MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 47786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011027	TGT	2	6	531302	531307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_011027	TTC	2	6	531488	531493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212166
11003	NC_011027	CGAT	2	8	531531	531538	25 %	25 %	25 %	25 %	193212166
11004	NC_011027	GAG	2	6	531539	531544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212166
11005	NC_011027	GCG	2	6	531582	531587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212166
11006	NC_011027	GCA	2	6	531670	531675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212166
11007	NC_011027	TGATGC	2	12	531771	531782	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	193212166
11008	NC_011027	GCT	2	6	531883	531888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212166
11009	NC_011027	TCGCG	2	10	531926	531935	0 %	20 %	40 %	40 %	193212166
11010	NC_011027	CCGG	2	8	532076	532083	0 %	0 %	50 %	50 %	193212166
11011	NC_011027	CG	3	6	532141	532146	0 %	0 %	50 %	50 %	193212167
11012	NC_011027	GTC	2	6	532153	532158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212167
11013	NC_011027	T	6	6	532201	532206	0 %	100 %	0 %	0 %	193212167
11014	NC_011027	TCT	2	6	532269	532274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212167
11015	NC_011027	GATC	2	8	532335	532342	25 %	25 %	25 %	25 %	193212167
11016	NC_011027	ACC	2	6	532463	532468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212167
11017	NC_011027	TCG	2	6	532473	532478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212167
11018	NC_011027	TGG	2	6	532671	532676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212167
11019	NC_011027	GAA	2	6	532678	532683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212167
11020	NC_011027	TGA	2	6	532866	532871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212167
11021	NC_011027	GA	3	6	532880	532885	50 %	0 %	50 %	0 %	193212167
11022	NC_011027	TGT	2	6	532956	532961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212167
11023	NC_011027	GAG	2	6	532966	532971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212167
11024	NC_011027	GGTGCA	2	12	532977	532988	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	193212167
11025	NC_011027	GC	3	6	533044	533049	0 %	0 %	50 %	50 %	193212167
11026	NC_011027	GGTGG	2	10	533122	533131	0 %	20 %	80 %	0 %	193212167
11027	NC_011027	GAT	2	6	533170	533175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212167
11028	NC_011027	GTT	2	6	533188	533193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212167
11029	NC_011027	CGA	2	6	533226	533231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212167
11030	NC_011027	CTGGAG	2	12	533242	533253	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	193212167
11031	NC_011027	T	6	6	533290	533295	0 %	100 %	0 %	0 %	193212167
11032	NC_011027	GAT	2	6	533344	533349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212167
11033	NC_011027	CGC	2	6	533415	533420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212167
11034	NC_011027	GGA	2	6	533439	533444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212167
11035	NC_011027	TCG	2	6	533477	533482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212167
11036	NC_011027	GAT	4	12	533590	533601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212167
11037	NC_011027	TGC	2	6	533679	533684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212167
11038	NC_011027	AGG	3	9	533699	533707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212167
11039	NC_011027	GCC	2	6	533716	533721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212167
11040	NC_011027	CAC	2	6	533806	533811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212167
11041	NC_011027	GAT	2	6	533845	533850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212167
11042	NC_011027	CGG	2	6	533885	533890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212167
11043	NC_011027	AGC	2	6	533993	533998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212167
11044	NC_011027	TCG	2	6	533999	534004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212167
11045	NC_011027	AGC	2	6	534063	534068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_011027	GTTCA	2	10	534179	534188	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11047	NC_011027	A	7	7	534269	534275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_011027	TAT	2	6	534279	534284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_011027	GAT	2	6	534513	534518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212168
11050	NC_011027	GTTCG	2	10	534585	534594	0 %	40 %	40 %	20 %	193212168
11051	NC_011027	TGC	2	6	534659	534664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212168
11052	NC_011027	TGG	2	6	534764	534769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212168
11053	NC_011027	CTTT	2	8	534836	534843	0 %	75 %	0 %	25 %	193212168
11054	NC_011027	CGG	2	6	534846	534851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212168
11055	NC_011027	TGC	2	6	534866	534871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212168
11056	NC_011027	TGG	2	6	534872	534877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212168
11057	NC_011027	AGA	2	6	534911	534916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212168
11058	NC_011027	CTG	2	6	534949	534954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212168
11059	NC_011027	GTG	2	6	535027	535032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212168
11060	NC_011027	TCA	2	6	535040	535045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212168
11061	NC_011027	CAT	2	6	535215	535220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212168
11062	NC_011027	TTCG	2	8	535278	535285	0 %	50 %	25 %	25 %	193212168
11063	NC_011027	GCC	2	6	535330	535335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212168
11064	NC_011027	TGG	2	6	535400	535405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212168
11065	NC_011027	GGC	2	6	535456	535461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212168
11066	NC_011027	GTTT	2	8	535497	535504	0 %	75 %	25 %	0 %	193212168
11067	NC_011027	CGC	2	6	535509	535514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212168
11068	NC_011027	GGA	2	6	535518	535523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212168
11069	NC_011027	ATT	2	6	535544	535549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193212168
