MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 53629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010803	GATA	2	8	315634	315641	50 %	25 %	25 %	0 %	189345822
6002	NC_010803	GCA	2	6	315646	315651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345822
6003	NC_010803	GCA	2	6	315694	315699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345822
6004	NC_010803	T	6	6	315707	315712	0 %	100 %	0 %	0 %	189345822
6005	NC_010803	CCCA	2	8	315716	315723	25 %	0 %	0 %	75 %	189345822
6006	NC_010803	A	6	6	315868	315873	100 %	0 %	0 %	0 %	189345822
6007	NC_010803	CAT	2	6	315896	315901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345822
6008	NC_010803	TAA	2	6	315905	315910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345822
6009	NC_010803	T	7	7	315960	315966	0 %	100 %	0 %	0 %	189345822
6010	NC_010803	TTG	2	6	315979	315984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345822
6011	NC_010803	ATA	2	6	315997	316002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345822
6012	NC_010803	ATC	2	6	316023	316028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345822
6013	NC_010803	T	6	6	316034	316039	0 %	100 %	0 %	0 %	189345822
6014	NC_010803	T	6	6	316080	316085	0 %	100 %	0 %	0 %	189345822
6015	NC_010803	TCATG	2	10	316127	316136	20 %	40 %	20 %	20 %	189345822
6016	NC_010803	ATG	2	6	316151	316156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345822
6017	NC_010803	TGCG	2	8	316163	316170	0 %	25 %	50 %	25 %	189345822
6018	NC_010803	ATT	2	6	316186	316191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345822
6019	NC_010803	TA	3	6	316214	316219	50 %	50 %	0 %	0 %	189345822
6020	NC_010803	AAT	2	6	316256	316261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345822
6021	NC_010803	CCA	2	6	316272	316277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345822
6022	NC_010803	TAT	3	9	316301	316309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345822
6023	NC_010803	ATC	2	6	316321	316326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345822
6024	NC_010803	GTC	2	6	316344	316349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345822
6025	NC_010803	A	6	6	316353	316358	100 %	0 %	0 %	0 %	189345822
6026	NC_010803	TTC	2	6	316437	316442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345822
6027	NC_010803	GAA	2	6	316492	316497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345822
6028	NC_010803	TAT	2	6	316530	316535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345822
6029	NC_010803	TA	3	6	316602	316607	50 %	50 %	0 %	0 %	189345822
6030	NC_010803	AT	3	6	316720	316725	50 %	50 %	0 %	0 %	189345822
6031	NC_010803	ATTTT	2	10	316777	316786	20 %	80 %	0 %	0 %	189345822
6032	NC_010803	GTTT	2	8	316796	316803	0 %	75 %	25 %	0 %	189345822
6033	NC_010803	ATT	2	6	316812	316817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345822
6034	NC_010803	TTC	2	6	316833	316838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345822
6035	NC_010803	ATG	2	6	316839	316844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345822
6036	NC_010803	T	8	8	316895	316902	0 %	100 %	0 %	0 %	189345822
6037	NC_010803	T	7	7	316904	316910	0 %	100 %	0 %	0 %	189345822
6038	NC_010803	T	8	8	316912	316919	0 %	100 %	0 %	0 %	189345822
6039	NC_010803	A	7	7	316938	316944	100 %	0 %	0 %	0 %	189345822
6040	NC_010803	TGT	2	6	317000	317005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345823
6041	NC_010803	TAT	2	6	317017	317022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345823
6042	NC_010803	T	6	6	317026	317031	0 %	100 %	0 %	0 %	189345823
6043	NC_010803	AT	3	6	317034	317039	50 %	50 %	0 %	0 %	189345823
6044	NC_010803	AT	3	6	317056	317061	50 %	50 %	0 %	0 %	189345823
6045	NC_010803	ATA	2	6	317223	317228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345823
6046	NC_010803	CCTC	2	8	317241	317248	0 %	25 %	0 %	75 %	189345823
6047	NC_010803	T	7	7	317350	317356	0 %	100 %	0 %	0 %	189345823
6048	NC_010803	TTA	2	6	317364	317369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345823
6049	NC_010803	TAT	2	6	317384	317389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345823
6050	NC_010803	T	8	8	317495	317502	0 %	100 %	0 %	0 %	189345823
6051	NC_010803	TAT	2	6	317549	317554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345823
