MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010287	CTA	2	6	139077	139082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_010287	TCT	2	6	139083	139088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_010287	CTG	2	6	139221	139226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_010287	ATGT	2	8	139241	139248	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_010287	AAG	2	6	139300	139305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_010287	TTA	2	6	139357	139362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_010287	GAAA	2	8	139375	139382	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_010287	GAA	2	6	139394	139399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_010287	TGT	2	6	139401	139406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_010287	CTT	2	6	139415	139420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_010287	GAA	2	6	139430	139435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_010287	ATC	2	6	139469	139474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154082
3013	NC_010287	AGA	2	6	139484	139489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154082
3014	NC_010287	CTA	2	6	139527	139532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154082
3015	NC_010287	TCT	2	6	139569	139574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154082
3016	NC_010287	GA	4	8	139684	139691	50 %	0 %	50 %	0 %	166154082
3017	NC_010287	TTCT	2	8	139718	139725	0 %	75 %	0 %	25 %	166154082
3018	NC_010287	CTT	2	6	139741	139746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154082
3019	NC_010287	CTT	2	6	139836	139841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154082
3020	NC_010287	AGA	2	6	139847	139852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154082
3021	NC_010287	CCT	2	6	139860	139865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154082
3022	NC_010287	GTT	2	6	139886	139891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154082
3023	NC_010287	AG	3	6	139950	139955	50 %	0 %	50 %	0 %	166154082
3024	NC_010287	AT	3	6	139957	139962	50 %	50 %	0 %	0 %	166154082
3025	NC_010287	GGTCG	2	10	139988	139997	0 %	20 %	60 %	20 %	166154082
3026	NC_010287	AAG	2	6	140014	140019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154082
3027	NC_010287	CTG	2	6	140059	140064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154082
3028	NC_010287	AAG	2	6	140068	140073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154082
3029	NC_010287	AGAT	2	8	140111	140118	50 %	25 %	25 %	0 %	166154082
3030	NC_010287	AGG	2	6	140213	140218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154082
3031	NC_010287	AGAA	2	8	140276	140283	75 %	0 %	25 %	0 %	166154082
3032	NC_010287	ACA	2	6	140322	140327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154082
3033	NC_010287	AAG	3	9	140338	140346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154082
3034	NC_010287	TCT	2	6	140361	140366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154082
3035	NC_010287	TGC	2	6	140430	140435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154082
3036	NC_010287	TCA	2	6	140469	140474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154082
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3038	NC_010287	TAA	2	6	140555	140560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154082
3039	NC_010287	ATC	2	6	140606	140611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154082
3040	NC_010287	ATT	2	6	140612	140617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154082
3041	NC_010287	TAA	2	6	140644	140649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154082
3042	NC_010287	TGC	2	6	140705	140710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154082
3043	NC_010287	A	6	6	140813	140818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_010287	T	6	6	140828	140833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_010287	TTA	2	6	140840	140845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_010287	TG	3	6	140973	140978	0 %	50 %	50 %	0 %	166154083
3047	NC_010287	CTTTTT	2	12	141046	141057	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	166154083
3048	NC_010287	GAC	2	6	141068	141073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154083
3049	NC_010287	GAG	2	6	141161	141166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154083
3050	NC_010287	A	6	6	141219	141224	100 %	0 %	0 %	0 %	166154083
3051	NC_010287	TTA	2	6	141251	141256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_010287	T	7	7	141496	141502	0 %	100 %	0 %	0 %	166154084
3053	NC_010287	GAG	2	6	141553	141558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154084
3054	NC_010287	GAAG	2	8	141582	141589	50 %	0 %	50 %	0 %	166154084
3055	NC_010287	AAT	2	6	141707	141712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154084
3056	NC_010287	T	8	8	141712	141719	0 %	100 %	0 %	0 %	166154084
3057	NC_010287	AG	3	6	141772	141777	50 %	0 %	50 %	0 %	166154084
3058	NC_010287	TCT	2	6	141780	141785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154084
