MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 53629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_010803	TC	3	6	2314670	2314675	0 %	50 %	0 %	50 %	189347576
45002	NC_010803	CGC	2	6	2314837	2314842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189347576
45003	NC_010803	ATC	2	6	2314892	2314897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347576
45004	NC_010803	GCC	2	6	2314999	2315004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189347576
45005	NC_010803	TTC	2	6	2315018	2315023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189347576
45006	NC_010803	A	6	6	2315085	2315090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45007	NC_010803	TCA	2	6	2315134	2315139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45008	NC_010803	GCA	2	6	2315154	2315159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45009	NC_010803	CGC	2	6	2315250	2315255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45010	NC_010803	TCA	2	6	2315281	2315286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45011	NC_010803	A	6	6	2315306	2315311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45012	NC_010803	TATT	2	8	2315318	2315325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45013	NC_010803	CCT	2	6	2315330	2315335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45014	NC_010803	TCA	2	6	2315343	2315348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45015	NC_010803	CAT	2	6	2315411	2315416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347577
45016	NC_010803	AACG	2	8	2315420	2315427	50 %	0 %	25 %	25 %	189347577
45017	NC_010803	CTG	2	6	2315455	2315460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347577
45018	NC_010803	GCAAA	2	10	2315472	2315481	60 %	0 %	20 %	20 %	189347577
45019	NC_010803	AGA	2	6	2315621	2315626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189347577
45020	NC_010803	CTG	2	6	2315679	2315684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347577
45021	NC_010803	CAGG	2	8	2315743	2315750	25 %	0 %	50 %	25 %	189347577
45022	NC_010803	TCA	2	6	2315764	2315769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45023	NC_010803	CTG	2	6	2315835	2315840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347578
45024	NC_010803	GAA	2	6	2315894	2315899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189347578
45025	NC_010803	GTA	2	6	2315917	2315922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189347578
45026	NC_010803	ACGA	2	8	2315936	2315943	50 %	0 %	25 %	25 %	189347578
45027	NC_010803	AC	3	6	2315957	2315962	50 %	0 %	0 %	50 %	189347578
45028	NC_010803	TGC	2	6	2315984	2315989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347578
45029	NC_010803	GAC	2	6	2316053	2316058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347578
45030	NC_010803	TCA	2	6	2316127	2316132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347578
45031	NC_010803	TTC	2	6	2316135	2316140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189347578
45032	NC_010803	ATTC	2	8	2316210	2316217	25 %	50 %	0 %	25 %	189347578
45033	NC_010803	CAGCAA	2	12	2316282	2316293	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45034	NC_010803	CCCTTA	2	12	2316351	2316362	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
45035	NC_010803	GTT	2	6	2316456	2316461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45036	NC_010803	CGA	2	6	2316494	2316499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45037	NC_010803	CGA	2	6	2316529	2316534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45038	NC_010803	CCT	2	6	2316546	2316551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45039	NC_010803	TGA	2	6	2316597	2316602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45040	NC_010803	CAT	2	6	2316647	2316652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45041	NC_010803	CGA	2	6	2316718	2316723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45042	NC_010803	CGGCCA	2	12	2316741	2316752	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45043	NC_010803	CTT	2	6	2316865	2316870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45044	NC_010803	GCT	2	6	2316890	2316895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45045	NC_010803	GCC	2	6	2316971	2316976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45046	NC_010803	TGC	2	6	2317065	2317070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45047	NC_010803	AACA	2	8	2317190	2317197	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45048	NC_010803	TCC	2	6	2317293	2317298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45049	NC_010803	TCA	2	6	2317304	2317309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45050	NC_010803	CAC	2	6	2317315	2317320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45051	NC_010803	CAT	2	6	2317352	2317357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45052	