MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_010117	AGCG	2	8	1530311	1530318	25 %	0 %	50 %	25 %	161830440
33502	NC_010117	TTGT	2	8	1530359	1530366	0 %	75 %	25 %	0 %	161830440
33503	NC_010117	TTG	2	6	1530375	1530380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830440
33504	NC_010117	GAG	2	6	1530408	1530413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830440
33505	NC_010117	GGGT	2	8	1530472	1530479	0 %	25 %	75 %	0 %	161830440
33506	NC_010117	TCA	2	6	1530521	1530526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830440
33507	NC_010117	ACA	2	6	1530575	1530580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830440
33508	NC_010117	AGG	2	6	1530595	1530600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830440
33509	NC_010117	TGT	2	6	1530601	1530606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830440
33510	NC_010117	A	6	6	1530683	1530688	100 %	0 %	0 %	0 %	161830440
33511	NC_010117	GAAT	2	8	1530739	1530746	50 %	25 %	25 %	0 %	161830440
33512	NC_010117	TG	3	6	1530753	1530758	0 %	50 %	50 %	0 %	161830440
33513	NC_010117	CCG	2	6	1530837	1530842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830014
33514	NC_010117	A	8	8	1530848	1530855	100 %	0 %	0 %	0 %	161830014
33515	NC_010117	AC	3	6	1530872	1530877	50 %	0 %	0 %	50 %	161830014
33516	NC_010117	TGA	2	6	1530903	1530908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830014
33517	NC_010117	TCA	2	6	1530997	1531002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830014
33518	NC_010117	TGG	2	6	1531012	1531017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830014
33519	NC_010117	CTTT	2	8	1531057	1531064	0 %	75 %	0 %	25 %	161830014
33520	NC_010117	TCA	2	6	1531065	1531070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830014
33521	NC_010117	TTG	2	6	1531078	1531083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830014
33522	NC_010117	ACA	2	6	1531084	1531089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830014
33523	NC_010117	GGGT	2	8	1531091	1531098	0 %	25 %	75 %	0 %	161830014
33524	NC_010117	AGCGA	2	10	1531112	1531121	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33525	NC_010117	C	7	7	1531158	1531164	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33526	NC_010117	AGG	2	6	1531168	1531173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33527	NC_010117	T	7	7	1531184	1531190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33528	NC_010117	GGTAA	2	10	1531240	1531249	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33529	NC_010117	ATTTTC	2	12	1531257	1531268	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33530	NC_010117	CTT	2	6	1531371	1531376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829851
33531	NC_010117	AAT	2	6	1531404	1531409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829851
33532	NC_010117	A	6	6	1531422	1531427	100 %	0 %	0 %	0 %	161829851
33533	NC_010117	ATA	2	6	1531454	1531459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829851
33534	NC_010117	GC	3	6	1531462	1531467	0 %	0 %	50 %	50 %	161829851
33535	NC_010117	GAA	2	6	1531537	1531542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829851
33536	NC_010117	T	6	6	1531563	1531568	0 %	100 %	0 %	0 %	161829851
33537	NC_010117	GAA	2	6	1531576	1531581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829851
33538	NC_010117	CTT	2	6	1531643	1531648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829851
33539	NC_010117	T	6	6	1531651	1531656	0 %	100 %	0 %	0 %	161829851
33540	NC_010117	GA	3	6	1531716	1531721	50 %	0 %	50 %	0 %	161829851
33541	NC_010117	A	6	6	1531734	1531739	100 %	0 %	0 %	0 %	161829851
33542	NC_010117	CGA	2	6	1531740	1531745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161829851
33543	NC_010117	T	6	6	1531749	1531754	0 %	100 %	0 %	0 %	161829851
33544	NC_010117	ATGA	2	8	1531813	1531820	50 %	25 %	25 %	0 %	161829851
33545	NC_010117	CTT	2	6	1531828	1531833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829851
33546	NC_010117	AG	3	6	1531852	1531857	50 %	0 %	50 %	0 %	161829851
33547	NC_010117	ATT	3	9	1531875	1531883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829851
33548	NC_010117	CAA	2	6	1531890	1531895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161829851
33549	NC_010117	AGC	2	6	1531911	1531916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161829851
33550	NC_010117	TCC	2	6	1531928	1531933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161829851
33551	NC_010117	TCG	2	6	1531971	1531976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161829851
33552	NC_010117	T	6	6	1532014	1532019	0 %	100 %	0 %	0 %	161829851
33553	NC_010117	ATT	2	6	1532056	1532061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829851
33554	NC_010117	TAC	2	6	1532079	1532084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829851
33555	NC_010117	TTC	2	6	1532089	1532094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829851
33556	NC_010117	CTT	2	6	1532150	1532155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829851
33557	NC_010117	AGGG	2	8	1532181	1532188	25 %	0 %	75 %	0 %	161829851
33558	NC_010117	T	6	6	1532200	1532205	0 %	100 %	0 %	0 %	161829851
33559	NC_010117	AAT	2	6	1532221	1532226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829851
