC_011027	GCC	2	6	147158	147163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211802
3022	NC_011027	GATC	2	8	147199	147206	25 %	25 %	25 %	25 %	193211802
3023	NC_011027	CGG	2	6	147244	147249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211802
3024	NC_011027	ACA	2	6	147448	147453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211802
3025	NC_011027	ACG	2	6	147468	147473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211802
3026	NC_011027	CAGG	2	8	147518	147525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_011027	CCTG	2	8	147533	147540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_011027	CTT	2	6	147562	147567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211803
3029	NC_011027	CTG	2	6	147589	147594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211803
3030	NC_011027	TCT	2	6	147606	147611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211803
3031	NC_011027	CGAG	2	8	147678	147685	25 %	0 %	50 %	25 %	193211803
3032	NC_011027	ATC	2	6	147697	147702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211803
3033	NC_011027	TGATC	2	10	147723	147732	20 %	40 %	20 %	20 %	193211803
3034	NC_011027	TTG	2	6	147734	147739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211803
3035	NC_011027	GAT	2	6	147757	147762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211803
3036	NC_011027	A	6	6	147836	147841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_011027	CGTT	2	8	147845	147852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3038	NC_011027	GAA	2	6	147860	147865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_011027	CGG	2	6	147902	147907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_011027	TACATG	2	12	147962	147973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	193211804
3041	NC_011027	CTG	3	9	148096	148104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211804
3042	NC_011027	GAG	2	6	148136	148141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211804
3043	NC_011027	GCGAG	2	10	148179	148188	20 %	0 %	60 %	20 %	193211804
3044	NC_011027	CGC	2	6	148221	148226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211804
3045	NC_011027	GAT	2	6	148273	148278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211804
3046	NC_011027	TGA	2	6	148290	148295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211804
3047	NC_011027	GCT	2	6	148308	148313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211804
3048	NC_011027	TCA	2	6	148314	148319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211804
3049	NC_011027	GGC	2	6	148330	148335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211804
3050	NC_011027	GTT	2	6	148435	148440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211804
3051	NC_011027	CGT	2	6	148476	148481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211804
3052	NC_011027	GCT	2	6	148548	148553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211804
3053	NC_011027	TGA	2	6	148671	148676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211804
3054	NC_011027	GC	3	6	148738	148743	0 %	0 %	50 %	50 %	193211805
3055	NC_011027	CGG	2	6	148758	148763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211805
3056	NC_011027	TGA	2	6	148803	148808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211805
3057	NC_011027	GCTG	2	8	148908	148915	0 %	25 %	50 %	25 %	193211805
3058	NC_011027	CG	3	6	148924	148929	0 %	0 %	50 %	50 %	193211805
3059	NC_011027	CCG	3	9	148935	148943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211805
3060	NC_011027	CCA	2	6	148959	148964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193211805
3061	NC_011027	TCA	2	6	149043	149048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211805
3062	NC_011027	GC	4	8	149092	149099	0 %	0 %	50 %	50 %	193211805
3063	NC_011027	CGC	2	6	149182	149187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211805
3064	NC_011027	TCG	2	6	149237	149242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211805
3065	NC_011027	GAT	2	6	149251	149256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211805
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3067	NC_011027	CTG	2	6	149278	149283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211805
3068	NC_011027	CGC	2	6	149304	149309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211805
3069	NC_011027	CGC	2	6	149392	149397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211805
3070	NC_011027	CAG	2	6	149419	149424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211805
3071	NC_011027	GCC	2	6	149429	149434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211805
3072	NC_011027	CTC	2	6	149485	149490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193211805
3073	NC_011027	TCG	2	6	149537	149542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211805
3074	NC_011027	GT	4	8	149647	149654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_011027	CGC	2	6	149694	149699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211806
3076	NC_011027	TCT	2	6	149757	149762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211806
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3078	NC_011027	TCA	3	9	149829	149837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211806
3079	NC_011027	CGG	2	6	149865	149870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211806
3080	NC_011027	ATG	2	6	149879	149884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211806
3081	NC_011027	CCAG	2	8	149907	149914	25 %	0 %	25 %	50 %	193211806
3082	NC_011027	CAT	2	6	149947	149952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211806
3083	NC_011027	GGC	2	6	150000	150005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211806
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3085	NC_011027	CG	3	6	150122	150127	0 %	0 %	50 %	50 %	193211806
