MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cellvibrio japonicus Ueda107 chromosome

Total Repeats: 89956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010995	GTT	2	6	4	9	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192359033
2	NC_010995	GCC	2	6	37	42	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192359033
3	NC_010995	GCA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192359033
4	NC_010995	TCC	2	6	179	184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192359033
5	NC_010995	CGC	2	6	272	277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192359033
6	NC_010995	CCT	2	6	286	291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192359033
7	NC_010995	AGAT	2	8	326	333	50 %	25 %	25 %	0 %	192359033
8	NC_010995	TGC	2	6	387	392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192359033
9	NC_010995	GCC	2	6	427	432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192359033
10	NC_010995	GCG	2	6	658	663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192359033
11	NC_010995	CGG	2	6	684	689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192359033
12	NC_010995	GGT	2	6	715	720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192359033
13	NC_010995	GGT	2	6	792	797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192359033
14	NC_010995	T	6	6	916	921	0 %	100 %	0 %	0 %	192359033
15	NC_010995	CTG	2	6	970	975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192359033
16	NC_010995	CGGTAG	2	12	1073	1084	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192359033
17	NC_010995	GCC	2	6	1086	1091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192359033
18	NC_010995	AAG	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192359033
19	NC_010995	CTT	2	6	1167	1172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192359033
20	NC_010995	TCGA	3	12	1254	1265	25 %	25 %	25 %	25 %	192359033
21	NC_010995	ACAA	2	8	1313	1320	75 %	0 %	0 %	25 %	192359033
22	NC_010995	ATA	2	6	1331	1336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	192359033
23	NC_010995	GTG	2	6	1345	1350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192359033
24	NC_010995	TAC	2	6	1357	1362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192359033
25	NC_010995	GGC	2	6	1489	1494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192359033
26	NC_010995	ACCAC	2	10	1499	1508	40 %	0 %	0 %	60 %	192359033
27	NC_010995	TGC	2	6	1583	1588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192359033
28	NC_010995	ACA	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192359033
29	NC_010995	T	6	6	1619	1624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010995	TAA	2	6	1636	1641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010995	TGGTG	2	10	1729	1738	0 %	40 %	60 %	0 %	192362292
32	NC_010995	CGT	2	6	1742	1747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192362292
33	NC_010995	GCAG	2	8	1855	1862	25 %	0 %	50 %	25 %	192362292
34	NC_010995	T	6	6	1943	1948	0 %	100 %	0 %	0 %	192362292
35	NC_010995	GAA	2	6	1952	1957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362292
36	NC_010995	CT	3	6	1995	2000	0 %	50 %	0 %	50 %	192362292
37	NC_010995	AGA	2	6	2032	2037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362292
38	NC_010995	TGT	2	6	2245	2250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192362292
39	NC_010995	GT	3	6	2274	2279	0 %	50 %	50 %	0 %	192362292
40	NC_010995	GAT	2	6	2300	2305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192362292
41	NC_010995	GC	3	6	2310	2315	0 %	0 %	50 %	50 %	192362292
42	NC_010995	AAGTGG	2	12	2316	2327	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	192362292
43	NC_010995	TGG	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192362292
44	NC_010995	CG	3	6	2424	2429	0 %	0 %	50 %	50 %	192362292
45	NC_010995	AGT	2	6	2440	2445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192362292
46	NC_010995	TC	3	6	2494	2499	0 %	50 %	0 %	50 %	192362292
47	NC_010995	TGT	2	6	2526	2531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192362292
48	NC_010995	GAA	2	6	2576	2581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362292
49	NC_010995	GAA	2	6	2585	2590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362292
50	NC_010995	GAA	2	6	2726	2731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362292
51	NC_010995	TGT	2	6	2755	2760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192362292
52	NC_010995	T	6	6	2790	2795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010995	TCA	2	6	2836	2841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192361120
54	NC_010995	TCG	2	6	2876	2881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192361120
55	NC_010995	TTG	2	6	2927	2932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192361120
56	NC_010995	TCA	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192361120
57	NC_010995	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192361120
58	NC_010995	GCG	2	6	3047	3052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192361120
59	NC_010995	CAG	2	6	3080	3085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192361120
60	NC_010995	TCG	2	6	3208	3213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192361120
61	NC_010995	ATAGA	2	10	3318	3327	60 %	20 %	20 %	0 %	192361120
62	NC_010995	TTGT	2	8	3410	3417	0 %	75 %	25 %	0 %	192361120
63	NC_010995	AGC	2	6	3429	3434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192361120
64	NC_010995	GTC	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192361120
65	NC_010995	GGGAT	2	10	3484	3493	20 %	20 %	60 %	0 %	192361120
66	NC_010995	TGC	2	6	3610	3615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192361120
67	NC_010995	GCT	2	6	3643	3648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192361120
68	NC_010995	GC	3	6	3654	3659	0 %	0 %	50 %	50 %	192361120
69	NC_010995	TGG	2	6	3717	3722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192361120
70	NC_010995	AAC	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192361120
71	NC_010995	TGG	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192361120
72	NC_010995	TATT	2	8	3798	3805	25 %	75 %	0 %	0 %	192361120
73	NC_010995	TTG	2	6	3827	3832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192361120
74	NC_010995	GCTG	3	12	3833	3844	0 %	25 %	50 %	25 %	192361120
