MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51002	NC_011026	GC	3	6	2513219	2513224	0 %	0 %	50 %	50 %	193215803
51003	NC_011026	A	6	6	2513234	2513239	100 %	0 %	0 %	0 %	193215803
51004	NC_011026	TTG	2	6	2513315	2513320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193215803
51005	NC_011026	TTG	2	6	2513339	2513344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193215803
51006	NC_011026	TTC	2	6	2513352	2513357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193215803
51007	NC_011026	TGA	2	6	2513433	2513438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193215803
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51009	NC_011026	TGA	3	9	2513571	2513579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193215803
51010	NC_011026	A	6	6	2513630	2513635	100 %	0 %	0 %	0 %	193215803
51011	NC_011026	CCT	2	6	2513650	2513655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193215803
51012	NC_011026	GTT	2	6	2513695	2513700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193215803
51013	NC_011026	TGA	2	6	2513709	2513714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193215803
51014	NC_011026	TGC	2	6	2513745	2513750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193215803
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51055	NC_011026	TATT	2	8	2515589	2515596	25 %	75 %	0 %	0 %	193215803
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51061	NC_011026	CCAC	2	8	2515745	2515752	25 %	0 %	0 %	75 %	193215803
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51114	NC_011026	TGA	2	6	2518585	2518590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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51119	NC_011026	GACGCT	2	12	2518832	2518843	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	193215806
51120	NC_011026	GCG	2	6	2518850	2518855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193215806
51121	NC_011026	GAC	2	6	2518861	2518866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193215806
51122	NC_011026	TGA	2	6	2518887	2518892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193215806
51123	NC_011026	A	6	6	2518913	2518918	100 %	0 %	0 %	0 %	193215806
51124	NC_011026	CGC	2	6	2518930	2518935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193215806
51125	NC_011026	ATG	2	6	2518965	2518970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193215806
51126	NC_011026	CCGC	2	8	2519058	2519065	0 %	0 %	25 %	75 %	193215806
51127	NC_011026	TGA	3	9	2519068	2519076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193215806
51128	NC_011026	TTG	2	6	2519088	2519093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193215806
51129	NC_011026	T	6	6	2519163	2519168	0 %	100 %	0 %	0 %	193215806
51130	NC_011026	A	6	6	2519175	2519180	100 %	0 %	0 %	0 %	193215806
51131	NC_011026	GGT	2	6	2519183	2519188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193215806
51132	NC_011026	TTG	2	6	2519237	2519242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193215806
51133	NC_011026	CGG	2	6	2519267	2519272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193215806
51134	NC_011026	AAAT	2	8	2519496	2519503	75 %	25 %	0 %	0 %	193215806
51135	NC_011026	T	6	6	2519507	2519512	0 %	100 %	0 %	0 %	193215806
51136	NC_011026	CGT	2	6	2519552	2519557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193215806
51137	NC_011026	CAT	2	6	2519561	2519566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193215806
51138	NC_011026	CGGG	2	8	2519621	2519628	0 %	0 %	75 %	25 %	193215806
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51141	NC_011026	T	6	6	2519674	2519679	0 %	100 %	0 %	0 %	193215807
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51147	NC_011026	T	6	6	2519974	2519979	0 %	100 %	0 %	0 %	193215807
51148	NC_011026	CCG	2	6	2520137	2520142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193215807
51149	NC_011026	CCG	2	6	2520248	2520253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193215807
51150	NC_011026	AGC	2	6	2520256	2520261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193215807
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51152	NC_011026	A	7	7	2520316	2520322	100 %	0 %	0 %	0 %	193215807
51153	NC_011026	AAT	2	6	2520360	2520365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51154	NC_011026	TC	3	6	2520529	2520534	0 %	50 %	0 %	50 %	193215808
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51157	NC_011026	ATGCCG	2	12	2520690	2520701	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	193215808
51158	NC_011026	TGC	2	6	2520729	2520734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193215808
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51179	NC_011026	AAC	2	6	2521853	2521858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193215810
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51185	NC_011026	GCAA	2	8	2522327	2522334	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51186	NC_011026	T	8	8	2522353	2522360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51187	NC_011026	AAT	2	6	2522361	2522366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51188	NC_011026	A	6	6	2522377	2522382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51189	NC_011026	TGAT	2	8	2522396	2522403	25 %	50 %	25 %	0 %	193215811