11070	NC_011027	GAG	2	6	535552	535557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212168
11071	NC_011027	CTC	2	6	535682	535687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11072	NC_011027	ATG	2	6	535756	535761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_011027	GGTA	2	8	535777	535784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_011027	TG	3	6	535795	535800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_011027	ATT	2	6	535809	535814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_011027	AAC	2	6	535894	535899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_011027	CGT	2	6	535900	535905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_011027	ACA	2	6	535957	535962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_011027	GTGTC	2	10	535997	536006	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11080	NC_011027	GAG	2	6	536041	536046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_011027	TCA	2	6	536062	536067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212169
11082	NC_011027	GTT	2	6	536079	536084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212169
11083	NC_011027	CAGG	2	8	536116	536123	25 %	0 %	50 %	25 %	193212169
11084	NC_011027	TGA	3	9	536153	536161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212169
11085	NC_011027	GTG	2	6	536188	536193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212169
11086	NC_011027	GTC	2	6	536241	536246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212169
11087	NC_011027	TGC	2	6	536252	536257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212169
11088	NC_011027	TGGT	2	8	536554	536561	0 %	50 %	50 %	0 %	193212169
11089	NC_011027	ACCT	2	8	536715	536722	25 %	25 %	0 %	50 %	193212169
11090	NC_011027	AG	3	6	536908	536913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_011027	GTT	2	6	536922	536927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_011027	CTT	2	6	536970	536975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_011027	TCGATT	2	12	537060	537071	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11094	NC_011027	CCA	2	6	537193	537198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212170
11095	NC_011027	GGT	2	6	537223	537228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212170
11096	NC_011027	TGG	2	6	537237	537242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212170
11097	NC_011027	GTCG	2	8	537301	537308	0 %	25 %	50 %	25 %	193212170
11098	NC_011027	TCC	2	6	537312	537317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212170
11099	NC_011027	TCA	2	6	537331	537336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212170
11100	NC_011027	TGA	2	6	537337	537342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212170
11101	NC_011027	GGC	2	6	537356	537361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212170
11102	NC_011027	AGGGGT	2	12	537394	537405	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	193212170
11103	NC_011027	ACG	2	6	537429	537434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212170
11104	NC_011027	CCAT	2	8	537442	537449	25 %	25 %	0 %	50 %	193212170
11105	NC_011027	GCG	2	6	537450	537455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212170
11106	NC_011027	GAT	3	9	537470	537478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212170
11107	NC_011027	TCC	3	9	537636	537644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212170
11108	NC_011027	AGC	2	6	537645	537650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212170
11109	NC_011027	T	6	6	537724	537729	0 %	100 %	0 %	0 %	193212170
11110	NC_011027	GAT	2	6	537734	537739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212170
11111	NC_011027	GAC	2	6	537746	537751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212170
11112	NC_011027	GAC	2	6	537758	537763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212170
11113	NC_011027	CCG	2	6	537770	537775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212170
11114	NC_011027	GCGT	2	8	537819	537826	0 %	25 %	50 %	25 %	193212170
11115	NC_011027	TGG	2	6	537841	537846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212170
11116	NC_011027	TTC	2	6	537861	537866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_011027	CG	3	6	537939	537944	0 %	0 %	50 %	50 %	193212171
11118	NC_011027	CGA	2	6	537967	537972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212171
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11120	NC_011027	GCC	2	6	537989	537994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212171
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11231	NC_011027	TTCGC	2	10	543454	543463	0 %	40 %	20 %	40 %	193212175
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11242	NC_011027	AGG	2	6	544015	544020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212175
11243	NC_011027	GAT	2	6	544037	544042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212175
11244	NC_011027	CCG	2	6	544065	544070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212175
11245	NC_011027	CG	3	6	544069	544074	0 %	0 %	50 %	50 %	193212175
11246	NC_011027	GAG	2	6	544095	544100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212175
11247	NC_011027	ACG	2	6	544260	544265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212175
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11249	NC_011027	CACG	2	8	544388	544395	25 %	0 %	25 %	50 %	193212175
11250	NC_011027	GAG	2	6	544419	544424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212175
11251	NC_011027	GGT	2	6	544442	544447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212175
11252	NC_011027	GGA	2	6	544451	544456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212175
11253	NC_011027	TCG	2	6	544468	544473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212175
11254	NC_011027	ACG	2	6	544525	544530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212175
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11257	NC_011027	GCG	3	9	544593	544601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212175
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11262	NC_011027	CGC	2	6	544771	544776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212175
11263	NC_011027	CTG	2	6	544788	544793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212175
11264	NC_011027	GCT	2	6	544796	544801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212175
