MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011026	CGA	3	9	349223	349231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214024
7002	NC_011026	CAG	2	6	349256	349261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214024
7003	NC_011026	GGC	2	6	349317	349322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214024
7004	NC_011026	CTCG	2	8	349364	349371	0 %	25 %	25 %	50 %	193214024
7005	NC_011026	GCC	2	6	349386	349391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214024
7006	NC_011026	AG	3	6	349413	349418	50 %	0 %	50 %	0 %	193214024
7007	NC_011026	TAC	2	6	349431	349436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214024
7008	NC_011026	CCAG	2	8	349465	349472	25 %	0 %	25 %	50 %	193214024
7009	NC_011026	AC	3	6	349534	349539	50 %	0 %	0 %	50 %	193214024
7010	NC_011026	ACCTTA	2	12	349791	349802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214024
7011	NC_011026	CA	3	6	349886	349891	50 %	0 %	0 %	50 %	193214024
7012	NC_011026	CGTT	2	8	349956	349963	0 %	50 %	25 %	25 %	193214024
7013	NC_011026	CA	3	6	349991	349996	50 %	0 %	0 %	50 %	193214024
7014	NC_011026	GTTACC	2	12	350007	350018	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	193214024
7015	NC_011026	AGA	2	6	350075	350080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214024
7016	NC_011026	AAG	2	6	350105	350110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_011026	GGC	2	6	350139	350144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_011026	GCG	2	6	350167	350172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_011026	GAA	2	6	350202	350207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214025
7020	NC_011026	GCT	2	6	350208	350213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214025
7021	NC_011026	GCA	2	6	350218	350223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214025
7022	NC_011026	CG	3	6	350315	350320	0 %	0 %	50 %	50 %	193214025
7023	NC_011026	T	6	6	350371	350376	0 %	100 %	0 %	0 %	193214025
7024	NC_011026	ACTG	2	8	350392	350399	25 %	25 %	25 %	25 %	193214025
7025	NC_011026	GCA	2	6	350562	350567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214025
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7028	NC_011026	TGC	2	6	350667	350672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214025
7029	NC_011026	AGAA	2	8	350711	350718	75 %	0 %	25 %	0 %	193214025
7030	NC_011026	A	6	6	350717	350722	100 %	0 %	0 %	0 %	193214025
7031	NC_011026	T	6	6	350784	350789	0 %	100 %	0 %	0 %	193214025
7032	NC_011026	A	7	7	350812	350818	100 %	0 %	0 %	0 %	193214025
7033	NC_011026	A	7	7	350829	350835	100 %	0 %	0 %	0 %	193214025
7034	NC_011026	GTG	2	6	350844	350849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193214025
7035	NC_011026	T	6	6	350852	350857	0 %	100 %	0 %	0 %	193214025
7036	NC_011026	TGT	2	6	350932	350937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_011026	T	6	6	350970	350975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_011026	TTGC	2	8	351026	351033	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7039	NC_011026	AT	3	6	351051	351056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_011026	GCATT	2	10	351064	351073	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7041	NC_011026	ATTT	2	8	351100	351107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_011026	A	7	7	351240	351246	100 %	0 %	0 %	0 %	193214026
7043	NC_011026	AAG	2	6	351302	351307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214026
7044	NC_011026	CGA	2	6	351339	351344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214026
7045	NC_011026	T	8	8	351377	351384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_011026	A	6	6	351386	351391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_011026	TGTTT	2	10	351443	351452	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_011026	GCAC	2	8	351582	351589	25 %	0 %	25 %	50 %	193214027
7049	NC_011026	CTT	2	6	351698	351703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214027
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7053	NC_011026	CGA	2	6	351922	351927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214027
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7055	NC_011026	AAAG	2	8	352017	352024	75 %	0 %	25 %	0 %	193214027
7056	NC_011026	GGTTG	2	10	352147	352156	0 %	40 %	60 %	0 %	193214027
7057	NC_011026	ATGA	2	8	352186	352193	50 %	25 %	25 %	0 %	193214027
7058	NC_011026	A	7	7	352208	352214	100 %	0 %	0 %	0 %	193214027
7059	NC_011026	TGC	2	6	352248	352253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214027
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7062	NC_011026	TAA	2	6	352390	352395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193214028
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7067	NC_011026	A	7	7	352518	352524	100 %	0 %	0 %	0 %	193214028
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7079	NC_011026	GCT	2	6	353132	353137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214029
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7089	NC_011026	A	8	8	353893	353900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_011026	T	6	6	353919	353924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7096	NC_011026	GCG	2	6	354229	354234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214030
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7101	NC_011026	TTCA	2	8	354335	354342	25 %	50 %	0 %	25 %	193214030
7102	NC_011026	AAT	2	6	354440	354445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193214030
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7109	NC_011026	ATCG	2	8	354875	354882	25 %	25 %	25 %	25 %	193214030
7110	NC_011026	GCT	2	6	354946	354951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214030
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7117	NC_011026	GCCA	2	8	355202	355209	25 %	0 %	25 %	50 %	193214030
7118	NC_011026	AAGC	2	8	355210	355217	50 %	0 %	25 %	25 %	193214030
7119	NC_011026	GTTT	2	8	355249	355256	0 %	75 %	25 %	0 %	193214030
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7125	NC_011026	GCT	2	6	355494	355499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214031
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7232	NC_011026	AT	3	6	360363	360368	50 %	50 %	0 %	0 %	193214034
