MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39501	NC_010117	TCA	2	6	1797703	1797708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831616
39502	NC_010117	GAT	2	6	1797792	1797797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831616
39503	NC_010117	TGG	2	6	1797819	1797824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831616
39504	NC_010117	GCA	2	6	1797863	1797868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831616
39505	NC_010117	ACAA	2	8	1797884	1797891	75 %	0 %	0 %	25 %	161831616
39506	NC_010117	CCT	2	6	1797938	1797943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39507	NC_010117	ATTTTT	2	12	1798042	1798053	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	161831104
39508	NC_010117	ACG	2	6	1798173	1798178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831104
39509	NC_010117	TCC	2	6	1798258	1798263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161831104
39510	NC_010117	CGC	2	6	1798292	1798297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831104
39511	NC_010117	ATTA	2	8	1798305	1798312	50 %	50 %	0 %	0 %	161831104
39512	NC_010117	CGG	2	6	1798422	1798427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831104
39513	NC_010117	TTA	2	6	1798492	1798497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831104
39514	NC_010117	TCT	3	9	1798570	1798578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831104
39515	NC_010117	T	6	6	1798703	1798708	0 %	100 %	0 %	0 %	161831104
39516	NC_010117	CAT	2	6	1798731	1798736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831104
39517	NC_010117	CGG	2	6	1798775	1798780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831104
39518	NC_010117	TTC	2	6	1798827	1798832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831104
39519	NC_010117	GCG	2	6	1798837	1798842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831104
39520	NC_010117	CG	3	6	1798882	1798887	0 %	0 %	50 %	50 %	161831104
39521	NC_010117	GCT	2	6	1798930	1798935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831104
39522	NC_010117	ATT	2	6	1798962	1798967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831104
39523	NC_010117	ACCC	2	8	1799141	1799148	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39524	NC_010117	A	7	7	1799194	1799200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39525	NC_010117	TG	3	6	1799264	1799269	0 %	50 %	50 %	0 %	161831518
39526	NC_010117	TGA	2	6	1799274	1799279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831518
39527	NC_010117	GTAT	2	8	1799322	1799329	25 %	50 %	25 %	0 %	161831518
39528	NC_010117	GTG	2	6	1799359	1799364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831518
39529	NC_010117	GGA	2	6	1799377	1799382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831518
39530	NC_010117	GCA	2	6	1799442	1799447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831518
39531	NC_010117	AAC	2	6	1799555	1799560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831518
39532	NC_010117	GTT	2	6	1799637	1799642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831518
39533	NC_010117	GTG	2	6	1799669	1799674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831518
39534	NC_010117	AGCG	2	8	1799709	1799716	25 %	0 %	50 %	25 %	161831518
39535	NC_010117	TTGT	2	8	1799757	1799764	0 %	75 %	25 %	0 %	161831518
39536	NC_010117	TTG	2	6	1799773	1799778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831518
39537	NC_010117	GAG	2	6	1799806	1799811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831518
39538	NC_010117	GGGT	2	8	1799870	1799877	0 %	25 %	75 %	0 %	161831518
39539	NC_010117	TCA	2	6	1799919	1799924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831518
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39542	NC_010117	TGT	2	6	1799999	1800004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831518
39543	NC_010117	A	6	6	1800081	1800086	100 %	0 %	0 %	0 %	161831518
39544	NC_010117	GAAT	2	8	1800137	1800144	50 %	25 %	25 %	0 %	161831518
39545	NC_010117	TG	3	6	1800151	1800156	0 %	50 %	50 %	0 %	161831518
39546	NC_010117	CCG	2	6	1800235	1800240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830116
39547	NC_010117	A	8	8	1800246	1800253	100 %	0 %	0 %	0 %	161830116
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39549	NC_010117	TGA	2	6	1800301	1800306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830116
39550	NC_010117	TCA	2	6	1800395	1800400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830116
39551	NC_010117	TGG	2	6	1800410	1800415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830116
39552	NC_010117	CTTT	2	8	1800455	1800462	0 %	75 %	0 %	25 %	161830116
39553	NC_010117	TCA	2	6	1800463	1800468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830116
