MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_010117	GAT	2	6	715895	715900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830859
15503	NC_010117	CTG	2	6	715912	715917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830859
15504	NC_010117	GAT	2	6	715967	715972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830859
15505	NC_010117	GCC	2	6	715975	715980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830859
15506	NC_010117	ATC	2	6	716045	716050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830859
15507	NC_010117	ATT	2	6	716066	716071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830859
15508	NC_010117	TTGG	2	8	716136	716143	0 %	50 %	50 %	0 %	161830859
15509	NC_010117	TTAG	2	8	716159	716166	25 %	50 %	25 %	0 %	161830859
15510	NC_010117	A	7	7	716174	716180	100 %	0 %	0 %	0 %	161830859
15511	NC_010117	GA	3	6	716204	716209	50 %	0 %	50 %	0 %	161830859
15512	NC_010117	A	6	6	716247	716252	100 %	0 %	0 %	0 %	161830859
15513	NC_010117	TTA	2	6	716257	716262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831044
15514	NC_010117	ATC	2	6	716345	716350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831044
15515	NC_010117	TC	3	6	716369	716374	0 %	50 %	0 %	50 %	161831044
15516	NC_010117	GAA	2	6	716385	716390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831044
15517	NC_010117	ATTA	2	8	716745	716752	50 %	50 %	0 %	0 %	161831044
15518	NC_010117	A	9	9	716878	716886	100 %	0 %	0 %	0 %	161831044
15519	NC_010117	CAA	2	6	716964	716969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831044
15520	NC_010117	ATTTA	2	10	717038	717047	40 %	60 %	0 %	0 %	161831044
15521	NC_010117	TGT	2	6	717071	717076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831044
15522	NC_010117	CTG	2	6	717100	717105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831044
15523	NC_010117	A	6	6	717132	717137	100 %	0 %	0 %	0 %	161831044
15524	NC_010117	TTGG	2	8	717151	717158	0 %	50 %	50 %	0 %	161831044
15525	NC_010117	CTT	2	6	717169	717174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831044
15526	NC_010117	TTA	2	6	717184	717189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831044
15527	NC_010117	TGC	2	6	717229	717234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831044
15528	NC_010117	AAAC	2	8	717249	717256	75 %	0 %	0 %	25 %	161831044
15529	NC_010117	CTA	2	6	717309	717314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830477
15530	NC_010117	A	8	8	717526	717533	100 %	0 %	0 %	0 %	161830477
15531	NC_010117	TCA	2	6	717565	717570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830477
15532	NC_010117	CAG	2	6	717687	717692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830477
15533	NC_010117	TGA	2	6	717699	717704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830477
15534	NC_010117	TAT	2	6	717742	717747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830477
15535	NC_010117	AGT	2	6	717775	717780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830477
15536	NC_010117	T	6	6	717823	717828	0 %	100 %	0 %	0 %	161830477
15537	NC_010117	CGA	2	6	717848	717853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830477
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15539	NC_010117	ATTT	2	8	717941	717948	25 %	75 %	0 %	0 %	161830477
15540	NC_010117	T	6	6	718067	718072	0 %	100 %	0 %	0 %	161830477
15541	NC_010117	TCAA	2	8	718123	718130	50 %	25 %	0 %	25 %	161830477
15542	NC_010117	ACA	2	6	718257	718262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830182
15543	NC_010117	GATC	2	8	718394	718401	25 %	25 %	25 %	25 %	161830182
15544	NC_010117	AGAA	2	8	718427	718434	75 %	0 %	25 %	0 %	161830182
15545	NC_010117	GCA	2	6	718474	718479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830182
15546	NC_010117	ATG	2	6	718480	718485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830182
15547	NC_010117	ACT	2	6	718488	718493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830182
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15549	NC_010117	A	6	6	718548	718553	100 %	0 %	0 %	0 %	161830182
15550	NC_010117	GAT	2	6	718572	718577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830182
15551	NC_010117	T	8	8	718595	718602	0 %	100 %	0 %	0 %	161830182
15552	NC_010117	TGA	2	6	718721	718726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830182
15553	NC_010117	TAT	2	6	718812	718817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830182
15554	NC_010117	TGT	2	6	718871	718876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830182
15555	NC_010117	TGG	2	6	718892	718897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830182
15556	NC_010117	TAA	2	6	718928	718933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830182
15557	NC_010117	ATCAA	3	15	718938	718952	60 %	20 %	0 %	20 %	161830182
15558	NC_010117	TAA	2	6	718954	718959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830182
