MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 114465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010520	GGA	2	6	1	6	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010520	AATA	2	8	49	56	75 %	25 %	0 %	0 %	170760502
3	NC_010520	AAGT	2	8	78	85	50 %	25 %	25 %	0 %	170760502
4	NC_010520	AAT	2	6	128	133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760502
5	NC_010520	TTAC	2	8	218	225	25 %	50 %	0 %	25 %	170760502
6	NC_010520	A	7	7	229	235	100 %	0 %	0 %	0 %	170760502
7	NC_010520	ACT	2	6	257	262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170760502
8	NC_010520	GAA	2	6	263	268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760502
9	NC_010520	A	6	6	267	272	100 %	0 %	0 %	0 %	170760502
10	NC_010520	A	7	7	276	282	100 %	0 %	0 %	0 %	170760502
11	NC_010520	ATA	2	6	285	290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760502
12	NC_010520	ATG	2	6	315	320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760502
13	NC_010520	CTA	2	6	327	332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170760502
14	NC_010520	GCA	2	6	395	400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170760502
15	NC_010520	TAGCAG	2	12	405	416	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170760502
16	NC_010520	TTTA	2	8	442	449	25 %	75 %	0 %	0 %	170760502
17	NC_010520	TA	3	6	448	453	50 %	50 %	0 %	0 %	170760502
18	NC_010520	TGG	2	6	454	459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170760502
19	NC_010520	ATGC	2	8	485	492	25 %	25 %	25 %	25 %	170760502
20	NC_010520	TA	3	6	503	508	50 %	50 %	0 %	0 %	170760502
21	NC_010520	AGT	2	6	532	537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760502
22	NC_010520	TCT	2	6	545	550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170760502
23	NC_010520	AATT	3	12	567	578	50 %	50 %	0 %	0 %	170760502
24	NC_010520	GAT	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760502
25	NC_010520	AAAT	2	8	610	617	75 %	25 %	0 %	0 %	170760502
26	NC_010520	TGA	2	6	643	648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760502
27	NC_010520	AGAA	2	8	670	677	75 %	0 %	25 %	0 %	170760502
28	NC_010520	AACA	2	8	722	729	75 %	0 %	0 %	25 %	170760502
29	NC_010520	AAT	2	6	730	735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760502
30	NC_010520	TACC	2	8	765	772	25 %	25 %	0 %	50 %	170760502
31	NC_010520	AGA	2	6	775	780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760502
32	NC_010520	A	6	6	863	868	100 %	0 %	0 %	0 %	170760502
33	NC_010520	TA	4	8	909	916	50 %	50 %	0 %	0 %	170760502
34	NC_010520	TAA	2	6	960	965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760502
35	NC_010520	TAG	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760502
36	NC_010520	TCA	2	6	980	985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170760502
37	NC_010520	TAA	2	6	991	996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760502
38	NC_010520	AAAC	2	8	1049	1056	75 %	0 %	0 %	25 %	170760502
39	NC_010520	AAG	2	6	1083	1088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760502
40	NC_010520	TAT	2	6	1100	1105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170760502
41	NC_010520	AGA	2	6	1117	1122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760502
42	NC_010520	AGA	2	6	1136	1141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760502
43	NC_010520	GAA	2	6	1223	1228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760502
44	NC_010520	TAC	2	6	1246	1251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170760502
45	NC_010520	A	6	6	1269	1274	100 %	0 %	0 %	0 %	170760502
46	NC_010520	TAA	2	6	1279	1284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760502
47	NC_010520	A	7	7	1288	1294	100 %	0 %	0 %	0 %	170760502
48	NC_010520	TAAA	2	8	1326	1333	75 %	25 %	0 %	0 %	170760502
49	NC_010520	AAAAAT	2	12	1344	1355	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170760502
50	NC_010520	TAA	2	6	1372	1377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010520	TTAT	2	8	1382	1389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010520	TTG	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010520	ATT	2	6	1468	1473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010520	TTA	2	6	1513	1518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010520	CTA	6	18	1534	1551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010520	TAT	2	6	1555	1560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010520	TCTATT	2	12	1565	1576	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010520	TAA	2	6	1594	1599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010520	AGG	2	6	1600	1605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010520	A	7	7	1630	1636	100 %	0 %	0 %	0 %	170761565
61	NC_010520	TAT	2	6	1699	1704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761565
62	NC_010520	TTA	2	6	1714	1719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761565
63	NC_010520	TAA	2	6	1724	1729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
64	NC_010520	AGA	2	6	1799	1804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761565
65	NC_010520	ATA	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
66	NC_010520	AAAT	2	8	1873	1880	75 %	25 %	0 %	0 %	170761565
67	NC_010520	AGA	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761565
68	NC_010520	ATA	2	6	1905	1910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
69	NC_010520	AT	4	8	1935	1942	50 %	50 %	0 %	0 %	170761565
70	NC_010520	TAT	2	6	1970	1975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761565
71	NC_010520	T	6	6	1990	1995	0 %	100 %	0 %	0 %	170761565
72	NC_010520	A	6	6	2015	2020	100 %	0 %	0 %	0 %	170761565
73	NC_010520	TAG	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170761565
74	NC_010520	AAG	2	6	2147	2152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761565
75	NC_010520	GTT	2	6	2157	2162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170761565
76	NC_010520	GATAAT	2	12	2163	2174	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170761565
77	NC_010520	AGA	3	9	2228	2236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761565
