MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 4674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010379	CCT	2	6	16	21	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010379	A	6	6	70	75	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010379	ATTG	2	8	189	196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010379	TTTA	2	8	212	219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010379	A	6	6	278	283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010379	CTA	2	6	329	334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010379	T	6	6	336	341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010379	TTA	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010379	TA	3	6	362	367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010379	TAAT	2	8	401	408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010379	T	6	6	456	461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010379	T	7	7	546	552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010379	TAA	2	6	568	573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010379	A	7	7	572	578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010379	TA	3	6	656	661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010379	AT	3	6	666	671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010379	TTTA	2	8	702	709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010379	A	6	6	880	885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010379	ATATA	2	10	903	912	60 %	40 %	0 %	0 %	169834666
20	NC_010379	A	6	6	914	919	100 %	0 %	0 %	0 %	169834666
21	NC_010379	ATT	2	6	936	941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834666
22	NC_010379	T	6	6	953	958	0 %	100 %	0 %	0 %	169834666
23	NC_010379	AT	3	6	959	964	50 %	50 %	0 %	0 %	169834666
24	NC_010379	TCT	2	6	978	983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834666
25	NC_010379	TCT	2	6	1041	1046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010379	T	6	6	1056	1061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010379	TGAT	2	8	1079	1086	25 %	50 %	25 %	0 %	169834641
28	NC_010379	TTC	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834641
29	NC_010379	TCTCCA	2	12	1115	1126	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	169834641
30	NC_010379	TGC	2	6	1180	1185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834641
31	NC_010379	ATT	2	6	1186	1191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834641
32	NC_010379	TTC	2	6	1207	1212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834641
33	NC_010379	CTC	2	6	1237	1242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834641
34	NC_010379	TA	3	6	1291	1296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010379	CT	3	6	1305	1310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010379	TCA	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010379	TAAT	2	8	1342	1349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010379	T	6	6	1359	1364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010379	ATA	2	6	1385	1390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010379	TA	3	6	1441	1446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010379	TTA	2	6	1448	1453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010379	ATT	2	6	1460	1465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010379	TTA	2	6	1477	1482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010379	ATA	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010379	TA	3	6	1508	1513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010379	TAT	2	6	1518	1523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010379	TA	3	6	1527	1532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010379	ATGT	2	8	1564	1571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010379	T	7	7	1571	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010379	TAA	3	9	1585	1593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010379	TA	3	6	1597	1602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010379	ATT	2	6	1624	1629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010379	ATA	2	6	1682	1687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834598
54	NC_010379	CT	3	6	1712	1717	0 %	50 %	0 %	50 %	169834598
55	NC_010379	ATATT	2	10	1755	1764	40 %	60 %	0 %	0 %	169834598
56	NC_010379	TA	3	6	1767	1772	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
57	NC_010379	TAT	2	6	1791	1796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834598
58	NC_010379	TTA	2	6	1797	1802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834598
59	NC_010379	AAT	2	6	1811	1816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834598
60	NC_010379	TAA	2	6	1828	1833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834598
61	NC_010379	TGA	2	6	1843	1848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834598
62	NC_010379	AATT	2	8	1857	1864	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
63	NC_010379	A	6	6	1888	1893	100 %	0 %	0 %	0 %	169834598
64	NC_010379	A	6	6	1907	1912	100 %	0 %	0 %	0 %	169834598
65	NC_010379	TAA	2	6	1918	1923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834598
66	NC_010379	TA	3	6	1930	1935	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
67	NC_010379	AAAT	2	8	2019	2026	75 %	25 %	0 %	0 %	169834598
68	NC_010379	AT	3	6	2060	2065	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
69	NC_010379	A	8	8	2069	2076	100 %	0 %	0 %	0 %	169834598
70	NC_010379	ATT	2	6	2084	2089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834598
71	NC_010379	AT	3	6	2131	2136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010379	TA	3	6	2146	2151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010379	T	6	6	2179	2184	0 %	100 %	0 %	0 %	169834657
