MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 53629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_010803	GCC	2	6	2262435	2262440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189347531
44002	NC_010803	CTG	2	6	2262512	2262517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347531
44003	NC_010803	GCT	2	6	2262518	2262523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347531
44004	NC_010803	CTT	2	6	2262533	2262538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189347531
44005	NC_010803	ATG	2	6	2262610	2262615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189347531
44006	NC_010803	TGC	2	6	2262733	2262738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347531
44007	NC_010803	GGA	2	6	2262741	2262746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189347531
44008	NC_010803	GCT	2	6	2262764	2262769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347531
44009	NC_010803	GCCT	2	8	2262945	2262952	0 %	25 %	25 %	50 %	189347531
44010	NC_010803	CGA	2	6	2263049	2263054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347531
44011	NC_010803	TC	3	6	2263064	2263069	0 %	50 %	0 %	50 %	189347531
44012	NC_010803	ACA	2	6	2263087	2263092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189347531
44013	NC_010803	GAA	2	6	2263134	2263139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189347531
44014	NC_010803	AG	3	6	2263207	2263212	50 %	0 %	50 %	0 %	189347531
44015	NC_010803	CGA	2	6	2263253	2263258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347531
44016	NC_010803	GGAA	2	8	2263391	2263398	50 %	0 %	50 %	0 %	189347531
44017	NC_010803	A	6	6	2263483	2263488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44018	NC_010803	A	6	6	2263513	2263518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44019	NC_010803	CCT	2	6	2263580	2263585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189347532
44020	NC_010803	GCAAGC	2	12	2263664	2263675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347532
44021	NC_010803	CGG	2	6	2263725	2263730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189347532
44022	NC_010803	AGC	2	6	2263751	2263756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347532
44023	NC_010803	TTCCA	2	10	2263768	2263777	20 %	40 %	0 %	40 %	189347532
44024	NC_010803	GATG	2	8	2263896	2263903	25 %	25 %	50 %	0 %	189347532
44025	NC_010803	ATA	2	6	2263909	2263914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189347532
44026	NC_010803	CCA	2	6	2263920	2263925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189347532
44027	NC_010803	A	8	8	2263949	2263956	100 %	0 %	0 %	0 %	189347532
44028	NC_010803	AGC	2	6	2263964	2263969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347532
44029	NC_010803	GCC	2	6	2264006	2264011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189347532
44030	NC_010803	GCA	2	6	2264046	2264051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347532
44031	NC_010803	ATC	2	6	2264117	2264122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347532
44032	NC_010803	GCC	2	6	2264157	2264162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189347533
44033	NC_010803	ATC	2	6	2264382	2264387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347533
44034	NC_010803	CG	3	6	2264393	2264398	0 %	0 %	50 %	50 %	189347533
44035	NC_010803	ATG	2	6	2264435	2264440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189347533
44036	NC_010803	GCCGC	2	10	2264485	2264494	0 %	0 %	40 %	60 %	189347533
44037	NC_010803	AGC	2	6	2264550	2264555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347533
44038	NC_010803	CGT	2	6	2264612	2264617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347533
44039	NC_010803	GCA	2	6	2264644	2264649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347533
44040	NC_010803	GAC	2	6	2264729	2264734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347533
44041	NC_010803	TGA	2	6	2264782	2264787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189347533
44042	NC_010803	CTG	2	6	2264798	2264803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347533
44043	NC_010803	TTC	2	6	2264809	2264814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189347533
44044	NC_010803	T	7	7	2264843	2264849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44045	NC_010803	TCG	2	6	2264914	2264919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347534
44046	NC_010803	T	7	7	2264959	2264965	0 %	100 %	0 %	0 %	189347534
44047	NC_010803	AAT	2	6	2264967	2264972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189347534
44048	NC_010803	TCAG	2	8	2265049	2265056	25 %	25 %	25 %	25 %	189347534
44049	NC_010803	CTG	2	6	2265147	2265152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347534
44050	NC_010803	TGA	2	6	2265170	2265175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189347534
