MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 chromosome

Total Repeats: 44489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_010830	AGC	2	6	1649185	1649190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189502616
39003	NC_010830	T	7	7	1649230	1649236	0 %	100 %	0 %	0 %	189502616
39004	NC_010830	GAT	2	6	1649406	1649411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189502616
39005	NC_010830	ACT	3	9	1649567	1649575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502616
39006	NC_010830	T	6	6	1649580	1649585	0 %	100 %	0 %	0 %	189502616
39007	NC_010830	T	6	6	1649614	1649619	0 %	100 %	0 %	0 %	189502616
39008	NC_010830	GAA	2	6	1649693	1649698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189502616
39009	NC_010830	GAA	2	6	1649750	1649755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189502616
39010	NC_010830	A	6	6	1649785	1649790	100 %	0 %	0 %	0 %	189502616
39011	NC_010830	AGC	2	6	1649806	1649811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189502616
39012	NC_010830	CTT	2	6	1649817	1649822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189502616
39013	NC_010830	TTC	2	6	1649860	1649865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189502616
39014	NC_010830	CTC	2	6	1649884	1649889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189502616
39015	NC_010830	TCG	2	6	1649972	1649977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189502616
39016	NC_010830	TTC	2	6	1650025	1650030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189502616
39017	NC_010830	ATC	2	6	1650073	1650078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502616
39018	NC_010830	TCT	2	6	1650119	1650124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189502616
39019	NC_010830	CAT	2	6	1650216	1650221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502616
39020	NC_010830	AAGC	2	8	1650303	1650310	50 %	0 %	25 %	25 %	189502616
39021	NC_010830	TCA	2	6	1650374	1650379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502616
39022	NC_010830	TGC	2	6	1650476	1650481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189502616
39023	NC_010830	TAG	3	9	1650537	1650545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189502616
39024	NC_010830	TTA	2	6	1650581	1650586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502616
39025	NC_010830	CAT	2	6	1650606	1650611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502616
39026	NC_010830	AGT	2	6	1650639	1650644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189502616
39027	NC_010830	TTA	2	6	1650656	1650661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502616
39028	NC_010830	TTA	2	6	1650684	1650689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502616
39029	NC_010830	TCTTCA	2	12	1650716	1650727	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	189502616
39030	NC_010830	TTC	2	6	1650730	1650735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189502616
39031	NC_010830	CTT	2	6	1650746	1650751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189502616
39032	NC_010830	TCA	2	6	1650761	1650766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502616
39033	NC_010830	G	7	7	1650782	1650788	0 %	0 %	100 %	0 %	189502616
39034	NC_010830	CTTTC	2	10	1650801	1650810	0 %	60 %	0 %	40 %	189502616
39035	NC_010830	GCC	2	6	1650822	1650827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189502616
39036	NC_010830	GTT	2	6	1650870	1650875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189502616
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39038	NC_010830	T	6	6	1650995	1651000	0 %	100 %	0 %	0 %	189502616
39039	NC_010830	TGT	2	6	1651017	1651022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189502616
39040	NC_010830	TAA	2	6	1651033	1651038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189502616
39041	NC_010830	CTGG	2	8	1651043	1651050	0 %	25 %	50 %	25 %	189502616
39042	NC_010830	TGC	2	6	1651066	1651071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189502616
39043	NC_010830	TA	3	6	1651074	1651079	50 %	50 %	0 %	0 %	189502616
39044	NC_010830	TCCT	2	8	1651105	1651112	0 %	50 %	0 %	50 %	189502616
39045	NC_010830	TAT	2	6	1651120	1651125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502616
39046	NC_010830	CAG	2	6	1651161	1651166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189502616
39047	NC_010830	ATT	2	6	1651204	1651209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502616
39048	NC_010830	TA	3	6	1651212	1651217	50 %	50 %	0 %	0 %	189502616
39049	NC_010830	ACCT	2	8	1651218	1651225	25 %	25 %	0 %	50 %	189502616
39050	NC_010830	AATTG	2	10	1651227	1651236	40 %	40 %	20 %	0 %	189502616
39051	NC_010830	TATATC	2	12	1651255	1651266	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189502616
39052	NC_010830	AAC	2	6	1651273	1651278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189502616
39053	NC_010830	TTC	2	6	1651291	1651296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189502616
39054	NC_010830	TCCT	2	8	1651310	1651317	0 %	50 %	0 %	50 %	189502616
39055	NC_010830	AAAT	2	8	1651338	1651345	75 %	25 %	0 %	0 %	189502616
39056	NC_010830	CTT	2	6	1651374	1651379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189502616
39057	NC_010830	TAT	2	6	1651401	1651406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502616
39058	NC_010830	GAA	2	6	1651421	1651426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189502616
39059	NC_010830	ATT	2	6	1651480	1651485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502616
39060	NC_010830	TAC	2	6	1651548	1651553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502616
39061	NC_010830	ATA	2	6	1651555	1651560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189502616
