MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_010117	GTTG	2	8	1123047	1123054	0 %	50 %	50 %	0 %	161831584
24503	NC_010117	TTC	2	6	1123111	1123116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831584
24504	NC_010117	GTAAA	2	10	1123128	1123137	60 %	20 %	20 %	0 %	161831584
24505	NC_010117	GT	4	8	1123166	1123173	0 %	50 %	50 %	0 %	161831584
24506	NC_010117	TGAAT	2	10	1123228	1123237	40 %	40 %	20 %	0 %	161831584
24507	NC_010117	TAATT	2	10	1123261	1123270	40 %	60 %	0 %	0 %	161831584
24508	NC_010117	TATT	3	12	1123276	1123287	25 %	75 %	0 %	0 %	161831584
24509	NC_010117	A	6	6	1123347	1123352	100 %	0 %	0 %	0 %	161831584
24510	NC_010117	AAT	2	6	1123367	1123372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831584
24511	NC_010117	ATC	2	6	1123403	1123408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831584
24512	NC_010117	A	6	6	1123436	1123441	100 %	0 %	0 %	0 %	161831584
24513	NC_010117	ACG	2	6	1123457	1123462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831584
24514	NC_010117	AAG	2	6	1123467	1123472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831584
24515	NC_010117	A	7	7	1123529	1123535	100 %	0 %	0 %	0 %	161831584
24516	NC_010117	ATC	2	6	1123564	1123569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24517	NC_010117	AAT	2	6	1123628	1123633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24518	NC_010117	GAT	2	6	1123634	1123639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24519	NC_010117	TCC	2	6	1123665	1123670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24520	NC_010117	T	6	6	1123682	1123687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24521	NC_010117	TGC	2	6	1123714	1123719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24522	NC_010117	T	7	7	1123726	1123732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24523	NC_010117	GA	3	6	1123754	1123759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24524	NC_010117	CGC	2	6	1123765	1123770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24525	NC_010117	AG	3	6	1123804	1123809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24526	NC_010117	AGA	2	6	1123821	1123826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24528	NC_010117	AAC	2	6	1123841	1123846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24529	NC_010117	A	7	7	1123863	1123869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24530	NC_010117	TTA	3	9	1123870	1123878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24531	NC_010117	ATTA	2	8	1123886	1123893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24532	NC_010117	GCTC	2	8	1123975	1123982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24533	NC_010117	A	7	7	1124026	1124032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24534	NC_010117	ATT	2	6	1124095	1124100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24535	NC_010117	ACAAA	2	10	1124139	1124148	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24536	NC_010117	T	7	7	1124171	1124177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24537	NC_010117	CGC	2	6	1124207	1124212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24538	NC_010117	CAA	2	6	1124220	1124225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24539	NC_010117	T	6	6	1124247	1124252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24540	NC_010117	AAG	2	6	1124312	1124317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24541	NC_010117	ACA	2	6	1124327	1124332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24542	NC_010117	CCCTA	2	10	1124337	1124346	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24543	NC_010117	CAA	2	6	1124387	1124392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24544	NC_010117	CGT	2	6	1124405	1124410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24545	NC_010117	CGG	2	6	1124492	1124497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24546	NC_010117	TTAGC	2	10	1124533	1124542	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24547	NC_010117	TCA	2	6	1124549	1124554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24549	NC_010117	A	6	6	1124631	1124636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24550	NC_010117	GAGT	2	8	1124648	1124655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24551	NC_010117	TTTC	2	8	1124701	1124708	0 %	75 %	0 %	25 %	161829749
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24553	NC_010117	TTCCA	2	10	1124833	1124842	20 %	40 %	0 %	40 %	161829749
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24557	NC_010117	AAG	2	6	1125118	1125123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829749
24558	NC_010117	T	6	6	1125172	1125177	0 %	100 %	0 %	0 %	161829749
24559	NC_010117	AT	3	6	1125180	1125185	50 %	50 %	0 %	0 %	161829749
24560	NC_010117	TCA	2	6	1125251	1125256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829749
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24563	NC_010117	A	7	7	1125478	1125484	100 %	0 %	0 %	0 %	161829749
24564	NC_010117	GTA	2	6	1125485	1125490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161829749
24565	NC_010117	TTA	2	6	1125559	1125564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24572	NC_010117	CGT	2	6	1125909	1125914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831361
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24579	NC_010117	AAT	2	6	1126279	1126284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831361
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24588	NC_010117	T	7	7	1126597	1126603	0 %	100 %	0 %	0 %	161830909
24589	NC_010117	TAT	2	6	1126662	1126667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830909
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24596	NC_010117	TCGCT	2	10	1126997	1127006	0 %	40 %	20 %	40 %	161831475
24597	NC_010117	TTG	2	6	1127019	1127024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24598	NC_010117	GAT	2	6	1127057	1127062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24599	NC_010117	ATA	2	6	1127111	1127116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24600	NC_010117	TTAT	2	8	1127131	1127138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24601	NC_010117	GTTAG	2	10	1127171	1127180	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24602	NC_010117	GA	3	6	1127392	1127397	50 %	0 %	50 %	0 %	161830914
24603	NC_010117	TAAAAA	2	12	1127437	1127448	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	161830914
24604	NC_010117	ATT	2	6	1127480	1127485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830914
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24606	NC_010117	ATA	2	6	1127563	1127568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830914
24607	NC_010117	GAA	2	6	1127589	1127594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24608	NC_010117	A	6	6	1127593	1127598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24609	NC_010117	TCA	2	6	1127599	1127604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24610	NC_010117	T	7	7	1127609	1127615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24611	NC_010117	C	6	6	1127656	1127661	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24612	NC_010117	A	6	6	1127675	1127680	100 %	0 %	0 %	0 %	161830257
24613	NC_010117	AAAAGA	4	24	1127693	1127716	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	161830257
24614	NC_010117	CTT	2	6	1127767	1127772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830257
24615	NC_010117	ATG	2	6	1127863	1127868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24617	NC_010117	AAC	2	6	1127886	1127891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24618	NC_010117	CTTT	2	8	1127974	1127981	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24619	NC_010117	TCT	2	6	1127982	1127987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24620	NC_010117	TC	3	6	1127989	1127994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24621	NC_010117	TTA	2	6	1128144	1128149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24622	NC_010117	CAG	2	6	1128164	1128169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24994	NC_010117	TCG	2	6	1143196	1143201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830651
24995	NC_010117	AAT	2	6	1143265	1143270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830651
24996	NC_010117	TCC	2	6	1143333	1143338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830651
24997	NC_010117	TATTT	2	10	1143360	1143369	20 %	80 %	0 %	0 %	161830651
24998	NC_010117	TCA	2	6	1143370	1143375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830651
24999	NC_010117	GCA	2	6	1143425	1143430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830651
25000	NC_010117	TTC	2	6	1143471	1143476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830651

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