44051	NC_010803	GC	3	6	2265176	2265181	0 %	0 %	50 %	50 %	189347534
44052	NC_010803	TCC	2	6	2265370	2265375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189347534
44053	NC_010803	GAT	2	6	2265432	2265437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189347534
44054	NC_010803	TA	3	6	2265447	2265452	50 %	50 %	0 %	0 %	189347534
44055	NC_010803	TGA	2	6	2265497	2265502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189347534
44056	NC_010803	TTC	2	6	2265568	2265573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189347534
44057	NC_010803	CTC	2	6	2265576	2265581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189347534
44058	NC_010803	T	6	6	2265632	2265637	0 %	100 %	0 %	0 %	189347534
44059	NC_010803	CTC	2	6	2265681	2265686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189347534
44060	NC_010803	GAA	2	6	2265697	2265702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189347534
44061	NC_010803	TCA	2	6	2265712	2265717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347534
44062	NC_010803	TTC	2	6	2265751	2265756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189347534
44063	NC_010803	CAT	2	6	2265768	2265773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347534
44064	NC_010803	AGC	2	6	2265782	2265787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44065	NC_010803	T	6	6	2265811	2265816	0 %	100 %	0 %	0 %	189347535
44066	NC_010803	CGT	2	6	2265885	2265890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347535
44067	NC_010803	AGC	2	6	2265893	2265898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347535
44068	NC_010803	CTT	2	6	2265979	2265984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189347535
44069	NC_010803	TG	3	6	2266001	2266006	0 %	50 %	50 %	0 %	189347535
44070	NC_010803	AGC	2	6	2266100	2266105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347535
44071	NC_010803	ATA	2	6	2266126	2266131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189347535
44072	NC_010803	CGG	2	6	2266161	2266166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189347535
44073	NC_010803	TAA	2	6	2266185	2266190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189347535
44074	NC_010803	ATA	2	6	2266214	2266219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189347535
44075	NC_010803	TTGA	2	8	2266353	2266360	25 %	50 %	25 %	0 %	189347535
44076	NC_010803	TAT	2	6	2266410	2266415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189347535
44077	NC_010803	ATCGAT	2	12	2266468	2266479	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189347535
44078	NC_010803	GTT	2	6	2266535	2266540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189347535
44079	NC_010803	AGCA	2	8	2266590	2266597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44080	NC_010803	CAG	2	6	2266608	2266613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44082	NC_010803	CCG	2	6	2266762	2266767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189347536
44083	NC_010803	GAT	2	6	2266775	2266780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189347536
44084	NC_010803	TCG	2	6	2266800	2266805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347536
44085	NC_010803	GAA	2	6	2266857	2266862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189347536
44086	NC_010803	CGGAA	2	10	2266863	2266872	40 %	0 %	40 %	20 %	189347536
44087	NC_010803	GAT	2	6	2266876	2266881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189347536
44088	NC_010803	AC	3	6	2266960	2266965	50 %	0 %	0 %	50 %	189347536
44089	NC_010803	ACG	2	6	2267026	2267031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347536
44090	NC_010803	TCA	2	6	2267232	2267237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347536
44091	NC_010803	ACG	2	6	2267296	2267301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44092	NC_010803	CTG	2	6	2267368	2267373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44093	NC_010803	GAG	2	6	2267403	2267408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44094	NC_010803	T	7	7	2267527	2267533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44095	NC_010803	GC	3	6	2267618	2267623	0 %	0 %	50 %	50 %	189347537
44096	NC_010803	TGCC	2	8	2267648	2267655	0 %	25 %	25 %	50 %	189347537
44097	NC_010803	TCGATT	2	12	2267753	2267764	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189347537
44098	NC_010803	GCA	2	6	2267766	2267771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347537
44099	NC_010803	CTG	2	6	2267776	2267781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347537
44100	NC_010803	AAG	2	6	2267794	2267799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189347537
44101	NC_010803	CGG	2	6	2267828	2267833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189347537
44102	NC_010803	GAG	2	6	2267854	2267859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189347537