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51199	NC_011026	A	6	6	2522977	2522982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51200	NC_011026	TAAT	2	8	2523098	2523105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51201	NC_011026	AGAA	2	8	2523280	2523287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51202	NC_011026	ATA	2	6	2523302	2523307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51203	NC_011026	T	6	6	2523316	2523321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51204	NC_011026	T	6	6	2523338	2523343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51226	NC_011026	GGT	2	6	2524397	2524402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51227	NC_011026	ACC	2	6	2524410	2524415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51228	NC_011026	TAAG	2	8	2524465	2524472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51229	NC_011026	ATT	2	6	2524566	2524571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51230	NC_011026	AGT	2	6	2524574	2524579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51231	NC_011026	T	7	7	2524613	2524619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51232	NC_011026	TCA	2	6	2524682	2524687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193215813
51233	NC_011026	TCA	2	6	2524706	2524711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193215813
51234	NC_011026	TCA	2	6	2524743	2524748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193215813
51235	NC_011026	TAA	2	6	2524749	2524754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193215813
51236	NC_011026	T	6	6	2524830	2524835	0 %	100 %	0 %	0 %	193215813
51237	NC_011026	CCG	2	6	2524955	2524960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193215813
51238	NC_011026	GAA	2	6	2525123	2525128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193215813
51239	NC_011026	CCTA	2	8	2525158	2525165	25 %	25 %	0 %	50 %	193215813
51240	NC_011026	GC	3	6	2525174	2525179	0 %	0 %	50 %	50 %	193215813
51241	NC_011026	GAT	2	6	2525215	2525220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193215813
51242	NC_011026	ATATCG	2	12	2525324	2525335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	193215813
51243	NC_011026	TTCG	2	8	2525356	2525363	0 %	50 %	25 %	25 %	193215813
51244	NC_011026	GCT	2	6	2525498	2525503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51245	NC_011026	ATTT	2	8	2525505	2525512	25 %	75 %	0 %	0 %	193215814
51246	NC_011026	TCT	2	6	2525513	2525518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193215814
51247	NC_011026	GTC	2	6	2525519	2525524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193215814
51248	NC_011026	CCG	2	6	2525559	2525564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193215814
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51250	NC_011026	TTC	2	6	2525591	2525596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193215814
51251	NC_011026	TCA	2	6	2525604	2525609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193215814
51252	NC_011026	GTTT	2	8	2525633	2525640	0 %	75 %	25 %	0 %	193215814
51253	NC_011026	TTA	2	6	2525664	2525669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193215814
51254	NC_011026	TTTC	2	8	2525670	2525677	0 %	75 %	0 %	25 %	193215814
51255	NC_011026	TGC	2	6	2525758	2525763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193215814
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51262	NC_011026	TCT	2	6	2526273	2526278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193215814
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51265	NC_011026	CAAG	2	8	2526316	2526323	50 %	0 %	25 %	25 %	193215814
51266	NC_011026	TTC	2	6	2526332	2526337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193215814
51267	NC_011026	GCT	2	6	2526374	2526379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193215814
51268	NC_011026	GCAA	2	8	2526387	2526394	50 %	0 %	25 %	25 %	193215814
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51270	NC_011026	T	7	7	2526666	2526672	0 %	100 %	0 %	0 %	193215814
51271	NC_011026	GGC	2	6	2526707	2526712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193215814
51272	NC_011026	AAAT	2	8	2526791	2526798	75 %	25 %	0 %	0 %	193215814
51273	NC_011026	TTTTTC	2	12	2526902	2526913	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	193215814
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51276	NC_011026	TGC	2	6	2527098	2527103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193215814
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51281	NC_011026	GC	3	6	2527357	2527362	0 %	0 %	50 %	50 %	193215814
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51287	NC_011026	TGA	2	6	2527807	2527812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193215814
