MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 47786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011027	CGGT	2	8	627799	627806	0 %	25 %	50 %	25 %	193212251
13002	NC_011027	CGG	2	6	627836	627841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212251
13003	NC_011027	GCTG	2	8	627852	627859	0 %	25 %	50 %	25 %	193212251
13004	NC_011027	CTG	2	6	627892	627897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212251
13005	NC_011027	CAG	2	6	627912	627917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212251
13006	NC_011027	GCTCA	2	10	627937	627946	20 %	20 %	20 %	40 %	193212251
13007	NC_011027	TGG	2	6	627947	627952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212251
13008	NC_011027	GGT	2	6	627993	627998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212251
13009	NC_011027	GCC	2	6	628031	628036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212251
13010	NC_011027	GCG	2	6	628038	628043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212251
13011	NC_011027	GC	3	6	628057	628062	0 %	0 %	50 %	50 %	193212251
13012	NC_011027	ACG	2	6	628082	628087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212251
13013	NC_011027	CAA	2	6	628125	628130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212251
13014	NC_011027	CGG	2	6	628178	628183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212251
13015	NC_011027	CGA	2	6	628299	628304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212251
13016	NC_011027	GAG	2	6	628327	628332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212251
13017	NC_011027	ATG	2	6	628351	628356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212251
13018	NC_011027	TGG	2	6	628433	628438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212251
13019	NC_011027	ATG	2	6	628459	628464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212251
13020	NC_011027	GCA	2	6	628606	628611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212252
13021	NC_011027	CCA	2	6	628618	628623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212252
13022	NC_011027	GTC	2	6	628634	628639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212252
13023	NC_011027	GGT	2	6	628655	628660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212252
13024	NC_011027	TGA	2	6	628723	628728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212252
13025	NC_011027	GAT	2	6	628742	628747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212252
13026	NC_011027	GCG	2	6	628750	628755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212252
13027	NC_011027	GTA	2	6	628772	628777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212252
13028	NC_011027	TCC	2	6	628788	628793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212252
13029	NC_011027	GC	4	8	628814	628821	0 %	0 %	50 %	50 %	193212252
13030	NC_011027	TTG	2	6	628887	628892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212252
13031	NC_011027	CCA	2	6	628897	628902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212252
13032	NC_011027	GTC	2	6	628934	628939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212252
13033	NC_011027	TTG	2	6	629100	629105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212252
13034	NC_011027	TGC	2	6	629110	629115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212252
13035	NC_011027	GCC	2	6	629138	629143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212252
13036	NC_011027	AGT	2	6	629149	629154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212252
13037	NC_011027	GCC	2	6	629157	629162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212252
13038	NC_011027	ACC	2	6	629166	629171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212252
13039	NC_011027	ATC	2	6	629175	629180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212252
13040	NC_011027	TGTCA	2	10	629186	629195	20 %	40 %	20 %	20 %	193212252
13041	NC_011027	TCG	2	6	629286	629291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212252
13042	NC_011027	GCC	2	6	629405	629410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212252
13043	NC_011027	GCCC	2	8	629587	629594	0 %	0 %	25 %	75 %	193212252
13044	NC_011027	GGT	2	6	629698	629703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212252
13045	NC_011027	TGA	2	6	629710	629715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212252
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13051	NC_011027	GCC	2	6	629908	629913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212252
13052	NC_011027	CCA	2	6	629947	629952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212252
13053	NC_011027	GCCCGC	2	12	629969	629980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212252
13054	NC_011027	TCG	2	6	630028	630033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212252
13055	NC_011027	GCC	2	6	630041	630046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212252
13056	NC_011027	CT	3	6	630075	630080	0 %	50 %	0 %	50 %	193212252
13057	NC_011027	T	6	6	630080	630085	0 %	100 %	0 %	0 %	193212252
13058	NC_011027	TGA	2	6	630088	630093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212252
13059	NC_011027	TGAT	2	8	630199	630206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_011027	TTG	2	6	630311	630316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_011027	GCA	3	9	630405	630413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212253
13062	NC_011027	GTC	2	6	630431	630436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212253
13063	NC_011027	TTG	2	6	630533	630538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212253
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13072	NC_011027	CGAA	2	8	630873	630880	50 %	0 %	25 %	25 %	193212253
13073	NC_011027	GA	3	6	630881	630886	50 %	0 %	50 %	0 %	193212253
13074	NC_011027	GGT	2	6	630946	630951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_011027	TGT	2	6	630978	630983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_011027	T	6	6	631026	631031	0 %	100 %	0 %	0 %	193212254
13077	NC_011027	A	6	6	631048	631053	100 %	0 %	0 %	0 %	193212254
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13080	NC_011027	TCA	2	6	631130	631135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212254
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13082	NC_011027	GCGCC	2	10	631162	631171	0 %	0 %	40 %	60 %	193212254
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13089	NC_011027	CGG	2	6	631380	631385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212254
13090	NC_011027	CGA	2	6	631563	631568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212254
