MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_010117	T	6	6	1574322	1574327	0 %	100 %	0 %	0 %	161830967
34503	NC_010117	CATT	2	8	1574344	1574351	25 %	50 %	0 %	25 %	161830967
34504	NC_010117	CGGTTA	2	12	1574383	1574394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161830967
34505	NC_010117	TTC	2	6	1574408	1574413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830967
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34507	NC_010117	TAA	2	6	1574506	1574511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830967
34508	NC_010117	CGG	2	6	1574515	1574520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830967
34509	NC_010117	TCAAA	2	10	1574632	1574641	60 %	20 %	0 %	20 %	161830967
34510	NC_010117	CA	3	6	1574666	1574671	50 %	0 %	0 %	50 %	161830967
34511	NC_010117	CGG	2	6	1574692	1574697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830967
34512	NC_010117	TGGC	2	8	1574721	1574728	0 %	25 %	50 %	25 %	161830967
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34517	NC_010117	TTA	2	6	1575035	1575040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830967
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34519	NC_010117	GGT	2	6	1575112	1575117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830967
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34527	NC_010117	GTTTT	2	10	1575634	1575643	0 %	80 %	20 %	0 %	161831514
34528	NC_010117	GC	3	6	1575651	1575656	0 %	0 %	50 %	50 %	161831514
34529	NC_010117	T	6	6	1575705	1575710	0 %	100 %	0 %	0 %	161831514
34530	NC_010117	TTAT	2	8	1575718	1575725	25 %	75 %	0 %	0 %	161831514
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34537	NC_010117	A	7	7	1576157	1576163	100 %	0 %	0 %	0 %	161831514
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34550	NC_010117	TAA	2	6	1576765	1576770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34551	NC_010117	ATTT	2	8	1576804	1576811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34552	NC_010117	TGCGC	2	10	1576853	1576862	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34553	NC_010117	GC	3	6	1576870	1576875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34554	NC_010117	TTC	2	6	1576950	1576955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830261
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34558	NC_010117	CAAATC	2	12	1577082	1577093	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	161830261
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34560	NC_010117	CCAA	2	8	1577206	1577213	50 %	0 %	0 %	50 %	161830261
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34588	NC_010117	TAA	2	6	1578537	1578542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34589	NC_010117	GA	3	6	1578590	1578595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34590	NC_010117	CTT	2	6	1578616	1578621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34591	NC_010117	GCT	2	6	1578630	1578635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34592	NC_010117	T	6	6	1578635	1578640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34595	NC_010117	TACT	2	8	1578746	1578753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34596	NC_010117	T	6	6	1578816	1578821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34597	NC_010117	T	6	6	1578848	1578853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34598	NC_010117	GTAA	2	8	1578865	1578872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34599	NC_010117	ATA	2	6	1578873	1578878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34600	NC_010117	T	6	6	1578994	1578999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34601	NC_010117	TA	3	6	1579094	1579099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34602	NC_010117	GCCT	2	8	1579174	1579181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34603	NC_010117	TGC	2	6	1579203	1579208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34605	NC_010117	GA	3	6	1579249	1579254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34606	NC_010117	GGT	2	6	1579334	1579339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34607	NC_010117	AGCGA	2	10	1579365	1579374	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34608	NC_010117	AAT	2	6	1579384	1579389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34609	NC_010117	CGCTT	2	10	1579407	1579416	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34610	NC_010117	TTTC	2	8	1579469	1579476	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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34614	NC_010117	A	6	6	1579541	1579546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34615	NC_010117	TAA	2	6	1579551	1579556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34620	NC_010117	TGA	3	9	1579665	1579673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34621	NC_010117	GAGTC	2	10	1579686	1579695	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34622	NC_010117	AAC	2	6	1579780	1579785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34999	NC_010117	TTAAT	2	10	1595734	1595743	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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