MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 107311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_010546	AAC	2	6	609701	609706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035522
13502	NC_010546	CAG	2	6	609750	609755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035522
13503	NC_010546	CGG	2	6	609759	609764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172035522
13504	NC_010546	ATT	2	6	609794	609799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035522
13505	NC_010546	TGG	2	6	609865	609870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035522
13506	NC_010546	CTAT	2	8	609897	609904	25 %	50 %	0 %	25 %	172035522
13507	NC_010546	GCA	2	6	610039	610044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035522
13508	NC_010546	ATT	2	6	610045	610050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035522
13509	NC_010546	AAG	2	6	610170	610175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035522
13510	NC_010546	AGA	2	6	610201	610206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035522
13511	NC_010546	T	6	6	610343	610348	0 %	100 %	0 %	0 %	172035522
13512	NC_010546	CGAT	2	8	610433	610440	25 %	25 %	25 %	25 %	172035522
13513	NC_010546	TGC	2	6	610468	610473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035522
13514	NC_010546	T	6	6	610517	610522	0 %	100 %	0 %	0 %	172035522
13515	NC_010546	TTA	2	6	610529	610534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035522
13516	NC_010546	A	6	6	610665	610670	100 %	0 %	0 %	0 %	172035522
13517	NC_010546	GAA	2	6	610727	610732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035522
13518	NC_010546	TGA	2	6	610831	610836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035522
13519	NC_010546	ATG	2	6	611001	611006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035522
13520	NC_010546	AAG	2	6	611016	611021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035522
13521	NC_010546	ATC	2	6	611026	611031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035522
13522	NC_010546	AGA	2	6	611047	611052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035522
13523	NC_010546	CTT	2	6	611135	611140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_010546	ATT	2	6	611163	611168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_010546	AAT	2	6	611182	611187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_010546	ATTC	2	8	611197	611204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13527	NC_010546	AG	3	6	611208	611213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_010546	A	8	8	611287	611294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_010546	CTTT	2	8	611366	611373	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13530	NC_010546	ACC	2	6	611388	611393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13531	NC_010546	TAT	2	6	611417	611422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035523
13532	NC_010546	GAA	2	6	611448	611453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035523
13533	NC_010546	TC	3	6	611459	611464	0 %	50 %	0 %	50 %	172035523
13534	NC_010546	AG	4	8	611471	611478	50 %	0 %	50 %	0 %	172035523
13535	NC_010546	TGA	2	6	611519	611524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035523
13536	NC_010546	TAA	2	6	611531	611536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035523
13537	NC_010546	GTG	2	6	611605	611610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035523
13538	NC_010546	GTT	2	6	611634	611639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035523
13539	NC_010546	GATT	2	8	611687	611694	25 %	50 %	25 %	0 %	172035523
13540	NC_010546	TCA	2	6	611726	611731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_010546	A	6	6	611906	611911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_010546	CCTA	2	8	611912	611919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13543	NC_010546	AGA	2	6	612068	612073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035524
13544	NC_010546	AACA	2	8	612074	612081	75 %	0 %	0 %	25 %	172035524
13545	NC_010546	CTT	2	6	612217	612222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035524
13546	NC_010546	TCT	2	6	612228	612233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035524
13547	NC_010546	TAA	2	6	612248	612253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035524
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13549	NC_010546	CTCC	2	8	612282	612289	0 %	25 %	0 %	75 %	172035524
13550	NC_010546	TAG	2	6	612311	612316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035524
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13556	NC_010546	ATT	2	6	612521	612526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035524
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13558	NC_010546	GAA	2	6	612705	612710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035524
13559	NC_010546	CAA	2	6	612738	612743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035524
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13571	NC_010546	CCA	2	6	613482	613487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035524
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13573	NC_010546	ACT	2	6	613588	613593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13574	NC_010546	CTT	2	6	613602	613607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13575	NC_010546	GAA	2	6	613616	613621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_010546	ATT	2	6	613638	613643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13582	NC_010546	CTG	2	6	613862	613867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035525
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13592	NC_010546	TAA	3	9	614359	614367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_010546	AGGTT	2	10	614465	614474	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_010546	TGA	2	6	614493	614498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13602	NC_010546	CGT	2	6	614847	614852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13603	NC_010546	ACGCA	2	10	614856	614865	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13604	NC_010546	T	6	6	614874	614879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_010546	ATA	2	6	614886	614891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_010546	ATT	2	6	615029	615034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_010546	TTGA	2	8	615092	615099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_010546	A	6	6	615099	615104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_010546	TAA	2	6	615116	615121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_010546	CGT	2	6	615134	615139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13611	NC_010546	TATAAG	2	12	615193	615204	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_010546	TAT	2	6	615229	615234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_010546	ATT	2	6	615241	615246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_010546	AAT	3	9	615305	615313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_010546	AGC	2	6	615329	615334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13618	NC_010546	CTTAT	2	10	615558	615567	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13619	NC_010546	TTG	2	6	615619	615624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035527
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13622	NC_010546	T	6	6	615783	615788	0 %	100 %	0 %	0 %	172035527
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13863	NC_010546	TAGA	2	8	625987	625994	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13988	NC_010546	ATC	2	6	632228	632233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035543
13989	NC_010546	A	6	6	632279	632284	100 %	0 %	0 %	0 %	172035543
13990	NC_010546	GCT	2	6	632298	632303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035543
13991	NC_010546	TTG	2	6	632318	632323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035543
13992	NC_010546	CTT	2	6	632329	632334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035543
13993	NC_010546	ATT	2	6	632363	632368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035543
13994	NC_010546	TAA	3	9	632375	632383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035543
13995	NC_010546	TAA	2	6	632387	632392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035543
13996	NC_010546	CT	3	6	632438	632443	0 %	50 %	0 %	50 %	172035543
13997	NC_010546	ATT	2	6	632444	632449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035543
13998	NC_010546	ATC	2	6	632456	632461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035543
13999	NC_010546	CTT	2	6	632509	632514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035543
14000	NC_010546	TTC	2	6	632539	632544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035543

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