MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_010117	GTTTT	2	10	850444	850453	0 %	80 %	20 %	0 %	161830215
18502	NC_010117	TC	3	6	850519	850524	0 %	50 %	0 %	50 %	161830215
18503	NC_010117	CGG	2	6	850543	850548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830215
18504	NC_010117	CGT	2	6	850620	850625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830215
18505	NC_010117	AGCC	2	8	850675	850682	25 %	0 %	25 %	50 %	161830215
18506	NC_010117	GCC	2	6	850702	850707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830215
18507	NC_010117	GGT	2	6	850708	850713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830215
18508	NC_010117	CATTAT	2	12	850775	850786	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	161830548
18509	NC_010117	TAA	2	6	850935	850940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830548
18510	NC_010117	ATT	2	6	850963	850968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830548
18511	NC_010117	ACT	2	6	851061	851066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830548
18512	NC_010117	A	7	7	851088	851094	100 %	0 %	0 %	0 %	161830548
18513	NC_010117	TTA	2	6	851138	851143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830548
18514	NC_010117	A	6	6	851187	851192	100 %	0 %	0 %	0 %	161830548
18515	NC_010117	ATA	3	9	851214	851222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18516	NC_010117	TAT	2	6	851241	851246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830983
18517	NC_010117	A	7	7	851248	851254	100 %	0 %	0 %	0 %	161830983
18518	NC_010117	TAA	2	6	851258	851263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830983
18519	NC_010117	GGC	2	6	851293	851298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830983
18520	NC_010117	TG	3	6	851339	851344	0 %	50 %	50 %	0 %	161830983
18521	NC_010117	AAG	2	6	851369	851374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830983
18522	NC_010117	T	6	6	851384	851389	0 %	100 %	0 %	0 %	161830983
18523	NC_010117	TTG	2	6	851461	851466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830983
18524	NC_010117	GT	3	6	851480	851485	0 %	50 %	50 %	0 %	161830983
18525	NC_010117	A	6	6	851527	851532	100 %	0 %	0 %	0 %	161830983
18526	NC_010117	CAT	2	6	851548	851553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830983
18527	NC_010117	TAA	2	6	851554	851559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830983
18528	NC_010117	GTT	2	6	851579	851584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830983
18529	NC_010117	GTAA	2	8	851585	851592	50 %	25 %	25 %	0 %	161830983
18530	NC_010117	TTG	2	6	851612	851617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830983
18531	NC_010117	GAGAAA	2	12	851623	851634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830983
18532	NC_010117	AGC	2	6	851649	851654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830983
18533	NC_010117	T	6	6	851698	851703	0 %	100 %	0 %	0 %	161830983
18534	NC_010117	TGGG	2	8	851727	851734	0 %	25 %	75 %	0 %	161830983
18535	NC_010117	GTC	2	6	851783	851788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830983
18536	NC_010117	T	8	8	851816	851823	0 %	100 %	0 %	0 %	161830983
18537	NC_010117	TGT	2	6	851826	851831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830983
18538	NC_010117	A	6	6	851849	851854	100 %	0 %	0 %	0 %	161830983
18539	NC_010117	ATT	2	6	851871	851876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830983
18540	NC_010117	T	6	6	851875	851880	0 %	100 %	0 %	0 %	161830983
18541	NC_010117	ATT	2	6	851885	851890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830983
18542	NC_010117	T	6	6	851930	851935	0 %	100 %	0 %	0 %	161830983
18543	NC_010117	A	6	6	851964	851969	100 %	0 %	0 %	0 %	161830983
18544	NC_010117	TCA	2	6	852048	852053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830983
18545	NC_010117	CAAT	2	8	852058	852065	50 %	25 %	0 %	25 %	161830983
18546	NC_010117	TAG	2	6	852084	852089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830983
18547	NC_010117	AAC	2	6	852110	852115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830983
18548	NC_010117	TTTC	2	8	852142	852149	0 %	75 %	0 %	25 %	161830983
18549	NC_010117	A	7	7	852159	852165	100 %	0 %	0 %	0 %	161830983
18550	NC_010117	ATT	2	6	852191	852196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830983
18551	NC_010117	T	6	6	852469	852474	0 %	100 %	0 %	0 %	161830983
18552	NC_010117	AAT	2	6	852515	852520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830983
18553	NC_010117	T	6	6	852520	852525	0 %	100 %	0 %	0 %	161830983
18554	NC_010117	CAAA	2	8	852556	852563	75 %	0 %	0 %	25 %	161830983
18555	NC_010117	TCA	2	6	852651	852656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830983
18556	NC_010117	CCGCCA	2	12	852738	852749	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	161830983
18557	NC_010117	AAG	2	6	852764	852769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830983