6052	NC_010803	AAGTC	2	10	317566	317575	40 %	20 %	20 %	20 %	189345823
6053	NC_010803	A	7	7	317667	317673	100 %	0 %	0 %	0 %	189345823
6054	NC_010803	T	6	6	317681	317686	0 %	100 %	0 %	0 %	189345823
6055	NC_010803	T	6	6	317845	317850	0 %	100 %	0 %	0 %	189345823
6056	NC_010803	T	6	6	317852	317857	0 %	100 %	0 %	0 %	189345823
6057	NC_010803	AT	4	8	318010	318017	50 %	50 %	0 %	0 %	189345823
6058	NC_010803	AT	3	6	318088	318093	50 %	50 %	0 %	0 %	189345823
6059	NC_010803	TTTC	2	8	318112	318119	0 %	75 %	0 %	25 %	189345823
6060	NC_010803	AGC	2	6	318144	318149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345824
6061	NC_010803	CAT	3	9	318176	318184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345824
6062	NC_010803	ATA	2	6	318279	318284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345824
6063	NC_010803	AAT	2	6	318305	318310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345824
6064	NC_010803	TATT	2	8	318362	318369	25 %	75 %	0 %	0 %	189345824
6065	NC_010803	ATTC	2	8	318377	318384	25 %	50 %	0 %	25 %	189345824
6066	NC_010803	GAT	2	6	318404	318409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345824
6067	NC_010803	TGG	2	6	318428	318433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345824
6068	NC_010803	GTT	2	6	318471	318476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345824
6069	NC_010803	AT	3	6	318488	318493	50 %	50 %	0 %	0 %	189345824
6070	NC_010803	TATT	3	12	318511	318522	25 %	75 %	0 %	0 %	189345824
6071	NC_010803	T	7	7	318521	318527	0 %	100 %	0 %	0 %	189345824
6072	NC_010803	TGA	2	6	318532	318537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345824
6073	NC_010803	CAT	2	6	318561	318566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345824
6074	NC_010803	TTATAT	2	12	318568	318579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345824
6075	NC_010803	TCT	2	6	318682	318687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345824
6076	NC_010803	T	6	6	318779	318784	0 %	100 %	0 %	0 %	189345824
6077	NC_010803	TCT	2	6	318820	318825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345824
6078	NC_010803	T	7	7	318931	318937	0 %	100 %	0 %	0 %	189345824
6079	NC_010803	T	7	7	318965	318971	0 %	100 %	0 %	0 %	189345824
6080	NC_010803	TGA	2	6	319049	319054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345824
6081	NC_010803	TCA	2	6	319057	319062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345824
6082	NC_010803	CAA	2	6	319079	319084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345824
6083	NC_010803	TGCAG	2	10	319104	319113	20 %	20 %	40 %	20 %	189345824
6084	NC_010803	ACG	2	6	319179	319184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345824
6085	NC_010803	TCCAA	2	10	319191	319200	40 %	20 %	0 %	40 %	189345824
6086	NC_010803	ATTT	2	8	319227	319234	25 %	75 %	0 %	0 %	189345824
6087	NC_010803	GCG	2	6	319250	319255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345824
6088	NC_010803	ATT	2	6	319297	319302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345824
6089	NC_010803	A	7	7	319318	319324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_010803	GCT	2	6	319347	319352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_010803	ATT	2	6	319354	319359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_010803	TAT	2	6	319430	319435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_010803	TCAT	2	8	319458	319465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6094	NC_010803	ATG	2	6	319507	319512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_010803	ATG	2	6	319569	319574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_010803	A	6	6	319627	319632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_010803	CAG	2	6	319664	319669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345825
6098	NC_010803	TG	3	6	319741	319746	0 %	50 %	50 %	0 %	189345825
6099	NC_010803	CAG	2	6	319859	319864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345825
6100	NC_010803	CGA	2	6	319876	319881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345825
6101	NC_010803	AAT	2	6	319922	319927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345825
6102	NC_010803	TC	3	6	319997	320002	0 %	50 %	0 %	50 %	189345825
6103	NC_010803	TTC	2	6	320033	320038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345825
