MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 47786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_011027	CAT	2	6	1499313	1499318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213027
31003	NC_011027	GTC	2	6	1499329	1499334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31004	NC_011027	CGT	2	6	1499473	1499478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31005	NC_011027	CGT	2	6	1499550	1499555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31006	NC_011027	TCG	2	6	1499565	1499570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31007	NC_011027	GCC	2	6	1499572	1499577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213027
31008	NC_011027	CGT	2	6	1499710	1499715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31009	NC_011027	CGT	2	6	1499787	1499792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31010	NC_011027	TCG	2	6	1499802	1499807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31011	NC_011027	GCC	2	6	1499809	1499814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213027
31012	NC_011027	CGT	2	6	1499947	1499952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31013	NC_011027	CGT	2	6	1500024	1500029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31014	NC_011027	TCG	2	6	1500039	1500044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31015	NC_011027	GCC	2	6	1500046	1500051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213027
31016	NC_011027	CGT	2	6	1500184	1500189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31017	NC_011027	CGT	2	6	1500261	1500266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31018	NC_011027	TCG	2	6	1500276	1500281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31019	NC_011027	GCC	2	6	1500283	1500288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213027
31020	NC_011027	CGTGCC	2	12	1500406	1500417	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	193213027
31021	NC_011027	CGT	2	6	1500421	1500426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31022	NC_011027	CGT	2	6	1500498	1500503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31023	NC_011027	TCG	2	6	1500513	1500518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31024	NC_011027	GCC	2	6	1500520	1500525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213027
31025	NC_011027	CGT	2	6	1500658	1500663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31026	NC_011027	CGT	2	6	1500735	1500740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31027	NC_011027	TCG	2	6	1500750	1500755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31028	NC_011027	GCC	2	6	1500757	1500762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213027
31029	NC_011027	GTACCT	2	12	1500791	1500802	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	193213027
31030	NC_011027	CGT	2	6	1500969	1500974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31031	NC_011027	ACA	2	6	1500986	1500991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213027
31032	NC_011027	ATT	2	6	1501006	1501011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213027
31033	NC_011027	TCAG	2	8	1501043	1501050	25 %	25 %	25 %	25 %	193213027
31034	NC_011027	AGA	2	6	1501080	1501085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213027
31035	NC_011027	CAG	2	6	1501320	1501325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31036	NC_011027	CAG	2	6	1501363	1501368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31037	NC_011027	CGT	2	6	1501374	1501379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31038	NC_011027	GTT	2	6	1501417	1501422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213027
31039	NC_011027	TGG	2	6	1501656	1501661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213027
31040	NC_011027	TTA	2	6	1501679	1501684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213027
31041	NC_011027	TA	3	6	1501750	1501755	50 %	50 %	0 %	0 %	193213027
31042	NC_011027	GGT	2	6	1501888	1501893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213027
31043	NC_011027	ATT	2	6	1502170	1502175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213027
31044	NC_011027	TAG	2	6	1502348	1502353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213027
31045	NC_011027	GTT	2	6	1502416	1502421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213027
31046	NC_011027	CTGCG	2	10	1502431	1502440	0 %	20 %	40 %	40 %	193213027
31047	NC_011027	CAC	2	6	1502460	1502465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213027
31048	NC_011027	GTTG	2	8	1502689	1502696	0 %	50 %	50 %	0 %	193213027
31049	NC_011027	GA	3	6	1502714	1502719	50 %	0 %	50 %	0 %	193213027
31050	NC_011027	AAGC	2	8	1502730	1502737	50 %	0 %	25 %	25 %	193213027
31051	NC_011027	CAT	2	6	1502781	1502786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213027
31052	NC_011027	AAT	2	6	1502797	1502802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213027
31053	NC_011027	CCG	2	6	1502921	1502926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213027
31054	NC_011027	TCG	2	6	1502972	1502977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31055	NC_011027	AG	3	6	1502980	1502985	50 %	0 %	50 %	0 %	193213027
31056	NC_011027	ACG	2	6	1502987	1502992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31057	NC_011027	CCG	2	6	1502996	1503001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213027
31058	NC_011027	CAG	2	6	1503021	1503026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31059	NC_011027	CCG	2	6	1503080	1503085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213027
31060	NC_011027	ACC	2	6	1503160	1503165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213027
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31063	NC_011027	CAA	2	6	1503291	1503296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213027
31064	NC_011027	CAT	2	6	1503376	1503381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213027