NC_010803	CTC	2	6	2317475	2317480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45053	NC_010803	TCA	2	6	2317492	2317497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45054	NC_010803	GTA	2	6	2317541	2317546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45055	NC_010803	T	9	9	2317648	2317656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45056	NC_010803	CAACT	3	15	2317661	2317675	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45057	NC_010803	CTA	2	6	2317791	2317796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45058	NC_010803	T	7	7	2317820	2317826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45059	NC_010803	CCT	2	6	2317837	2317842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45060	NC_010803	CCG	2	6	2317844	2317849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45061	NC_010803	GTTG	2	8	2317856	2317863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45062	NC_010803	TGA	2	6	2317910	2317915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45063	NC_010803	AGC	2	6	2317930	2317935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45064	NC_010803	AGC	2	6	2317942	2317947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45065	NC_010803	TCG	2	6	2317963	2317968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45066	NC_010803	TGG	2	6	2318003	2318008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45067	NC_010803	ATG	2	6	2318011	2318016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45068	NC_010803	ATG	2	6	2318018	2318023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45069	NC_010803	TGA	2	6	2318042	2318047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45070	NC_010803	T	6	6	2318073	2318078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45071	NC_010803	CAT	2	6	2318089	2318094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45072	NC_010803	TCG	2	6	2318099	2318104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45073	NC_010803	CAG	2	6	2318110	2318115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45074	NC_010803	GCC	2	6	2318150	2318155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45075	NC_010803	CCG	2	6	2318249	2318254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45076	NC_010803	GCT	2	6	2318414	2318419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45077	NC_010803	GC	3	6	2318512	2318517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45078	NC_010803	TTC	2	6	2318518	2318523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45079	NC_010803	TGG	2	6	2318586	2318591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45080	NC_010803	GGT	2	6	2318634	2318639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45081	NC_010803	CTG	2	6	2318647	2318652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45082	NC_010803	ACGA	2	8	2318659	2318666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45083	NC_010803	TTC	2	6	2318739	2318744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45084	NC_010803	GAT	3	9	2318795	2318803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45085	NC_010803	GGT	3	9	2319005	2319013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45086	NC_010803	ACC	2	6	2319019	2319024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45087	NC_010803	TGT	2	6	2319185	2319190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45088	NC_010803	CGTT	2	8	2319330	2319337	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45089	NC_010803	GT	3	6	2319578	2319583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45090	NC_010803	A	6	6	2319597	2319602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45091	NC_010803	GCTG	2	8	2319653	2319660	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45092	NC_010803	AGC	2	6	2319691	2319696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45093	NC_010803	TCA	2	6	2319727	2319732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45094	NC_010803	GAT	2	6	2319800	2319805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45095	NC_010803	TGT	2	6	2320149	2320154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45096	NC_010803	T	6	6	2320166	2320171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45097	NC_010803	TTGG	2	8	2320202	2320209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45098	NC_010803	T	6	6	2320236	2320241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45099	NC_010803	CGGC	2	8	2320326	2320333	0 %	0 %	50 %	50 %	189347579
45100	NC_010803	CCGA	2	8	2320426	2320433	25 %	0 %	25 %	50 %	189347579