75	NC_010995	AGA	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192360461
76	NC_010995	CAC	2	6	4094	4099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192360461
77	NC_010995	GGT	2	6	4111	4116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192360461
78	NC_010995	CGA	2	6	4129	4134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192360461
79	NC_010995	CTGG	2	8	4139	4146	0 %	25 %	50 %	25 %	192360461
80	NC_010995	GGT	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192360461
81	NC_010995	CGA	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192360461
82	NC_010995	CGG	2	6	4318	4323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192360461
83	NC_010995	AGT	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192360461
84	NC_010995	CCG	2	6	4384	4389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192360461
85	NC_010995	GCGT	2	8	4578	4585	0 %	25 %	50 %	25 %	192360461
86	NC_010995	ACC	2	6	4679	4684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192360461
87	NC_010995	TAA	2	6	4687	4692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	192360461
88	NC_010995	TTG	2	6	4704	4709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192360461
89	NC_010995	TTCC	2	8	4762	4769	0 %	50 %	0 %	50 %	192360461
90	NC_010995	CTGTT	2	10	4778	4787	0 %	60 %	20 %	20 %	192360461
91	NC_010995	CAA	2	6	4792	4797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192360461
92	NC_010995	CTG	2	6	4856	4861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192360461
93	NC_010995	AAG	2	6	4878	4883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192360461
94	NC_010995	CCA	2	6	4908	4913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192360461
95	NC_010995	ATT	2	6	4946	4951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192360461
96	NC_010995	CCAAA	2	10	4984	4993	60 %	0 %	0 %	40 %	192360461
97	NC_010995	CGG	2	6	5022	5027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192360461
98	NC_010995	TCC	2	6	5054	5059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192360461
99	NC_010995	CTG	2	6	5063	5068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192360461
100	NC_010995	ATG	2	6	5079	5084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192360461
101	NC_010995	GAT	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192360461
102	NC_010995	CCG	2	6	5158	5163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192360461
103	NC_010995	TGG	2	6	5247	5252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192360461
104	NC_010995	GGT	2	6	5267	5272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192360461
105	NC_010995	GC	3	6	5291	5296	0 %	0 %	50 %	50 %	192360461
106	NC_010995	AGA	2	6	5422	5427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192360461
107	NC_010995	CAT	2	6	5458	5463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192360461
108	NC_010995	CTT	3	9	5518	5526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192360461
109	NC_010995	GCC	2	6	5575	5580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192360461
110	NC_010995	CAG	2	6	5735	5740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192360461
111	NC_010995	GAT	2	6	5806	5811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192360461
112	NC_010995	GC	3	6	5827	5832	0 %	0 %	50 %	50 %	192360461
113	NC_010995	CAG	2	6	5861	5866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192360461
114	NC_010995	GC	3	6	5903	5908	0 %	0 %	50 %	50 %	192360461
115	NC_010995	CAT	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192360461
116	NC_010995	CTT	2	6	6025	6030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192360461
117	NC_010995	TTG	2	6	6054	6059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192360461
118	NC_010995	GAA	2	6	6089	6094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192360461
119	NC_010995	GCG	2	6	6111	6116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192360461
120	NC_010995	GCAA	2	8	6120	6127	50 %	0 %	25 %	25 %	192360461
121	NC_010995	ACA	2	6	6186	6191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192360461
122	NC_010995	ACC	2	6	6242	6247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192360461
123	NC_010995	TGC	2	6	6270	6275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192360461
124	NC_010995	CAC	2	6	6316	6321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192360461
125	NC_010995	GCCGC	2	10	6343	6352	0 %	0 %	40 %	60 %	192360461
126	NC_010995	GA	3	6	6467	6472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010995	TTG	2	6	6557	6562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192361286
128	NC_010995	GGA	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192361286
129	NC_010995	GAA	2	6	6584	6589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192361286
130	NC_010995	TGA	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192361286
131	NC_010995	GC	3	6	6667	6672	0 %	0 %	50 %	50 %	192361286
132	NC_010995	CAGT	2	8	6730	6737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010995	AAT	2	6	6742	6747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010995	GTT	2	6	6953	6958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192362495
135	NC_010995	CTGACA	2	12	7014	7025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	192362495
136	NC_010995	GCT	3	9	7034	7042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192362495
137	NC_010995	CATT	2	8	7110	7117	25 %	50 %	0 %	25 %	192362495
138	NC_010995	GGT	2	6	7208	7213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192362495
139	NC_010995	GTT	2	6	7271	7276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192362495
140	NC_010995	GCC	2	6	7298	7303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
141	NC_010995	GTA	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192362495
142	NC_010995	GGC	2	6	7376	7381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192362495
143	NC_010995	GCC	2	6	7394	7399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
144	NC_010995	GAA	2	6	7445	7450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362495
145	NC_010995	CCG	2	6	7500	7505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
146	NC_010995	CCG	2	6	7509	7514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
147	NC_010995	CG	3	6	7522	7527	0 %	0 %	50 %	50 %	192362495
