MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 47786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_011027	GCAG	2	8	1448732	1448739	25 %	0 %	50 %	25 %	193212983
30003	NC_011027	TGA	2	6	1448746	1448751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212983
30004	NC_011027	CTC	2	6	1448787	1448792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212983
30005	NC_011027	CTA	2	6	1448849	1448854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212983
30006	NC_011027	GGT	2	6	1448891	1448896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212983
30007	NC_011027	ATC	2	6	1448904	1448909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212983
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30009	NC_011027	GGC	2	6	1448991	1448996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212983
30010	NC_011027	GGA	2	6	1449218	1449223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212983
30011	NC_011027	CGG	2	6	1449239	1449244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212983
30012	NC_011027	A	6	6	1449261	1449266	100 %	0 %	0 %	0 %	193212983
30013	NC_011027	GGA	3	9	1449309	1449317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30014	NC_011027	CTC	2	6	1449327	1449332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30015	NC_011027	TCA	2	6	1449387	1449392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30016	NC_011027	ACC	2	6	1449464	1449469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212984
30017	NC_011027	A	6	6	1449565	1449570	100 %	0 %	0 %	0 %	193212984
30018	NC_011027	CTG	2	6	1449577	1449582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212984
30019	NC_011027	CAA	2	6	1449588	1449593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212984
30020	NC_011027	GC	3	6	1449715	1449720	0 %	0 %	50 %	50 %	193212984
30021	NC_011027	GAC	2	6	1449754	1449759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212984
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30024	NC_011027	A	6	6	1449848	1449853	100 %	0 %	0 %	0 %	193212984
30025	NC_011027	CGGAC	2	10	1449902	1449911	20 %	0 %	40 %	40 %	193212984
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30027	NC_011027	GGGC	2	8	1449963	1449970	0 %	0 %	75 %	25 %	193212984
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30032	NC_011027	CAG	2	6	1450321	1450326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212984
30033	NC_011027	TGA	2	6	1450340	1450345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212984
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30051	NC_011027	T	6	6	1451219	1451224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30052	NC_011027	TAT	2	6	1451241	1451246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30053	NC_011027	CT	3	6	1451320	1451325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30054	NC_011027	CAC	2	6	1451326	1451331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30055	NC_011027	ATC	2	6	1451578	1451583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212986
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30104	NC_011027	ATCA	3	12	1453671	1453682	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30105	NC_011027	T	6	6	1453742	1453747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30106	NC_011027	CAA	2	6	1453748	1453753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30116	NC_011027	CCT	2	6	1454145	1454150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212988
30117	NC_011027	T	6	6	1454240	1454245	0 %	100 %	0 %	0 %	193212988
30118	NC_011027	T	6	6	1454267	1454272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30119	NC_011027	A	6	6	1454283	1454288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30120	NC_011027	TCCA	2	8	1454399	1454406	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30121	NC_011027	T	6	6	1454412	1454417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30122	NC_011027	CGC	2	6	1454418	1454423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30123	NC_011027	CAT	2	6	1454436	1454441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30124	NC_011027	GAA	2	6	1454540	1454545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30125	NC_011027	TCA	2	6	1454557	1454562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30126	NC_011027	GATC	2	8	1454577	1454584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30127	NC_011027	TCAC	2	8	1454628	1454635	25 %	25 %	0 %	50 %	193212989
30128	NC_011027	CTG	2	6	1454637	1454642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212989
30129	NC_011027	GCA	2	6	1454665	1454670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212989
30130	NC_011027	GAT	2	6	1454756	1454761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212989
30131	NC_011027	GTCG	2	8	1454792	1454799	0 %	25 %	50 %	25 %	193212989
30132	NC_011027	AT	3	6	1454819	1454824	50 %	50 %	0 %	0 %	193212989
30133	NC_011027	CTTT	2	8	1454839	1454846	0 %	75 %	0 %	25 %	193212989
30134	NC_011027	ATC	2	6	1454925	1454930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212989
30135	NC_011027	GAA	2	6	1454931	1454936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212989
30136	NC_011027	CTG	2	6	1454961	1454966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212989
30137	NC_011027	GCCATT	2	12	1455078	1455089	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	193212989
30138	NC_011027	GAAA	2	8	1455148	1455155	75 %	0 %	25 %	0 %	193212989
30139	NC_011027	CGA	2	6	1455299	1455304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212989
30140	NC_011027	CCG	2	6	1455316	1455321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212989
30141	NC_011027	ACC	2	6	1455337	1455342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212989
