MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_010117	T	6	6	1553531	1553536	0 %	100 %	0 %	0 %	161830383
34002	NC_010117	CGG	2	6	1553568	1553573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830383
34003	NC_010117	GATT	2	8	1553580	1553587	25 %	50 %	25 %	0 %	161830383
34004	NC_010117	AT	3	6	1553761	1553766	50 %	50 %	0 %	0 %	161830383
34005	NC_010117	ACC	2	6	1553976	1553981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830383
34006	NC_010117	TAA	2	6	1554067	1554072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830383
34007	NC_010117	CAC	2	6	1554095	1554100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830383
34008	NC_010117	ATT	2	6	1554191	1554196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830383
34009	NC_010117	TCA	2	6	1554216	1554221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830383
34010	NC_010117	T	6	6	1554346	1554351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34011	NC_010117	GA	3	6	1554391	1554396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34012	NC_010117	T	6	6	1554617	1554622	0 %	100 %	0 %	0 %	161830186
34013	NC_010117	TCC	2	6	1554634	1554639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830186
34014	NC_010117	CT	3	6	1554668	1554673	0 %	50 %	0 %	50 %	161830186
34015	NC_010117	ACAGTT	2	12	1554689	1554700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161830186
34016	NC_010117	TGG	2	6	1554741	1554746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830186
34017	NC_010117	TTC	2	6	1554775	1554780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830186
34018	NC_010117	AT	3	6	1554827	1554832	50 %	50 %	0 %	0 %	161830186
34019	NC_010117	TAA	2	6	1554919	1554924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831235
34020	NC_010117	T	6	6	1554934	1554939	0 %	100 %	0 %	0 %	161831235
34021	NC_010117	TCA	2	6	1554962	1554967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831235
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34023	NC_010117	TGA	2	6	1554990	1554995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831235
34024	NC_010117	CCG	2	6	1555012	1555017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831235
34025	NC_010117	TCA	2	6	1555061	1555066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831235
34026	NC_010117	GTG	2	6	1555142	1555147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831235
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34028	NC_010117	GCT	2	6	1555312	1555317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831047
34029	NC_010117	CGA	2	6	1555423	1555428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831047
34030	NC_010117	ATTA	2	8	1555445	1555452	50 %	50 %	0 %	0 %	161831047
34031	NC_010117	GCG	2	6	1555468	1555473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831047
34032	NC_010117	GC	3	6	1555505	1555510	0 %	0 %	50 %	50 %	161831047
34033	NC_010117	CGA	2	6	1555513	1555518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831047
34034	NC_010117	CAT	2	6	1555679	1555684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34035	NC_010117	ACT	2	6	1555692	1555697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34036	NC_010117	A	6	6	1555758	1555763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34037	NC_010117	TTAA	2	8	1555786	1555793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34038	NC_010117	T	7	7	1555798	1555804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34039	NC_010117	TGT	2	6	1555827	1555832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34040	NC_010117	TTA	2	6	1555862	1555867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34041	NC_010117	TTA	2	6	1555885	1555890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34042	NC_010117	ACA	2	6	1555894	1555899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34043	NC_010117	ATT	2	6	1555911	1555916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34044	NC_010117	AGA	2	6	1555969	1555974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34045	NC_010117	A	7	7	1555989	1555995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34049	NC_010117	AAAG	2	8	1556082	1556089	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34050	NC_010117	CGG	3	9	1556107	1556115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34051	NC_010117	CAG	2	6	1556116	1556121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34052	NC_010117	CGA	2	6	1556182	1556187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34053	NC_010117	CGT	2	6	1556281	1556286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34054	NC_010117	GAA	2	6	1556417	1556422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34055	NC_010117	GAA	2	6	1556456	1556461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34056	NC_010117	A	6	6	1556460	1556465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34057	NC_010117	GAAAAG	3	18	1556477	1556494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34058	NC_010117	GAA	2	6	1556519	1556524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34059	NC_010117	AGAAAA	2	12	1556659	1556670	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34060	NC_010117	A	6	6	1556685	1556690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34061	