13091	NC_011027	CAG	2	6	631633	631638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212254
13092	NC_011027	GCGCCT	2	12	631740	631751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	193212254
13093	NC_011027	TCG	2	6	631769	631774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212254
13094	NC_011027	CCAG	2	8	631842	631849	25 %	0 %	25 %	50 %	193212254
13095	NC_011027	TGG	2	6	631866	631871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212254
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13102	NC_011027	TCG	2	6	632165	632170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212254
13103	NC_011027	GTT	2	6	632191	632196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212254
13104	NC_011027	GGA	2	6	632255	632260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_011027	GCT	2	6	632284	632289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212255
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13108	NC_011027	GGC	3	9	632479	632487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212255
13109	NC_011027	GTGTT	2	10	632514	632523	0 %	60 %	40 %	0 %	193212255
13110	NC_011027	CGC	2	6	632560	632565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212255
13111	NC_011027	ATC	2	6	632571	632576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212255
13112	NC_011027	CTTGC	2	10	632720	632729	0 %	40 %	20 %	40 %	193212255
13113	NC_011027	T	6	6	632730	632735	0 %	100 %	0 %	0 %	193212255
13114	NC_011027	GTT	2	6	632764	632769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_011027	AAC	2	6	632784	632789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_011027	ATC	2	6	632792	632797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_011027	TTC	2	6	632928	632933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_011027	CAC	2	6	633015	633020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13119	NC_011027	CTCA	2	8	633024	633031	25 %	25 %	0 %	50 %	193212256
13120	NC_011027	T	7	7	633088	633094	0 %	100 %	0 %	0 %	193212256
13121	NC_011027	CCG	2	6	633174	633179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212256
13122	NC_011027	GCC	2	6	633187	633192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212256
13123	NC_011027	CGAA	2	8	633239	633246	50 %	0 %	25 %	25 %	193212256
13124	NC_011027	CTC	2	6	633247	633252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212256
13125	NC_011027	CAGGTG	2	12	633274	633285	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	193212256
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13220	NC_011027	T	7	7	638131	638137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13227	NC_011027	ACC	2	6	638559	638564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13228	NC_011027	TTCTG	2	10	638567	638576	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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13230	NC_011027	TTCG	2	8	638593	638600	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13231	NC_011027	GAG	2	6	638603	638608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13232	NC_011027	T	7	7	638609	638615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13233	NC_011027	AGG	2	6	638666	638671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212261
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13235	NC_011027	AAGA	2	8	638719	638726	75 %	0 %	25 %	0 %	193212261
13236	NC_011027	ACT	2	6	638750	638755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212261
13237	NC_011027	CAG	2	6	638773	638778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212261
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13239	NC_011027	TCG	2	6	638789	638794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212261
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13241	NC_011027	CGA	2	6	638919	638924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212261
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13243	NC_011027	AGC	2	6	638984	638989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212261
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13257	NC_011027	GCC	2	6	639621	639626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13260	NC_011027	TCA	2	6	639739	639744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212262
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13303	NC_011027	GAT	2	6	641902	641907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13353	NC_011027	CGG	2	6	644086	644091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212265
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13358	NC_011027	GAG	2	6	644334	644339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212265
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13361	NC_011027	AGC	2	6	644449	644454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212265
13362	NC_011027	CAA	2	6	644486	644491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212265
13363	NC_011027	CGA	2	6	644504	644509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212265
13364	NC_011027	AGC	2	6	644539	644544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212265
13365	NC_011027	GCGA	2	8	644583	644590	25 %	0 %	50 %	25 %	193212265
13366	NC_011027	GGC	2	6	644603	644608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212265
13367	NC_011027	ATG	2	6	644631	644636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212265
13368	NC_011027	GC	3	6	644644	644649	0 %	0 %	50 %	50 %	193212265
13369	NC_011027	ATG	2	6	644745	644750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212265
13370	NC_011027	ACC	2	6	644814	644819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212265
13371	NC_011027	TCC	2	6	644919	644924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212265
13372	NC_011027	CGA	2	6	644936	644941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212265
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13374	NC_011027	GAG	3	9	644961	644969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212265
13375	NC_011027	AGG	2	6	644992	644997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212265
13376	NC_011027	TCG	2	6	645010	645015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212265
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13380	NC_011027	TGG	2	6	645253	645258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212265
13381	NC_011027	GAC	2	6	645425	645430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212265
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13383	NC_011027	ACA	2	6	645523	645528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212265