33560	NC_010117	GCT	2	6	1532230	1532235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161829851
33561	NC_010117	CCA	2	6	1532278	1532283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161829851
33562	NC_010117	ATT	2	6	1532313	1532318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830213
33563	NC_010117	TTTC	2	8	1532343	1532350	0 %	75 %	0 %	25 %	161830213
33564	NC_010117	AAT	2	6	1532386	1532391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830213
33565	NC_010117	GGC	2	6	1532428	1532433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830213
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33567	NC_010117	TTG	2	6	1532530	1532535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830213
33568	NC_010117	TGGCGT	2	12	1532556	1532567	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	161830213
33569	NC_010117	TTC	2	6	1532629	1532634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830213
33570	NC_010117	T	7	7	1532689	1532695	0 %	100 %	0 %	0 %	161830213
33571	NC_010117	CCTC	2	8	1532726	1532733	0 %	25 %	0 %	75 %	161830213
33572	NC_010117	CAA	2	6	1532768	1532773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830213
33573	NC_010117	CGT	2	6	1532871	1532876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830213
33574	NC_010117	GGC	2	6	1532889	1532894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830213
33575	NC_010117	TCT	2	6	1532897	1532902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830213
33576	NC_010117	CAT	2	6	1532944	1532949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830213
33577	NC_010117	T	7	7	1533047	1533053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33578	NC_010117	CAT	2	6	1533108	1533113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33579	NC_010117	TCT	2	6	1533114	1533119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831159
33580	NC_010117	GCA	2	6	1533137	1533142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831159
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33582	NC_010117	GTC	2	6	1533201	1533206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831159
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33584	NC_010117	T	7	7	1533255	1533261	0 %	100 %	0 %	0 %	161831159
33585	NC_010117	T	7	7	1533268	1533274	0 %	100 %	0 %	0 %	161831159
33586	NC_010117	TTAA	2	8	1533281	1533288	50 %	50 %	0 %	0 %	161831159
33587	NC_010117	ATC	2	6	1533328	1533333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831159
33588	NC_010117	TAA	2	6	1533350	1533355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831159
33589	NC_010117	GAT	2	6	1533365	1533370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831159
33590	NC_010117	TCA	2	6	1533432	1533437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831159
33591	NC_010117	AAT	2	6	1533455	1533460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831159
33592	NC_010117	GCTG	2	8	1533481	1533488	0 %	25 %	50 %	25 %	161831159
33593	NC_010117	ATTTCA	2	12	1533527	1533538	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	161831159
33594	NC_010117	T	7	7	1533653	1533659	0 %	100 %	0 %	0 %	161831159
33595	NC_010117	CTT	2	6	1533663	1533668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831159
33596	NC_010117	A	7	7	1533750	1533756	100 %	0 %	0 %	0 %	161831159
33597	NC_010117	GT	3	6	1533760	1533765	0 %	50 %	50 %	0 %	161831159
33598	NC_010117	ATT	2	6	1533767	1533772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831159
33599	NC_010117	T	6	6	1533771	1533776	0 %	100 %	0 %	0 %	161831159
33600	NC_010117	AAC	2	6	1533862	1533867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831159
33601	NC_010117	CTT	2	6	1534014	1534019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831582
33602	NC_010117	T	7	7	1534018	1534024	0 %	100 %	0 %	0 %	161831582
33603	NC_010117	A	6	6	1534041	1534046	100 %	0 %	0 %	0 %	161831582
33604	NC_010117	CTGT	2	8	1534093	1534100	0 %	50 %	25 %	25 %	161831582
33605	NC_010117	TGT	2	6	1534110	1534115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831582
33606	NC_010117	GATC	2	8	1534177	1534184	25 %	25 %	25 %	25 %	161831582
33607	NC_010117	T	6	6	1534188	1534193	0 %	100 %	0 %	0 %	161831582
33608	NC_010117	GAC	2	6	1534231	1534236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831582
33609	NC_010117	AATT	2	8	1534271	1534278	50 %	50 %	0 %	0 %	161831582
33610	NC_010117	TAA	2	6	1534283	1534288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831582
33611	NC_010117	ATT	2	6	1534304	1534309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831582
33612	NC_010117	TTC	2	6	1534310	1534315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831582
33613	NC_010117	CGTTAA	2	12	1534322	1534333	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161831582
33614	NC_010117	AGTT	2	8	1534358	1534365	25 %	50 %	25 %	0 %	161831582
33615	NC_010117	CGA	2	6	1534374	1534379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831582
33616	NC_010117	TGG	2	6	1534430	1534435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831582
33617	NC_010117	CTT	3	9	1534453	1534461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831582
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33619	NC_010117	AAAT	2	8	1534594	1534601	75 %	25 %	0 %	0 %	161831582
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