MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30217	NC_010117	A	6	6	1381813	1381818	100 %	0 %	0 %	0 %	161831019
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30226	NC_010117	TGGG	2	8	1382260	1382267	0 %	25 %	75 %	0 %	161829775
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30230	NC_010117	CG	3	6	1382456	1382461	0 %	0 %	50 %	50 %	161830212
30231	NC_010117	ATG	2	6	1382503	1382508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830212
30232	NC_010117	T	6	6	1382637	1382642	0 %	100 %	0 %	0 %	161830212
30233	NC_010117	GTT	2	6	1382646	1382651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830212
30234	NC_010117	CGG	2	6	1382652	1382657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830212
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30236	NC_010117	AATC	2	8	1382718	1382725	50 %	25 %	0 %	25 %	161830212
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30239	NC_010117	GTTTT	2	10	1383008	1383017	0 %	80 %	20 %	0 %	161830212
30240	NC_010117	TAA	2	6	1383109	1383114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830212
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30242	NC_010117	CA	3	6	1383189	1383194	50 %	0 %	0 %	50 %	161830212
30243	NC_010117	ATG	2	6	1383220	1383225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830212
30244	NC_010117	C	6	6	1383252	1383257	0 %	0 %	0 %	100 %	161830212
30245	NC_010117	AAT	2	6	1383325	1383330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830212
30246	NC_010117	TAA	2	6	1383351	1383356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830212
30247	NC_010117	TC	3	6	1383369	1383374	0 %	50 %	0 %	50 %	161830212
30248	NC_010117	TTC	2	6	1383379	1383384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830212
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30250	NC_010117	GCT	2	6	1383540	1383545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830212
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30252	NC_010117	GCA	2	6	1383670	1383675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831539
30253	NC_010117	CCA	2	6	1383679	1383684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831539
30254	NC_010117	A	6	6	1383754	1383759	100 %	0 %	0 %	0 %	161831539
30255	NC_010117	CAT	2	6	1383808	1383813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831539
30256	NC_010117	CGA	2	6	1383857	1383862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831539
30257	NC_010117	TTG	2	6	1383977	1383982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831539
30258	NC_010117	GAT	2	6	1384003	1384008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831539
30259	NC_010117	CGT	2	6	1384039	1384044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831539
30260	NC_010117	ATA	2	6	1384049	1384054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831539
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30263	NC_010117	ATC	2	6	1384106	1384111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831539
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30269	NC_010117	CGTT	2	8	1384294	1384301	0 %	50 %	25 %	25 %	161831539
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30271	NC_010117	AAG	2	6	1384343	1384348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831539
30272	NC_010117	GA	3	6	1384395	1384400	50 %	0 %	50 %	0 %	161831539
30273	NC_010117	GAA	2	6	1384447	1384452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831539
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30292	NC_010117	CAAA	2	8	1385388	1385395	75 %	0 %	0 %	25 %	161830751
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30322	NC_010117	CAA	2	6	1387108	1387113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161829979
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30325	NC_010117	TGA	2	6	1387272	1387277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161829979
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30329	NC_010117	CGT	2	6	1387408	1387413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161829979
30330	NC_010117	GCG	2	6	1387427	1387432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161829979
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30332	NC_010117	GCCA	2	8	1387528	1387535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30333	NC_010117	AGCGA	2	10	1387564	1387573	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30334	NC_010117	GAC	2	6	1387589	1387594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30337	NC_010117	GCT	2	6	1387795	1387800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831007
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30341	NC_010117	TAT	3	9	1387981	1387989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831007
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30349	NC_010117	AATT	2	8	1388346	1388353	50 %	50 %	0 %	0 %	161831007
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30352	NC_010117	A	7	7	1388381	1388387	100 %	0 %	0 %	0 %	161831007
30353	NC_010117	TCA	2	6	1388428	1388433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831007
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30357	NC_010117	GAT	2	6	1388774	1388779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831007
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30359	NC_010117	A	6	6	1388831	1388836	100 %	0 %	0 %	0 %	161831007
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30481	NC_010117	A	6	6	1395009	1395014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30482	NC_010117	GAA	2	6	1395015	1395020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30483	NC_010117	GGA	2	6	1395035	1395040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30484	NC_010117	GAA	2	6	1395057	1395062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30485	NC_010117	A	6	6	1395091	1395096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30486	NC_010117	CTT	2	6	1395123	1395128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30487	NC_010117	ATG	2	6	1395135	1395140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30488	NC_010117	G	6	6	1395143	1395148	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30489	NC_010117	TAC	2	6	1395161	1395166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30490	NC_010117	GCCGA	2	10	1395191	1395200	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30491	NC_010117	G	12	12	1395213	1395224	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30492	NC_010117	AAG	2	6	1395273	1395278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831184
30493	NC_010117	CT	3	6	1395392	1395397	0 %	50 %	0 %	50 %	161831184
30494	NC_010117	CAT	2	6	1395538	1395543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831351
30495	NC_010117	GTT	2	6	1395545	1395550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831351
30496	NC_010117	TA	3	6	1395616	1395621	50 %	50 %	0 %	0 %	161831351
30497	NC_010117	CTT	2	6	1395649	1395654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30498	NC_010117	TCCAAG	2	12	1395715	1395726	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	161831289
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