MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_010117	AT	3	6	693320	693325	50 %	50 %	0 %	0 %	161831621
15002	NC_010117	TGC	2	6	693349	693354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831621
15003	NC_010117	ATC	2	6	693361	693366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831621
15004	NC_010117	AGC	2	6	693404	693409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831621
15005	NC_010117	TTG	2	6	693418	693423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831621
15006	NC_010117	AAAT	2	8	693428	693435	75 %	25 %	0 %	0 %	161831621
15007	NC_010117	TGG	2	6	693436	693441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831621
15008	NC_010117	AT	3	6	693482	693487	50 %	50 %	0 %	0 %	161831621
15009	NC_010117	TGA	2	6	693506	693511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831621
15010	NC_010117	TGAAG	2	10	693518	693527	40 %	20 %	40 %	0 %	161831621
15011	NC_010117	CCA	2	6	693543	693548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831621
15012	NC_010117	T	8	8	693584	693591	0 %	100 %	0 %	0 %	161831621
15013	NC_010117	TTATTT	2	12	693603	693614	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	161831621
15014	NC_010117	ATT	2	6	693625	693630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831621
15015	NC_010117	TAAA	2	8	693631	693638	75 %	25 %	0 %	0 %	161831621
15016	NC_010117	T	6	6	693711	693716	0 %	100 %	0 %	0 %	161831621
15017	NC_010117	A	6	6	693775	693780	100 %	0 %	0 %	0 %	161831621
15018	NC_010117	GTT	2	6	693829	693834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831621
15019	NC_010117	GTG	2	6	693852	693857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831621
15020	NC_010117	CGA	2	6	693863	693868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831621
15021	NC_010117	TG	3	6	693878	693883	0 %	50 %	50 %	0 %	161831621
15022	NC_010117	GCG	2	6	693938	693943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831621
15023	NC_010117	TGAT	2	8	694003	694010	25 %	50 %	25 %	0 %	161831621
15024	NC_010117	AAG	2	6	694024	694029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831621
15025	NC_010117	GCA	2	6	694058	694063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831621
15026	NC_010117	ATCGTT	2	12	694195	694206	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161831621
15027	NC_010117	GTC	2	6	694221	694226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831621
15028	NC_010117	AATC	2	8	694278	694285	50 %	25 %	0 %	25 %	161831621
15029	NC_010117	ATT	2	6	694347	694352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831621
15030	NC_010117	GAT	2	6	694383	694388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831621
15031	NC_010117	TGA	2	6	694400	694405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831621
15032	NC_010117	CGT	2	6	694432	694437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831621
15033	NC_010117	A	7	7	694461	694467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_010117	AAAC	2	8	694578	694585	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15035	NC_010117	AAT	2	6	694593	694598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_010117	TAC	2	6	694608	694613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15037	NC_010117	TTC	2	6	694620	694625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15038	NC_010117	GTG	2	6	694632	694637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_010117	GAGC	2	8	694721	694728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15040	NC_010117	GCC	2	6	694761	694766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15041	NC_010117	GCC	2	6	694776	694781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15042	NC_010117	GCA	2	6	694840	694845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15043	NC_010117	TTG	2	6	694904	694909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_010117	GAG	2	6	694955	694960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_010117	TCA	2	6	695077	695082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_010117	T	10	10	695094	695103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_010117	ATT	2	6	695111	695116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_010117	TCA	2	6	695124	695129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15049	NC_010117	ATA	2	6	695189	695194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_010117	TGTCA	2	10	695210	695219	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15051	NC_010117	GTTTT	2	10	695344	695353	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_010117	ATTG	2	8	695377	695384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_010117	CTC	2	6	695420	695425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15054	NC_010117	ATC	2	6	695492	695497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_010117	AT	3	6	695661	695666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_010117	CATG	2	8	695674	695681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15057	NC_010117	GTT	2	6	695686	695691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_010117	CTT	2	6	695789	695794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15059	NC_010117	ATT	2	6	695904	695909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_010117	CAAA	2	8	695923	695930	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15061	NC_010117	CTT	2	6	695950	695955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15062	NC_010117	TTC	2	6	695969	695974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15063	NC_010117	AAC	2	6	696002	696007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15064	NC_010117	ATA	3	9	696021	696029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_010117	TTCTC	2	10	696043	696052	0 %	60 %	0 %	40 %	161830305