31065	NC_011027	GTT	2	6	1503415	1503420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213027
31066	NC_011027	ATC	2	6	1503437	1503442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213027
31067	NC_011027	CGA	2	6	1503444	1503449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31068	NC_011027	CCA	2	6	1503452	1503457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213027
31069	NC_011027	ACT	2	6	1503482	1503487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213027
31070	NC_011027	GAA	2	6	1503557	1503562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213027
31071	NC_011027	CCA	2	6	1503564	1503569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213027
31072	NC_011027	ACC	2	6	1503571	1503576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213027
31073	NC_011027	GCT	2	6	1503777	1503782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
31074	NC_011027	TGG	2	6	1503816	1503821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213027
31075	NC_011027	ACC	2	6	1503850	1503855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213027
31076	NC_011027	TGCCAT	2	12	1503895	1503906	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	193213027
31077	NC_011027	TGC	2	6	1503910	1503915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213027
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31080	NC_011027	GTA	2	6	1504034	1504039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31081	NC_011027	A	7	7	1504173	1504179	100 %	0 %	0 %	0 %	193213028
31082	NC_011027	ACGATC	2	12	1504199	1504210	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	193213028
31083	NC_011027	ATG	2	6	1504391	1504396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213028
31084	NC_011027	ATC	2	6	1504488	1504493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213028
31085	NC_011027	GCC	2	6	1504547	1504552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213028
31086	NC_011027	GCTC	2	8	1504564	1504571	0 %	25 %	25 %	50 %	193213028
31087	NC_011027	GTC	2	6	1504620	1504625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213028
31088	NC_011027	G	6	6	1504627	1504632	0 %	0 %	100 %	0 %	193213028
31089	NC_011027	GAT	2	6	1504645	1504650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213028
31090	NC_011027	CAG	2	6	1504703	1504708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213028
31091	NC_011027	CCG	2	6	1504885	1504890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213028
31092	NC_011027	GATT	2	8	1504942	1504949	25 %	50 %	25 %	0 %	193213028
31093	NC_011027	GCC	2	6	1504958	1504963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213028
31094	NC_011027	ATTG	2	8	1505063	1505070	25 %	50 %	25 %	0 %	193213028
31095	NC_011027	ATCT	2	8	1505243	1505250	25 %	50 %	0 %	25 %	193213028
31096	NC_011027	AG	3	6	1505276	1505281	50 %	0 %	50 %	0 %	193213028
31097	NC_011027	TGA	2	6	1505296	1505301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213028
31098	NC_011027	TCA	2	6	1505317	1505322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213028
31099	NC_011027	AACC	2	8	1505529	1505536	50 %	0 %	0 %	50 %	193213028
31100	NC_011027	TTGT	2	8	1505562	1505569	0 %	75 %	25 %	0 %	193213028
31101	NC_011027	AAAG	2	8	1505589	1505596	75 %	0 %	25 %	0 %	193213028
31102	NC_011027	TTG	2	6	1505625	1505630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213028
31103	NC_011027	GACACG	2	12	1505681	1505692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213028
31104	NC_011027	CTT	2	6	1505741	1505746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213028
31105	NC_011027	TAT	2	6	1505876	1505881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213028
31106	NC_011027	TCA	2	6	1505890	1505895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213028
31107	NC_011027	CGA	2	6	1505915	1505920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31108	NC_011027	A	6	6	1505923	1505928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31109	NC_011027	ATG	2	6	1505970	1505975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31110	NC_011027	A	6	6	1505979	1505984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31111	NC_011027	CAAA	2	8	1506024	1506031	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31112	NC_011027	AC	3	6	1506043	1506048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31113	NC_011027	A	6	6	1506110	1506115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31114	NC_011027	C	6	6	1506146	1506151	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31115	NC_011027	TAC	2	6	1506209	1506214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31116	NC_011027	CAT	2	6	1506234	1506239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31117	NC_011027	AAC	2	6	1506268	1506273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213029
31118	NC_011027	CGG	2	6	1506395	1506400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213029
31119	NC_011027	TGG	2	6	1506413	1506418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213029
31120	NC_011027	CGG	2	6	1506423	1506428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213029
31121	NC_011027	ATC	2	6	1506460	1506465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213029
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31123	NC_011027	CGTAC	2	10	1506504	1506513	20 %	20 %	20 %	40 %	193213029
31124	NC_011027	CGG	2	6	1506555	1506560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213029
31125	NC_011027	GTG	2	6	1506565	1506570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213029
31126	NC_011027	TGG	2	6	1506623	1506628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213029
31127	NC_011027	GAC	3	9	1506637	1506645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213029
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31129	NC_011027	GGT	2	6	1506768	1506773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213029
31130	NC_011027	GCT	2	6	1506885	1506890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213029