3086	NC_011027	CGC	2	6	150171	150176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211806
3087	NC_011027	GTC	2	6	150203	150208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211806
3088	NC_011027	GGA	2	6	150229	150234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211806
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3090	NC_011027	GC	3	6	150291	150296	0 %	0 %	50 %	50 %	193211806
3091	NC_011027	GGC	2	6	150328	150333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211806
3092	NC_011027	CAGG	2	8	150382	150389	25 %	0 %	50 %	25 %	193211806
3093	NC_011027	GAT	2	6	150430	150435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211806
3094	NC_011027	TCG	2	6	150446	150451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211806
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3096	NC_011027	GGA	2	6	150528	150533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211806
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3099	NC_011027	TCG	2	6	150572	150577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211806
3100	NC_011027	TTG	2	6	150605	150610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211806
3101	NC_011027	GTC	2	6	150641	150646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211806
3102	NC_011027	GCT	2	6	150653	150658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211806
3103	NC_011027	TGA	2	6	150678	150683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_011027	T	6	6	150713	150718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_011027	GAGC	2	8	150719	150726	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_011027	AG	3	6	150732	150737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_011027	GAT	2	6	150740	150745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_011027	CTGC	2	8	150761	150768	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_011027	TGC	2	6	150798	150803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211807
3110	NC_011027	CG	3	6	150864	150869	0 %	0 %	50 %	50 %	193211807
3111	NC_011027	GAC	2	6	150871	150876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211807
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3114	NC_011027	GCCTG	2	10	150973	150982	0 %	20 %	40 %	40 %	193211807
3115	NC_011027	GCA	2	6	150991	150996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211807
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3117	NC_011027	CAA	2	6	151100	151105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211807
3118	NC_011027	TCT	2	6	151178	151183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211807
3119	NC_011027	TTC	2	6	151185	151190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211807
3120	NC_011027	CTC	2	6	151245	151250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193211807
3121	NC_011027	TCGA	2	8	151285	151292	25 %	25 %	25 %	25 %	193211807
3122	NC_011027	CGA	2	6	151376	151381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211807
3123	NC_011027	GCC	2	6	151471	151476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211807
3124	NC_011027	CGA	2	6	151554	151559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211807
3125	NC_011027	TCC	2	6	151594	151599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193211807
3126	NC_011027	TGA	2	6	151604	151609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211807
3127	NC_011027	GCAT	2	8	151618	151625	25 %	25 %	25 %	25 %	193211807
3128	NC_011027	CAG	2	6	151695	151700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211807
3129	NC_011027	TTAT	2	8	151818	151825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_011027	CGA	2	6	151839	151844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211808
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3137	NC_011027	CAGGT	2	10	152355	152364	20 %	20 %	40 %	20 %	193211809
3138	NC_011027	ATC	2	6	152394	152399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211809
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3142	NC_011027	ATC	2	6	152612	152617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3143	NC_011027	GAAAAA	2	12	152618	152629	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_011027	GAA	2	6	152646	152651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_011027	A	7	7	152659	152665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_011027	A	7	7	152821	152827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_011027	GCG	2	6	152844	152849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3155	NC_011027	TCG	2	6	153212	153217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3158	NC_011027	T	9	9	153291	153299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3159	NC_011027	ATT	2	6	153343	153348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3161	NC_011027	TAT	3	9	153381	153389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3162	NC_011027	AT	3	6	153388	153393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_011027	TCC	2	6	153412	153417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3164	NC_011027	TGC	2	6	153433	153438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3181	NC_011027	GCGT	2	8	154094	154101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3209	NC_011027	GAC	2	6	156032	156037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3223	NC_011027	GCAA	2	8	156641	156648	50 %	0 %	25 %	25 %	193211813
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3232	NC_011027	GTC	2	6	156978	156983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211814
3233	NC_011027	GC	3	6	157012	157017	0 %	0 %	50 %	50 %	193211814
3234	NC_011027	CGG	3	9	157082	157090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211814
3235	NC_011027	GCT	2	6	157100	157105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211814
3236	NC_011027	ACGGTG	2	12	157143	157154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	193211814
