MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26501	NC_010117	ATCA	2	8	1209273	1209280	50 %	25 %	0 %	25 %	161831046
26502	NC_010117	GCCTTC	2	12	1209300	1209311	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	161831046
26503	NC_010117	ATC	2	6	1209360	1209365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831046
26504	NC_010117	TCG	2	6	1209393	1209398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831046
26505	NC_010117	T	6	6	1209405	1209410	0 %	100 %	0 %	0 %	161831046
26506	NC_010117	AAC	2	6	1209432	1209437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831046
26507	NC_010117	GCC	2	6	1209601	1209606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831046
26508	NC_010117	GAC	2	6	1209673	1209678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831046
26509	NC_010117	TCC	2	6	1209703	1209708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161831046
26510	NC_010117	GCTC	2	8	1209713	1209720	0 %	25 %	25 %	50 %	161831046
26511	NC_010117	ATA	2	6	1209765	1209770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831046
26512	NC_010117	CGT	2	6	1209804	1209809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831046
26513	NC_010117	GAAA	2	8	1209827	1209834	75 %	0 %	25 %	0 %	161831046
26514	NC_010117	CGGAT	2	10	1209857	1209866	20 %	20 %	40 %	20 %	161831046
26515	NC_010117	AAT	2	6	1209868	1209873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831046
26516	NC_010117	TAT	2	6	1209912	1209917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831046
26517	NC_010117	CCCG	2	8	1209933	1209940	0 %	0 %	25 %	75 %	161831046
26518	NC_010117	GCC	2	6	1209962	1209967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831046
26519	NC_010117	A	6	6	1210080	1210085	100 %	0 %	0 %	0 %	161831046
26520	NC_010117	TTGAT	2	10	1210159	1210168	20 %	60 %	20 %	0 %	161831046
26521	NC_010117	A	7	7	1210197	1210203	100 %	0 %	0 %	0 %	161831046
26522	NC_010117	TC	4	8	1210253	1210260	0 %	50 %	0 %	50 %	161831046
26523	NC_010117	T	7	7	1210305	1210311	0 %	100 %	0 %	0 %	161831046
26524	NC_010117	TGA	2	6	1210345	1210350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831046
26525	NC_010117	TAAA	2	8	1210356	1210363	75 %	25 %	0 %	0 %	161831046
26526	NC_010117	AGGAT	2	10	1210368	1210377	40 %	20 %	40 %	0 %	161831046
26527	NC_010117	ATC	2	6	1210380	1210385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831046
26528	NC_010117	GCA	2	6	1210388	1210393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831046
26529	NC_010117	TGA	2	6	1210421	1210426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831046
26530	NC_010117	TCG	2	6	1210469	1210474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831046
26531	NC_010117	CAT	2	6	1210497	1210502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831046
26532	NC_010117	CGA	2	6	1210528	1210533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831046
26533	NC_010117	GCT	2	6	1210539	1210544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831046
26534	NC_010117	GC	3	6	1210563	1210568	0 %	0 %	50 %	50 %	161831046
26535	NC_010117	GGTA	2	8	1210626	1210633	25 %	25 %	50 %	0 %	161831046
26536	NC_010117	GAGG	2	8	1210708	1210715	25 %	0 %	75 %	0 %	161829894
26537	NC_010117	GGA	2	6	1210729	1210734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161829894
26538	NC_010117	ATCA	2	8	1210797	1210804	50 %	25 %	0 %	25 %	161829894
26539	NC_010117	TA	3	6	1210882	1210887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26540	NC_010117	GAG	2	6	1210895	1210900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26541	NC_010117	GCCTA	2	10	1210904	1210913	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26542	NC_010117	GAT	2	6	1210975	1210980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26543	NC_010117	A	6	6	1211052	1211057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26544	NC_010117	GC	3	6	1211072	1211077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26545	NC_010117	GCC	2	6	1211144	1211149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26546	NC_010117	ACCC	2	8	1211186	1211193	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26547	NC_010117	A	7	7	1211239	1211245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26548	NC_010117	TG	3	6	1211309	1211314	0 %	50 %	50 %	0 %	161830618
26549	NC_010117	TGA	2	6	1211319	1211324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830618
26550	NC_010117	GTAT	2	8	1211367	1211374	25 %	50 %	25 %	0 %	161830618
26551	NC_010117	GTG	2	6	1211404	1211409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830618