45101	NC_010803	T	6	6	2320535	2320540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45102	NC_010803	ACC	2	6	2320550	2320555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45103	NC_010803	ATTT	2	8	2320682	2320689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45104	NC_010803	AGT	2	6	2320705	2320710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45105	NC_010803	TAC	2	6	2320743	2320748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45106	NC_010803	TCT	2	6	2320776	2320781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45107	NC_010803	TAC	2	6	2320788	2320793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45108	NC_010803	GCT	2	6	2320912	2320917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347580
45109	NC_010803	GATGT	2	10	2320940	2320949	20 %	40 %	40 %	0 %	189347580
45110	NC_010803	CTG	2	6	2321011	2321016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347580
45111	NC_010803	GGAT	2	8	2321022	2321029	25 %	25 %	50 %	0 %	189347580
45112	NC_010803	TTCA	2	8	2321252	2321259	25 %	50 %	0 %	25 %	189347580
45113	NC_010803	TCA	2	6	2321337	2321342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347580
45114	NC_010803	CAA	2	6	2321345	2321350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189347580
45115	NC_010803	T	7	7	2321441	2321447	0 %	100 %	0 %	0 %	189347580
45116	NC_010803	TTTC	2	8	2321458	2321465	0 %	75 %	0 %	25 %	189347580
45117	NC_010803	CTT	2	6	2321536	2321541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189347580
45118	NC_010803	TCA	2	6	2321652	2321657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347580
45119	NC_010803	CT	3	6	2321720	2321725	0 %	50 %	0 %	50 %	189347580
45120	NC_010803	TTC	2	6	2321801	2321806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189347580
45121	NC_010803	ATA	2	6	2321848	2321853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189347580
45122	NC_010803	TCA	2	6	2321892	2321897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347580
45123	NC_010803	T	6	6	2321900	2321905	0 %	100 %	0 %	0 %	189347580
45124	NC_010803	GGC	2	6	2321945	2321950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189347580
45125	NC_010803	AGC	2	6	2322054	2322059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347580
45126	NC_010803	CTTT	2	8	2322180	2322187	0 %	75 %	0 %	25 %	189347580
45127	NC_010803	AAGT	2	8	2322308	2322315	50 %	25 %	25 %	0 %	189347580
45128	NC_010803	CCT	2	6	2322337	2322342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189347580
45129	NC_010803	CAT	2	6	2322406	2322411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347580
45130	NC_010803	CT	3	6	2322549	2322554	0 %	50 %	0 %	50 %	189347580
45131	NC_010803	A	7	7	2322602	2322608	100 %	0 %	0 %	0 %	189347580
45132	NC_010803	CTT	2	6	2322611	2322616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189347580
45133	NC_010803	CATTC	2	10	2322619	2322628	20 %	40 %	0 %	40 %	189347580
45134	NC_010803	CTTT	2	8	2322632	2322639	0 %	75 %	0 %	25 %	189347580
45135	NC_010803	TGT	2	6	2322749	2322754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189347580
45136	NC_010803	CGA	2	6	2322921	2322926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347580
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45138	NC_010803	TAA	3	9	2323064	2323072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189347580
45139	NC_010803	CT	3	6	2323086	2323091	0 %	50 %	0 %	50 %	189347580
45140	NC_010803	CAT	3	9	2323111	2323119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347580
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45143	NC_010803	CTA	2	6	2323327	2323332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347580
45144	NC_010803	A	7	7	2323344	2323350	100 %	0 %	0 %	0 %	189347580
45145	NC_010803	TCT	2	6	2323458	2323463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189347580
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45148	NC_010803	A	6	6	2323610	2323615	100 %	0 %	0 %	0 %	189347580
45149	NC_010803	GTC	2	6	2323648	2323653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347580
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45152	NC_010803	GA	3	6	2324112	2324117	50 %	0 %	50 %	0 %	189347580
45153	NC_010803	GCT	2	6	2324139	2324144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347580
45154	NC_010803	T	6	6	2324155	2324160	0 %	100 %	0 %	0 %	189347580
45155	NC_010803	CT	3	6	2324199	2324204	0 %	50 %	0 %	50 %	189347580
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45234	NC_010803	GAC	2	6	2328799	2328804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347581
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45237	NC_010803	TCGG	2	8	2328974	2328981	0 %	25 %	50 %	25 %	189347581
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45239	NC_010803	GAG	2	6	2329036	2329041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189347581
45240	NC_010803	GCA	2	6	2329122	2329127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347581
45241	NC_010803	AGA	2	6	2329181	2329186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189347581
45242	NC_010803	GATA	2	8	2329248	2329255	50 %	25 %	25 %	0 %	189347581
45243	NC_010803	TTC	2	6	2329276	2329281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189347581