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13385	NC_011027	GAC	2	6	645653	645658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212265
13386	NC_011027	GTT	2	6	645661	645666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212265
13387	NC_011027	GATTG	2	10	645672	645681	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13388	NC_011027	T	6	6	645717	645722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13389	NC_011027	G	6	6	645723	645728	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13390	NC_011027	TTG	2	6	645735	645740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13391	NC_011027	TGAG	2	8	645800	645807	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13392	NC_011027	TCA	2	6	645827	645832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13393	NC_011027	TG	3	6	645857	645862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13394	NC_011027	ATA	2	6	645924	645929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193212266
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13397	NC_011027	TGA	2	6	646078	646083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212266
13398	NC_011027	AAAG	2	8	646099	646106	75 %	0 %	25 %	0 %	193212266
13399	NC_011027	TTG	2	6	646122	646127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212266
13400	NC_011027	A	7	7	646147	646153	100 %	0 %	0 %	0 %	193212266
13401	NC_011027	GTA	2	6	646164	646169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212266
13402	NC_011027	AT	3	6	646171	646176	50 %	50 %	0 %	0 %	193212266
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13410	NC_011027	GTA	2	6	646400	646405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212267
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13416	NC_011027	TTCT	2	8	646802	646809	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13417	NC_011027	AG	3	6	646825	646830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13418	NC_011027	TCT	2	6	646926	646931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212268
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13425	NC_011027	TCC	2	6	647264	647269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212268
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13429	NC_011027	TTTTC	2	10	647639	647648	0 %	80 %	0 %	20 %	193212269
13430	NC_011027	AGCCG	2	10	647730	647739	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13431	NC_011027	ACT	2	6	647817	647822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13432	NC_011027	AC	3	6	647896	647901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13433	NC_011027	G	6	6	647911	647916	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13434	NC_011027	ATT	2	6	648055	648060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13435	NC_011027	GAAC	2	8	648070	648077	50 %	0 %	25 %	25 %	193212270
13436	NC_011027	CGA	2	6	648128	648133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212270
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13438	NC_011027	GGTCG	2	10	648165	648174	0 %	20 %	60 %	20 %	193212270
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13442	NC_011027	GCA	2	6	648308	648313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212270
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13446	NC_011027	GGGGC	2	10	648371	648380	0 %	0 %	80 %	20 %	193212270
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13449	NC_011027	TG	3	6	648554	648559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13450	NC_011027	AC	3	6	648611	648616	50 %	0 %	0 %	50 %	193212271
13451	NC_011027	ATTT	2	8	648645	648652	25 %	75 %	0 %	0 %	193212271
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13469	NC_011027	CGGG	2	8	649717	649724	0 %	0 %	75 %	25 %	193212272
13470	NC_011027	GGA	2	6	649735	649740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212272
13471	NC_011027	TCC	2	6	649767	649772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212272
13472	NC_011027	CTT	2	6	649796	649801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212272
13473	NC_011027	GAC	2	6	649802	649807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212272
13474	NC_011027	GTGCC	2	10	649813	649822	0 %	20 %	40 %	40 %	193212272
13475	NC_011027	TGA	2	6	649894	649899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13476	NC_011027	GGT	2	6	649987	649992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212273
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13478	NC_011027	TGA	2	6	650016	650021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212273
13479	NC_011027	CTTGC	2	10	650057	650066	0 %	40 %	20 %	40 %	193212273
13480	NC_011027	CGTGG	2	10	650111	650120	0 %	20 %	60 %	20 %	193212273
13481	NC_011027	TTC	2	6	650220	650225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212273
13482	NC_011027	GTG	2	6	650238	650243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212273
13483	NC_011027	CTCTTT	2	12	650268	650279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212273
13484	NC_011027	CGCC	2	8	650286	650293	0 %	0 %	25 %	75 %	193212273
13485	NC_011027	TGC	2	6	650353	650358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212273
13486	NC_011027	A	6	6	650381	650386	100 %	0 %	0 %	0 %	193212273
13487	NC_011027	TACGAC	2	12	650396	650407	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	193212273
13488	NC_011027	GGCA	2	8	650454	650461	25 %	0 %	50 %	25 %	193212273
13489	NC_011027	ACA	3	9	650581	650589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212273
13490	NC_011027	ATG	3	9	650644	650652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212274
13491	NC_011027	CAT	2	6	650663	650668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212274
13492	NC_011027	GGT	2	6	650697	650702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212274
13493	NC_011027	ATG	2	6	650717	650722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212274
13494	NC_011027	GTC	2	6	650808	650813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212274
13495	NC_011027	GGC	2	6	650839	650844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212274
13496	NC_011027	TCGA	2	8	650938	650945	25 %	25 %	25 %	25 %	193212274
13497	NC_011027	GGC	2	6	650997	651002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212274
13498	NC_011027	AGG	2	6	651021	651026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_011027	T	6	6	651035	651040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_011027	CAG	2	6	651048	651053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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