MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 107311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010546	T	8	8	499099	499106	0 %	100 %	0 %	0 %	172035417
11002	NC_010546	CTT	2	6	499184	499189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_010546	T	6	6	499198	499203	0 %	100 %	0 %	0 %	172035418
11004	NC_010546	ACA	2	6	499233	499238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035418
11005	NC_010546	ATG	2	6	499274	499279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035418
11006	NC_010546	CAA	2	6	499307	499312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035418
11007	NC_010546	ATT	2	6	499319	499324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035418
11008	NC_010546	AACA	2	8	499356	499363	75 %	0 %	0 %	25 %	172035418
11009	NC_010546	GT	3	6	499373	499378	0 %	50 %	50 %	0 %	172035418
11010	NC_010546	AACC	2	8	499386	499393	50 %	0 %	0 %	50 %	172035418
11011	NC_010546	TTA	2	6	499436	499441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035418
11012	NC_010546	TGA	2	6	499462	499467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035418
11013	NC_010546	CAGT	2	8	499563	499570	25 %	25 %	25 %	25 %	172035418
11014	NC_010546	T	6	6	499600	499605	0 %	100 %	0 %	0 %	172035418
11015	NC_010546	AAG	2	6	499716	499721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035418
11016	NC_010546	A	7	7	499787	499793	100 %	0 %	0 %	0 %	172035418
11017	NC_010546	TTA	2	6	499823	499828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035418
11018	NC_010546	GCT	2	6	499874	499879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035418
11019	NC_010546	ATTCCC	2	12	499907	499918	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	172035418
11020	NC_010546	TAT	2	6	499996	500001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035418
11021	NC_010546	TGTT	2	8	500038	500045	0 %	75 %	25 %	0 %	172035418
11022	NC_010546	GTT	2	6	500097	500102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035418
11023	NC_010546	TAT	2	6	500103	500108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035418
11024	NC_010546	TTA	2	6	500146	500151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035418
11025	NC_010546	ATT	2	6	500185	500190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035418
11026	NC_010546	CCACAG	2	12	500274	500285	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	172035418
11027	NC_010546	CAT	2	6	500303	500308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035418
11028	NC_010546	GAT	2	6	500311	500316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035418
11029	NC_010546	AAG	2	6	500328	500333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035418
11030	NC_010546	TTG	2	6	500397	500402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035418
11031	NC_010546	AAG	2	6	500433	500438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035418
11032	NC_010546	GTT	2	6	500468	500473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035418
11033	NC_010546	AGGA	2	8	500529	500536	50 %	0 %	50 %	0 %	172035418
11034	NC_010546	AAC	2	6	500607	500612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035418
11035	NC_010546	CTT	2	6	500623	500628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035418
11036	NC_010546	A	8	8	500737	500744	100 %	0 %	0 %	0 %	172035419
11037	NC_010546	AGA	2	6	500789	500794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035419
11038	NC_010546	TGA	2	6	500816	500821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035419
11039	NC_010546	AT	3	6	500822	500827	50 %	50 %	0 %	0 %	172035419
11040	NC_010546	AGC	2	6	500870	500875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035419
11041	NC_010546	ATC	2	6	500899	500904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035419
11042	NC_010546	CCTGG	2	10	500922	500931	0 %	20 %	40 %	40 %	172035419
11043	NC_010546	ACC	2	6	500937	500942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035419
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11045	NC_010546	GTTA	2	8	501032	501039	25 %	50 %	25 %	0 %	172035419
11046	NC_010546	TATT	2	8	501061	501068	25 %	75 %	0 %	0 %	172035419
11047	NC_010546	GAA	2	6	501099	501104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035419
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11049	NC_010546	CCTA	2	8	501185	501192	25 %	25 %	0 %	50 %	172035419
11050	NC_010546	TAG	2	6	501202	501207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035419
11051	NC_010546	CAA	2	6	501211	501216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035419
11052	NC_010546	GAA	2	6	501291	501296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035419
11053	NC_010546	ATT	2	6	501306	501311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035419
11054	NC_010546	AACG	2	8	501313	501320	50 %	0 %	25 %	25 %	172035419
11055	NC_010546	ATT	2	6	501326	501331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035419
11056	NC_010546	TAC	2	6	501409	501414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035419
11057	NC_010546	TA	3	6	501429	501434	50 %	50 %	0 %	0 %	172035419
11058	NC_010546	A	6	6	501441	501446	100 %	0 %	0 %	0 %	172035419
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11061	NC_010546	AGC	2	6	501590	501595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035419
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11064	NC_010546	GAA	2	6	501729	501734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035419
11065	NC_010546	TTGT	2	8	501783	501790	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_010546	T	7	7	501842	501848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_010546	A	7	7	501864	501870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11071	NC_010546	GGAT	2	8	502061	502068	25 %	25 %	50 %	0 %	172035420
11072	NC_010546	T	7	7	502087	502093	0 %	100 %	0 %	0 %	172035420
11073	NC_010546	AGA	2	6	502096	502101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035420
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11077	NC_010546	T	7	7	502276	502282	0 %	100 %	0 %	0 %	172035420
11078	NC_010546	TAA	2	6	502285	502290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035420
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11080	NC_010546	TTTG	2	8	502318	502325	0 %	75 %	25 %	0 %	172035420
11081	NC_010546	ATA	2	6	502357	502362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_010546	TGA	2	6	502368	502373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_010546	GAG	2	6	502392	502397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_010546	AAT	2	6	502480	502485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035421
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11087	NC_010546	CCAT	2	8	502556	502563	25 %	25 %	0 %	50 %	172035421
11088	NC_010546	G	7	7	502577	502583	0 %	0 %	100 %	0 %	172035421
11089	NC_010546	AGA	2	6	502605	502610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035421
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11092	NC_010546	TCT	2	6	502715	502720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035421
11093	NC_010546	TTC	2	6	502741	502746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035421
11094	NC_010546	CTT	3	9	502812	502820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035421
11095	NC_010546	TCT	2	6	502856	502861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035421
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11103	NC_010546	GTTC	2	8	503352	503359	0 %	50 %	25 %	25 %	172035421
11104	NC_010546	T	7	7	503514	503520	0 %	100 %	0 %	0 %	172035421
11105	NC_010546	TTTA	2	8	503617	503624	25 %	75 %	0 %	0 %	172035421
11106	NC_010546	C	6	6	503649	503654	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11107	NC_010546	TTTA	2	8	503680	503687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_010546	TAAAA	2	10	503703	503712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_010546	TAA	2	6	503740	503745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035422
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11111	NC_010546	T	6	6	503784	503789	0 %	100 %	0 %	0 %	172035422
11112	NC_010546	CAT	2	6	503885	503890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035422
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11120	NC_010546	T	6	6	504340	504345	0 %	100 %	0 %	0 %	172035423
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11122	NC_010546	T	6	6	504419	504424	0 %	100 %	0 %	0 %	172035423
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11230	NC_010546	T	6	6	509304	509309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11231	NC_010546	TCA	2	6	509313	509318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11233	NC_010546	TAG	2	6	509402	509407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11236	NC_010546	A	7	7	509460	509466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11237	NC_010546	TCC	2	6	509500	509505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11238	NC_010546	ATA	2	6	509556	509561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11239	NC_010546	TA	3	6	509564	509569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11240	NC_010546	T	6	6	509646	509651	0 %	100 %	0 %	0 %	172035426
11241	NC_010546	GTTACC	2	12	509661	509672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	172035426
11242	NC_010546	CAA	2	6	509680	509685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035426
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