30142	NC_011027	CGG	2	6	1455350	1455355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212989
30143	NC_011027	CGG	2	6	1455362	1455367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212989
30144	NC_011027	CAGC	2	8	1455508	1455515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30145	NC_011027	CTT	2	6	1455526	1455531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212990
30146	NC_011027	GCT	2	6	1455565	1455570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212990
30147	NC_011027	CAT	2	6	1455596	1455601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212990
30148	NC_011027	TCG	2	6	1455657	1455662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212990
30149	NC_011027	ATC	2	6	1455669	1455674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212990
30150	NC_011027	GCG	2	6	1455709	1455714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212990
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30152	NC_011027	ATG	2	6	1455804	1455809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212990
30153	NC_011027	GGT	2	6	1455817	1455822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212990
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30155	NC_011027	GCG	2	6	1455892	1455897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212990
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30188	NC_011027	GCC	2	6	1457304	1457309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212990
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30208	NC_011027	T	10	10	1458180	1458189	0 %	100 %	0 %	0 %	193212992
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30224	NC_011027	ATG	2	6	1458936	1458941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212992
30225	NC_011027	GTC	2	6	1459001	1459006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212992
30226	NC_011027	TGT	2	6	1459012	1459017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212992
30227	NC_011027	GCTC	2	8	1459049	1459056	0 %	25 %	25 %	50 %	193212992
30228	NC_011027	CG	3	6	1459165	1459170	0 %	0 %	50 %	50 %	193212992
30229	NC_011027	CCG	2	6	1459171	1459176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212992
30230	NC_011027	CGC	2	6	1459189	1459194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212992
30231	NC_011027	CGTTG	2	10	1459340	1459349	0 %	40 %	40 %	20 %	193212993
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30233	NC_011027	GCT	2	6	1459465	1459470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212993
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30349	NC_011027	GCT	2	6	1465207	1465212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212998
30350	NC_011027	CGC	2	6	1465222	1465227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212998
30351	NC_011027	GCA	2	6	1465257	1465262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212998
30352	NC_011027	TCG	2	6	1465275	1465280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212998
30353	NC_011027	CG	3	6	1465284	1465289	0 %	0 %	50 %	50 %	193212998
30354	NC_011027	ATG	2	6	1465346	1465351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212998
30355	NC_011027	CCGCG	2	10	1465392	1465401	0 %	0 %	40 %	60 %	193212999
30356	NC_011027	ACCG	2	8	1465405	1465412	25 %	0 %	25 %	50 %	193212999
30357	NC_011027	GCG	2	6	1465595	1465600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212999
30358	NC_011027	GCT	2	6	1465605	1465610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212999
30359	NC_011027	TCG	2	6	1465622	1465627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212999
30360	NC_011027	GC	3	6	1465638	1465643	0 %	0 %	50 %	50 %	193212999
30361	NC_011027	CAC	2	6	1465677	1465682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212999
30362	NC_011027	AC	3	6	1465757	1465762	50 %	0 %	0 %	50 %	193212999
30363	NC_011027	CGC	2	6	1465792	1465797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212999
30364	NC_011027	GCT	2	6	1465833	1465838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212999
30365	NC_011027	CAA	2	6	1465890	1465895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212999
30366	NC_011027	CGA	2	6	1465896	1465901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212999
30367	NC_011027	TGA	2	6	1465971	1465976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212999
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30369	NC_011027	GAT	2	6	1466016	1466021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212999
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30373	NC_011027	ATC	2	6	1466210	1466215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212999
30374	NC_011027	ACG	2	6	1466246	1466251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212999
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30378	NC_011027	G	6	6	1466362	1466367	0 %	0 %	100 %	0 %	193212999
30379	NC_011027	A	7	7	1466374	1466380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30380	NC_011027	GGCC	2	8	1466388	1466395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30381	NC_011027	GCCA	2	8	1466459	1466466	25 %	0 %	25 %	50 %	193213000
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30383	NC_011027	CG	3	6	1466488	1466493	0 %	0 %	50 %	50 %	193213000
30384	NC_011027	ATG	2	6	1466496	1466501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213000
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30386	NC_011027	CCG	2	6	1466532	1466537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213000
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30390	NC_011027	TGA	2	6	1466789	1466794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213000
