MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011026	GTTGAA	2	12	643669	643680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214263
13002	NC_011026	GAT	2	6	643723	643728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214263
13003	NC_011026	GCAAAA	2	12	643789	643800	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	193214263
13004	NC_011026	TGC	2	6	643940	643945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214263
13005	NC_011026	ATT	2	6	643999	644004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193214263
13006	NC_011026	A	7	7	644025	644031	100 %	0 %	0 %	0 %	193214263
13007	NC_011026	GC	3	6	644147	644152	0 %	0 %	50 %	50 %	193214263
13008	NC_011026	TGAAA	2	10	644202	644211	60 %	20 %	20 %	0 %	193214263
13009	NC_011026	GTT	2	6	644248	644253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193214263
13010	NC_011026	A	6	6	644282	644287	100 %	0 %	0 %	0 %	193214263
13011	NC_011026	GAA	2	6	644302	644307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214263
13012	NC_011026	GCA	2	6	644312	644317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214263
13013	NC_011026	ATG	2	6	644404	644409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214263
13014	NC_011026	TGC	2	6	644546	644551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_011026	AGC	2	6	644588	644593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_011026	T	6	6	644595	644600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_011026	CAT	2	6	644606	644611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_011026	A	8	8	644643	644650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_011026	T	8	8	644671	644678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_011026	T	6	6	644680	644685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_011026	TTG	2	6	644693	644698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_011026	TTAT	2	8	644759	644766	25 %	75 %	0 %	0 %	193214264
13023	NC_011026	TGC	2	6	644782	644787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214264
13024	NC_011026	CA	3	6	644788	644793	50 %	0 %	0 %	50 %	193214264
13025	NC_011026	CTT	2	6	644794	644799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214264
13026	NC_011026	GAA	2	6	644800	644805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214264
13027	NC_011026	AAG	2	6	644927	644932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214264
13028	NC_011026	TGG	2	6	644997	645002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193214264
13029	NC_011026	ATG	2	6	645031	645036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214264
13030	NC_011026	ATT	2	6	645085	645090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193214264
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13032	NC_011026	TGC	2	6	645237	645242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214264
13033	NC_011026	AT	3	6	645260	645265	50 %	50 %	0 %	0 %	193214264
13034	NC_011026	GTTCA	2	10	645292	645301	20 %	40 %	20 %	20 %	193214264
13035	NC_011026	TTA	2	6	645310	645315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193214264
13036	NC_011026	GAT	2	6	645319	645324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214264
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13039	NC_011026	AGC	2	6	645399	645404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214264
13040	NC_011026	TGAA	2	8	645436	645443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_011026	CTTT	2	8	645530	645537	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13042	NC_011026	TGC	3	9	645742	645750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214265
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13044	NC_011026	CCA	2	6	645842	645847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193214265
13045	NC_011026	TTG	2	6	645964	645969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_011026	CTTAA	2	10	646013	646022	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13047	NC_011026	AAT	2	6	646032	646037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_011026	CAAA	2	8	646041	646048	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13049	NC_011026	T	8	8	646089	646096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_011026	AAC	2	6	646097	646102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_011026	CTT	2	6	646104	646109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_011026	T	6	6	646108	646113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_011026	T	6	6	646123	646128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_011026	CTT	2	6	646129	646134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_011026	TTA	2	6	646163	646168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13057	NC_011026	AAG	2	6	646232	646237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_011026	TTTG	2	8	646278	646285	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_011026	ACA	2	6	646332	646337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_011026	TAGT	2	8	646357	646364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13062	NC_011026	TA	3	6	646390	646395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_011026	AGT	2	6	646410	646415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_011026	CT	3	6	646422	646427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13065	NC_011026	TTC	2	6	646437	646442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_011026	TGT	2	6	646468	646473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_011026	A	6	6	646526	646531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13069	NC_011026	GTT	2	6	646635	646640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_011026	TAGA	2	8	646670	646677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_011026	ATTG	2	8	646687	646694	25 %	50 %	25 %	0 %	193214266