15066	NC_010117	GA	3	6	696076	696081	50 %	0 %	50 %	0 %	161830305
15067	NC_010117	TTC	2	6	696161	696166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830305
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15069	NC_010117	T	6	6	696206	696211	0 %	100 %	0 %	0 %	161830305
15070	NC_010117	GAT	2	6	696216	696221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830305
15071	NC_010117	T	7	7	696228	696234	0 %	100 %	0 %	0 %	161830305
15072	NC_010117	TAA	2	6	696243	696248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830305
15073	NC_010117	TAT	2	6	696341	696346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830305
15074	NC_010117	ATTCC	2	10	696376	696385	20 %	40 %	0 %	40 %	161830305
15075	NC_010117	GAC	2	6	696405	696410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830305
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15077	NC_010117	GACC	2	8	696502	696509	25 %	0 %	25 %	50 %	161830305
15078	NC_010117	AAC	2	6	696525	696530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830305
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15080	NC_010117	ACGG	2	8	696678	696685	25 %	0 %	50 %	25 %	161830798
15081	NC_010117	AAT	3	9	696686	696694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830798
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15083	NC_010117	GCATT	2	10	696756	696765	20 %	40 %	20 %	20 %	161830798
15084	NC_010117	T	7	7	696807	696813	0 %	100 %	0 %	0 %	161830798
15085	NC_010117	CCG	2	6	696825	696830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830798
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15089	NC_010117	GCG	2	6	697011	697016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830798
15090	NC_010117	AATA	2	8	697034	697041	75 %	25 %	0 %	0 %	161830798
15091	NC_010117	ATTGCG	2	12	697049	697060	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161830798
15092	NC_010117	T	6	6	697093	697098	0 %	100 %	0 %	0 %	161830798
15093	NC_010117	TTGAT	2	10	697104	697113	20 %	60 %	20 %	0 %	161830798
15094	NC_010117	CTT	2	6	697120	697125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830798
15095	NC_010117	AAC	2	6	697140	697145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830798
15096	NC_010117	AC	3	6	697160	697165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15097	NC_010117	TGAAT	2	10	697191	697200	40 %	40 %	20 %	0 %	161830355
15098	NC_010117	TGT	2	6	697294	697299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830355
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15103	NC_010117	ATC	2	6	697490	697495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830355
15104	NC_010117	TGAG	2	8	697526	697533	25 %	25 %	50 %	0 %	161830355
15105	NC_010117	TCC	2	6	697566	697571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830355
15106	NC_010117	GAT	2	6	697583	697588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830355
15107	NC_010117	TTAGTA	2	12	697608	697619	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	161830355
15108	NC_010117	TCA	2	6	697692	697697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830355
15109	NC_010117	GAGC	2	8	697735	697742	25 %	0 %	50 %	25 %	161830355
15110	NC_010117	CGA	2	6	697768	697773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830355
15111	NC_010117	GTTG	2	8	697799	697806	0 %	50 %	50 %	0 %	161830355
15112	NC_010117	AT	3	6	697818	697823	50 %	50 %	0 %	0 %	161830355
15113	NC_010117	GTA	2	6	697946	697951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_010117	AATT	2	8	697961	697968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_010117	T	9	9	698031	698039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_010117	ATT	2	6	698083	698088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_010117	AGG	2	6	698122	698127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831429
15118	NC_010117	T	6	6	698204	698209	0 %	100 %	0 %	0 %	161831429
15119	NC_010117	GAT	2	6	698213	698218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831429
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15494	NC_010117	AGC	3	9	715435	715443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830859
15495	NC_010117	ACG	2	6	715590	715595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830859
15496	NC_010117	CAC	2	6	715596	715601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830859
15497	NC_010117	AT	3	6	715616	715621	50 %	50 %	0 %	0 %	161830859
15498	NC_010117	CTG	2	6	715690	715695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830859
15499	NC_010117	TG	3	6	715728	715733	0 %	50 %	50 %	0 %	161830859
15500	NC_010117	AAG	2	6	715835	715840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830859

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