MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_010117	AAT	2	6	1866543	1866548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41002	NC_010117	CAT	2	6	1866584	1866589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830889
41003	NC_010117	AGT	2	6	1866661	1866666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830889
41004	NC_010117	CCTTGT	2	12	1866670	1866681	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	161830889
41005	NC_010117	ACC	2	6	1866792	1866797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830889
41006	NC_010117	CGC	2	6	1866807	1866812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830889
41007	NC_010117	A	6	6	1866832	1866837	100 %	0 %	0 %	0 %	161830889
41008	NC_010117	GTCC	2	8	1866859	1866866	0 %	25 %	25 %	50 %	161830889
41009	NC_010117	A	6	6	1866922	1866927	100 %	0 %	0 %	0 %	161830889
41010	NC_010117	T	7	7	1866929	1866935	0 %	100 %	0 %	0 %	161830889
41011	NC_010117	TCAC	2	8	1866958	1866965	25 %	25 %	0 %	50 %	161830889
41012	NC_010117	TTG	2	6	1866966	1866971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830889
41013	NC_010117	CAA	2	6	1866999	1867004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830889
41014	NC_010117	CAA	2	6	1867017	1867022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830889
41015	NC_010117	TAAT	2	8	1867058	1867065	50 %	50 %	0 %	0 %	161830889
41016	NC_010117	GCG	2	6	1867244	1867249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831603
41017	NC_010117	TTG	2	6	1867294	1867299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831603
41018	NC_010117	TAA	2	6	1867354	1867359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831603
41019	NC_010117	T	6	6	1867378	1867383	0 %	100 %	0 %	0 %	161831603
41020	NC_010117	GTG	2	6	1867449	1867454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41021	NC_010117	ATT	2	6	1867585	1867590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41022	NC_010117	T	7	7	1867602	1867608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41023	NC_010117	CAA	2	6	1867617	1867622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41024	NC_010117	A	6	6	1867666	1867671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41025	NC_010117	CAA	2	6	1867784	1867789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41026	NC_010117	CTA	2	6	1867798	1867803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41027	NC_010117	GAT	2	6	1867838	1867843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41028	NC_010117	TTGT	2	8	1867907	1867914	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41029	NC_010117	CCG	2	6	1867922	1867927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41030	NC_010117	TCC	2	6	1868020	1868025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41031	NC_010117	CGC	2	6	1868058	1868063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41032	NC_010117	ATT	2	6	1868069	1868074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41033	NC_010117	AAT	2	6	1868126	1868131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41034	NC_010117	AGA	2	6	1868149	1868154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41035	NC_010117	AAC	2	6	1868166	1868171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41036	NC_010117	TGT	2	6	1868190	1868195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41037	NC_010117	TTA	2	6	1868227	1868232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41038	NC_010117	CATT	2	8	1868374	1868381	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41039	NC_010117	ATTG	2	8	1868438	1868445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41040	NC_010117	CCT	2	6	1868558	1868563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41041	NC_010117	CAAA	2	8	1868570	1868577	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41042	NC_010117	ATA	2	6	1868581	1868586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41043	NC_010117	ACGA	2	8	1868654	1868661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41044	NC_010117	A	6	6	1868727	1868732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41045	NC_010117	T	8	8	1868755	1868762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41046	NC_010117	ATTT	2	8	1868782	1868789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41047	NC_010117	TAAA	2	8	1868812	1868819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41048	NC_010117	GAG	2	6	1868981	1868986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41049	NC_010117	AAT	2	6	1869062	1869067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41050	NC_010117	TGC	2	6	1869076	1869081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41051	NC_010117	GAG	2	6	1869152	1869157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41052	NC_010117	ATT	2	6	1869201	1869206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41053	NC_010117	TCAAAG	2	12	1869219	1869230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41054	NC_010117	AGG	2	6	1869385	1869390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41055	NC_010117	CTT	2	6	1869444	1869449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41056	NC_010117	AGCA	2	8	1869463	1869470	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41057	NC_010117	ACC	2	6	1869492	1869497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41058	NC_010117	A	6	6	1869511	1869516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41059	NC_010117	CAT	2	6	1869526	1869531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41060	NC_010117	GC	3	6	1869567	1869572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41061	NC_010117	ATA	3	9	1869575	1869583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41062	NC_010117	T	6	6	1869586	1869591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41063	NC_010117	ATT	2	6	1869592	1869597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41064	NC_010117	AG	3	6	1869652	1869657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41065	NC_010117	TTA	2	6	1869696	1869701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41082	NC_010117	CTG	2	6	1870519	1870524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41088	NC_010117	T	6	6	1870834	1870839	0 %	100 %	0 %	0 %	161830781
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41094	NC_010117	CAA	2	6	1871003	1871008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830781
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41097	NC_010117	GCT	3	9	1871206	1871214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830781
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41102	NC_010117	TCG	2	6	1871391	1871396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830781
41103	NC_010117	ATC	2	6	1871452	1871457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830781
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41106	NC_010117	GTCTT	2	10	1871510	1871519	0 %	60 %	20 %	20 %	161830781
41107	NC_010117	ATT	2	6	1871526	1871531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830781
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41110	NC_010117	A	7	7	1871699	1871705	100 %	0 %	0 %	0 %	161830781
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41113	NC_010117	T	6	6	1871769	1871774	0 %	100 %	0 %	0 %	161830781
41114	NC_010117	TAT	2	6	1871778	1871783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830781
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41121	NC_010117	A	6	6	1872078	1872083	100 %	0 %	0 %	0 %	161830781
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41487	NC_010117	A	6	6	1889224	1889229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41488	NC_010117	CGT	2	6	1889233	1889238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41489	NC_010117	TCC	2	6	1889364	1889369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41490	NC_010117	CCG	2	6	1889375	1889380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41491	NC_010117	TAC	2	6	1889402	1889407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41492	NC_010117	GAC	2	6	1889428	1889433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41493	NC_010117	CAC	2	6	1889456	1889461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41494	NC_010117	CT	3	6	1889496	1889501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41495	NC_010117	TG	3	6	1889729	1889734	0 %	50 %	50 %	0 %	161830147
41496	NC_010117	TAA	2	6	1889809	1889814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830147
41497	NC_010117	ATC	2	6	1889840	1889845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830147
41498	NC_010117	A	6	6	1889939	1889944	100 %	0 %	0 %	0 %	161830147
41499	NC_010117	A	6	6	1889981	1889986	100 %	0 %	0 %	0 %	161830147
41500	NC_010117	CAA	2	6	1890071	1890076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830147

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