NC_010117	TA	3	6	1556692	1556697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34062	NC_010117	AGG	2	6	1556733	1556738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34063	NC_010117	CCT	2	6	1556777	1556782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34064	NC_010117	GCCAT	2	10	1556786	1556795	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34065	NC_010117	TTCC	2	8	1556832	1556839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34066	NC_010117	GAA	2	6	1556840	1556845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34069	NC_010117	T	6	6	1556899	1556904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34070	NC_010117	CAA	2	6	1556935	1556940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34071	NC_010117	GGA	2	6	1556941	1556946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34072	NC_010117	TTC	2	6	1557052	1557057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831188
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34074	NC_010117	GCT	2	6	1557069	1557074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831188
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34082	NC_010117	TCC	2	6	1557188	1557193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161831188
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34088	NC_010117	GTA	2	6	1557396	1557401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831188
34089	NC_010117	TCGA	2	8	1557421	1557428	25 %	25 %	25 %	25 %	161831188
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34093	NC_010117	A	6	6	1557590	1557595	100 %	0 %	0 %	0 %	161831188
34094	NC_010117	CGA	2	6	1557596	1557601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831188
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34101	NC_010117	CT	3	6	1557952	1557957	0 %	50 %	0 %	50 %	161831188
34102	NC_010117	AACTG	2	10	1557994	1558003	40 %	20 %	20 %	20 %	161831188
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34105	NC_010117	T	6	6	1558033	1558038	0 %	100 %	0 %	0 %	161831188
34106	NC_010117	CTT	2	6	1558152	1558157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831188
34107	NC_010117	C	6	6	1558312	1558317	0 %	0 %	0 %	100 %	161831188
34108	NC_010117	A	6	6	1558346	1558351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34109	NC_010117	CAG	2	6	1558353	1558358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34110	NC_010117	A	6	6	1558382	1558387	100 %	0 %	0 %	0 %	161829911
34111	NC_010117	GCA	2	6	1558424	1558429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161829911
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34231	NC_010117	TTA	2	6	1563804	1563809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34233	NC_010117	CTAC	2	8	1563934	1563941	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34234	NC_010117	T	6	6	1564025	1564030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34235	NC_010117	CGT	2	6	1564046	1564051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34238	NC_010117	CTT	2	6	1564232	1564237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34239	NC_010117	AAGT	2	8	1564239	1564246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34240	NC_010117	T	6	6	1564261	1564266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34242	NC_010117	ATA	2	6	1564354	1564359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34286	NC_010117	AT	3	6	1565803	1565808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34287	NC_010117	T	6	6	1565834	1565839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34352	NC_010117	AGAAA	2	10	1568148	1568157	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34353	NC_010117	A	6	6	1568155	1568160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34359	NC_010117	A	6	6	1568341	1568346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34360	NC_010117	CGG	2	6	1568354	1568359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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34362	NC_010117	CTG	2	6	1568404	1568409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34365	NC_010117	A	6	6	1568494	1568499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34366	NC_010117	CAA	2	6	1568518	1568523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34367	NC_010117	ATT	2	6	1568567	1568572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34492	NC_010117	ATG	2	6	1574003	1574008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830967
34493	NC_010117	ACA	2	6	1574040	1574045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830967
34494	NC_010117	ACC	2	6	1574066	1574071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830967
34495	NC_010117	TCA	2	6	1574136	1574141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830967
34496	NC_010117	CGC	2	6	1574161	1574166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830967
34497	NC_010117	GC	4	8	1574165	1574172	0 %	0 %	50 %	50 %	161830967
34498	NC_010117	CCAAC	2	10	1574179	1574188	40 %	0 %	0 %	60 %	161830967
34499	NC_010117	GAC	2	6	1574207	1574212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830967
34500	NC_010117	A	6	6	1574264	1574269	100 %	0 %	0 %	0 %	161830967

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