MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011026	AGA	2	6	618648	618653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_011026	A	6	6	618685	618690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_011026	T	6	6	618692	618697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_011026	CGG	2	6	618740	618745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214240
12505	NC_011026	A	7	7	618795	618801	100 %	0 %	0 %	0 %	193214240
12506	NC_011026	CTTT	2	8	618846	618853	0 %	75 %	0 %	25 %	193214240
12507	NC_011026	CAT	2	6	618858	618863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214240
12508	NC_011026	CA	3	6	618878	618883	50 %	0 %	0 %	50 %	193214240
12509	NC_011026	TGA	2	6	618919	618924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214240
12510	NC_011026	CAGA	2	8	618972	618979	50 %	0 %	25 %	25 %	193214240
12511	NC_011026	CGA	2	6	618992	618997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214240
12512	NC_011026	GCG	2	6	619077	619082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214240
12513	NC_011026	GCTG	2	8	619169	619176	0 %	25 %	50 %	25 %	193214240
12514	NC_011026	ATG	3	9	619452	619460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214240
12515	NC_011026	GGC	2	6	619533	619538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214240
12516	NC_011026	T	6	6	619570	619575	0 %	100 %	0 %	0 %	193214240
12517	NC_011026	GCGA	2	8	619612	619619	25 %	0 %	50 %	25 %	193214240
12518	NC_011026	TCG	2	6	619663	619668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214240
12519	NC_011026	AAG	2	6	619708	619713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214240
12520	NC_011026	GCAA	2	8	619783	619790	50 %	0 %	25 %	25 %	193214240
12521	NC_011026	GAAATT	2	12	619794	619805	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	193214240
12522	NC_011026	ATG	2	6	619812	619817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214240
12523	NC_011026	ATTT	2	8	619997	620004	25 %	75 %	0 %	0 %	193214240
12524	NC_011026	AAG	2	6	620025	620030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214240
12525	NC_011026	AGT	2	6	620150	620155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_011026	GGAAAA	2	12	620164	620175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214241
12527	NC_011026	CTT	2	6	620249	620254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214241
12528	NC_011026	GCA	2	6	620281	620286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214241
12529	NC_011026	GCT	2	6	620363	620368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214241
12530	NC_011026	GAT	2	6	620369	620374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214241
12531	NC_011026	ATG	2	6	620382	620387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214241
12532	NC_011026	CAT	2	6	620407	620412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214241
12533	NC_011026	CGA	2	6	620413	620418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214241
12534	NC_011026	GCA	2	6	620434	620439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214241
12535	NC_011026	CGA	2	6	620446	620451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214241
12536	NC_011026	TGC	2	6	620460	620465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214241
12537	NC_011026	AGC	2	6	620478	620483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214241
12538	NC_011026	A	7	7	620528	620534	100 %	0 %	0 %	0 %	193214242
12539	NC_011026	T	6	6	620564	620569	0 %	100 %	0 %	0 %	193214242
12540	NC_011026	CT	3	6	620584	620589	0 %	50 %	0 %	50 %	193214242
12541	NC_011026	GGCT	2	8	620628	620635	0 %	25 %	50 %	25 %	193214242
12542	NC_011026	AACG	2	8	620649	620656	50 %	0 %	25 %	25 %	193214242
12543	NC_011026	A	8	8	620678	620685	100 %	0 %	0 %	0 %	193214242
12544	NC_011026	TTG	2	6	620762	620767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193214242
12545	NC_011026	GGC	2	6	620779	620784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214242
12546	NC_011026	A	6	6	620806	620811	100 %	0 %	0 %	0 %	193214242
12547	NC_011026	GCTT	2	8	620819	620826	0 %	50 %	25 %	25 %	193214242
12548	NC_011026	ACGG	2	8	620866	620873	25 %	0 %	50 %	25 %	193214242
12549	NC_011026	A	6	6	620880	620885	100 %	0 %	0 %	0 %	193214242
12550	NC_011026	GATTT	2	10	620888	620897	20 %	60 %	20 %	0 %	193214242
12551	NC_011026	T	6	6	620955	620960	0 %	100 %	0 %	0 %	193214242
12552	NC_011026	AAGC	2	8	620983	620990	50 %	0 %	25 %	25 %	193214242
12553	NC_011026	T	6	6	621017	621022	0 %	100 %	0 %	0 %	193214242
12554	NC_011026	GAT	2	6	621073	621078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214242
12555	NC_011026	CGC	2	6	621146	621151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214242
12556	NC_011026	GCT	2	6	621277	621282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214242
12557	NC_011026	CTT	2	6	621319	621324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_011026	CGCA	2	8	621336	621343	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12559	NC_011026	AC	3	6	621356	621361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12560	NC_011026	CTG	2	6	621500	621505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214243
12561	NC_011026	GGC	2	6	621539	621544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214243
12562	NC_011026	AGC	2	6	621650	621655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214243
12563	NC_011026	CTC	2	6	621682	621687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193214243
12564	NC_011026	GCCA	2	8	621775	621782	25 %	0 %	25 %	50 %	193214243
12565	NC_011026	A	6	6	621812	621817	100 %	0 %	0 %	0 %	193214243
12566	NC_011026	CGAG	2	8	621888	621895	25 %	0 %	50 %	25 %	193214243
12567	NC_011026	GTT	2	6	621934	621939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193214243
12568	NC_011026	ATC	2	6	621941	621946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214243