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7238	NC_011026	AATC	2	8	360756	360763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7239	NC_011026	GAT	2	6	360794	360799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7241	NC_011026	GAA	2	6	360828	360833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7242	NC_011026	AAG	2	6	360835	360840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7243	NC_011026	GTG	2	6	360859	360864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7244	NC_011026	TCA	2	6	360938	360943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7245	NC_011026	TAGAAA	2	12	360947	360958	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7246	NC_011026	T	7	7	361016	361022	0 %	100 %	0 %	0 %	193214035
7247	NC_011026	AAT	2	6	361075	361080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193214035
7248	NC_011026	GTA	2	6	361081	361086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214035
7249	NC_011026	GAGC	2	8	361108	361115	25 %	0 %	50 %	25 %	193214035
7250	NC_011026	GCT	2	6	361193	361198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214035
7251	NC_011026	AAAG	2	8	361290	361297	75 %	0 %	25 %	0 %	193214035
7252	NC_011026	ATC	2	6	361318	361323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214035
7253	NC_011026	A	6	6	361435	361440	100 %	0 %	0 %	0 %	193214035
7254	NC_011026	CTT	2	6	361501	361506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214035
7255	NC_011026	GC	3	6	361566	361571	0 %	0 %	50 %	50 %	193214035
7256	NC_011026	T	6	6	361588	361593	0 %	100 %	0 %	0 %	193214035
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7260	NC_011026	CTT	2	6	361735	361740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214035
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7264	NC_011026	GAT	2	6	361879	361884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214035
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7268	NC_011026	GCT	2	6	362064	362069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214035
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7271	NC_011026	TCA	2	6	362162	362167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214035
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7277	NC_011026	CAAG	2	8	362283	362290	50 %	0 %	25 %	25 %	193214035
7278	NC_011026	CAA	2	6	362310	362315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193214035
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7280	NC_011026	TCA	2	6	362340	362345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214035
7281	NC_011026	GTT	2	6	362361	362366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7282	NC_011026	ATT	2	6	362401	362406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7283	NC_011026	TCT	2	6	362448	362453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7284	NC_011026	CTT	2	6	362529	362534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7285	NC_011026	CAAT	3	12	362544	362555	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7286	NC_011026	TTA	2	6	362568	362573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7287	NC_011026	TCC	2	6	362602	362607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7288	NC_011026	GCCT	2	8	362675	362682	0 %	25 %	25 %	50 %	193214036
7289	NC_011026	CCG	2	6	362683	362688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214036
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7320	NC_011026	CGC	2	6	364161	364166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214036
7321	NC_011026	AAGCC	2	10	364173	364182	40 %	0 %	20 %	40 %	193214036
7322	NC_011026	CG	3	6	364236	364241	0 %	0 %	50 %	50 %	193214036
7323	NC_011026	TCG	2	6	364277	364282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214036
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7325	NC_011026	CCCG	2	8	364321	364328	0 %	0 %	25 %	75 %	193214036
7326	NC_011026	TGC	2	6	364365	364370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214036
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7332	NC_011026	A	7	7	364674	364680	100 %	0 %	0 %	0 %	193214036
7333	NC_011026	CGC	2	6	364707	364712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214036
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7338	NC_011026	TGA	2	6	364905	364910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214036
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7343	NC_011026	A	8	8	365137	365144	100 %	0 %	0 %	0 %	193214036
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7349	NC_011026	ATC	2	6	365318	365323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214036
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7351	NC_011026	TAA	2	6	365352	365357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7352	NC_011026	GTT	2	6	365369	365374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193214037
7353	NC_011026	TCGG	2	8	365381	365388	0 %	25 %	50 %	25 %	193214037
7354	NC_011026	CGAG	2	8	365415	365422	25 %	0 %	50 %	25 %	193214037
7355	NC_011026	CGG	2	6	365439	365444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214037
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7357	NC_011026	TGA	2	6	365475	365480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214037
7358	NC_011026	TTTTG	2	10	365542	365551	0 %	80 %	20 %	0 %	193214037
7359	NC_011026	CCGA	2	8	365692	365699	25 %	0 %	25 %	50 %	193214037
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7362	NC_011026	GCG	2	6	365867	365872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214037
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7366	NC_011026	A	7	7	366185	366191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7367	NC_011026	AGC	2	6	366246	366251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7368	NC_011026	TCA	2	6	366255	366260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7369	NC_011026	T	6	6	366264	366269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7370	NC_011026	GA	3	6	366291	366296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7371	NC_011026	T	7	7	366379	366385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7372	NC_011026	A	6	6	366457	366462	100 %	0 %	0 %	0 %	193214038
7373	NC_011026	GAC	2	6	366500	366505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214038
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7496	NC_011026	CGA	2	6	371810	371815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214040
7497	NC_011026	GAA	2	6	371916	371921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214040
7498	NC_011026	CGG	2	6	371962	371967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214040
7499	NC_011026	CGTC	2	8	371968	371975	0 %	25 %	25 %	50 %	193214040
7500	NC_011026	CGC	2	6	372053	372058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214040

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