MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011026	ATG	2	6	544654	544659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214184
11002	NC_011026	TGG	2	6	544754	544759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193214184
11003	NC_011026	AGCA	2	8	544852	544859	50 %	0 %	25 %	25 %	193214184
11004	NC_011026	CAG	2	6	544865	544870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214184
11005	NC_011026	GCT	2	6	544899	544904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214184
11006	NC_011026	TGG	2	6	544922	544927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193214184
11007	NC_011026	A	8	8	544975	544982	100 %	0 %	0 %	0 %	193214184
11008	NC_011026	TTG	2	6	545204	545209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_011026	TTG	2	6	545231	545236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_011026	GCAA	2	8	545243	545250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11011	NC_011026	AGCA	2	8	545278	545285	50 %	0 %	25 %	25 %	193214185
11012	NC_011026	A	6	6	545367	545372	100 %	0 %	0 %	0 %	193214185
11013	NC_011026	GGT	2	6	545522	545527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193214185
11014	NC_011026	GAA	2	6	545529	545534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214185
11015	NC_011026	GAA	2	6	545565	545570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214185
11016	NC_011026	GAC	2	6	545583	545588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214185
11017	NC_011026	ATT	2	6	545638	545643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193214185
11018	NC_011026	AGA	2	6	545683	545688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214185
11019	NC_011026	GAA	2	6	545721	545726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214185
11020	NC_011026	CAG	2	6	545755	545760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214185
11021	NC_011026	TCA	2	6	545765	545770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214185
11022	NC_011026	AAG	2	6	545782	545787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214185
11023	NC_011026	TACA	2	8	545795	545802	50 %	25 %	0 %	25 %	193214185
11024	NC_011026	GCT	2	6	545828	545833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214185
11025	NC_011026	A	6	6	545848	545853	100 %	0 %	0 %	0 %	193214185
11026	NC_011026	TGA	2	6	546002	546007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214185
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11028	NC_011026	GCGT	2	8	546150	546157	0 %	25 %	50 %	25 %	193214185
11029	NC_011026	CAA	2	6	546200	546205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193214185
11030	NC_011026	GC	5	10	546255	546264	0 %	0 %	50 %	50 %	193214185
11031	NC_011026	CAA	2	6	546374	546379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193214185
11032	NC_011026	CGATAT	2	12	546461	546472	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	193214185
11033	NC_011026	GAA	2	6	546486	546491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214185
11034	NC_011026	CGA	2	6	546497	546502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214185
11035	NC_011026	GTT	2	6	546515	546520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193214185
11036	NC_011026	A	7	7	546543	546549	100 %	0 %	0 %	0 %	193214185
11037	NC_011026	ACCGC	2	10	546588	546597	20 %	0 %	20 %	60 %	193214185
11038	NC_011026	CGC	2	6	546600	546605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214185
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11040	NC_011026	GAA	3	9	546732	546740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214185
11041	NC_011026	A	6	6	546761	546766	100 %	0 %	0 %	0 %	193214185
11042	NC_011026	GAA	2	6	546834	546839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214185
11043	NC_011026	AAT	2	6	546859	546864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193214185
11044	NC_011026	TCA	2	6	546918	546923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_011026	GGA	2	6	546976	546981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_011026	GA	3	6	546980	546985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_011026	CTG	2	6	546990	546995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214186
11048	NC_011026	AGAAA	2	10	547000	547009	80 %	0 %	20 %	0 %	193214186
11049	NC_011026	GAT	2	6	547055	547060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214186
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11051	NC_011026	AAC	2	6	547093	547098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193214186
11052	NC_011026	GAAAA	2	10	547157	547166	80 %	0 %	20 %	0 %	193214186
11053	NC_011026	A	7	7	547163	547169	100 %	0 %	0 %	0 %	193214186
11054	NC_011026	TC	3	6	547233	547238	0 %	50 %	0 %	50 %	193214186
11055	NC_011026	AGA	2	6	547260	547265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214186
11056	NC_011026	CTG	2	6	547269	547274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214186
11057	NC_011026	AGG	2	6	547281	547286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193214186
11058	NC_011026	GAA	2	6	547337	547342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214186
11059	NC_011026	GAC	2	6	547364	547369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214186
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11061	NC_011026	GAACCT	2	12	547418	547429	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	193214186
11062	NC_011026	GATG	2	8	547435	547442	25 %	25 %	50 %	0 %	193214186
11063	NC_011026	GCTG	2	8	547462	547469	0 %	25 %	50 %	25 %	193214186
11064	NC_011026	GAA	2	6	547472	547477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214186
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11072	NC_011026	CTG	2	6	547689	547694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214186
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11093	NC_011026	TGA	2	6	548362	548367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214186
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11099	NC_011026	TGA	2	6	548722	548727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214186
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11102	NC_011026	CAT	2	6	548776	548781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214186
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11104	NC_011026	GC	5	10	548956	548965	0 %	0 %	50 %	50 %	193214186
11105	NC_011026	TGG	2	6	548994	548999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193214186
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11109	NC_011026	TGAT	2	8	549225	549232	25 %	50 %	25 %	0 %	193214186
11110	NC_011026	TCG	2	6	549240	549245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214186
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11122	NC_011026	TTAT	2	8	549909	549916	25 %	75 %	0 %	0 %	193214186
11123	NC_011026	AAG	2	6	550158	550163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214186
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11126	NC_011026	GGA	2	6	550311	550316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_011026	GC	3	6	550454	550459	0 %	0 %	50 %	50 %	193214187
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11241	NC_011026	CGCT	2	8	556117	556124	0 %	25 %	25 %	50 %	193214191
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11247	NC_011026	A	6	6	556363	556368	100 %	0 %	0 %	0 %	193214191
11248	NC_011026	TCA	2	6	556434	556439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214191
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11252	NC_011026	A	7	7	556545	556551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11359	NC_011026	AT	3	6	561087	561092	50 %	50 %	0 %	0 %	193214196
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11365	NC_011026	CAAA	2	8	561596	561603	75 %	0 %	0 %	25 %	193214197
11366	NC_011026	T	6	6	561611	561616	0 %	100 %	0 %	0 %	193214197
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11492	NC_011026	TCC	2	6	568705	568710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11493	NC_011026	A	6	6	568755	568760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11494	NC_011026	GC	3	6	568777	568782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11495	NC_011026	CATTTT	2	12	568798	568809	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11496	NC_011026	T	7	7	568825	568831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11497	NC_011026	A	7	7	568874	568880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11498	NC_011026	GAAA	2	8	568932	568939	75 %	0 %	25 %	0 %	193214205
11499	NC_011026	AC	3	6	568941	568946	50 %	0 %	0 %	50 %	193214205
11500	NC_011026	CAA	2	6	569043	569048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193214205

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