39554	NC_010117	TTG	2	6	1800476	1800481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830116
39555	NC_010117	ACA	2	6	1800482	1800487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830116
39556	NC_010117	GGGT	2	8	1800489	1800496	0 %	25 %	75 %	0 %	161830116
39557	NC_010117	CGAAA	2	10	1800513	1800522	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39558	NC_010117	ATT	2	6	1800535	1800540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39559	NC_010117	CGCTT	2	10	1800552	1800561	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39560	NC_010117	A	6	6	1800618	1800623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39561	NC_010117	TGAT	2	8	1800650	1800657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39562	NC_010117	TAA	2	6	1800679	1800684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39563	NC_010117	TTTTC	2	10	1800728	1800737	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39564	NC_010117	TCA	2	6	1800739	1800744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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39568	NC_010117	GAC	2	6	1801007	1801012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830982
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39573	NC_010117	ATT	2	6	1801088	1801093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830982
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39583	NC_010117	GCA	2	6	1801645	1801650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830982
39584	NC_010117	A	7	7	1801683	1801689	100 %	0 %	0 %	0 %	161830982
39585	NC_010117	AGCA	2	8	1801809	1801816	50 %	0 %	25 %	25 %	161830982
39586	NC_010117	GA	3	6	1801819	1801824	50 %	0 %	50 %	0 %	161830982
39587	NC_010117	TCAAA	2	10	1801842	1801851	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39588	NC_010117	AT	3	6	1801950	1801955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39589	NC_010117	TGA	2	6	1801956	1801961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39590	NC_010117	ATT	2	6	1802061	1802066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39591	NC_010117	CAT	2	6	1802212	1802217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39592	NC_010117	CTAA	2	8	1802234	1802241	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39593	NC_010117	CAC	2	6	1802260	1802265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830502
39594	NC_010117	CCAC	2	8	1802291	1802298	25 %	0 %	0 %	75 %	161830502
39595	NC_010117	TCG	2	6	1802390	1802395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830502
39596	NC_010117	CG	3	6	1802394	1802399	0 %	0 %	50 %	50 %	161830502
39597	NC_010117	ATCGA	2	10	1802467	1802476	40 %	20 %	20 %	20 %	161830502
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39600	NC_010117	CATA	2	8	1802583	1802590	50 %	25 %	0 %	25 %	161830502
39601	NC_010117	TCA	2	6	1802609	1802614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830502
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39603	NC_010117	CGGCTA	2	12	1802700	1802711	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161830502
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39611	NC_010117	CCTTT	2	10	1803036	1803045	0 %	60 %	0 %	40 %	161830502
39612	NC_010117	GAAAT	2	10	1803096	1803105	60 %	20 %	20 %	0 %	161830502
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39617	NC_010117	TAAGG	2	10	1803280	1803289	40 %	20 %	40 %	0 %	161830502
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39619	NC_010117	CAA	2	6	1803301	1803306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830502
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39983	NC_010117	GCA	2	6	1819863	1819868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831073
39984	NC_010117	T	6	6	1819949	1819954	0 %	100 %	0 %	0 %	161831073
39985	NC_010117	T	7	7	1819958	1819964	0 %	100 %	0 %	0 %	161831073
39986	NC_010117	TCC	2	6	1820018	1820023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161831073
39987	NC_010117	CTG	2	6	1820162	1820167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831073
39988	NC_010117	AGC	2	6	1820189	1820194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831073
39989	NC_010117	ATG	2	6	1820270	1820275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831073
39990	NC_010117	TCT	2	6	1820288	1820293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831073
39991	NC_010117	CTT	2	6	1820322	1820327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831073
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39998	NC_010117	TTC	2	6	1820662	1820667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831073
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