31131	NC_011027	CTG	2	6	1506943	1506948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213029
31132	NC_011027	AAAG	2	8	1507036	1507043	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31133	NC_011027	CGA	2	6	1507154	1507159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213030
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31136	NC_011027	GCT	2	6	1507253	1507258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213030
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31139	NC_011027	GC	3	6	1507333	1507338	0 %	0 %	50 %	50 %	193213030
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31152	NC_011027	GCC	2	6	1507840	1507845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213030
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31169	NC_011027	T	7	7	1508553	1508559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31201	NC_011027	CTCAC	2	10	1509741	1509750	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
31202	NC_011027	C	7	7	1509760	1509766	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31203	NC_011027	TCA	2	6	1509805	1509810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31224	NC_011027	TGC	2	6	1510723	1510728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213033
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31232	NC_011027	GCC	3	9	1511150	1511158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213033
31233	NC_011027	TCGA	2	8	1511172	1511179	25 %	25 %	25 %	25 %	193213033
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31259	NC_011027	TCC	2	6	1512431	1512436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31349	NC_011027	CGAT	2	8	1516656	1516663	25 %	25 %	25 %	25 %	193213036
31350	NC_011027	CG	3	6	1516677	1516682	0 %	0 %	50 %	50 %	193213036
31351	NC_011027	ACC	2	6	1516685	1516690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213036
31352	NC_011027	CA	3	6	1516803	1516808	50 %	0 %	0 %	50 %	193213036
31353	NC_011027	GC	3	6	1516902	1516907	0 %	0 %	50 %	50 %	193213036
31354	NC_011027	CTGCTC	2	12	1516937	1516948	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	193213036
31355	NC_011027	CGA	2	6	1516957	1516962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213036
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31460	NC_011027	AGCC	2	8	1523488	1523495	25 %	0 %	25 %	50 %	193213042
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31464	NC_011027	GTC	2	6	1523573	1523578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213042
31465	NC_011027	GCC	2	6	1523599	1523604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213042
31466	NC_011027	CGT	2	6	1523622	1523627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213042
31467	NC_011027	GC	3	6	1523644	1523649	0 %	0 %	50 %	50 %	193213042
31468	NC_011027	AGC	2	6	1523651	1523656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213042
31469	NC_011027	AAC	2	6	1523719	1523724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213042
31470	NC_011027	GCG	2	6	1523749	1523754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213042
31471	NC_011027	CAG	2	6	1523755	1523760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213042
31472	NC_011027	GTAG	2	8	1523770	1523777	25 %	25 %	50 %	0 %	193213042
31473	NC_011027	GAT	2	6	1523836	1523841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213042
31474	NC_011027	CCGA	2	8	1523867	1523874	25 %	0 %	25 %	50 %	193213042
31475	NC_011027	TGC	2	6	1523972	1523977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213042
31476	NC_011027	AG	3	6	1524118	1524123	50 %	0 %	50 %	0 %	193213043
31477	NC_011027	CCCT	2	8	1524290	1524297	0 %	25 %	0 %	75 %	193213043
31478	NC_011027	TCG	2	6	1524314	1524319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213043
31479	NC_011027	TGA	2	6	1524381	1524386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213043
31480	NC_011027	GTT	2	6	1524442	1524447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213043
31481	NC_011027	GCA	2	6	1524452	1524457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213043
31482	NC_011027	GATTG	2	10	1524481	1524490	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31483	NC_011027	GAA	2	6	1524508	1524513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213044
31484	NC_011027	GAATCG	2	12	1524546	1524557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	193213044
31485	NC_011027	CCTCCG	2	12	1524591	1524602	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	193213044
31486	NC_011027	GCG	2	6	1524608	1524613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213044
31487	NC_011027	AGGT	2	8	1524647	1524654	25 %	25 %	50 %	0 %	193213044
31488	NC_011027	CGG	2	6	1524741	1524746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213044
31489	NC_011027	TCAC	2	8	1524761	1524768	25 %	25 %	0 %	50 %	193213044
31490	NC_011027	CCT	2	6	1524975	1524980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213044
31491	NC_011027	CTG	2	6	1525099	1525104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213044
31492	NC_011027	TGA	2	6	1525122	1525127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213044
31493	NC_011027	AAT	2	6	1525150	1525155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213044
31494	NC_011027	GCC	2	6	1525201	1525206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213044
31495	NC_011027	T	7	7	1525221	1525227	0 %	100 %	0 %	0 %	193213044
31496	NC_011027	A	6	6	1525258	1525263	100 %	0 %	0 %	0 %	193213044
31497	NC_011027	CAG	4	12	1525267	1525278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213044
31498	NC_011027	AGA	2	6	1525323	1525328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213044
31499	NC_011027	GC	3	6	1525383	1525388	0 %	0 %	50 %	50 %	193213044
31500	NC_011027	GAC	2	6	1525402	1525407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213044

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