MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 114465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010520	AGAA	2	8	58591	58598	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_010520	TTCT	2	8	58604	58611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_010520	GA	3	6	58638	58643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_010520	TC	3	6	58648	58653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_010520	GAA	2	6	58845	58850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_010520	TAT	2	6	58944	58949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_010520	GGA	2	6	59008	59013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_010520	AGAA	2	8	59016	59023	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_010520	GCG	2	6	59042	59047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_010520	AGA	2	6	59108	59113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_010520	ACC	2	6	59244	59249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_010520	TAC	2	6	59263	59268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_010520	GGA	2	6	59558	59563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_010520	CGT	2	6	59671	59676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_010520	TAG	2	6	59721	59726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010520	TAAGT	2	10	59847	59856	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_010520	AGC	2	6	59903	59908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_010520	ACC	2	6	59982	59987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_010520	AGGT	2	8	60446	60453	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_010520	GAG	2	6	60454	60459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010520	GAA	2	6	60478	60483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_010520	CGG	2	6	60701	60706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_010520	TGCT	2	8	60833	60840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_010520	ACC	2	6	60972	60977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_010520	CGG	2	6	61000	61005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_010520	CCT	2	6	61060	61065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_010520	CG	3	6	61113	61118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_010520	GGT	2	6	61196	61201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_010520	TCG	2	6	61311	61316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_010520	CGT	2	6	61391	61396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_010520	GAG	2	6	61440	61445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_010520	GAA	2	6	61615	61620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_010520	TAA	2	6	61677	61682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_010520	AAAAT	2	10	61698	61707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_010520	AAAT	2	8	61743	61750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_010520	CCA	2	6	61944	61949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_010520	T	8	8	61973	61980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_010520	A	6	6	61993	61998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_010520	ATT	2	6	62022	62027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_010520	TGATT	2	10	62034	62043	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_010520	TTA	2	6	62108	62113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_010520	CAT	2	6	62168	62173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_010520	TATT	2	8	62178	62185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_010520	T	6	6	62184	62189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010520	CAGT	2	8	62215	62222	25 %	25 %	25 %	25 %	170761002
1546	NC_010520	ATT	2	6	62263	62268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761002
1547	NC_010520	TCTA	2	8	62273	62280	25 %	50 %	0 %	25 %	170761002
1548	NC_010520	AT	3	6	62296	62301	50 %	50 %	0 %	0 %	170761002
1549	NC_010520	T	6	6	62319	62324	0 %	100 %	0 %	0 %	170761002
1550	NC_010520	ATA	2	6	62325	62330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761002
1551	NC_010520	TTGA	2	8	62354	62361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_010520	ATT	2	6	62367	62372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_010520	AAG	2	6	62429	62434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_010520	AATT	2	8	62460	62467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_010520	TAA	2	6	62535	62540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_010520	GTAT	2	8	62603	62610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_010520	ACAT	2	8	62612	62619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_010520	TTAT	2	8	62634	62641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_010520	ATT	2	6	62670	62675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_010520	TTA	2	6	62691	62696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170758479
1561	NC_010520	ATT	2	6	62708	62713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170758479
1562	NC_010520	TTAT	2	8	62716	62723	25 %	75 %	0 %	0 %	170758479
1563	NC_010520	AGA	2	6	62775	62780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170758479
1564	NC_010520	A	6	6	62785	62790	100 %	0 %	0 %	0 %	170758479
1565	NC_010520	ACT	2	6	62815	62820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170758479
1566	NC_010520	AAT	2	6	62842	62847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758479
1567	NC_010520	GAAA	2	8	62865	62872	75 %	0 %	25 %	0 %	170758479
1568	NC_010520	AT	3	6	62903	62908	50 %	50 %	0 %	0 %	170758479
1569	NC_010520	TA	3	6	62911	62916	50 %	50 %	0 %	0 %	170758479
1570	NC_010520	ATG	2	6	62930	62935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170758479
1571	NC_010520	TCT	2	6	62946	62951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170758479
1572	NC_010520	ATT	2	6	62981	62986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170758479
1573	NC_010520	A	6	6	63036	63041	100 %	0 %	0 %	0 %	170758479
1574	NC_010520	A	7	7	63060	63066	100 %	0 %	0 %	0 %	170758479
1575	NC_010520	AATATG	2	12	63115	63126	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_010520	TGA	2	6	63168	63173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_010520	AAC	2	6	63193	63198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_010520	AAT	2	6	63218	63223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_010520	TAT	2	6	63236	63241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_010520	TAA	2	6	63251	63256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759492
1581	NC_010520	ACA	2	6	63265	63270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170759492
1582	NC_010520	AT	3	6	63306	63311	50 %	50 %	0 %	0 %	170759492
1583	NC_010520	AAAT	2	8	63326	63333	75 %	25 %	0 %	0 %	170759492
1584	NC_010520	GTATA	2	10	63355	63364	40 %	40 %	20 %	0 %	170759492
1585	NC_010520	ATA	2	6	63395	63400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_010520	TTATA	2	10	63427	63436	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_010520	TAAA	2	8	63458	63465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_010520	ATA	2	6	63479	63484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_010520	A	7	7	63512	63518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_010520	TAA	2	6	63519	63524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_010520	AT	3	6	63536	63541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_010520	ATA	2	6	63566	63571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_010520	TTA	3	9	63592	63600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_010520	GT	3	6	63694	63699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_010520	TTA	2	6	63757	63762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_010520	AT	3	6	63806	63811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_010520	TGA	2	6	63840	63845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_010520	AAG	2	6	63859	63864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_010520	A	6	6	63907	63912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_010520	GGC	2	6	64109	64114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_010520	CTTC	2	8	64146	64153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_010520	GCG	2	6	64167	64172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_010520	ATA	2	6	64245	64250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_010520	GA	3	6	64252	64257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_010520	GGTAA	2	10	64322	64331	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_010520	GCA	2	6	64419	64424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_010520	GCA	2	6	64459	64464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_010520	CGC	2	6	64466	64471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_010520	TGA	2	6	64477	64482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_010520	AGG	2	6	64535	64540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_010520	CAG	2	6	64562	64567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_010520	GAA	2	6	64754	64759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_010520	GGC	2	6	64773	64778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_010520	AGC	2	6	64982	64987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_010520	GAA	2	6	65017	65022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_010520	GGT	2	6	65090	65095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_010520	GTC	2	6	65104	65109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_010520	TCGTG	2	10	65113	65122	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1619	NC_010520	TTA	2	6	65161	65166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_010520	AGG	2	6	65214	65219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_010520	ATC	2	6	65239	65244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_010520	AC	3	6	65266	65271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_010520	GGTA	2	8	65282	65289	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_010520	AC	3	6	65435	65440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_010520	CCT	2	6	65576	65581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_010520	GAA	3	9	65597	65605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_010520	TTCT	2	8	65608	65615	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_010520	GA	3	6	65642	65647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_010520	TC	3	6	65652	65657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_010520	GAA	2	6	65849	65854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_010520	TAT	2	6	65948	65953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_010520	GGA	2	6	66012	66017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_010520	AGAA	2	8	66020	66027	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_010520	GCG	2	6	66046	66051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_010520	AGA	2	6	66112	66117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_010520	ACC	2	6	66248	66253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1637	NC_010520	TAC	2	6	66267	66272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1639	NC_010520	CGT	2	6	66675	66680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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