MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_010117	TTA	2	6	1100295	1100300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829878
24003	NC_010117	AAG	2	6	1100338	1100343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829878
24004	NC_010117	CTT	2	6	1100350	1100355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829878
24005	NC_010117	TAA	2	6	1100420	1100425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829878
24006	NC_010117	ATG	2	6	1100642	1100647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161829878
24007	NC_010117	CTT	2	6	1100653	1100658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829878
24008	NC_010117	TGTT	2	8	1100665	1100672	0 %	75 %	25 %	0 %	161829878
24009	NC_010117	CTT	2	6	1100704	1100709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829878
24010	NC_010117	TCA	2	6	1100736	1100741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829878
24011	NC_010117	CTT	2	6	1100884	1100889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829878
24012	NC_010117	TTTC	2	8	1101025	1101032	0 %	75 %	0 %	25 %	161829878
24013	NC_010117	TCT	2	6	1101078	1101083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829878
24014	NC_010117	TC	3	6	1101115	1101120	0 %	50 %	0 %	50 %	161829878
24015	NC_010117	AGCG	2	8	1101122	1101129	25 %	0 %	50 %	25 %	161829878
24016	NC_010117	GAC	2	6	1101164	1101169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161829878
24017	NC_010117	TGGAT	2	10	1101265	1101274	20 %	40 %	40 %	0 %	161829878
24018	NC_010117	CTT	2	6	1101289	1101294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829878
24019	NC_010117	GAA	2	6	1101295	1101300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829878
24020	NC_010117	TAAG	2	8	1101385	1101392	50 %	25 %	25 %	0 %	161829878
24021	NC_010117	CTT	2	6	1101415	1101420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829878
24022	NC_010117	GCT	2	6	1101445	1101450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161829878
24023	NC_010117	GTG	2	6	1101503	1101508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24024	NC_010117	GAGAG	2	10	1101510	1101519	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24025	NC_010117	TAA	2	6	1101656	1101661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24026	NC_010117	CATG	2	8	1101723	1101730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24027	NC_010117	CTAC	2	8	1101755	1101762	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24028	NC_010117	CGA	2	6	1101788	1101793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831387
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24031	NC_010117	T	6	6	1101892	1101897	0 %	100 %	0 %	0 %	161831387
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24033	NC_010117	TACG	2	8	1101943	1101950	25 %	25 %	25 %	25 %	161831387
24034	NC_010117	GGC	2	6	1102094	1102099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831387
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24037	NC_010117	AAT	2	6	1102199	1102204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831387
24038	NC_010117	TCA	2	6	1102221	1102226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831387
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24040	NC_010117	TAT	2	6	1102307	1102312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831387
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24044	NC_010117	A	6	6	1102437	1102442	100 %	0 %	0 %	0 %	161831387
24045	NC_010117	TTA	2	6	1102541	1102546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830718
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24049	NC_010117	AT	3	6	1102733	1102738	50 %	50 %	0 %	0 %	161830718
24050	NC_010117	TTTC	2	8	1102746	1102753	0 %	75 %	0 %	25 %	161830718
24051	NC_010117	CG	3	6	1102775	1102780	0 %	0 %	50 %	50 %	161830718
24052	NC_010117	GCT	2	6	1102844	1102849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830718
24053	NC_010117	CGG	2	6	1102992	1102997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830718
24054	NC_010117	A	6	6	1103009	1103014	100 %	0 %	0 %	0 %	161830718
24055	NC_010117	TAAA	2	8	1103026	1103033	75 %	25 %	0 %	0 %	161830718
24056	NC_010117	TTCA	2	8	1103038	1103045	25 %	50 %	0 %	25 %	161830718
24057	NC_010117	AAT	2	6	1103047	1103052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830718
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24061	NC_010117	GCAG	2	8	1103406	1103413	25 %	0 %	50 %	25 %	161830220
24062	NC_010117	GC	3	6	1103433	1103438	0 %	0 %	50 %	50 %	161830220
24063	NC_010117	GAC	2	6	1103475	1103480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830220
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24070	NC_010117	TGA	2	6	1103733	1103738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831455
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24091	NC_010117	TAT	2	6	1104626	1104631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24092	NC_010117	GAAA	2	8	1104644	1104651	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24093	NC_010117	A	6	6	1104743	1104748	100 %	0 %	0 %	0 %	161830447
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24103	NC_010117	TGCGA	2	10	1105094	1105103	20 %	20 %	40 %	20 %	161830705
24104	NC_010117	ATA	2	6	1105110	1105115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830705
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24120	NC_010117	ACA	2	6	1105596	1105601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830705
24121	NC_010117	ACA	2	6	1105617	1105622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830705
24122	NC_010117	A	8	8	1105631	1105638	100 %	0 %	0 %	0 %	161830705
24123	NC_010117	AAAT	2	8	1105645	1105652	75 %	25 %	0 %	0 %	161830705
24124	NC_010117	CCCGGC	2	12	1105679	1105690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830138
24125	NC_010117	GGA	2	6	1105694	1105699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830138
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24129	NC_010117	CG	3	6	1105876	1105881	0 %	0 %	50 %	50 %	161830138
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24134	NC_010117	CCT	2	6	1106145	1106150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830138
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24205	NC_010117	TTA	2	6	1109163	1109168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24211	NC_010117	ATTCG	2	10	1109517	1109526	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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24229	NC_010117	A	6	6	1110447	1110452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24230	NC_010117	A	6	6	1110479	1110484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24231	NC_010117	AAGT	2	8	1110546	1110553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24232	NC_010117	GATC	2	8	1110585	1110592	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24233	NC_010117	A	6	6	1110660	1110665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24234	NC_010117	AAG	2	6	1110679	1110684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24235	NC_010117	CT	3	6	1110704	1110709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24236	NC_010117	ATT	2	6	1110757	1110762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24237	NC_010117	ATC	2	6	1110763	1110768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24239	NC_010117	A	7	7	1110879	1110885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24240	NC_010117	AAC	2	6	1110910	1110915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24241	NC_010117	ATC	2	6	1110940	1110945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24242	NC_010117	TCC	2	6	1111010	1111015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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24244	NC_010117	ATT	2	6	1111116	1111121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830204
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24483	NC_010117	TAT	2	6	1122221	1122226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831584
24484	NC_010117	GC	3	6	1122228	1122233	0 %	0 %	50 %	50 %	161831584
24485	NC_010117	ATTA	2	8	1122247	1122254	50 %	50 %	0 %	0 %	161831584
24486	NC_010117	GCC	2	6	1122280	1122285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831584
24487	NC_010117	A	6	6	1122314	1122319	100 %	0 %	0 %	0 %	161831584
24488	NC_010117	CG	3	6	1122497	1122502	0 %	0 %	50 %	50 %	161831584
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