MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_010117	ACGT	2	8	895631	895638	25 %	25 %	25 %	25 %	161831384
19502	NC_010117	AG	3	6	895724	895729	50 %	0 %	50 %	0 %	161831384
19503	NC_010117	TAA	2	6	895766	895771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831070
19504	NC_010117	A	6	6	895782	895787	100 %	0 %	0 %	0 %	161831070
19505	NC_010117	GAG	2	6	895837	895842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831070
19506	NC_010117	T	6	6	895848	895853	0 %	100 %	0 %	0 %	161831070
19507	NC_010117	CGA	3	9	895886	895894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831070
19508	NC_010117	CAA	2	6	895917	895922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831070
19509	NC_010117	GCG	2	6	895972	895977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831070
19510	NC_010117	CAA	2	6	896053	896058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831070
19511	NC_010117	TAC	2	6	896065	896070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831070
19512	NC_010117	A	6	6	896084	896089	100 %	0 %	0 %	0 %	161831070
19513	NC_010117	GGT	2	6	896167	896172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831070
19514	NC_010117	CGT	2	6	896179	896184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831070
19515	NC_010117	TCG	2	6	896265	896270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831070
19516	NC_010117	TCAA	2	8	896297	896304	50 %	25 %	0 %	25 %	161831070
19517	NC_010117	GGA	2	6	896305	896310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831070
19518	NC_010117	ATT	2	6	896317	896322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831070
19519	NC_010117	ACG	2	6	896326	896331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831070
19520	NC_010117	GAA	2	6	896341	896346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831070
19521	NC_010117	ATT	2	6	896374	896379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831070
19522	NC_010117	ATT	2	6	896392	896397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831070
19523	NC_010117	ACC	2	6	896404	896409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831070
19524	NC_010117	CA	3	6	896521	896526	50 %	0 %	0 %	50 %	161831070
19525	NC_010117	AGA	2	6	896631	896636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831070
19526	NC_010117	ATT	2	6	896637	896642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831070
19527	NC_010117	AAAT	2	8	896665	896672	75 %	25 %	0 %	0 %	161831070
19528	NC_010117	AGA	2	6	896682	896687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829949
19529	NC_010117	ATTGA	2	10	896716	896725	40 %	40 %	20 %	0 %	161829949
19530	NC_010117	T	7	7	896787	896793	0 %	100 %	0 %	0 %	161829949
19531	NC_010117	AT	3	6	896844	896849	50 %	50 %	0 %	0 %	161829949
19532	NC_010117	ATG	2	6	896875	896880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161829949
19533	NC_010117	CTTT	2	8	896918	896925	0 %	75 %	0 %	25 %	161829949
19534	NC_010117	GAA	2	6	896950	896955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829949
19535	NC_010117	TTG	2	6	896989	896994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161829949
19536	NC_010117	AGC	2	6	897004	897009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161829949
19537	NC_010117	TGG	2	6	897029	897034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161829949
19538	NC_010117	ATC	2	6	897037	897042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829949
19539	NC_010117	T	6	6	897061	897066	0 %	100 %	0 %	0 %	161829949
19540	NC_010117	GCC	2	6	897106	897111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161829949
19541	NC_010117	TTA	2	6	897146	897151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829949
19542	NC_010117	T	6	6	897233	897238	0 %	100 %	0 %	0 %	161829949
19543	NC_010117	TAT	2	6	897300	897305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829949
19544	NC_010117	T	6	6	897363	897368	0 %	100 %	0 %	0 %	161829949
19545	NC_010117	ATT	3	9	897382	897390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829949
19546	NC_010117	CTA	2	6	897405	897410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829949
19547	NC_010117	TTC	2	6	897482	897487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830249
19548	NC_010117	T	6	6	897491	897496	0 %	100 %	0 %	0 %	161830249
19549	NC_010117	TCT	2	6	897549	897554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830249
19550	NC_010117	TAA	2	6	897668	897673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830249
19551	NC_010117	ATT	2	6	897677	897682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830249
19552	NC_010117	GCC	2	6	897684	897689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830249
19553	NC_010117	GCC	2	6	897692	897697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830249
19554	NC_010117	AC	3	6	897767	897772	50 %	0 %	0 %	50 %	161830249
19555	NC_010117	CG	3	6	897785	897790	0 %	0 %	50 %	50 %	161830249