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51289	NC_011026	AGT	2	6	2527836	2527841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51290	NC_011026	TTCAA	2	10	2527842	2527851	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51291	NC_011026	CTT	2	6	2527880	2527885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51292	NC_011026	AAT	2	6	2527899	2527904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51297	NC_011026	CTG	2	6	2528059	2528064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193215815
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51303	NC_011026	ATC	2	6	2528605	2528610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193215815
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51308	NC_011026	T	6	6	2528800	2528805	0 %	100 %	0 %	0 %	193215815
51309	NC_011026	TC	3	6	2528891	2528896	0 %	50 %	0 %	50 %	193215815
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51319	NC_011026	CTAA	2	8	2529355	2529362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51320	NC_011026	AGC	2	6	2529415	2529420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51336	NC_011026	GCCAA	2	10	2530282	2530291	40 %	0 %	20 %	40 %	193215816
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51338	NC_011026	TGTT	2	8	2530329	2530336	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51339	NC_011026	GAT	2	6	2530359	2530364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51340	NC_011026	TTA	2	6	2530397	2530402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51341	NC_011026	TG	3	6	2530419	2530424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51342	NC_011026	CTT	2	6	2530434	2530439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51343	NC_011026	TCT	2	6	2530525	2530530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51344	NC_011026	AAGGG	2	10	2530581	2530590	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
51345	NC_011026	ATA	2	6	2530591	2530596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51346	NC_011026	TG	3	6	2530603	2530608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51347	NC_011026	TG	3	6	2530686	2530691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51348	NC_011026	AAG	2	6	2530756	2530761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51349	NC_011026	TTCG	2	8	2530867	2530874	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51350	NC_011026	GC	3	6	2530918	2530923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51351	NC_011026	T	8	8	2530929	2530936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51352	NC_011026	TGA	2	6	2531057	2531062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193215817
51353	NC_011026	A	6	6	2531096	2531101	100 %	0 %	0 %	0 %	193215817
51354	NC_011026	TGG	2	6	2531235	2531240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193215817
51355	NC_011026	TGA	2	6	2531429	2531434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193215817
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51474	NC_011026	AGCC	2	8	2537653	2537660	25 %	0 %	25 %	50 %	193215823
51475	NC_011026	ATAA	2	8	2537679	2537686	75 %	25 %	0 %	0 %	193215823
51476	NC_011026	TTGC	2	8	2537759	2537766	0 %	50 %	25 %	25 %	193215824
51477	NC_011026	TG	3	6	2537770	2537775	0 %	50 %	50 %	0 %	193215824
51478	NC_011026	T	6	6	2537794	2537799	0 %	100 %	0 %	0 %	193215824
51479	NC_011026	GTGTT	2	10	2537836	2537845	0 %	60 %	40 %	0 %	193215824
51480	NC_011026	CTC	2	6	2537861	2537866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193215824
51481	NC_011026	TG	4	8	2537888	2537895	0 %	50 %	50 %	0 %	193215824
51482	NC_011026	CTT	2	6	2537959	2537964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193215824
51483	NC_011026	TCA	2	6	2537965	2537970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193215824
51484	NC_011026	ATC	2	6	2538002	2538007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193215824
51485	NC_011026	CGT	2	6	2538050	2538055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193215824
51486	NC_011026	A	8	8	2538086	2538093	100 %	0 %	0 %	0 %	193215824
51487	NC_011026	GCA	2	6	2538099	2538104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193215824
51488	NC_011026	AGCC	2	8	2538114	2538121	25 %	0 %	25 %	50 %	193215824
51489	NC_011026	TGCG	2	8	2538123	2538130	0 %	25 %	50 %	25 %	193215824
51490	NC_011026	CAT	2	6	2538229	2538234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193215824
51491	NC_011026	GAT	2	6	2538292	2538297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193215824
51492	NC_011026	TTGAT	2	10	2538329	2538338	20 %	60 %	20 %	0 %	193215824
51493	NC_011026	TGC	2	6	2538344	2538349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193215824
51494	NC_011026	ATA	2	6	2538472	2538477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51495	NC_011026	TA	3	6	2538476	2538481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51496	NC_011026	AAGC	2	8	2538503	2538510	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51497	NC_011026	GAC	2	6	2538579	2538584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51498	NC_011026	AG	3	6	2538605	2538610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51499	NC_011026	T	7	7	2538617	2538623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51500	NC_011026	T	6	6	2538665	2538670	0 %	100 %	0 %	0 %	193215825

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