39062	NC_010830	TA	3	6	1651562	1651567	50 %	50 %	0 %	0 %	189502616
39063	NC_010830	GCT	2	6	1651607	1651612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189502616
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39065	NC_010830	TTGA	2	8	1651695	1651702	25 %	50 %	25 %	0 %	189502616
39066	NC_010830	CT	3	6	1651709	1651714	0 %	50 %	0 %	50 %	189502616
39067	NC_010830	ACT	2	6	1651763	1651768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502616
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39071	NC_010830	A	6	6	1651893	1651898	100 %	0 %	0 %	0 %	189502616
39072	NC_010830	GAG	2	6	1651901	1651906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189502616
39073	NC_010830	GATA	2	8	1651955	1651962	50 %	25 %	25 %	0 %	189502616
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39084	NC_010830	TCC	3	9	1652428	1652436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189502616
39085	NC_010830	CAA	2	6	1652475	1652480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189502616
39086	NC_010830	GAAT	2	8	1652488	1652495	50 %	25 %	25 %	0 %	189502616
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39088	NC_010830	A	6	6	1652542	1652547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39089	NC_010830	GAT	2	6	1652617	1652622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39090	NC_010830	AT	3	6	1652719	1652724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39091	NC_010830	GAT	2	6	1652821	1652826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39092	NC_010830	AGT	2	6	1652859	1652864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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39094	NC_010830	TGTA	2	8	1652976	1652983	25 %	50 %	25 %	0 %	189502618
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39096	NC_010830	TG	3	6	1653197	1653202	0 %	50 %	50 %	0 %	189502618
39097	NC_010830	AATT	2	8	1653218	1653225	50 %	50 %	0 %	0 %	189502618
39098	NC_010830	AACT	2	8	1653374	1653381	50 %	25 %	0 %	25 %	189502618
39099	NC_010830	CTA	2	6	1653496	1653501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502618
39100	NC_010830	T	6	6	1653531	1653536	0 %	100 %	0 %	0 %	189502618
39101	NC_010830	ACCA	2	8	1653567	1653574	50 %	0 %	0 %	50 %	189502618
39102	NC_010830	ATT	2	6	1653603	1653608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502618
39103	NC_010830	TGG	2	6	1653684	1653689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189502618
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39105	NC_010830	TGC	2	6	1653789	1653794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189502618
39106	NC_010830	AAT	2	6	1653805	1653810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189502618
39107	NC_010830	ATT	2	6	1653826	1653831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502618
39108	NC_010830	TCT	2	6	1653859	1653864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189502618
39109	NC_010830	CTT	2	6	1653866	1653871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189502618
39110	NC_010830	TCTT	2	8	1653887	1653894	0 %	75 %	0 %	25 %	189502618
39111	NC_010830	TTG	2	6	1653920	1653925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189502618
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39115	NC_010830	CTTT	2	8	1653996	1654003	0 %	75 %	0 %	25 %	189502618
39116	NC_010830	TCA	2	6	1654009	1654014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502618
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39118	NC_010830	TAGG	2	8	1654039	1654046	25 %	25 %	50 %	0 %	189502618
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39231	NC_010830	TG	4	8	1658221	1658228	0 %	50 %	50 %	0 %	189502623
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39233	NC_010830	ATT	2	6	1658274	1658279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502623
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39482	NC_010830	TAA	2	6	1668632	1668637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39483	NC_010830	TGTTC	2	10	1668664	1668673	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39484	NC_010830	ATGG	2	8	1668699	1668706	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39485	NC_010830	TTC	2	6	1668717	1668722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39486	NC_010830	CTT	2	6	1668735	1668740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39487	NC_010830	CTT	2	6	1668783	1668788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39488	NC_010830	AGTA	2	8	1668817	1668824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39489	NC_010830	GCT	2	6	1668878	1668883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39490	NC_010830	CTAT	2	8	1668932	1668939	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39491	NC_010830	CAAA	2	8	1668945	1668952	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39492	NC_010830	CTATAT	2	12	1668984	1668995	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39493	NC_010830	CTT	2	6	1669027	1669032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39494	NC_010830	GCT	2	6	1669034	1669039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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39496	NC_010830	AGC	2	6	1669089	1669094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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39498	NC_010830	CTTCT	2	10	1669194	1669203	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
39499	NC_010830	CTTTA	2	10	1669227	1669236	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39500	NC_010830	AAG	2	6	1669259	1669264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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