12569	NC_011026	T	6	6	621975	621980	0 %	100 %	0 %	0 %	193214243
12570	NC_011026	CCT	2	6	621996	622001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193214243
12571	NC_011026	CACGC	2	10	622019	622028	20 %	0 %	20 %	60 %	193214243
12572	NC_011026	CAC	2	6	622096	622101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193214243
12573	NC_011026	T	6	6	622124	622129	0 %	100 %	0 %	0 %	193214243
12574	NC_011026	TTG	2	6	622152	622157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193214243
12575	NC_011026	ATG	2	6	622166	622171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214243
12576	NC_011026	T	9	9	622215	622223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_011026	TTTTG	2	10	622231	622240	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12578	NC_011026	AAG	2	6	622256	622261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_011026	TGA	2	6	622280	622285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_011026	CTTC	2	8	622291	622298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12581	NC_011026	AATG	2	8	622318	622325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_011026	ATT	2	6	622340	622345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193214244
12583	NC_011026	GCTCT	2	10	622396	622405	0 %	40 %	20 %	40 %	193214244
12584	NC_011026	CG	3	6	622439	622444	0 %	0 %	50 %	50 %	193214244
12585	NC_011026	GTC	3	9	622473	622481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214244
12586	NC_011026	ATCA	2	8	622500	622507	50 %	25 %	0 %	25 %	193214244
12587	NC_011026	CCG	2	6	622523	622528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214244
12588	NC_011026	TCA	2	6	622547	622552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214244
12589	NC_011026	CATCG	2	10	622686	622695	20 %	20 %	20 %	40 %	193214244
12590	NC_011026	AAAT	2	8	622718	622725	75 %	25 %	0 %	0 %	193214244
12591	NC_011026	GCC	2	6	622737	622742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214244
12592	NC_011026	CG	3	6	622773	622778	0 %	0 %	50 %	50 %	193214244
12593	NC_011026	CAT	2	6	622779	622784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214244
12594	NC_011026	TTC	2	6	622839	622844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214244
12595	NC_011026	CTT	2	6	622847	622852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214244
12596	NC_011026	TTC	2	6	622879	622884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214244
12597	NC_011026	CGAAA	2	10	622965	622974	60 %	0 %	20 %	20 %	193214244
12598	NC_011026	CAT	2	6	622995	623000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214244
12599	NC_011026	TCA	2	6	623065	623070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214244
12600	NC_011026	T	6	6	623085	623090	0 %	100 %	0 %	0 %	193214244
12601	NC_011026	GTT	2	6	623158	623163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193214244
12602	NC_011026	GC	3	6	623199	623204	0 %	0 %	50 %	50 %	193214244
12603	NC_011026	T	6	6	623205	623210	0 %	100 %	0 %	0 %	193214244
12604	NC_011026	GGAA	2	8	623273	623280	50 %	0 %	50 %	0 %	193214244
12605	NC_011026	TC	3	6	623334	623339	0 %	50 %	0 %	50 %	193214244
12606	NC_011026	GAT	2	6	623391	623396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214244
12607	NC_011026	T	6	6	623458	623463	0 %	100 %	0 %	0 %	193214244
12608	NC_011026	AAT	2	6	623538	623543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193214244
12609	NC_011026	CGAA	2	8	623621	623628	50 %	0 %	25 %	25 %	193214244
12610	NC_011026	GCA	2	6	623641	623646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214244
12611	NC_011026	CG	3	6	623684	623689	0 %	0 %	50 %	50 %	193214244
12612	NC_011026	AAT	2	6	623698	623703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193214244
12613	NC_011026	CAAAC	2	10	623725	623734	60 %	0 %	0 %	40 %	193214244
12614	NC_011026	TGCG	2	8	623856	623863	0 %	25 %	50 %	25 %	193214244
12615	NC_011026	AAAT	2	8	623896	623903	75 %	25 %	0 %	0 %	193214244
12616	NC_011026	T	7	7	623945	623951	0 %	100 %	0 %	0 %	193214244
12617	NC_011026	TGC	2	6	624023	624028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214244
12618	NC_011026	T	6	6	624116	624121	0 %	100 %	0 %	0 %	193214244
12619	NC_011026	CTT	2	6	624176	624181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214244
12620	NC_011026	TTTC	2	8	624248	624255	0 %	75 %	0 %	25 %	193214244
12621	NC_011026	CTT	2	6	624320	624325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214244
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12623	NC_011026	CAC	2	6	624426	624431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193214244
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12866	NC_011026	T	9	9	636051	636059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12867	NC_011026	ATC	2	6	636101	636106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12985	NC_011026	TCA	2	6	642628	642633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12988	NC_011026	A	8	8	642724	642731	100 %	0 %	0 %	0 %	193214263
12989	NC_011026	TTGA	2	8	642745	642752	25 %	50 %	25 %	0 %	193214263
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12991	NC_011026	A	6	6	642832	642837	100 %	0 %	0 %	0 %	193214263
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12995	NC_011026	TC	3	6	643292	643297	0 %	50 %	0 %	50 %	193214263
12996	NC_011026	ACG	2	6	643322	643327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214263
12997	NC_011026	CG	3	6	643510	643515	0 %	0 %	50 %	50 %	193214263
12998	NC_011026	GGC	2	6	643543	643548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214263
12999	NC_011026	AGA	2	6	643647	643652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214263
13000	NC_011026	GC	3	6	643657	643662	0 %	0 %	50 %	50 %	193214263

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