MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40502	NC_010117	ACGCT	2	10	1843395	1843404	20 %	20 %	20 %	40 %	161830666
40503	NC_010117	A	6	6	1843423	1843428	100 %	0 %	0 %	0 %	161830666
40504	NC_010117	TAA	2	6	1843466	1843471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830666
40505	NC_010117	GAA	2	6	1843494	1843499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830666
40506	NC_010117	A	8	8	1843521	1843528	100 %	0 %	0 %	0 %	161830666
40507	NC_010117	GAA	2	6	1843566	1843571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830666
40508	NC_010117	A	6	6	1843570	1843575	100 %	0 %	0 %	0 %	161830666
40509	NC_010117	GA	3	6	1843727	1843732	50 %	0 %	50 %	0 %	161830666
40510	NC_010117	CACT	2	8	1843794	1843801	25 %	25 %	0 %	50 %	161830666
40511	NC_010117	ACAA	2	8	1843828	1843835	75 %	0 %	0 %	25 %	161830666
40512	NC_010117	GCC	2	6	1843873	1843878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830666
40513	NC_010117	TCAA	2	8	1843902	1843909	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40514	NC_010117	ATA	2	6	1843966	1843971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40515	NC_010117	ATG	2	6	1843979	1843984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40516	NC_010117	GGT	2	6	1844002	1844007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40517	NC_010117	TAA	2	6	1844023	1844028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40518	NC_010117	TCA	2	6	1844039	1844044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40519	NC_010117	TTC	2	6	1844056	1844061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40520	NC_010117	AATA	2	8	1844093	1844100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40521	NC_010117	A	6	6	1844141	1844146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40522	NC_010117	CAT	2	6	1844187	1844192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40523	NC_010117	AGC	2	6	1844233	1844238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40524	NC_010117	CAT	2	6	1844301	1844306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40525	NC_010117	CTC	2	6	1844371	1844376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40526	NC_010117	AAT	2	6	1844390	1844395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40527	NC_010117	TAA	2	6	1844400	1844405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40528	NC_010117	GGA	2	6	1844485	1844490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831265
40529	NC_010117	TAA	2	6	1844502	1844507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831265
40530	NC_010117	TCA	2	6	1844522	1844527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831265
40531	NC_010117	TC	3	6	1844564	1844569	0 %	50 %	0 %	50 %	161831265
40532	NC_010117	TGG	2	6	1844580	1844585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831265
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40540	NC_010117	GCAA	2	8	1844950	1844957	50 %	0 %	25 %	25 %	161830901
40541	NC_010117	A	6	6	1844984	1844989	100 %	0 %	0 %	0 %	161830901
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40548	NC_010117	CAC	2	6	1845117	1845122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830357
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40550	NC_010117	T	7	7	1845203	1845209	0 %	100 %	0 %	0 %	161830357
40551	NC_010117	CCGC	2	8	1845296	1845303	0 %	0 %	25 %	75 %	161830357
40552	NC_010117	CGG	2	6	1845364	1845369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830357
40553	NC_010117	TTA	2	6	1845390	1845395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830357
40554	NC_010117	AAATA	2	10	1845506	1845515	80 %	20 %	0 %	0 %	161830357
40555	NC_010117	TTAAT	2	10	1845663	1845672	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40556	NC_010117	TTC	2	6	1845737	1845742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831524
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40563	NC_010117	AG	3	6	1845963	1845968	50 %	0 %	50 %	0 %	161831524
40564	NC_010117	CAAA	2	8	1845983	1845990	75 %	0 %	0 %	25 %	161831524
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40591	NC_010117	GC	3	6	1846801	1846806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40592	NC_010117	GAT	2	6	1846895	1846900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40604	NC_010117	CCGTG	2	10	1847614	1847623	0 %	20 %	40 %	40 %	161830960
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40978	NC_010117	CGT	2	6	1865436	1865441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40979	NC_010117	CTG	2	6	1865458	1865463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40980	NC_010117	TAT	2	6	1865464	1865469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40981	NC_010117	G	6	6	1865500	1865505	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40982	NC_010117	TGTC	2	8	1865602	1865609	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40983	NC_010117	ACG	2	6	1865631	1865636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40984	NC_010117	T	8	8	1865641	1865648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40985	NC_010117	CT	3	6	1865678	1865683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40986	NC_010117	GAT	2	6	1865712	1865717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40987	NC_010117	ATGGT	2	10	1865752	1865761	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40988	NC_010117	TAT	2	6	1865775	1865780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40989	NC_010117	TTC	2	6	1865793	1865798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40990	NC_010117	TATT	2	8	1865803	1865810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40991	NC_010117	ATT	2	6	1865822	1865827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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