74	NC_010379	GCA	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834657
75	NC_010379	TA	4	8	2229	2236	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
76	NC_010379	TA	3	6	2280	2285	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
77	NC_010379	AT	4	8	2299	2306	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
78	NC_010379	ATG	2	6	2309	2314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834657
79	NC_010379	CTTT	2	8	2349	2356	0 %	75 %	0 %	25 %	169834657
80	NC_010379	T	6	6	2360	2365	0 %	100 %	0 %	0 %	169834657
81	NC_010379	T	7	7	2423	2429	0 %	100 %	0 %	0 %	169834657
82	NC_010379	ACT	2	6	2449	2454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834657
83	NC_010379	TA	3	6	2497	2502	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
84	NC_010379	AGA	2	6	2518	2523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834657
85	NC_010379	ATT	2	6	2530	2535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834657
86	NC_010379	TAT	2	6	2547	2552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834657
87	NC_010379	T	7	7	2578	2584	0 %	100 %	0 %	0 %	169834657
88	NC_010379	ATA	2	6	2699	2704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834657
89	NC_010379	ATTAA	2	10	2708	2717	60 %	40 %	0 %	0 %	169834657
90	NC_010379	TTA	3	9	2738	2746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834657
91	NC_010379	CTTTTT	2	12	2760	2771	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	169834657
92	NC_010379	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834657
93	NC_010379	TATTTA	2	12	2799	2810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834657
94	NC_010379	CAT	2	6	2812	2817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834657
95	NC_010379	ATC	2	6	2857	2862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834681
96	NC_010379	TTA	2	6	2871	2876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
97	NC_010379	TAT	2	6	2892	2897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
98	NC_010379	TAA	2	6	2916	2921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834681
99	NC_010379	ATA	2	6	2948	2953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834681
100	NC_010379	T	7	7	2958	2964	0 %	100 %	0 %	0 %	169834681
101	NC_010379	AAT	2	6	2965	2970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834681
102	NC_010379	TTA	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
103	NC_010379	TCTT	2	8	2996	3003	0 %	75 %	0 %	25 %	169834681
104	NC_010379	ATT	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
105	NC_010379	TAT	3	9	3015	3023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
106	NC_010379	TTTA	2	8	3055	3062	25 %	75 %	0 %	0 %	169834681
107	NC_010379	AT	4	8	3068	3075	50 %	50 %	0 %	0 %	169834681
108	NC_010379	ATT	2	6	3088	3093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010379	ATT	3	9	3103	3111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010379	A	8	8	3139	3146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010379	TTTA	2	8	3155	3162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010379	TAAA	2	8	3171	3178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010379	TTA	2	6	3184	3189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010379	CAT	2	6	3222	3227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834676
115	NC_010379	ATC	2	6	3241	3246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834676
116	NC_010379	TTTCCA	2	12	3257	3268	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	169834676
117	NC_010379	ATT	2	6	3304	3309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834676
118	NC_010379	ATG	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834676
119	NC_010379	CTT	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834676
120	NC_010379	TA	3	6	3379	3384	50 %	50 %	0 %	0 %	169834676
121	NC_010379	CTT	2	6	3413	3418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834676
122	NC_010379	TGCT	2	8	3481	3488	0 %	50 %	25 %	25 %	169834676
123	NC_010379	TAC	2	6	3496	3501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834676
124	NC_010379	TC	3	6	3521	3526	0 %	50 %	0 %	50 %	169834676
125	NC_010379	TCT	2	6	3544	3549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834676
126	NC_010379	AAC	2	6	3637	3642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834676
127	NC_010379	TA	4	8	3672	3679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010379	CTA	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010379	ACA	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010379	AT	3	6	3876	3881	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
131	NC_010379	ATC	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834692
132	NC_010379	T	6	6	3965	3970	0 %	100 %	0 %	0 %	169834692
133	NC_010379	AGC	2	6	4080	4085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834692
134	NC_010379	AGT	2	6	4148	4153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834692
135	NC_010379	GTTA	2	8	4163	4170	25 %	50 %	25 %	0 %	169834692
136	NC_010379	AAT	2	6	4185	4190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834692
137	NC_010379	GTT	2	6	4318	4323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834692
138	NC_010379	ATAG	2	8	4400	4407	50 %	25 %	25 %	0 %	169834692
139	NC_010379	CTA	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834692
140	NC_010379	TTA	2	6	4446	4451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834692
141	NC_010379	AT	3	6	4494	4499	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
142	NC_010379	AAG	2	6	4500	4505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834692
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144	NC_010379	TAG	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834692
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