45244	NC_010803	TCG	2	6	2329334	2329339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347581
45245	NC_010803	ACC	2	6	2329429	2329434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189347581
45246	NC_010803	AGC	2	6	2329508	2329513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347581
45247	NC_010803	CGG	2	6	2329566	2329571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189347581
45248	NC_010803	TCA	2	6	2329661	2329666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347581
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45251	NC_010803	CAT	2	6	2329764	2329769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347581
45252	NC_010803	ATCG	2	8	2329798	2329805	25 %	25 %	25 %	25 %	189347581
45253	NC_010803	CA	3	6	2329837	2329842	50 %	0 %	0 %	50 %	189347581
45254	NC_010803	GGT	2	6	2329843	2329848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189347581
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45258	NC_010803	GGGT	2	8	2330111	2330118	0 %	25 %	75 %	0 %	189347581
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45265	NC_010803	TCGA	2	8	2330503	2330510	25 %	25 %	25 %	25 %	189347581
45266	NC_010803	TCC	2	6	2330511	2330516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189347581
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45269	NC_010803	ACTG	2	8	2330757	2330764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45270	NC_010803	TTGA	2	8	2330896	2330903	25 %	50 %	25 %	0 %	189347582
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45301	NC_010803	T	6	6	2332694	2332699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45302	NC_010803	CATC	2	8	2332720	2332727	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45303	NC_010803	TCT	2	6	2332764	2332769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45312	NC_010803	A	6	6	2333131	2333136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45318	NC_010803	GCT	2	6	2333352	2333357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347587
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45322	NC_010803	CTG	2	6	2333428	2333433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347587
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45328	NC_010803	A	7	7	2333879	2333885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45329	NC_010803	GCA	2	6	2333907	2333912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347588
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45341	NC_010803	CAG	2	6	2334803	2334808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347588
45342	NC_010803	AAT	2	6	2334954	2334959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189347588
45343	NC_010803	AGATTC	2	12	2334974	2334985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45344	NC_010803	ACG	2	6	2334988	2334993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45345	NC_010803	CA	3	6	2335039	2335044	50 %	0 %	0 %	50 %	189347589
45346	NC_010803	CCG	2	6	2335061	2335066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189347589
45347	NC_010803	AAG	2	6	2335081	2335086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189347589
45348	NC_010803	T	6	6	2335119	2335124	0 %	100 %	0 %	0 %	189347589
45349	NC_010803	TCG	2	6	2335289	2335294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347589
45350	NC_010803	CGG	2	6	2335314	2335319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189347589
45351	NC_010803	A	7	7	2335320	2335326	100 %	0 %	0 %	0 %	189347589
45352	NC_010803	GA	3	6	2335338	2335343	50 %	0 %	50 %	0 %	189347589
45353	NC_010803	GCC	2	6	2335412	2335417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189347589
45354	NC_010803	GAT	2	6	2335431	2335436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189347589
45355	NC_010803	AG	3	6	2335474	2335479	50 %	0 %	50 %	0 %	189347589
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45357	NC_010803	GCTG	2	8	2335528	2335535	0 %	25 %	50 %	25 %	189347589
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45461	NC_010803	A	6	6	2341523	2341528	100 %	0 %	0 %	0 %	189347594
45462	NC_010803	AG	3	6	2341554	2341559	50 %	0 %	50 %	0 %	189347594
45463	NC_010803	TACCC	2	10	2341569	2341578	20 %	20 %	0 %	60 %	189347594
45464	NC_010803	CT	3	6	2341608	2341613	0 %	50 %	0 %	50 %	189347594
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45476	NC_010803	ATC	2	6	2342137	2342142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347595
45477	NC_010803	AG	3	6	2342143	2342148	50 %	0 %	50 %	0 %	189347595
45478	NC_010803	CTG	3	9	2342242	2342250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347596
45479	NC_010803	ACGC	2	8	2342387	2342394	25 %	0 %	25 %	50 %	189347596
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45481	NC_010803	TGGG	2	8	2342456	2342463	0 %	25 %	75 %	0 %	189347596
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