MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65002	NC_011026	CAT	2	6	3204761	3204766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216362
65003	NC_011026	GTC	2	6	3204770	3204775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216362
65004	NC_011026	A	6	6	3204780	3204785	100 %	0 %	0 %	0 %	193216362
65005	NC_011026	CAC	2	6	3204875	3204880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193216362
65006	NC_011026	AAG	2	6	3204895	3204900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193216362
65007	NC_011026	ACCGAA	2	12	3204918	3204929	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	193216362
65008	NC_011026	AGA	2	6	3204935	3204940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193216362
65009	NC_011026	GAA	2	6	3204978	3204983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193216362
65010	NC_011026	GC	3	6	3205039	3205044	0 %	0 %	50 %	50 %	193216362
65011	NC_011026	ATG	2	6	3205068	3205073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216362
65012	NC_011026	GCTC	2	8	3205165	3205172	0 %	25 %	25 %	50 %	193216362
65013	NC_011026	CGA	2	6	3205241	3205246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216362
65014	NC_011026	GCC	2	6	3205262	3205267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193216362
65015	NC_011026	AGC	2	6	3205319	3205324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216362
65016	NC_011026	A	6	6	3205351	3205356	100 %	0 %	0 %	0 %	193216362
65017	NC_011026	GAT	2	6	3205389	3205394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216362
65018	NC_011026	CG	3	6	3205471	3205476	0 %	0 %	50 %	50 %	193216362
65019	NC_011026	TCGC	2	8	3205501	3205508	0 %	25 %	25 %	50 %	193216362
65020	NC_011026	A	6	6	3205558	3205563	100 %	0 %	0 %	0 %	193216362
65021	NC_011026	GATTC	2	10	3205578	3205587	20 %	40 %	20 %	20 %	193216362
65022	NC_011026	GC	3	6	3205604	3205609	0 %	0 %	50 %	50 %	193216362
65023	NC_011026	GAG	2	6	3205623	3205628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193216362
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65025	NC_011026	ACC	2	6	3205644	3205649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193216362
65026	NC_011026	AGA	2	6	3205733	3205738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193216362
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65028	NC_011026	AAAAG	2	10	3205881	3205890	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65029	NC_011026	TGC	2	6	3205964	3205969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216363
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65033	NC_011026	T	6	6	3206205	3206210	0 %	100 %	0 %	0 %	193216363
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65036	NC_011026	GAAA	2	8	3206287	3206294	75 %	0 %	25 %	0 %	193216363
65037	NC_011026	GCC	2	6	3206320	3206325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193216363
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65041	NC_011026	A	7	7	3206717	3206723	100 %	0 %	0 %	0 %	193216363
65042	NC_011026	TGC	2	6	3206790	3206795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216363
65043	NC_011026	AAGA	2	8	3206802	3206809	75 %	0 %	25 %	0 %	193216363
65044	NC_011026	A	6	6	3206844	3206849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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65046	NC_011026	T	6	6	3206868	3206873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65047	NC_011026	TAA	2	6	3206884	3206889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65048	NC_011026	CAT	2	6	3206936	3206941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216364
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65050	NC_011026	TGAA	2	8	3206965	3206972	50 %	25 %	25 %	0 %	193216364
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65052	NC_011026	GTA	2	6	3207122	3207127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216364
65053	NC_011026	GTT	2	6	3207138	3207143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193216364
65054	NC_011026	GCTG	2	8	3207186	3207193	0 %	25 %	50 %	25 %	193216364
65055	NC_011026	CCG	2	6	3207304	3207309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193216364
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65057	NC_011026	TTTA	2	8	3207332	3207339	25 %	75 %	0 %	0 %	193216364
65058	NC_011026	CAT	2	6	3207349	3207354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216364
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65064	NC_011026	CAAT	2	8	3207586	3207593	50 %	25 %	0 %	25 %	193216364
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65089	NC_011026	TTA	2	6	3208739	3208744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193216366
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65091	NC_011026	AAC	2	6	3208806	3208811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193216366
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65111	NC_011026	CG	3	6	3209929	3209934	0 %	0 %	50 %	50 %	193216366
65112	NC_011026	A	6	6	3209970	3209975	100 %	0 %	0 %	0 %	193216366
65113	NC_011026	AAAG	2	8	3210020	3210027	75 %	0 %	25 %	0 %	193216366
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65119	NC_011026	CAA	3	9	3210260	3210268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193216366
65120	NC_011026	TAA	2	6	3210285	3210290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193216366
65121	NC_011026	CAT	2	6	3210296	3210301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216366
65122	NC_011026	CAT	2	6	3210311	3210316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216366
65123	NC_011026	T	6	6	3210383	3210388	0 %	100 %	0 %	0 %	193216366
65124	NC_011026	GCT	2	6	3210400	3210405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216366
65125	NC_011026	TAA	2	6	3210452	3210457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193216366
65126	NC_011026	A	7	7	3210472	3210478	100 %	0 %	0 %	0 %	193216366
65127	NC_011026	AGA	2	6	3210511	3210516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193216366
65128	NC_011026	TAA	2	6	3210536	3210541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193216366
65129	NC_011026	A	8	8	3210567	3210574	100 %	0 %	0 %	0 %	193216366
65130	NC_011026	ACTT	2	8	3210581	3210588	25 %	50 %	0 %	25 %	193216366
65131	NC_011026	GT	4	8	3210594	3210601	0 %	50 %	50 %	0 %	193216366
65132	NC_011026	T	6	6	3210601	3210606	0 %	100 %	0 %	0 %	193216366
65133	NC_011026	AGA	2	6	3210648	3210653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193216366