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15562	NC_010117	CAT	2	6	719231	719236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830182
15563	NC_010117	T	6	6	719273	719278	0 %	100 %	0 %	0 %	161830182
15564	NC_010117	AAG	2	6	719299	719304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830182
15565	NC_010117	GGT	2	6	719340	719345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830182
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15568	NC_010117	TCTT	2	8	719456	719463	0 %	75 %	0 %	25 %	161831239
15569	NC_010117	TGG	2	6	719600	719605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831239
15570	NC_010117	CAAT	2	8	719625	719632	50 %	25 %	0 %	25 %	161831239
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15572	NC_010117	ATT	2	6	719646	719651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831239
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15576	NC_010117	ACT	2	6	720030	720035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831239
15577	NC_010117	TGGG	2	8	720081	720088	0 %	25 %	75 %	0 %	161831239
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15580	NC_010117	ATA	2	6	720199	720204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831239
15581	NC_010117	CCAAT	2	10	720256	720265	40 %	20 %	0 %	40 %	161831239
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15584	NC_010117	CATT	2	8	720509	720516	25 %	50 %	0 %	25 %	161830796
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15589	NC_010117	GCCA	2	8	720698	720705	25 %	0 %	25 %	50 %	161830796
15590	NC_010117	CA	3	6	720797	720802	50 %	0 %	0 %	50 %	161830796
15591	NC_010117	TCA	2	6	720825	720830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830796
15592	NC_010117	TTG	2	6	720852	720857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830796
15593	NC_010117	GCTG	2	8	720929	720936	0 %	25 %	50 %	25 %	161830796
15594	NC_010117	GCG	2	6	720948	720953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830796
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15597	NC_010117	CTT	2	6	721041	721046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830796
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15600	NC_010117	T	7	7	721089	721095	0 %	100 %	0 %	0 %	161830796
15601	NC_010117	CGA	2	6	721161	721166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830796
15602	NC_010117	CGGC	2	8	721205	721212	0 %	0 %	50 %	50 %	161830796
15603	NC_010117	AAT	2	6	721278	721283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830796
15604	NC_010117	ATA	2	6	721343	721348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830796
15605	NC_010117	GAA	2	6	721410	721415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830796
15606	NC_010117	TTC	2	6	721420	721425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830796
15607	NC_010117	ATTT	2	8	721571	721578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15608	NC_010117	ATA	2	6	721612	721617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_010117	ATT	2	6	721721	721726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831243
15610	NC_010117	A	6	6	721733	721738	100 %	0 %	0 %	0 %	161831243
15611	NC_010117	T	7	7	721893	721899	0 %	100 %	0 %	0 %	161831243
15612	NC_010117	GTTG	2	8	722003	722010	0 %	50 %	50 %	0 %	161831243
15613	NC_010117	ACA	2	6	722021	722026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831243
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15616	NC_010117	TTC	2	6	722215	722220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831243
15617	NC_010117	TAA	2	6	722253	722258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831243
15618	NC_010117	TGT	2	6	722353	722358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831243
15619	NC_010117	TAA	2	6	722376	722381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831243
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15621	NC_010117	AAT	2	6	722448	722453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831243
15622	NC_010117	CGT	2	6	722454	722459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831243
15623	NC_010117	CA	3	6	722460	722465	50 %	0 %	0 %	50 %	161831243
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15626	NC_010117	ATC	2	6	722623	722628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831243
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15994	NC_010117	TCA	2	6	737589	737594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831141
15995	NC_010117	TTAAA	2	10	737653	737662	60 %	40 %	0 %	0 %	161831141
15996	NC_010117	GAGC	2	8	737728	737735	25 %	0 %	50 %	25 %	161831141
15997	NC_010117	TTC	2	6	737744	737749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831141
15998	NC_010117	TTTTC	2	10	737841	737850	0 %	80 %	0 %	20 %	161831141
15999	NC_010117	T	8	8	737862	737869	0 %	100 %	0 %	0 %	161831141
16000	NC_010117	C	6	6	737933	737938	0 %	0 %	0 %	100 %	161831141

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