19556	NC_010117	CG	3	6	897840	897845	0 %	0 %	50 %	50 %	161830249
19557	NC_010117	TAAA	2	8	897890	897897	75 %	25 %	0 %	0 %	161830249
19558	NC_010117	CCG	2	6	897900	897905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830249
19559	NC_010117	TGC	2	6	898006	898011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830249
19560	NC_010117	TGAA	2	8	898076	898083	50 %	25 %	25 %	0 %	161830249
19561	NC_010117	AGC	2	6	898104	898109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830249
19562	NC_010117	AGATCG	2	12	898227	898238	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161830249
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19564	NC_010117	TCA	2	6	898314	898319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830249
19565	NC_010117	GTT	2	6	898327	898332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830249
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19567	NC_010117	T	6	6	898537	898542	0 %	100 %	0 %	0 %	161830249
19568	NC_010117	CGA	2	6	898602	898607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830249
19569	NC_010117	TGGC	2	8	898634	898641	0 %	25 %	50 %	25 %	161830249
19570	NC_010117	GCA	2	6	898707	898712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830249
19571	NC_010117	CTT	2	6	898723	898728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830249
19572	NC_010117	CAA	2	6	898743	898748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830249
19573	NC_010117	AGG	2	6	898749	898754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830249
19574	NC_010117	TTC	2	6	898769	898774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830249
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19577	NC_010117	TTG	2	6	898879	898884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830249
19578	NC_010117	TAAAA	2	10	898901	898910	80 %	20 %	0 %	0 %	161830249
19579	NC_010117	ATA	2	6	898975	898980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19580	NC_010117	GGC	2	6	899060	899065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831586
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19585	NC_010117	GAT	2	6	899329	899334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831586
19586	NC_010117	GAT	2	6	899480	899485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831586
19587	NC_010117	GCAAAA	2	12	899516	899527	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	161831586
19588	NC_010117	TA	3	6	899598	899603	50 %	50 %	0 %	0 %	161831586
19589	NC_010117	TGC	2	6	899679	899684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831586
19590	NC_010117	GTT	2	6	899744	899749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831586
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19593	NC_010117	ATT	2	6	899910	899915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831586
19594	NC_010117	ATT	3	9	899931	899939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831586
19595	NC_010117	TGA	2	6	900001	900006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831586
19596	NC_010117	A	6	6	900024	900029	100 %	0 %	0 %	0 %	161831586
19597	NC_010117	GAC	2	6	900059	900064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831586
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19600	NC_010117	TAT	2	6	900279	900284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831586
19601	NC_010117	GCCA	2	8	900293	900300	25 %	0 %	25 %	50 %	161831586
19602	NC_010117	G	6	6	900371	900376	0 %	0 %	100 %	0 %	161831586
19603	NC_010117	ATCA	2	8	900485	900492	50 %	25 %	0 %	25 %	161831586
19604	NC_010117	ATG	2	6	900510	900515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831586
19605	NC_010117	T	6	6	900528	900533	0 %	100 %	0 %	0 %	161831393
19606	NC_010117	TG	3	6	900607	900612	0 %	50 %	50 %	0 %	161831393
19607	NC_010117	ATT	2	6	900618	900623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831393
19608	NC_010117	TTA	2	6	900635	900640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831393
19609	NC_010117	TTAT	2	8	900696	900703	25 %	75 %	0 %	0 %	161831393
19610	NC_010117	TAT	2	6	900726	900731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831393
19611	NC_010117	TAA	2	6	900787	900792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831393
19612	NC_010117	CAA	2	6	900849	900854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831393
19613	NC_010117	C	6	6	900860	900865	0 %	0 %	0 %	100 %	161831393
19614	NC_010117	GCT	2	6	900876	900881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831393
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19616	NC_010117	T	7	7	900983	900989	0 %	100 %	0 %	0 %	161831393
19617	NC_010117	CGC	2	6	901032	901037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831393
19618	NC_010117	ATC	2	6	901087	901092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831393
19619	NC_010117	TGC	2	6	901097	901102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831393
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