MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 chromosome

Total Repeats: 44489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_010830	TTA	2	6	1457285	1457290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34502	NC_010830	TGGTA	2	10	1457337	1457346	20 %	40 %	40 %	0 %	189502492
34503	NC_010830	TA	3	6	1457345	1457350	50 %	50 %	0 %	0 %	189502492
34504	NC_010830	GAA	2	6	1457351	1457356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189502492
34505	NC_010830	AGA	3	9	1457359	1457367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189502492
34506	NC_010830	AGA	2	6	1457395	1457400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189502492
34507	NC_010830	AGCA	2	8	1457452	1457459	50 %	0 %	25 %	25 %	189502492
34508	NC_010830	CCTTA	2	10	1457534	1457543	20 %	40 %	0 %	40 %	189502492
34509	NC_010830	GAT	2	6	1457546	1457551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189502492
34510	NC_010830	AGC	2	6	1457593	1457598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189502492
34511	NC_010830	CAAC	2	8	1457602	1457609	50 %	0 %	0 %	50 %	189502492
34512	NC_010830	CTAA	2	8	1457675	1457682	50 %	25 %	0 %	25 %	189502492
34513	NC_010830	AGA	2	6	1457692	1457697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189502492
34514	NC_010830	GAAA	2	8	1457812	1457819	75 %	0 %	25 %	0 %	189502492
34515	NC_010830	ATT	2	6	1457871	1457876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502492
34516	NC_010830	CATA	2	8	1457920	1457927	50 %	25 %	0 %	25 %	294661333
34517	NC_010830	ATAA	2	8	1457941	1457948	75 %	25 %	0 %	0 %	294661333
34518	NC_010830	CTT	2	6	1458031	1458036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294661333
34519	NC_010830	TAC	2	6	1458065	1458070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34520	NC_010830	AAC	2	6	1458072	1458077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34521	NC_010830	AAAT	2	8	1458166	1458173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34522	NC_010830	A	6	6	1458179	1458184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34523	NC_010830	CAAT	2	8	1458185	1458192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34524	NC_010830	TCAA	2	8	1458199	1458206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34525	NC_010830	A	7	7	1458217	1458223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34526	NC_010830	T	6	6	1458235	1458240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34527	NC_010830	TAT	2	6	1458266	1458271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34528	NC_010830	TCC	2	6	1458356	1458361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294661334
34529	NC_010830	GAA	2	6	1458384	1458389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294661334
34530	NC_010830	A	6	6	1458424	1458429	100 %	0 %	0 %	0 %	294661334
34531	NC_010830	TAA	2	6	1458437	1458442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294661334
34532	NC_010830	A	6	6	1458441	1458446	100 %	0 %	0 %	0 %	294661334
34533	NC_010830	GTT	2	6	1458468	1458473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294661334
34534	NC_010830	GCCC	2	8	1458474	1458481	0 %	0 %	25 %	75 %	294661334
34535	NC_010830	TAC	2	6	1458484	1458489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294661334
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34537	NC_010830	ATC	2	6	1458501	1458506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294661334
34538	NC_010830	GCT	2	6	1458569	1458574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189502493
34539	NC_010830	TAG	3	9	1458611	1458619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189502493
34540	NC_010830	CTAC	2	8	1458625	1458632	25 %	25 %	0 %	50 %	189502493
34541	NC_010830	A	6	6	1458650	1458655	100 %	0 %	0 %	0 %	189502493
34542	NC_010830	CTAT	2	8	1458673	1458680	25 %	50 %	0 %	25 %	189502493
34543	NC_010830	ACCA	2	8	1458681	1458688	50 %	0 %	0 %	50 %	189502493
34544	NC_010830	A	6	6	1458742	1458747	100 %	0 %	0 %	0 %	189502493
34545	NC_010830	AG	4	8	1458788	1458795	50 %	0 %	50 %	0 %	189502493
34546	NC_010830	AAGA	2	8	1458811	1458818	75 %	0 %	25 %	0 %	189502493
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34549	NC_010830	A	6	6	1458877	1458882	100 %	0 %	0 %	0 %	189502493
34550	NC_010830	ATT	2	6	1458904	1458909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502493
34551	NC_010830	TTA	2	6	1459002	1459007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502493
34552	NC_010830	GT	3	6	1459151	1459156	0 %	50 %	50 %	0 %	189502493
34553	NC_010830	CAT	2	6	1459164	1459169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502493
34554	NC_010830	TGG	2	6	1459179	1459184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189502493
34555	NC_010830	AGC	2	6	1459238	1459243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189502493
34556	NC_010830	TAA	2	6	1459244	1459249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189502493
34557	NC_010830	TAAT	2	8	1459304	1459311	50 %	50 %	0 %	0 %	189502493
34558	NC_010830	CAG	2	6	1459336	1459341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189502493
34559	NC_010830	ATG	2	6	1459397	1459402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189502493
34560	NC_010830	A	7	7	1459428	1459434	100 %	0 %	0 %	0 %	189502493
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34563	NC_010830	GAAATA	2	12	1459537	1459548	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189502493
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34568	NC_010830	A	7	7	1459679	1459685	100 %	0 %	0 %	0 %	189502493
34569	NC_010830	GAAA	2	8	1459686	1459693	75 %	0 %	25 %	0 %	189502493
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34572	NC_010830	ATT	2	6	1459801	1459806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502493
34573	NC_010830	ACT	3	9	1459809	1459817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502493
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34589	NC_010830	AT	3	6	1460603	1460608	50 %	50 %	0 %	0 %	189502493
34590	NC_010830	CAGC	2	8	1460645	1460652	25 %	0 %	25 %	50 %	189502493
34591	NC_010830	CAG	2	6	1460660	1460665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189502493
34592	NC_010830	GCT	2	6	1460722	1460727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189502493
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34598	NC_010830	CCAAG	2	10	1461037	1461046	40 %	0 %	20 %	40 %	189502493
