MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_010117	GAAA	2	8	1441152	1441159	75 %	0 %	25 %	0 %	161830628
31503	NC_010117	GTC	2	6	1441208	1441213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830628
31504	NC_010117	TA	3	6	1441300	1441305	50 %	50 %	0 %	0 %	161830628
31505	NC_010117	ATC	2	6	1441399	1441404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830628
31506	NC_010117	CGG	2	6	1441428	1441433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830628
31507	NC_010117	GCA	2	6	1441460	1441465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830628
31508	NC_010117	ATA	2	6	1441498	1441503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830628
31509	NC_010117	CCG	2	6	1441520	1441525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830628
31510	NC_010117	TAC	2	6	1441551	1441556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830628
31511	NC_010117	CCGC	2	8	1441676	1441683	0 %	0 %	25 %	75 %	161830628
31512	NC_010117	GCT	2	6	1441690	1441695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830628
31513	NC_010117	AGA	2	6	1441704	1441709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830628
31514	NC_010117	AGG	2	6	1441728	1441733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830628
31515	NC_010117	CCA	2	6	1441882	1441887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831056
31516	NC_010117	TCT	2	6	1441986	1441991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831056
31517	NC_010117	TTG	2	6	1442039	1442044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831056
31518	NC_010117	CCAT	2	8	1442068	1442075	25 %	25 %	0 %	50 %	161831056
31519	NC_010117	CATA	2	8	1442128	1442135	50 %	25 %	0 %	25 %	161831056
31520	NC_010117	A	7	7	1442214	1442220	100 %	0 %	0 %	0 %	161831056
31521	NC_010117	ATT	2	6	1442252	1442257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831056
31522	NC_010117	GAC	2	6	1442263	1442268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831056
31523	NC_010117	GAT	2	6	1442314	1442319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831056
31524	NC_010117	AAG	2	6	1442494	1442499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831056
31525	NC_010117	TAA	2	6	1442533	1442538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831056
31526	NC_010117	A	7	7	1442547	1442553	100 %	0 %	0 %	0 %	161831056
31527	NC_010117	TTCATC	2	12	1442589	1442600	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	161831056
31528	NC_010117	TTG	2	6	1442647	1442652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31529	NC_010117	T	6	6	1442718	1442723	0 %	100 %	0 %	0 %	161830680
31530	NC_010117	TG	3	6	1442744	1442749	0 %	50 %	50 %	0 %	161830680
31531	NC_010117	GATC	2	8	1442750	1442757	25 %	25 %	25 %	25 %	161830680
31532	NC_010117	CTT	2	6	1442825	1442830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830680
31533	NC_010117	CTT	2	6	1442842	1442847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830680
31534	NC_010117	ATC	2	6	1442877	1442882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830680
31535	NC_010117	T	7	7	1442910	1442916	0 %	100 %	0 %	0 %	161830680
31536	NC_010117	GCTC	2	8	1442985	1442992	0 %	25 %	25 %	50 %	161830680
31537	NC_010117	T	6	6	1442999	1443004	0 %	100 %	0 %	0 %	161830680
31538	NC_010117	GAG	2	6	1443083	1443088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830680
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31541	NC_010117	T	7	7	1443125	1443131	0 %	100 %	0 %	0 %	161830680
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31545	NC_010117	A	7	7	1443329	1443335	100 %	0 %	0 %	0 %	161830680
31546	NC_010117	T	6	6	1443371	1443376	0 %	100 %	0 %	0 %	161830680
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31552	NC_010117	T	6	6	1443601	1443606	0 %	100 %	0 %	0 %	161830680
31553	NC_010117	AAT	2	6	1443617	1443622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830680
31554	NC_010117	AAT	2	6	1443627	1443632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830680
31555	NC_010117	GA	3	6	1443654	1443659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31556	NC_010117	A	6	6	1443684	1443689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31557	NC_010117	ACC	2	6	1443721	1443726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31558	NC_010117	TAATT	2	10	1443770	1443779	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31559	NC_010117	TAT	2	6	1443783	1443788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31560	NC_010117	ATA	2	6	1443794	1443799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31561	NC_010117	CGA	2	6	1443913	1443918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831001
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31564	NC_010117	TCAG	2	8	1444022	1444029	25 %	25 %	25 %	25 %	161831001
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31571	NC_010117	ACT	2	6	1444726	1444731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829811
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31588	NC_010117	TTTG	2	8	1445546	1445553	0 %	75 %	25 %	0 %	161831523
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31602	NC_010117	GCAA	2	8	1446403	1446410	50 %	0 %	25 %	25 %	161831523
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31606	NC_010117	CT	3	6	1446727	1446732	0 %	50 %	0 %	50 %	161831523
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31609	NC_010117	TCGT	2	8	1446886	1446893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31610	NC_010117	ACGC	2	8	1446896	1446903	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31611	NC_010117	AGC	2	6	1446968	1446973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31615	NC_010117	CTC	2	6	1447068	1447073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31617	NC_010117	TAA	2	6	1447096	1447101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31618	NC_010117	A	6	6	1447133	1447138	100 %	0 %	0 %	0 %	161830978
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31989	NC_010117	CGC	2	6	1463356	1463361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830000
31990	NC_010117	ATA	2	6	1463367	1463372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830000
31991	NC_010117	CTTCA	2	10	1463378	1463387	20 %	40 %	0 %	40 %	161830000
31992	NC_010117	TTA	2	6	1463400	1463405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830000
31993	NC_010117	TTGC	2	8	1463471	1463478	0 %	50 %	25 %	25 %	161830000
31994	NC_010117	T	6	6	1463522	1463527	0 %	100 %	0 %	0 %	161830000
31995	NC_010117	CAC	2	6	1463597	1463602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830000
31996	NC_010117	CTT	2	6	1463608	1463613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830000
31997	NC_010117	CAT	2	6	1463689	1463694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830000
31998	NC_010117	ATC	2	6	1463700	1463705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830000
31999	NC_010117	CTA	2	6	1463731	1463736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830000
32000	NC_010117	CGC	2	6	1463761	1463766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830000

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