MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_010117	T	6	6	1999597	1999602	0 %	100 %	0 %	0 %	161831587
44002	NC_010117	TGCT	2	8	1999641	1999648	0 %	50 %	25 %	25 %	161831587
44003	NC_010117	CTT	2	6	1999649	1999654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831587
44004	NC_010117	T	7	7	1999674	1999680	0 %	100 %	0 %	0 %	161831587
44005	NC_010117	TA	3	6	1999692	1999697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44006	NC_010117	CTT	2	6	1999768	1999773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829940
44007	NC_010117	CAA	2	6	1999774	1999779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161829940
44008	NC_010117	TTCAA	2	10	1999803	1999812	40 %	40 %	0 %	20 %	161829940
44009	NC_010117	TACA	2	8	1999814	1999821	50 %	25 %	0 %	25 %	161829940
44010	NC_010117	T	7	7	1999822	1999828	0 %	100 %	0 %	0 %	161829940
44011	NC_010117	TG	3	6	1999880	1999885	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44012	NC_010117	ACTG	2	8	1999900	1999907	25 %	25 %	25 %	25 %	161830496
44013	NC_010117	ACCA	2	8	1999927	1999934	50 %	0 %	0 %	50 %	161830496
44014	NC_010117	CCG	2	6	1999939	1999944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830496
44015	NC_010117	TCGCT	2	10	2000073	2000082	0 %	40 %	20 %	40 %	161830496
44016	NC_010117	AT	3	6	2000111	2000116	50 %	50 %	0 %	0 %	161830778
44017	NC_010117	T	7	7	2000152	2000158	0 %	100 %	0 %	0 %	161830778
44018	NC_010117	CTT	2	6	2000196	2000201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830778
44019	NC_010117	AAT	2	6	2000232	2000237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830778
44020	NC_010117	AT	3	6	2000369	2000374	50 %	50 %	0 %	0 %	161830778
44021	NC_010117	AAT	2	6	2000400	2000405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830778
44022	NC_010117	GAAA	2	8	2000471	2000478	75 %	0 %	25 %	0 %	161830778
44023	NC_010117	ACCC	2	8	2000568	2000575	25 %	0 %	0 %	75 %	161830778
44024	NC_010117	AAC	2	6	2000596	2000601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830778
44025	NC_010117	ATG	2	6	2000659	2000664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830778
44026	NC_010117	ACC	2	6	2000746	2000751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830778
44027	NC_010117	T	6	6	2000770	2000775	0 %	100 %	0 %	0 %	161830778
44028	NC_010117	ATG	2	6	2000852	2000857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831352
44029	NC_010117	ATT	2	6	2000916	2000921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831352
44030	NC_010117	GT	3	6	2000923	2000928	0 %	50 %	50 %	0 %	161831352
44031	NC_010117	CCG	2	6	2000950	2000955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831352
44032	NC_010117	AGG	2	6	2000992	2000997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831352
44033	NC_010117	TG	3	6	2001007	2001012	0 %	50 %	50 %	0 %	161831352
44034	NC_010117	AGT	2	6	2001019	2001024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831352
44035	NC_010117	ATT	2	6	2001027	2001032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831352
44036	NC_010117	AAT	3	9	2001045	2001053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831352
44037	NC_010117	TAAT	2	8	2001128	2001135	50 %	50 %	0 %	0 %	161831352
44038	NC_010117	AATT	2	8	2001158	2001165	50 %	50 %	0 %	0 %	161831352
44039	NC_010117	CCA	2	6	2001234	2001239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831352
44040	NC_010117	TAT	2	6	2001269	2001274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831352
44041	NC_010117	TTTTA	2	10	2001345	2001354	20 %	80 %	0 %	0 %	161831352
44042	NC_010117	AGC	2	6	2001363	2001368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831352
44043	NC_010117	TGT	2	6	2001382	2001387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831352
44044	NC_010117	AAC	2	6	2001495	2001500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831352
44045	NC_010117	A	6	6	2001576	2001581	100 %	0 %	0 %	0 %	161831352
44046	NC_010117	A	7	7	2001583	2001589	100 %	0 %	0 %	0 %	161831352
44047	NC_010117	CTC	2	6	2001683	2001688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830756
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44050	NC_010117	CCG	2	6	2001782	2001787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830756
44051	NC_010117	AAT	2	6	2001810	2001815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830756
44052	NC_010117	CAG	2	6	2001850	2001855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830756
44053	NC_010117	TTTTC	2	10	2001871	2001880	0 %	80 %	0 %	20 %	161830756
44054	NC_010117	T	6	6	2001926	2001931	0 %	100 %	0 %	0 %	161830756
44055	NC_010117	TCA	2	6	2001969	2001974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830756
44056	NC_010117	AATT	2	8	2002004	2002011	50 %	50 %	0 %	0 %	161830756
44057	NC_010117	ATAA	2	8	2002103	2002110	75 %	25 %	0 %	0 %	161830756
44058	NC_010117	T	6	6	2002111	2002116	0 %	100 %	0 %	0 %	161830756
44059	NC_010117	CAG	2	6	2002135	2002140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830756
44060	NC_010117	GAG	2	6	2002169	2002174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830756
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44064	NC_010117	CGT	2	6	2002389	2002394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830756
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44072	NC_010117	ATA	2	6	2002626	2002631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830756
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44078	NC_010117	AAT	2	6	2002781	2002786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830756
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44091	NC_010117	T	6	6	2003524	2003529	0 %	100 %	0 %	0 %	161831181
44092	NC_010117	TTG	2	6	2003568	2003573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831181
44093	NC_010117	GCC	2	6	2003655	2003660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831181
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44101	NC_010117	AC	3	6	2003957	2003962	50 %	0 %	0 %	50 %	161831629
44102	NC_010117	TCG	2	6	2004078	2004083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831629
44103	NC_010117	ATT	2	6	2004113	2004118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831629
44104	NC_010117	ATT	2	6	2004123	2004128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831629
44105	NC_010117	GCG	2	6	2004156	2004161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831629
44106	NC_010117	TAA	2	6	2004258	2004263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44107	NC_010117	TAA	2	6	2004271	2004276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44108	NC_010117	TAG	2	6	2004309	2004314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44109	NC_010117	GCT	2	6	2004419	2004424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44110	NC_010117	T	6	6	2004433	2004438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44111	NC_010117	ATG	2	6	2004528	2004533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44112	NC_010117	T	6	6	2004631	2004636	0 %	100 %	0 %	0 %	161829950
44113	NC_010117	ACT	2	6	2004644	2004649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829950
44114	NC_010117	CT	5	10	2004648	2004657	0 %	50 %	0 %	50 %	161829950
44115	NC_010117	A	6	6	2004669	2004674	100 %	0 %	0 %	0 %	161829950
44116	NC_010117	CAC	2	6	2004704	2004709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161829950
44117	NC_010117	GGA	2	6	2004742	2004747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161829950
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44351	NC_010117	T	6	6	2015566	2015571	0 %	100 %	0 %	0 %	161831597
44352	NC_010117	T	6	6	2015721	2015726	0 %	100 %	0 %	0 %	161831597
44353	NC_010117	CGT	2	6	2015787	2015792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831597
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