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11271	NC_011027	GCT	2	6	544985	544990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212175
11272	NC_011027	TCA	2	6	545002	545007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212175
11273	NC_011027	GCACA	2	10	545015	545024	40 %	0 %	20 %	40 %	193212175
11274	NC_011027	CGC	2	6	545074	545079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212175
11275	NC_011027	GCT	2	6	545192	545197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212175
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11279	NC_011027	ATC	2	6	545267	545272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212175
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11281	NC_011027	GGC	2	6	545313	545318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11282	NC_011027	GCC	2	6	545328	545333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11284	NC_011027	GCC	2	6	545390	545395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212176
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11312	NC_011027	CGT	2	6	546801	546806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212176
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11340	NC_011027	A	6	6	548142	548147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11341	NC_011027	A	6	6	548163	548168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11344	NC_011027	GTT	2	6	548272	548277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212177
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11349	NC_011027	GCT	2	6	548655	548660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212177
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11352	NC_011027	CGG	2	6	548765	548770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212177
11353	NC_011027	CGG	2	6	548832	548837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212177
11354	NC_011027	CAG	2	6	548854	548859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212177
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11357	NC_011027	GGCT	2	8	549004	549011	0 %	25 %	50 %	25 %	193212177
11358	NC_011027	CCCA	2	8	549013	549020	25 %	0 %	0 %	75 %	193212177
11359	NC_011027	TCG	2	6	549071	549076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212177
11360	NC_011027	TCT	2	6	549129	549134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212178
11361	NC_011027	CGA	2	6	549145	549150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212178
11362	NC_011027	TTG	2	6	549153	549158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212178
11363	NC_011027	GCG	2	6	549312	549317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212178
11364	NC_011027	AGC	2	6	549354	549359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212178
11365	NC_011027	TGC	2	6	549494	549499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212178
11366	NC_011027	AAT	2	6	549515	549520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193212178
11367	NC_011027	CGGTG	2	10	549628	549637	0 %	20 %	60 %	20 %	193212178
11368	NC_011027	TGA	2	6	549640	549645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212178
11369	NC_011027	GTG	2	6	549647	549652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212178
11370	NC_011027	CGC	2	6	549751	549756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212178
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11373	NC_011027	ATGGT	2	10	549825	549834	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11374	NC_011027	GAT	2	6	549894	549899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212179
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11377	NC_011027	GAG	2	6	550093	550098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212179
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11381	NC_011027	CCGA	2	8	550228	550235	25 %	0 %	25 %	50 %	193212179
11382	NC_011027	GCG	2	6	550258	550263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212179
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11385	NC_011027	CGCC	2	8	550361	550368	0 %	0 %	25 %	75 %	193212179
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11389	NC_011027	CGGA	2	8	550487	550494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11399	NC_011027	CT	3	6	551116	551121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11400	NC_011027	CTG	2	6	551157	551162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212181
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11432	NC_011027	TACCG	2	10	552904	552913	20 %	20 %	20 %	40 %	193212183
11433	NC_011027	GTTGT	2	10	552938	552947	0 %	60 %	40 %	0 %	193212183
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11445	NC_011027	TA	3	6	553433	553438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11468	NC_011027	GCCGT	2	10	554496	554505	0 %	20 %	40 %	40 %	193212184
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11476	NC_011027	GCT	2	6	554919	554924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212185
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11480	NC_011027	CAT	2	6	555087	555092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212185
11481	NC_011027	CA	3	6	555107	555112	50 %	0 %	0 %	50 %	193212185
11482	NC_011027	GA	3	6	555204	555209	50 %	0 %	50 %	0 %	193212185
11483	NC_011027	CGC	2	6	555226	555231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212185
11484	NC_011027	AGG	2	6	555237	555242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212185
11485	NC_011027	TCA	2	6	555246	555251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212185
11486	NC_011027	ATCG	2	8	555311	555318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11487	NC_011027	GGA	2	6	555336	555341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11488	NC_011027	AGG	2	6	555355	555360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11489	NC_011027	ATT	2	6	555530	555535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193212186
11490	NC_011027	AGG	2	6	555563	555568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212186
11491	NC_011027	CCA	2	6	555605	555610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212186
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11494	NC_011027	GCGAT	2	10	555848	555857	20 %	20 %	40 %	20 %	193212186
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11498	NC_011027	CCT	2	6	555959	555964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212186
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