44103	NC_010803	GCT	2	6	2267883	2267888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347537
44104	NC_010803	GCT	2	6	2267892	2267897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347537
44105	NC_010803	AGCG	2	8	2267946	2267953	25 %	0 %	50 %	25 %	189347537
44106	NC_010803	GAA	2	6	2267988	2267993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189347537
44107	NC_010803	TA	3	6	2268022	2268027	50 %	50 %	0 %	0 %	189347537
44108	NC_010803	GAC	2	6	2268076	2268081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347537
44109	NC_010803	CTG	2	6	2268103	2268108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347537
44110	NC_010803	GCT	3	9	2268117	2268125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347537
44111	NC_010803	CGC	2	6	2268128	2268133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189347537
44112	NC_010803	A	6	6	2268139	2268144	100 %	0 %	0 %	0 %	189347537
44113	NC_010803	AGG	2	6	2268317	2268322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189347537
44114	NC_010803	CGG	2	6	2268345	2268350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189347537
44115	NC_010803	GAA	2	6	2268364	2268369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189347537
44116	NC_010803	A	7	7	2268402	2268408	100 %	0 %	0 %	0 %	189347537
44117	NC_010803	GTG	2	6	2268424	2268429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189347537
44118	NC_010803	TTC	2	6	2268469	2268474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189347537
44119	NC_010803	TCA	2	6	2268521	2268526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347537
44120	NC_010803	GCG	2	6	2268533	2268538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189347537
44121	NC_010803	TCA	2	6	2268566	2268571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347537
44122	NC_010803	CGCT	2	8	2268574	2268581	0 %	25 %	25 %	50 %	189347537
44123	NC_010803	CGG	2	6	2268654	2268659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189347537
44124	NC_010803	CAT	2	6	2268725	2268730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347537
44125	NC_010803	TGC	2	6	2268776	2268781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347537
44126	NC_010803	TGC	2	6	2268803	2268808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347537
44127	NC_010803	CTG	2	6	2268814	2268819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347537
44128	NC_010803	CGGGC	2	10	2268823	2268832	0 %	0 %	60 %	40 %	189347537
44129	NC_010803	TCG	2	6	2268847	2268852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347537
44130	NC_010803	GCT	2	6	2268915	2268920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347537
44131	NC_010803	CTG	3	9	2268950	2268958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44132	NC_010803	GCC	3	9	2269046	2269054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189347538
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44139	NC_010803	GACG	2	8	2269573	2269580	25 %	0 %	50 %	25 %	189347538
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44143	NC_010803	GGA	2	6	2269730	2269735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189347538
44144	NC_010803	GGCT	2	8	2269736	2269743	0 %	25 %	50 %	25 %	189347538
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44186	NC_010803	GCA	2	6	2271845	2271850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347540
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44193	NC_010803	CGC	2	6	2272495	2272500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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44206	NC_010803	GCG	2	6	2273075	2273080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189347541
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44211	NC_010803	GC	3	6	2273247	2273252	0 %	0 %	50 %	50 %	189347541
44212	NC_010803	ACG	2	6	2273358	2273363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347541
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44219	NC_010803	TCA	2	6	2273628	2273633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347541
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44224	NC_010803	TGA	2	6	2273742	2273747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189347541
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44227	NC_010803	TCCC	2	8	2274048	2274055	0 %	25 %	0 %	75 %	189347541
44228	NC_010803	ATT	2	6	2274062	2274067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189347541
44229	NC_010803	CGA	2	6	2274103	2274108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347541
44230	NC_010803	ACA	2	6	2274111	2274116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189347541
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44232	NC_010803	TCCTTC	2	12	2274203	2274214	0 %	50 %	0 %	50 %	189347541
44233	NC_010803	CATG	2	8	2274241	2274248	25 %	25 %	25 %	25 %	189347541
