MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 102259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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102003	NC_010407	GCC	2	6	3248415	3248420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170783390
102004	NC_010407	CGC	2	6	3248441	3248446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170783390
102005	NC_010407	CGC	2	6	3248450	3248455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170783390
102006	NC_010407	GCA	2	6	3248474	3248479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170783390
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102009	NC_010407	CCCG	2	8	3248574	3248581	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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102011	NC_010407	GGA	2	6	3248661	3248666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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102228	NC_010407	ACGAGG	2	12	3257223	3257234	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	170783400
102229	NC_010407	GGT	2	6	3257285	3257290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170783400
102230	NC_010407	GGT	2	6	3257371	3257376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102231	NC_010407	CGA	3	9	3257402	3257410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170783401
102232	NC_010407	CTG	2	6	3257433	3257438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170783401
102233	NC_010407	CGGG	2	8	3257446	3257453	0 %	0 %	75 %	25 %	170783401
102234	NC_010407	CGT	2	6	3257456	3257461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170783401
102235	NC_010407	GCC	2	6	3257466	3257471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170783401
102236	NC_010407	GCC	2	6	3257514	3257519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170783401
102237	NC_010407	GTA	2	6	3257577	3257582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170783401
102238	NC_010407	GA	3	6	3257606	3257611	50 %	0 %	50 %	0 %	170783401
102239	NC_010407	CGC	2	6	3257643	3257648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170783401
102240	NC_010407	GAC	2	6	3257664	3257669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170783401
102241	NC_010407	TCC	2	6	3257727	3257732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170783402
102242	NC_010407	CTT	2	6	3257876	3257881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170783402
102243	NC_010407	CCG	2	6	3258014	3258019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102244	NC_010407	CGG	2	6	3258063	3258068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170783403
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102246	NC_010407	CGGC	2	8	3258084	3258091	0 %	0 %	50 %	50 %	170783403
102247	NC_010407	CTT	2	6	3258122	3258127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170783403
102248	NC_010407	CTT	2	6	3258131	3258136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170783403
102249	NC_010407	GTT	2	6	3258140	3258145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170783403
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102251	NC_010407	CGGGC	2	10	3258262	3258271	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102252	NC_010407	GTGGC	2	10	3258392	3258401	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
102253	NC_010407	CG	3	6	3258423	3258428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102254	NC_010407	CA	3	6	3258447	3258452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102255	NC_010407	CGCGGT	2	12	3258485	3258496	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102256	NC_010407	GGAC	2	8	3258529	3258536	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102257	NC_010407	CGCA	2	8	3258539	3258546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102258	NC_010407	CAG	2	6	3258573	3258578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102259	NC_010407	GGC	2	6	3258593	3258598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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