3059	NC_010287	T	6	6	141823	141828	0 %	100 %	0 %	0 %	166154084
3060	NC_010287	CTT	2	6	141858	141863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154084
3061	NC_010287	TTG	2	6	141905	141910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154084
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3064	NC_010287	TTG	2	6	142028	142033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154084
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3067	NC_010287	TTTA	2	8	142151	142158	25 %	75 %	0 %	0 %	166154084
3068	NC_010287	TGG	2	6	142160	142165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154084
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3071	NC_010287	TCA	2	6	142236	142241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154084
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3079	NC_010287	GAG	2	6	142474	142479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154084
3080	NC_010287	AAAG	2	8	142545	142552	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_010287	TCC	2	6	142564	142569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3082	NC_010287	AGG	2	6	142572	142577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_010287	A	8	8	142635	142642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_010287	A	6	6	142699	142704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_010287	ATT	2	6	142721	142726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154085
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3089	NC_010287	TAG	2	6	142805	142810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154085
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3096	NC_010287	T	7	7	142907	142913	0 %	100 %	0 %	0 %	166154085
3097	NC_010287	T	6	6	142925	142930	0 %	100 %	0 %	0 %	166154085
3098	NC_010287	TGC	2	6	143004	143009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154085
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3101	NC_010287	GTCA	2	8	143064	143071	25 %	25 %	25 %	25 %	166154085
3102	NC_010287	T	8	8	143072	143079	0 %	100 %	0 %	0 %	166154085
3103	NC_010287	A	6	6	143101	143106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_010287	GTT	3	9	143116	143124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_010287	T	7	7	143133	143139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_010287	GTTT	2	8	143159	143166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_010287	AGC	2	6	143214	143219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_010287	T	6	6	143287	143292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_010287	TGC	2	6	143304	143309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_010287	AGAAA	2	10	143359	143368	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_010287	AGA	2	6	143391	143396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_010287	TTC	2	6	143397	143402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3114	NC_010287	ATG	2	6	143439	143444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_010287	TCT	2	6	143459	143464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_010287	T	6	6	143486	143491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3123	NC_010287	CTTT	2	8	143942	143949	0 %	75 %	0 %	25 %	166154086
3124	NC_010287	ATA	2	6	143952	143957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154086
3125	NC_010287	A	7	7	144015	144021	100 %	0 %	0 %	0 %	166154086
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3231	NC_010287	AGT	2	6	148732	148737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154089
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3234	NC_010287	C	6	6	149143	149148	0 %	0 %	0 %	100 %	166154089
3235	NC_010287	AG	3	6	149355	149360	50 %	0 %	50 %	0 %	166154089
3236	NC_010287	TAA	2	6	149394	149399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154089
3237	NC_010287	A	9	9	149443	149451	100 %	0 %	0 %	0 %	166154089
3238	NC_010287	TA	3	6	149493	149498	50 %	50 %	0 %	0 %	166154089
3239	NC_010287	GGA	2	6	149513	149518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154089
3240	NC_010287	GTT	2	6	149534	149539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154089
3241	NC_010287	CCTCTA	2	12	149583	149594	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3243	NC_010287	T	6	6	149678	149683	0 %	100 %	0 %	0 %	166154090
3244	NC_010287	TTTG	2	8	149687	149694	0 %	75 %	25 %	0 %	166154090
3245	NC_010287	CTG	2	6	149709	149714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154090
3246	NC_010287	AT	3	6	149716	149721	50 %	50 %	0 %	0 %	166154090
3247	NC_010287	CTT	2	6	149843	149848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154090
3248	NC_010287	CTC	2	6	149862	149867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154090
3249	NC_010287	T	6	6	149888	149893	0 %	100 %	0 %	0 %	166154090
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3251	NC_010287	GC	3	6	149943	149948	0 %	0 %	50 %	50 %	166154090
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