MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_010117	TATC	2	8	1955933	1955940	25 %	50 %	0 %	25 %	161831029
43003	NC_010117	ATT	2	6	1955954	1955959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831029
43004	NC_010117	CTT	2	6	1955962	1955967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831029
43005	NC_010117	GAA	2	6	1956009	1956014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831029
43006	NC_010117	GGC	2	6	1956030	1956035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831029
43007	NC_010117	TGCGT	2	10	1956080	1956089	0 %	40 %	40 %	20 %	161831029
43008	NC_010117	AGA	2	6	1956128	1956133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831029
43009	NC_010117	GCT	2	6	1956207	1956212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831029
43010	NC_010117	A	6	6	1956263	1956268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43011	NC_010117	ATT	2	6	1956294	1956299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829868
43012	NC_010117	G	6	6	1956359	1956364	0 %	0 %	100 %	0 %	161829868
43013	NC_010117	ATT	2	6	1956401	1956406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829868
43014	NC_010117	ATT	2	6	1956469	1956474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829868
43015	NC_010117	GCAA	2	8	1956530	1956537	50 %	0 %	25 %	25 %	161829868
43016	NC_010117	TTA	2	6	1956618	1956623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829868
43017	NC_010117	AC	3	6	1956628	1956633	50 %	0 %	0 %	50 %	161829868
43018	NC_010117	ATT	2	6	1956693	1956698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829868
43019	NC_010117	GAG	2	6	1956747	1956752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161829868
43020	NC_010117	ACG	2	6	1956795	1956800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161829868
43021	NC_010117	A	6	6	1956812	1956817	100 %	0 %	0 %	0 %	161829868
43022	NC_010117	ATA	3	9	1956835	1956843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829868
43023	NC_010117	TAC	2	6	1956858	1956863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829868
43024	NC_010117	GCG	2	6	1956910	1956915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161829868
43025	NC_010117	GCC	2	6	1956918	1956923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161829868
43026	NC_010117	GAA	2	6	1956933	1956938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829868
43027	NC_010117	A	6	6	1957005	1957010	100 %	0 %	0 %	0 %	161829868
43028	NC_010117	GCTG	2	8	1957016	1957023	0 %	25 %	50 %	25 %	161829868
43029	NC_010117	TAT	2	6	1957031	1957036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829868
43030	NC_010117	ATGTCA	2	12	1957099	1957110	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161829868
43031	NC_010117	A	6	6	1957169	1957174	100 %	0 %	0 %	0 %	161829868
43032	NC_010117	CAC	2	6	1957175	1957180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161829868
43033	NC_010117	AGA	2	6	1957289	1957294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829868
43034	NC_010117	A	7	7	1957326	1957332	100 %	0 %	0 %	0 %	161829868
43035	NC_010117	GCA	2	6	1957348	1957353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161829868
43036	NC_010117	ATC	2	6	1957386	1957391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829868
43037	NC_010117	TAA	2	6	1957445	1957450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829868
43038	NC_010117	TAG	2	6	1957501	1957506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161829868
43039	NC_010117	CCA	2	6	1957531	1957536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161829868
43040	NC_010117	CAA	2	6	1957630	1957635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161829868
43041	NC_010117	AGAA	2	8	1957636	1957643	75 %	0 %	25 %	0 %	161829868
43042	NC_010117	AAG	2	6	1957703	1957708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43043	NC_010117	CAT	2	6	1957731	1957736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43044	NC_010117	AC	3	6	1957738	1957743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43045	NC_010117	GC	3	6	1957846	1957851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43046	NC_010117	GC	3	6	1957857	1957862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43047	NC_010117	GTG	2	6	1957955	1957960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43048	NC_010117	CGT	2	6	1957982	1957987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43049	NC_010117	TAT	2	6	1958010	1958015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43050	NC_010117	GGA	2	6	1958047	1958052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43051	NC_010117	ACG	2	6	1958178	1958183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43052	NC_010117	T	6	6	1958188	1958193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43053	NC_010117	ACT	2	6	1958196	1958201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43054	NC_010117	ACG	2	6	1958257	1958262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43055	NC_010117	A	6	6	1958325	1958330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43056	NC_010117	T	7	7	1958438	1958444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43057	NC_010117	AG	3	6	1958456	1958461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43058	NC_010117	GATC	2	8	1958534	1958541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43059	NC_010117	CGA	2	6	1958562	1958567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43060	NC_010117	GAA	2	6	1958592	1958597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43061	NC_010117	ATT	2	6	1958628	1958633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43062	NC_010117	CGT	2	6	1958666	1958671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43063	NC_010117	GC	3	6	1958768	1958773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43064	NC_010117	GGC	2	6	1958801	1958806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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43069	NC_010117	AGA	2	6	1959083	1959088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43070	NC_010117	TAT	2	6	1959091	1959096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43071	NC_010117	TTACC	2	10	1959103	1959112	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43072	NC_010117	TAT	2	6	1959162	1959167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43073	NC_010117	TAT	2	6	1959309	1959314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43074	NC_010117	ATTTT	2	10	1959343	1959352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43075	NC_010117	A	6	6	1959386	1959391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43076	NC_010117	ATC	2	6	1959394	1959399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43080	NC_010117	A	8	8	1959495	1959502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43081	NC_010117	TTG	2	6	1959534	1959539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43082	NC_010117	A	7	7	1959603	1959609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43083	NC_010117	TCC	2	6	1959623	1959628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43084	NC_010117	TGG	2	6	1959640	1959645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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43089	NC_010117	AATAG	2	10	1959913	1959922	60 %	20 %	20 %	0 %	161831424
43090	NC_010117	TGA	2	6	1959947	1959952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831424
43091	NC_010117	AACG	2	8	1959972	1959979	50 %	0 %	25 %	25 %	161831424
43092	NC_010117	CAT	2	6	1960014	1960019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831424
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43094	NC_010117	CCA	2	6	1960066	1960071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831424
43095	NC_010117	TCG	2	6	1960126	1960131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43097	NC_010117	TTG	2	6	1960223	1960228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830361
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43101	NC_010117	ATT	2	6	1960348	1960353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43102	NC_010117	A	6	6	1960367	1960372	100 %	0 %	0 %	0 %	161830070
43103	NC_010117	A	6	6	1960408	1960413	100 %	0 %	0 %	0 %	161830070
43104	NC_010117	GTA	2	6	1960456	1960461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830070
43105	NC_010117	GTTT	2	8	1960480	1960487	0 %	75 %	25 %	0 %	161830070
43106	NC_010117	CCG	2	6	1960516	1960521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830070
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43109	NC_010117	AGA	2	6	1960667	1960672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830070
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43113	NC_010117	TTG	2	6	1960863	1960868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830070
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43120	NC_010117	CG	3	6	1961067	1961072	0 %	0 %	50 %	50 %	161830070
43121	NC_010117	A	6	6	1961103	1961108	100 %	0 %	0 %	0 %	161830070
43122	NC_010117	CAA	2	6	1961109	1961114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830070
43123	NC_010117	ATG	2	6	1961130	1961135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830070
43124	NC_010117	A	6	6	1961206	1961211	100 %	0 %	0 %	0 %	161830070
43125	NC_010117	AATTTA	2	12	1961251	1961262	50 %	50 %	0 %	0 %	161830070
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43146	NC_010117	T	7	7	1962567	1962573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43147	NC_010117	TAT	2	6	1962576	1962581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43151	NC_010117	GC	3	6	1962645	1962650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43152	NC_010117	GC	3	6	1962656	1962661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43153	NC_010117	CCT	2	6	1962723	1962728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830724
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