3237	NC_011027	GGT	2	6	157247	157252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211814
3238	NC_011027	GGC	2	6	157261	157266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211814
3239	NC_011027	GAT	2	6	157302	157307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211814
3240	NC_011027	GCC	2	6	157317	157322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211814
3241	NC_011027	CGG	2	6	157362	157367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211814
3242	NC_011027	CG	3	6	157409	157414	0 %	0 %	50 %	50 %	193211814
3243	NC_011027	GCTG	2	8	157418	157425	0 %	25 %	50 %	25 %	193211814
3244	NC_011027	CTG	3	9	157437	157445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211814
3245	NC_011027	CGA	2	6	157448	157453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211814
3246	NC_011027	ACCG	2	8	157454	157461	25 %	0 %	25 %	50 %	193211814
3247	NC_011027	CCT	2	6	157499	157504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193211814
3248	NC_011027	CACG	2	8	157541	157548	25 %	0 %	25 %	50 %	193211814
3249	NC_011027	CAC	2	6	157566	157571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193211814
3250	NC_011027	GCCT	2	8	157584	157591	0 %	25 %	25 %	50 %	193211814
3251	NC_011027	TCG	2	6	157675	157680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211814
3252	NC_011027	GCT	2	6	157773	157778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211815
3253	NC_011027	CAT	2	6	157809	157814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211815
3254	NC_011027	GTG	3	9	157825	157833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211815
3255	NC_011027	TCA	2	6	157847	157852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211815
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3258	NC_011027	CTA	2	6	157896	157901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211815
3259	NC_011027	TGG	2	6	157919	157924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211815
3260	NC_011027	CAT	2	6	157926	157931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211815
3261	NC_011027	CGG	2	6	157946	157951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211815
3262	NC_011027	CATCGG	2	12	157953	157964	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	193211815
3263	NC_011027	GCG	2	6	158020	158025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211815
3264	NC_011027	TCA	2	6	158135	158140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211815
3265	NC_011027	GCT	2	6	158142	158147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211815
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3267	NC_011027	CG	3	6	158220	158225	0 %	0 %	50 %	50 %	193211815
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3270	NC_011027	GGT	2	6	158304	158309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211815
3271	NC_011027	CG	3	6	158355	158360	0 %	0 %	50 %	50 %	193211815
3272	NC_011027	CAG	3	9	158367	158375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211815
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3274	NC_011027	CAT	2	6	158475	158480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211815
3275	NC_011027	CGC	2	6	158484	158489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211815
3276	NC_011027	GGT	2	6	158493	158498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211815
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3278	NC_011027	TTCA	2	8	158621	158628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3279	NC_011027	CTA	2	6	158653	158658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211816
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3360	NC_011027	GGA	2	6	162129	162134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211822
3361	NC_011027	ACG	2	6	162173	162178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211822
3362	NC_011027	CCG	2	6	162207	162212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211822
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3366	NC_011027	AGC	2	6	162459	162464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211822
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3368	NC_011027	GGCT	2	8	162626	162633	0 %	25 %	50 %	25 %	193211822
3369	NC_011027	ATC	2	6	162675	162680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3371	NC_011027	A	6	6	162688	162693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3372	NC_011027	GCC	2	6	162696	162701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3373	NC_011027	TGC	2	6	162740	162745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3482	NC_011027	CGG	2	6	168129	168134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211829
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3489	NC_011027	GCC	2	6	168763	168768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211829
3490	NC_011027	GCT	2	6	168813	168818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211829
3491	NC_011027	CAT	2	6	169018	169023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211830
3492	NC_011027	CG	3	6	169030	169035	0 %	0 %	50 %	50 %	193211830
3493	NC_011027	GACG	2	8	169066	169073	25 %	0 %	50 %	25 %	193211830
3494	NC_011027	CAT	2	6	169090	169095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211830
3495	NC_011027	CAT	2	6	169117	169122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211830
3496	NC_011027	TGT	2	6	169175	169180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211830
3497	NC_011027	GCTG	2	8	169204	169211	0 %	25 %	50 %	25 %	193211830
3498	NC_011027	CGCT	2	8	169217	169224	0 %	25 %	25 %	50 %	193211830
3499	NC_011027	TGA	2	6	169234	169239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211830
3500	NC_011027	TCT	2	6	169264	169269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211830

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