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30392	NC_011027	TTC	2	6	1466966	1466971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213001
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30401	NC_011027	AGAA	2	8	1467389	1467396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30402	NC_011027	AGT	2	6	1467485	1467490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30403	NC_011027	CAGA	2	8	1467511	1467518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30404	NC_011027	GCA	2	6	1467535	1467540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30406	NC_011027	AAC	2	6	1467632	1467637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30407	NC_011027	TCA	2	6	1467648	1467653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30408	NC_011027	GAA	2	6	1467660	1467665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30409	NC_011027	CAT	2	6	1467684	1467689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30413	NC_011027	TCACC	3	15	1467783	1467797	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
30414	NC_011027	CGG	2	6	1467934	1467939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30415	NC_011027	TGAGT	2	10	1467943	1467952	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30416	NC_011027	TGGA	2	8	1467971	1467978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30417	NC_011027	TCGA	2	8	1467979	1467986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30418	NC_011027	CAG	2	6	1468081	1468086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213002
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30421	NC_011027	CTG	2	6	1468335	1468340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213002
30422	NC_011027	GAC	2	6	1468416	1468421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213002
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30424	NC_011027	CCAA	2	8	1468651	1468658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30425	NC_011027	TA	3	6	1468745	1468750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30426	NC_011027	ATA	2	6	1468755	1468760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30427	NC_011027	TGC	2	6	1468888	1468893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213003
30428	NC_011027	CTG	2	6	1468896	1468901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213003
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30433	NC_011027	TGC	2	6	1469236	1469241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213003
30434	NC_011027	AAC	2	6	1469300	1469305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213003
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30438	NC_011027	GCT	2	6	1469429	1469434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213003
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30442	NC_011027	CT	4	8	1469567	1469574	0 %	50 %	0 %	50 %	193213003
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30444	NC_011027	ACA	2	6	1469750	1469755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30445	NC_011027	CAT	2	6	1469919	1469924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213004
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30450	NC_011027	GCTC	2	8	1470074	1470081	0 %	25 %	25 %	50 %	193213004
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30452	NC_011027	CCGCA	2	10	1470265	1470274	20 %	0 %	20 %	60 %	193213004
30453	NC_011027	TGC	2	6	1470354	1470359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213004
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30455	NC_011027	CTG	2	6	1470403	1470408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213004
30456	NC_011027	GCA	2	6	1470440	1470445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213004
30457	NC_011027	CTG	2	6	1470457	1470462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213004
30458	NC_011027	GAA	2	6	1470487	1470492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213004
30459	NC_011027	GTA	2	6	1470493	1470498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213004
30460	NC_011027	TCG	2	6	1470505	1470510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213004
30461	NC_011027	GCCA	2	8	1470548	1470555	25 %	0 %	25 %	50 %	193213004
30462	NC_011027	GCT	2	6	1470579	1470584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213004
30463	NC_011027	CAG	2	6	1470615	1470620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213004
30464	NC_011027	CAC	2	6	1470726	1470731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213004
30465	NC_011027	CAA	2	6	1470750	1470755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213004
30466	NC_011027	A	6	6	1470786	1470791	100 %	0 %	0 %	0 %	193213004
30467	NC_011027	TGA	2	6	1470883	1470888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30468	NC_011027	CA	3	6	1470889	1470894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30469	NC_011027	GCG	2	6	1471085	1471090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213005
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30488	NC_011027	GAAC	2	8	1471981	1471988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30489	NC_011027	CG	3	6	1472055	1472060	0 %	0 %	50 %	50 %	193213006
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30496	NC_011027	CTG	2	6	1472573	1472578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30497	NC_011027	TAA	2	6	1472633	1472638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30498	NC_011027	A	7	7	1472677	1472683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30499	NC_011027	GAAA	2	8	1472720	1472727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30500	NC_011027	GA	3	6	1472730	1472735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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