65134	NC_011026	ATC	2	6	3210675	3210680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216366
65135	NC_011026	TTA	2	6	3210682	3210687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193216366
65136	NC_011026	GTA	2	6	3210742	3210747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216367
65137	NC_011026	ATA	2	6	3210748	3210753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193216367
65138	NC_011026	A	6	6	3210942	3210947	100 %	0 %	0 %	0 %	193216367
65139	NC_011026	GAC	2	6	3210985	3210990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216367
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65141	NC_011026	TA	3	6	3211067	3211072	50 %	50 %	0 %	0 %	193216367
65142	NC_011026	CAA	2	6	3211079	3211084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193216367
65143	NC_011026	A	6	6	3211125	3211130	100 %	0 %	0 %	0 %	193216367
65144	NC_011026	A	6	6	3211169	3211174	100 %	0 %	0 %	0 %	193216367
65145	NC_011026	AAT	2	6	3211199	3211204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193216367
65146	NC_011026	TAA	2	6	3211210	3211215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193216367
65147	NC_011026	TTCT	2	8	3211328	3211335	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65148	NC_011026	ATT	2	6	3211413	3211418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193216368
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65155	NC_011026	TGTT	2	8	3212001	3212008	0 %	75 %	25 %	0 %	193216368
65156	NC_011026	A	7	7	3212028	3212034	100 %	0 %	0 %	0 %	193216368
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65158	NC_011026	TAAC	2	8	3212160	3212167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65159	NC_011026	A	6	6	3212193	3212198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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65182	NC_011026	CAAC	2	8	3213169	3213176	50 %	0 %	0 %	50 %	193216369
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65190	NC_011026	A	6	6	3213356	3213361	100 %	0 %	0 %	0 %	193216369
65191	NC_011026	TAT	2	6	3213380	3213385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193216369
65192	NC_011026	ACC	2	6	3213436	3213441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193216369
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65198	NC_011026	TTTC	2	8	3213749	3213756	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65199	NC_011026	GAAA	2	8	3213759	3213766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65200	NC_011026	GGC	2	6	3213899	3213904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193216370
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65225	NC_011026	TGCAT	2	10	3215026	3215035	20 %	40 %	20 %	20 %	193216371
65226	NC_011026	TGC	3	9	3215050	3215058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216371
65227	NC_011026	GTT	2	6	3215066	3215071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193216371
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65229	NC_011026	CCA	2	6	3215167	3215172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193216371
65230	NC_011026	CGG	2	6	3215175	3215180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193216371
65231	NC_011026	TTTG	2	8	3215189	3215196	0 %	75 %	25 %	0 %	193216371
65232	NC_011026	TCAAA	2	10	3215257	3215266	60 %	20 %	0 %	20 %	193216371
65233	NC_011026	CGA	2	6	3215363	3215368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216371
65234	NC_011026	GAA	2	6	3215415	3215420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193216371
65235	NC_011026	CTG	2	6	3215432	3215437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216371
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65237	NC_011026	CGT	2	6	3215524	3215529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216371
65238	NC_011026	AGCGGA	2	12	3215618	3215629	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	193216371
65239	NC_011026	TGG	2	6	3215740	3215745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193216371
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65336	NC_011026	TTAT	2	8	3220875	3220882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65337	NC_011026	AATGGA	2	12	3220968	3220979	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	193216375
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65354	NC_011026	TTGA	2	8	3221904	3221911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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65356	NC_011026	AGA	2	6	3221965	3221970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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65360	NC_011026	A	8	8	3222069	3222076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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65476	NC_011026	CAG	2	6	3227793	3227798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216380
65477	NC_011026	GCA	2	6	3227886	3227891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216380
65478	NC_011026	TTC	2	6	3228000	3228005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216380
65479	NC_011026	TCT	2	6	3228098	3228103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216380
65480	NC_011026	ACG	2	6	3228129	3228134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216380
65481	NC_011026	ATG	2	6	3228182	3228187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216380
65482	NC_011026	CTATGG	2	12	3228379	3228390	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	193216380
65483	NC_011026	AATT	2	8	3228494	3228501	50 %	50 %	0 %	0 %	193216381
65484	NC_011026	CAAC	2	8	3228505	3228512	50 %	0 %	0 %	50 %	193216381
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65486	NC_011026	ACCAA	2	10	3228731	3228740	60 %	0 %	0 %	40 %	193216381
65487	NC_011026	CA	3	6	3228766	3228771	50 %	0 %	0 %	50 %	193216381
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65494	NC_011026	A	6	6	3229253	3229258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65495	NC_011026	A	7	7	3229288	3229294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65496	NC_011026	T	6	6	3229337	3229342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65497	NC_011026	AAC	2	6	3229387	3229392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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65499	NC_011026	GC	3	6	3229433	3229438	0 %	0 %	50 %	50 %	193216382
65500	NC_011026	CTT	2	6	3229458	3229463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216382

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