78	NC_010520	TTTA	2	8	2276	2283	25 %	75 %	0 %	0 %	170761565
79	NC_010520	AAT	2	6	2300	2305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
80	NC_010520	ATT	2	6	2312	2317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761565
81	NC_010520	GAA	2	6	2355	2360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761565
82	NC_010520	ATA	2	6	2373	2378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
83	NC_010520	AAG	2	6	2431	2436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761565
84	NC_010520	TAA	2	6	2482	2487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
85	NC_010520	AGA	2	6	2516	2521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761565
86	NC_010520	GGT	2	6	2528	2533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170761565
87	NC_010520	GAT	2	6	2604	2609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170761565
88	NC_010520	AGT	2	6	2631	2636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170761565
89	NC_010520	TAT	2	6	2648	2653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761565
90	NC_010520	A	6	6	2654	2659	100 %	0 %	0 %	0 %	170761565
91	NC_010520	AAT	2	6	2670	2675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
92	NC_010520	AAT	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
93	NC_010520	GAT	2	6	2736	2741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170758477
94	NC_010520	AATT	2	8	2751	2758	50 %	50 %	0 %	0 %	170758477
95	NC_010520	ATA	2	6	2764	2769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758477
96	NC_010520	T	6	6	2781	2786	0 %	100 %	0 %	0 %	170758477
97	NC_010520	CAA	2	6	2801	2806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170758477
98	NC_010520	T	6	6	2827	2832	0 %	100 %	0 %	0 %	170758477
99	NC_010520	AAGTTA	2	12	2846	2857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170758477
100	NC_010520	AGA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170758477
101	NC_010520	TAA	2	6	2916	2921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758477
102	NC_010520	ATT	2	6	2935	2940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170758477
103	NC_010520	AAT	2	6	2962	2967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010520	A	6	6	2975	2980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010520	TAT	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010520	TAAT	2	8	2991	2998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010520	TA	3	6	3015	3020	50 %	50 %	0 %	0 %	170759251
108	NC_010520	TAA	2	6	3034	3039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759251
109	NC_010520	ATG	2	6	3052	3057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170759251
110	NC_010520	CAAATA	2	12	3079	3090	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170759251
111	NC_010520	TAA	2	6	3101	3106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759251
112	NC_010520	TA	3	6	3137	3142	50 %	50 %	0 %	0 %	170759251
113	NC_010520	ATAAAG	2	12	3175	3186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170759251
114	NC_010520	ATA	2	6	3208	3213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759251
115	NC_010520	AT	3	6	3268	3273	50 %	50 %	0 %	0 %	170759251
116	NC_010520	A	6	6	3285	3290	100 %	0 %	0 %	0 %	170759251
117	NC_010520	TAAA	2	8	3301	3308	75 %	25 %	0 %	0 %	170759251
118	NC_010520	ATAAAA	2	12	3309	3320	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170759251
119	NC_010520	A	8	8	3317	3324	100 %	0 %	0 %	0 %	170759251
120	NC_010520	TGT	2	6	3350	3355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170759251
121	NC_010520	AGA	2	6	3368	3373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170759251
122	NC_010520	AAT	2	6	3380	3385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759251
123	NC_010520	TAT	2	6	3450	3455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170759251
124	NC_010520	ATA	2	6	3472	3477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759251
125	NC_010520	GAAA	2	8	3489	3496	75 %	0 %	25 %	0 %	170759251
126	NC_010520	A	6	6	3506	3511	100 %	0 %	0 %	0 %	170759251
127	NC_010520	ATG	2	6	3547	3552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170759251
128	NC_010520	AG	3	6	3587	3592	50 %	0 %	50 %	0 %	170759251
129	NC_010520	TAAAT	2	10	3608	3617	60 %	40 %	0 %	0 %	170759251
130	NC_010520	ATT	2	6	3618	3623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170759251
131	NC_010520	AAG	2	6	3639	3644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170759251
132	NC_010520	AGA	2	6	3659	3664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170759251
133	NC_010520	A	7	7	3746	3752	100 %	0 %	0 %	0 %	170759251
134	NC_010520	GA	3	6	3759	3764	50 %	0 %	50 %	0 %	170759251
135	NC_010520	GAT	2	6	3792	3797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170759251
136	NC_010520	ACA	2	6	3848	3853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170759251
137	NC_010520	CAT	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170759251
138	NC_010520	ATA	2	6	3894	3899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759251
139	NC_010520	A	6	6	3899	3904	100 %	0 %	0 %	0 %	170759251
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272	NC_010520	TTA	2	6	8878	8883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_010520	A	6	6	8898	8903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_010520	ATAA	2	8	8935	8942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_010520	AGA	2	6	8956	8961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_010520	ATT	2	6	8965	8970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_010520	TAT	2	6	8995	9000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_010520	ATA	2	6	9005	9010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_010520	GAAA	2	8	9054	9061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_010520	GGC	2	6	9288	9293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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286	NC_010520	GGTAA	2	10	9501	9510	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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