MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_010117	ATG	2	6	1232827	1232832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830626
27003	NC_010117	CATTG	2	10	1232957	1232966	20 %	40 %	20 %	20 %	161830626
27004	NC_010117	TTTTA	2	10	1233009	1233018	20 %	80 %	0 %	0 %	161830626
27005	NC_010117	A	6	6	1233028	1233033	100 %	0 %	0 %	0 %	161830626
27006	NC_010117	AAT	2	6	1233051	1233056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830626
27007	NC_010117	TAAA	2	8	1233066	1233073	75 %	25 %	0 %	0 %	161830626
27008	NC_010117	GCA	2	6	1233097	1233102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830626
27009	NC_010117	A	6	6	1233120	1233125	100 %	0 %	0 %	0 %	161830626
27010	NC_010117	A	7	7	1233132	1233138	100 %	0 %	0 %	0 %	161830626
27011	NC_010117	GAA	2	6	1233140	1233145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830626
27012	NC_010117	ATAA	2	8	1233165	1233172	75 %	25 %	0 %	0 %	161830626
27013	NC_010117	ATAA	2	8	1233203	1233210	75 %	25 %	0 %	0 %	161830626
27014	NC_010117	AC	3	6	1233245	1233250	50 %	0 %	0 %	50 %	161830626
27015	NC_010117	CA	3	6	1233357	1233362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27016	NC_010117	GC	3	6	1233400	1233405	0 %	0 %	50 %	50 %	161830063
27017	NC_010117	ATT	2	6	1233428	1233433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830063
27018	NC_010117	TATCAC	2	12	1233446	1233457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830063
27019	NC_010117	GAG	2	6	1233466	1233471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830063
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27021	NC_010117	AGCGA	2	10	1233538	1233547	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27022	NC_010117	A	6	6	1233641	1233646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27023	NC_010117	AAT	2	6	1233685	1233690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27024	NC_010117	GTTATA	2	12	1233700	1233711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27025	NC_010117	ATG	2	6	1233786	1233791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161829735
27026	NC_010117	TAT	2	6	1233793	1233798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829735
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27040	NC_010117	CCAT	2	8	1234427	1234434	25 %	25 %	0 %	50 %	161829735
27041	NC_010117	CTTT	2	8	1234442	1234449	0 %	75 %	0 %	25 %	161829735
27042	NC_010117	TAT	2	6	1234488	1234493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829735
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27050	NC_010117	GTT	2	6	1235009	1235014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27052	NC_010117	TTA	2	6	1235127	1235132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27053	NC_010117	ATTC	2	8	1235133	1235140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27054	NC_010117	CTT	2	6	1235142	1235147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27058	NC_010117	T	6	6	1235350	1235355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27059	NC_010117	GAA	2	6	1235457	1235462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27061	NC_010117	CCG	2	6	1235538	1235543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27062	NC_010117	AGT	2	6	1235606	1235611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27069	NC_010117	CTT	2	6	1235886	1235891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27072	NC_010117	T	7	7	1236043	1236049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27073	NC_010117	AAAT	2	8	1236100	1236107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27074	NC_010117	TAAAA	2	10	1236108	1236117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27090	NC_010117	TTAT	2	8	1236801	1236808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27091	NC_010117	T	8	8	1236826	1236833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27108	NC_010117	CGG	2	6	1237685	1237690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830865
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27110	NC_010117	GAACA	2	10	1237708	1237717	60 %	0 %	20 %	20 %	161830865
27111	NC_010117	TTTA	2	8	1237722	1237729	25 %	75 %	0 %	0 %	161830865
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27121	NC_010117	AG	3	6	1238229	1238234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27122	NC_010117	GCC	2	6	1238313	1238318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27123	NC_010117	ACCC	2	8	1238355	1238362	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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27246	NC_010117	GGC	2	6	1243345	1243350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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27364	NC_010117	AAT	2	6	1249680	1249685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830430
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27481	NC_010117	CAA	2	6	1255521	1255526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830979
27482	NC_010117	GAA	2	6	1255533	1255538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830979
27483	NC_010117	CAA	2	6	1255590	1255595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830979
27484	NC_010117	ACA	2	6	1255649	1255654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830979
27485	NC_010117	A	6	6	1255664	1255669	100 %	0 %	0 %	0 %	161830979
27486	NC_010117	GCT	2	6	1255679	1255684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830979
27487	NC_010117	AAC	2	6	1255763	1255768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830979
27488	NC_010117	ATT	2	6	1255774	1255779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830979
27489	NC_010117	A	6	6	1255812	1255817	100 %	0 %	0 %	0 %	161830979
27490	NC_010117	T	6	6	1255844	1255849	0 %	100 %	0 %	0 %	161830979
27491	NC_010117	TAT	2	6	1255955	1255960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830979
27492	NC_010117	AAG	2	6	1255978	1255983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830979
27493	NC_010117	AAAT	2	8	1256029	1256036	75 %	25 %	0 %	0 %	161830979
27494	NC_010117	TAAAA	2	10	1256087	1256096	80 %	20 %	0 %	0 %	161830979
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27496	NC_010117	TAAA	2	8	1256236	1256243	75 %	25 %	0 %	0 %	161830979
27497	NC_010117	TCA	2	6	1256285	1256290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830979
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27499	NC_010117	A	7	7	1256310	1256316	100 %	0 %	0 %	0 %	161830979
27500	NC_010117	ATT	2	6	1256367	1256372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830979

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