26552	NC_010117	GGA	2	6	1211422	1211427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830618
26553	NC_010117	GCA	2	6	1211487	1211492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830618
26554	NC_010117	AAC	2	6	1211600	1211605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830618
26555	NC_010117	GTT	2	6	1211682	1211687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830618
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26557	NC_010117	AGCG	2	8	1211754	1211761	25 %	0 %	50 %	25 %	161830618
26558	NC_010117	TTGT	2	8	1211802	1211809	0 %	75 %	25 %	0 %	161830618
26559	NC_010117	TTG	2	6	1211818	1211823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830618
26560	NC_010117	GAG	2	6	1211851	1211856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830618
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26565	NC_010117	TGT	2	6	1212044	1212049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830618
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26567	NC_010117	GAAT	2	8	1212182	1212189	50 %	25 %	25 %	0 %	161830618
26568	NC_010117	TG	3	6	1212196	1212201	0 %	50 %	50 %	0 %	161830618
26569	NC_010117	CCG	2	6	1212280	1212285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830162
26570	NC_010117	A	8	8	1212291	1212298	100 %	0 %	0 %	0 %	161830162
26571	NC_010117	AC	3	6	1212315	1212320	50 %	0 %	0 %	50 %	161830162
26572	NC_010117	TGA	2	6	1212346	1212351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830162
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26576	NC_010117	TCA	2	6	1212508	1212513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830162
26577	NC_010117	TTG	2	6	1212521	1212526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830162
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26579	NC_010117	GGGT	2	8	1212534	1212541	0 %	25 %	75 %	0 %	161830162
26580	NC_010117	AGCGA	2	10	1212555	1212564	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26581	NC_010117	ATG	2	6	1212579	1212584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26582	NC_010117	TCGCT	2	10	1212605	1212614	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26583	NC_010117	TTG	2	6	1212628	1212633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26584	NC_010117	TTG	2	6	1212874	1212879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26585	NC_010117	AGA	2	6	1212885	1212890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26586	NC_010117	TTGT	2	8	1212900	1212907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26587	NC_010117	ATA	2	6	1212917	1212922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26588	NC_010117	ACTA	2	8	1212933	1212940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26589	NC_010117	A	6	6	1212946	1212951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26590	NC_010117	TAA	2	6	1212975	1212980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830150
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26593	NC_010117	TTAA	2	8	1213052	1213059	50 %	50 %	0 %	0 %	161830150
26594	NC_010117	AC	3	6	1213118	1213123	50 %	0 %	0 %	50 %	161830150
26595	NC_010117	A	6	6	1213133	1213138	100 %	0 %	0 %	0 %	161830150
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26602	NC_010117	CAC	2	6	1213566	1213571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830150
26603	NC_010117	TCCAC	2	10	1213607	1213616	20 %	20 %	0 %	60 %	161831204
26604	NC_010117	TTG	2	6	1213663	1213668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831204
26605	NC_010117	TGC	2	6	1213806	1213811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831204
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26608	NC_010117	TATT	2	8	1213829	1213836	25 %	75 %	0 %	0 %	161831204
26609	NC_010117	AAT	2	6	1213931	1213936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831204
26610	NC_010117	TCT	2	6	1213967	1213972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831204
26611	NC_010117	ATC	2	6	1214042	1214047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831204
26612	NC_010117	T	6	6	1214110	1214115	0 %	100 %	0 %	0 %	161831204
26613	NC_010117	TCTCG	2	10	1214139	1214148	0 %	40 %	20 %	40 %	161831204
26614	NC_010117	A	9	9	1214186	1214194	100 %	0 %	0 %	0 %	161831204
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26617	NC_010117	GT	3	6	1214315	1214320	0 %	50 %	50 %	0 %	161831204
26618	NC_010117	CG	3	6	1214387	1214392	0 %	0 %	50 %	50 %	161831204
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