18558	NC_010117	T	7	7	852781	852787	0 %	100 %	0 %	0 %	161830983
18559	NC_010117	TTG	2	6	852815	852820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830983
18560	NC_010117	GCTT	2	8	852851	852858	0 %	50 %	25 %	25 %	161830983
18561	NC_010117	GCA	2	6	852897	852902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830983
18562	NC_010117	AGC	2	6	852905	852910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830983
18563	NC_010117	GGAT	2	8	852993	853000	25 %	25 %	50 %	0 %	161830983
18564	NC_010117	GTTT	2	8	853010	853017	0 %	75 %	25 %	0 %	161830983
18565	NC_010117	ATT	2	6	853032	853037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830983
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18567	NC_010117	TGC	2	6	853061	853066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830983
18568	NC_010117	CGG	2	6	853067	853072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830983
18569	NC_010117	G	6	6	853071	853076	0 %	0 %	100 %	0 %	161830983
18570	NC_010117	TCG	2	6	853092	853097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830983
18571	NC_010117	TTG	2	6	853129	853134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830983
18572	NC_010117	T	6	6	853163	853168	0 %	100 %	0 %	0 %	161830983
18573	NC_010117	TAA	2	6	853177	853182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830983
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18575	NC_010117	T	6	6	853390	853395	0 %	100 %	0 %	0 %	161830807
18576	NC_010117	TAAT	2	8	853397	853404	50 %	50 %	0 %	0 %	161830807
18577	NC_010117	ATG	2	6	853413	853418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830807
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18579	NC_010117	TGA	2	6	853448	853453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830807
18580	NC_010117	TGA	2	6	853456	853461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830807
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18582	NC_010117	A	6	6	853510	853515	100 %	0 %	0 %	0 %	161830807
18583	NC_010117	CGG	2	6	853519	853524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830807
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18586	NC_010117	CCG	2	6	853660	853665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830807
18587	NC_010117	TAA	2	6	853716	853721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830807
18588	NC_010117	CG	3	6	853766	853771	0 %	0 %	50 %	50 %	161830807
18589	NC_010117	ATT	2	6	853840	853845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830807
18590	NC_010117	TCT	2	6	853861	853866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830807
18591	NC_010117	TGC	2	6	853876	853881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830807
18592	NC_010117	TACA	2	8	853955	853962	50 %	25 %	0 %	25 %	161830807
18593	NC_010117	TCAT	3	12	854000	854011	25 %	50 %	0 %	25 %	161830807
18594	NC_010117	CT	3	6	854013	854018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18595	NC_010117	TAA	2	6	854118	854123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830106
18596	NC_010117	AGCG	2	8	854139	854146	25 %	0 %	50 %	25 %	161830106
18597	NC_010117	AAT	2	6	854151	854156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830106
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18600	NC_010117	CG	3	6	854309	854314	0 %	0 %	50 %	50 %	161830106
18601	NC_010117	ATAA	2	8	854324	854331	75 %	25 %	0 %	0 %	161830106
18602	NC_010117	AAT	2	6	854392	854397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830106
18603	NC_010117	T	6	6	854479	854484	0 %	100 %	0 %	0 %	161830106
18604	NC_010117	ACCA	2	8	854485	854492	50 %	0 %	0 %	50 %	161830106
18605	NC_010117	GAA	2	6	854511	854516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830106
18606	NC_010117	AAAAT	2	10	854583	854592	80 %	20 %	0 %	0 %	161830106
18607	NC_010117	ATT	2	6	854596	854601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830106
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18609	NC_010117	GTG	2	6	854654	854659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830106
18610	NC_010117	TTC	2	6	854677	854682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830106
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18612	NC_010117	ATA	2	6	854753	854758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830106
18613	NC_010117	TTC	2	6	854767	854772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830106
18614	NC_010117	TTC	2	6	854788	854793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830106
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18616	NC_010117	T	7	7	854821	854827	0 %	100 %	0 %	0 %	161830106
18617	NC_010117	TCA	2	6	854873	854878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830106
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18621	NC_010117	CCA	2	6	854987	854992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830106
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