148	NC_010995	CGC	3	9	7585	7593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
149	NC_010995	TGG	2	6	7615	7620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192362495
150	NC_010995	ACC	2	6	7630	7635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192362495
151	NC_010995	GTT	2	6	7745	7750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192362495
152	NC_010995	TCT	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192362495
153	NC_010995	GTG	2	6	7986	7991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192362495
154	NC_010995	GAA	2	6	8003	8008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192362495
155	NC_010995	GCCG	2	8	8075	8082	0 %	0 %	50 %	50 %	192362495
156	NC_010995	GTTATC	2	12	8126	8137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	192362495
157	NC_010995	ACC	2	6	8190	8195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192362495
158	NC_010995	GCC	2	6	8207	8212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
159	NC_010995	GTA	2	6	8222	8227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192362495
160	NC_010995	CTGG	2	8	8273	8280	0 %	25 %	50 %	25 %	192362495
161	NC_010995	CAC	2	6	8291	8296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192362495
162	NC_010995	GGC	2	6	8327	8332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192362495
163	NC_010995	CGG	2	6	8441	8446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192362495
164	NC_010995	TCAA	2	8	8496	8503	50 %	25 %	0 %	25 %	192362495
165	NC_010995	CGC	2	6	8515	8520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192362495
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169	NC_010995	TGG	2	6	8650	8655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192362495
170	NC_010995	CTG	2	6	8658	8663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192362495
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173	NC_010995	GATC	2	8	8818	8825	25 %	25 %	25 %	25 %	192362495
174	NC_010995	CTG	2	6	8861	8866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192362495
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187	NC_010995	GGT	2	6	9536	9541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192362495
188	NC_010995	GAG	2	6	9655	9660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
189	NC_010995	GTTATT	2	12	9670	9681	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
190	NC_010995	CAA	2	6	9730	9735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_010995	CGC	2	6	9809	9814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
192	NC_010995	CCT	2	6	9963	9968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
193	NC_010995	GCA	2	6	10021	10026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
194	NC_010995	C	6	6	10092	10097	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
195	NC_010995	A	6	6	10111	10116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_010995	AGAGA	2	10	10129	10138	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
197	NC_010995	AC	3	6	10162	10167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
198	NC_010995	CTGG	2	8	10173	10180	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
199	NC_010995	TTTG	2	8	10236	10243	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
200	NC_010995	GCC	2	6	10251	10256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
201	NC_010995	CCTGTC	2	12	10328	10339	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	192359692
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214	NC_010995	CGG	2	6	11221	11226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192359692
215	NC_010995	CGGC	2	8	11371	11378	0 %	0 %	50 %	50 %	192359692
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230	NC_010995	GGCA	2	8	11935	11942	25 %	0 %	50 %	25 %	192359692
231	NC_010995	AACCTG	2	12	11968	11979	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	192359692
232	NC_010995	CAG	2	6	12008	12013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192359692
233	NC_010995	CAG	2	6	12108	12113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192359692
234	NC_010995	AGT	2	6	12117	12122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192359692
235	NC_010995	GTG	2	6	12142	12147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192359692
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237	NC_010995	CCA	2	6	12184	12189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192359692
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239	NC_010995	AACC	2	8	12291	12298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
240	NC_010995	GGTT	2	8	12314	12321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
241	NC_010995	ATC	2	6	12341	12346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192359975
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246	NC_010995	A	6	6	12742	12747	100 %	0 %	0 %	0 %	192359975
247	NC_010995	GAGCG	2	10	12791	12800	20 %	0 %	60 %	20 %	192359975
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251	NC_010995	GC	4	8	13047	13054	0 %	0 %	50 %	50 %	192359975
252	NC_010995	CACCG	2	10	13056	13065	20 %	0 %	20 %	60 %	192359975
253	NC_010995	AAT	2	6	13105	13110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	192359975
254	NC_010995	GC	4	8	13180	13187	0 %	0 %	50 %	50 %	192359975
255	NC_010995	AATT	2	8	13188	13195	50 %	50 %	0 %	0 %	192359975
256	NC_010995	TGT	2	6	13273	13278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192359975
257	NC_010995	CCG	2	6	13280	13285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192359975
258	NC_010995	TCC	2	6	13405	13410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192359975
259	NC_010995	CGC	2	6	13570	13575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192359975
260	NC_010995	GGC	2	6	13593	13598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192359975
261	NC_010995	CA	3	6	13617	13622	50 %	0 %	0 %	50 %	192359975
262	NC_010995	TGG	2	6	13648	13653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192359975
263	NC_010995	CCG	3	9	13712	13720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192359975
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265	NC_010995	ATTGC	2	10	13999	14008	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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