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44350	NC_010803	AG	3	6	2280580	2280585	50 %	0 %	50 %	0 %	189347547
44351	NC_010803	CAC	2	6	2280603	2280608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189347547
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44354	NC_010803	T	6	6	2280764	2280769	0 %	100 %	0 %	0 %	189347547
44355	NC_010803	GCC	2	6	2280792	2280797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189347547
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44404	NC_010803	T	8	8	2283591	2283598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44448	NC_010803	C	6	6	2285790	2285795	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44449	NC_010803	CAA	2	6	2285843	2285848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44451	NC_010803	ACG	2	6	2285925	2285930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44452	NC_010803	GA	3	6	2285949	2285954	50 %	0 %	50 %	0 %	189347553
44453	NC_010803	CATCG	2	10	2285960	2285969	20 %	20 %	20 %	40 %	189347553
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44460	NC_010803	CGT	2	6	2286274	2286279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347553
44461	NC_010803	CTC	2	6	2286296	2286301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189347553
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44463	NC_010803	T	6	6	2286452	2286457	0 %	100 %	0 %	0 %	189347553
44464	NC_010803	GCCT	2	8	2286494	2286501	0 %	25 %	25 %	50 %	189347553
44465	NC_010803	TCA	2	6	2286653	2286658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44466	NC_010803	A	6	6	2286669	2286674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44467	NC_010803	TATTT	2	10	2286758	2286767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44468	NC_010803	AGT	2	6	2286775	2286780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44469	NC_010803	GAAG	2	8	2286789	2286796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44470	NC_010803	GT	3	6	2286798	2286803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44471	NC_010803	AGA	2	6	2286922	2286927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44472	NC_010803	GAA	2	6	2286958	2286963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44473	NC_010803	CAGGT	2	10	2286978	2286987	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44474	NC_010803	CAG	2	6	2287017	2287022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44475	NC_010803	TGT	2	6	2287042	2287047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44476	NC_010803	A	6	6	2287078	2287083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44477	NC_010803	GCGCG	2	10	2287101	2287110	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44478	NC_010803	TCC	2	6	2287114	2287119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44479	NC_010803	CCGA	2	8	2287153	2287160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44480	NC_010803	T	6	6	2287318	2287323	0 %	100 %	0 %	0 %	189347554
44481	NC_010803	GCG	2	6	2287358	2287363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189347554
44482	NC_010803	GCT	2	6	2287391	2287396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189347554
44483	NC_010803	CAC	2	6	2287440	2287445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189347554
44484	NC_010803	TGA	2	6	2287488	2287493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189347554
44485	NC_010803	TC	3	6	2287599	2287604	0 %	50 %	0 %	50 %	189347554
44486	NC_010803	GGC	2	6	2287633	2287638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189347554
44487	NC_010803	CCT	2	6	2287645	2287650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189347554
44488	NC_010803	ATA	2	6	2287785	2287790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189347554
44489	NC_010803	CTCGGA	2	12	2287814	2287825	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189347554
44490	NC_010803	TGAA	2	8	2287872	2287879	50 %	25 %	25 %	0 %	189347554
44491	NC_010803	TCA	2	6	2287953	2287958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347554
44492	NC_010803	T	8	8	2287977	2287984	0 %	100 %	0 %	0 %	189347554
44493	NC_010803	A	6	6	2287995	2288000	100 %	0 %	0 %	0 %	189347554
44494	NC_010803	ATC	2	6	2288021	2288026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189347554
44495	NC_010803	CGG	2	6	2288126	2288131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189347554
44496	NC_010803	AGC	2	6	2288265	2288270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189347555
44497	NC_010803	GGT	2	6	2288275	2288280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189347555
44498	NC_010803	GAA	2	6	2288410	2288415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189347555
44499	NC_010803	GCG	2	6	2288467	2288472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189347555
44500	NC_010803	TGCC	2	8	2288521	2288528	0 %	25 %	25 %	50 %	189347555

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