13072	NC_011026	TGA	3	9	646696	646704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214266
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13082	NC_011026	CAAT	2	8	646994	647001	50 %	25 %	0 %	25 %	193214266
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13096	NC_011026	GAA	2	6	647734	647739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214267
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13098	NC_011026	ATC	2	6	647881	647886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214267
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13102	NC_011026	AT	3	6	648076	648081	50 %	50 %	0 %	0 %	193214268
13103	NC_011026	TAC	2	6	648101	648106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214268
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13106	NC_011026	AATT	2	8	648228	648235	50 %	50 %	0 %	0 %	193214268
13107	NC_011026	A	6	6	648248	648253	100 %	0 %	0 %	0 %	193214268
13108	NC_011026	TTG	2	6	648282	648287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193214268
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13115	NC_011026	TTG	2	6	648674	648679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193214269
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13119	NC_011026	T	7	7	648926	648932	0 %	100 %	0 %	0 %	193214269
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13121	NC_011026	CGCT	2	8	648993	649000	0 %	25 %	25 %	50 %	193214269
13122	NC_011026	ATGCA	2	10	649102	649111	40 %	20 %	20 %	20 %	193214269
13123	NC_011026	A	7	7	649242	649248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_011026	T	7	7	649265	649271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_011026	TCTT	2	8	649315	649322	0 %	75 %	0 %	25 %	193214270
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13243	NC_011026	AC	3	6	655164	655169	50 %	0 %	0 %	50 %	193214275
13244	NC_011026	GCA	2	6	655173	655178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214275
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13246	NC_011026	TAT	2	6	655228	655233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193214275
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13248	NC_011026	GAGC	2	8	655544	655551	25 %	0 %	50 %	25 %	193214276
13249	NC_011026	AAATC	2	10	655576	655585	60 %	20 %	0 %	20 %	193214276
13250	NC_011026	T	6	6	655592	655597	0 %	100 %	0 %	0 %	193214276
13251	NC_011026	TTG	2	6	655639	655644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193214276
13252	NC_011026	GTG	2	6	655722	655727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193214276
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13254	NC_011026	ACGA	2	8	655980	655987	50 %	0 %	25 %	25 %	193214276
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13256	NC_011026	T	6	6	656002	656007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13257	NC_011026	TTC	2	6	656091	656096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13259	NC_011026	CTT	2	6	656149	656154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13260	NC_011026	T	9	9	656199	656207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13261	NC_011026	TCA	2	6	656215	656220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13262	NC_011026	TCA	2	6	656267	656272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214277
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13265	NC_011026	A	6	6	656368	656373	100 %	0 %	0 %	0 %	193214277
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13268	NC_011026	A	6	6	656553	656558	100 %	0 %	0 %	0 %	193214277
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13270	NC_011026	A	6	6	656882	656887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13356	NC_011026	CAT	2	6	662423	662428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13357	NC_011026	AAATG	2	10	662471	662480	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13358	NC_011026	TCG	2	6	662561	662566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13367	NC_011026	TGT	2	6	663028	663033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193214283
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13369	NC_011026	CAAT	2	8	663057	663064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13371	NC_011026	GAA	2	6	663145	663150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13372	NC_011026	GAA	2	6	663217	663222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13373	NC_011026	GCG	2	6	663267	663272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13494	NC_011026	AGA	2	6	670040	670045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214291
13495	NC_011026	A	6	6	670155	670160	100 %	0 %	0 %	0 %	193214291
13496	NC_011026	TGG	2	6	670276	670281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193214291
13497	NC_011026	AT	3	6	670394	670399	50 %	50 %	0 %	0 %	193214291
13498	NC_011026	CA	3	6	670493	670498	50 %	0 %	0 %	50 %	193214291
13499	NC_011026	GCT	2	6	670523	670528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214291
13500	NC_011026	A	8	8	670559	670566	100 %	0 %	0 %	0 %	193214291

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