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34601	NC_010830	T	6	6	1461135	1461140	0 %	100 %	0 %	0 %	189502493
34602	NC_010830	T	6	6	1461210	1461215	0 %	100 %	0 %	0 %	189502493
34603	NC_010830	GAA	2	6	1461245	1461250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189502493
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34606	NC_010830	ATC	2	6	1461370	1461375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502493
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34609	NC_010830	GCT	2	6	1461471	1461476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189502493
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34619	NC_010830	TCC	2	6	1462002	1462007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189502493
34620	NC_010830	AGC	2	6	1462119	1462124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189502493
34621	NC_010830	A	6	6	1462144	1462149	100 %	0 %	0 %	0 %	189502493
34622	NC_010830	TAC	2	6	1462161	1462166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502493
34623	NC_010830	T	6	6	1462209	1462214	0 %	100 %	0 %	0 %	189502493
34624	NC_010830	ATG	2	6	1462250	1462255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189502493
34625	NC_010830	TA	3	6	1462269	1462274	50 %	50 %	0 %	0 %	189502493
34626	NC_010830	GCT	2	6	1462300	1462305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189502493
34627	NC_010830	ATA	2	6	1462349	1462354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189502493
34628	NC_010830	CAC	2	6	1462459	1462464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189502493
34629	NC_010830	GTT	2	6	1462471	1462476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189502493
34630	NC_010830	CTA	2	6	1462542	1462547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502493
34631	NC_010830	AGA	2	6	1462620	1462625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189502493
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34633	NC_010830	AG	3	6	1462644	1462649	50 %	0 %	50 %	0 %	189502493
34634	NC_010830	CTG	2	6	1462700	1462705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189502493
34635	NC_010830	GAA	2	6	1462720	1462725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189502493
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34639	NC_010830	AGA	2	6	1462800	1462805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189502493
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34641	NC_010830	AGA	2	6	1462821	1462826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189502493
34642	NC_010830	AAC	2	6	1462844	1462849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189502493
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34644	NC_010830	A	6	6	1462975	1462980	100 %	0 %	0 %	0 %	189502493
34645	NC_010830	AG	3	6	1463049	1463054	50 %	0 %	50 %	0 %	189502493
34646	NC_010830	TATGG	2	10	1463055	1463064	20 %	40 %	40 %	0 %	189502493
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34648	NC_010830	CTT	2	6	1463223	1463228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189502493
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34650	NC_010830	TTA	2	6	1463255	1463260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189502493
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34654	NC_010830	TACC	2	8	1463339	1463346	25 %	25 %	0 %	50 %	189502493
34655	NC_010830	CAT	2	6	1463470	1463475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189502493
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34690	NC_010830	TGC	2	6	1464965	1464970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34691	NC_010830	A	6	6	1464992	1464997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34694	NC_010830	TA	3	6	1465023	1465028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34695	NC_010830	AAC	2	6	1465041	1465046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34696	NC_010830	T	6	6	1465065	1465070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34697	NC_010830	AGC	2	6	1465099	1465104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34700	NC_010830	AGC	2	6	1465189	1465194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294661335
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34704	NC_010830	TTAA	2	8	1465430	1465437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34705	NC_010830	TA	3	6	1465478	1465483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34706	NC_010830	AGCA	2	8	1465600	1465607	50 %	0 %	25 %	25 %	294661336
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34715	NC_010830	CAT	2	6	1465983	1465988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294661336
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34719	NC_010830	TGCT	2	8	1466068	1466075	0 %	50 %	25 %	25 %	294661336
34720	NC_010830	T	7	7	1466096	1466102	0 %	100 %	0 %	0 %	294661337
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34722	NC_010830	T	6	6	1466283	1466288	0 %	100 %	0 %	0 %	294661337
34723	NC_010830	GCT	2	6	1466292	1466297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294661337
34724	NC_010830	TAG	2	6	1466341	1466346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294661337
34725	NC_010830	T	6	6	1466374	1466379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34726	NC_010830	CT	3	6	1466401	1466406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34727	NC_010830	TAA	2	6	1466411	1466416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34728	NC_010830	TA	4	8	1466474	1466481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34729	NC_010830	TAC	2	6	1466491	1466496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34730	NC_010830	AT	3	6	1466508	1466513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34731	NC_010830	AAGA	2	8	1466551	1466558	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34732	NC_010830	CAAT	2	8	1466660	1466667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34733	NC_010830	TAG	2	6	1466671	1466676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34734	NC_010830	CCA	2	6	1466750	1466755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34735	NC_010830	TAC	2	6	1466779	1466784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34736	NC_010830	GTAA	2	8	1466821	1466828	50 %	25 %	25 %	0 %	189502495
34737	NC_010830	TGT	2	6	1466837	1466842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189502495
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