6104	NC_010803	CCT	2	6	320058	320063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345825
6105	NC_010803	ACG	2	6	320101	320106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345825
6106	NC_010803	TGA	2	6	320107	320112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345825
6107	NC_010803	GA	3	6	320128	320133	50 %	0 %	50 %	0 %	189345825
6108	NC_010803	TGG	2	6	320141	320146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345825
6109	NC_010803	TG	4	8	320223	320230	0 %	50 %	50 %	0 %	189345825
6110	NC_010803	ATG	2	6	320310	320315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345825
6111	NC_010803	TTG	2	6	320332	320337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345825
6112	NC_010803	GGT	2	6	320341	320346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345825
6113	NC_010803	GTAG	2	8	320462	320469	25 %	25 %	50 %	0 %	189345825
6114	NC_010803	TGC	2	6	320511	320516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345825
6115	NC_010803	AGA	2	6	320541	320546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345825
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6117	NC_010803	CTG	2	6	320612	320617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345825
6118	NC_010803	T	6	6	320624	320629	0 %	100 %	0 %	0 %	189345825
6119	NC_010803	GCA	2	6	320641	320646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345825
6120	NC_010803	GTT	2	6	320674	320679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345825
6121	NC_010803	T	6	6	320678	320683	0 %	100 %	0 %	0 %	189345825
6122	NC_010803	T	6	6	320724	320729	0 %	100 %	0 %	0 %	189345826
6123	NC_010803	AGC	2	6	320747	320752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345826
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6125	NC_010803	CT	3	6	320791	320796	0 %	50 %	0 %	50 %	189345826
6126	NC_010803	GAT	2	6	320836	320841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345826
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6229	NC_010803	GTCGA	2	10	326458	326467	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6230	NC_010803	TGC	2	6	326509	326514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345832
6231	NC_010803	A	8	8	326595	326602	100 %	0 %	0 %	0 %	189345832
6232	NC_010803	CAGC	2	8	326728	326735	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6233	NC_010803	GCAG	2	8	326765	326772	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6234	NC_010803	AGCTCC	2	12	326837	326848	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6235	NC_010803	A	6	6	326902	326907	100 %	0 %	0 %	0 %	189345833
6236	NC_010803	TGC	2	6	326916	326921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345833
6237	NC_010803	CCT	2	6	326939	326944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345833
6238	NC_010803	TCGAC	2	10	326989	326998	20 %	20 %	20 %	40 %	189345833
6239	NC_010803	CAG	2	6	327067	327072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345833
6240	NC_010803	CAAG	2	8	327094	327101	50 %	0 %	25 %	25 %	189345833
6241	NC_010803	CAAGCG	2	12	327136	327147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345833
6242	NC_010803	T	7	7	327254	327260	0 %	100 %	0 %	0 %	189345833
6243	NC_010803	T	7	7	327293	327299	0 %	100 %	0 %	0 %	189345833
6244	NC_010803	T	6	6	327345	327350	0 %	100 %	0 %	0 %	189345833
6245	NC_010803	A	6	6	327377	327382	100 %	0 %	0 %	0 %	189345833
6246	NC_010803	CTTC	2	8	327456	327463	0 %	50 %	0 %	50 %	189345833
6247	NC_010803	CGAA	2	8	327519	327526	50 %	0 %	25 %	25 %	189345833
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6493	NC_010803	AG	3	6	339238	339243	50 %	0 %	50 %	0 %	189345845
6494	NC_010803	AAC	2	6	339260	339265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345845
6495	NC_010803	CTG	2	6	339348	339353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345846
6496	NC_010803	CTGGA	2	10	339366	339375	20 %	20 %	40 %	20 %	189345846
6497	NC_010803	GAG	2	6	339597	339602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345846
6498	NC_010803	CAG	2	6	339681	339686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345846
6499	NC_010803	GGC	2	6	339903	339908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345846
6500	NC_010803	CCTC	2	8	339916	339923	0 %	25 %	0 %	75 %	189345846

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