MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_010117	CAA	2	6	646896	646901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830975
14003	NC_010117	CAACAG	2	12	646904	646915	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	161830975
14004	NC_010117	T	6	6	646965	646970	0 %	100 %	0 %	0 %	161830975
14005	NC_010117	TGC	2	6	647023	647028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830975
14006	NC_010117	AATT	2	8	647208	647215	50 %	50 %	0 %	0 %	161830975
14007	NC_010117	CAT	2	6	647229	647234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830975
14008	NC_010117	AGC	2	6	647239	647244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830975
14009	NC_010117	TTA	2	6	647245	647250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830975
14010	NC_010117	ATTTC	2	10	647323	647332	20 %	60 %	0 %	20 %	161830975
14011	NC_010117	AAT	2	6	647425	647430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830975
14012	NC_010117	T	6	6	647451	647456	0 %	100 %	0 %	0 %	161830975
14013	NC_010117	T	7	7	647459	647465	0 %	100 %	0 %	0 %	161830975
14014	NC_010117	ATA	2	6	647505	647510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830975
14015	NC_010117	T	6	6	647529	647534	0 %	100 %	0 %	0 %	161830975
14016	NC_010117	ACC	2	6	647581	647586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830975
14017	NC_010117	T	7	7	647600	647606	0 %	100 %	0 %	0 %	161830975
14018	NC_010117	ACC	2	6	647677	647682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830975
14019	NC_010117	TAA	2	6	647699	647704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830975
14020	NC_010117	GCC	2	6	647736	647741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830975
14021	NC_010117	CAG	2	6	647859	647864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831095
14022	NC_010117	CTT	2	6	647946	647951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831095
14023	NC_010117	T	7	7	648108	648114	0 %	100 %	0 %	0 %	161831095
14024	NC_010117	GATCGA	2	12	648117	648128	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161831095
14025	NC_010117	CA	3	6	648208	648213	50 %	0 %	0 %	50 %	161831095
14026	NC_010117	GA	3	6	648260	648265	50 %	0 %	50 %	0 %	161831095
14027	NC_010117	AAT	2	6	648319	648324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831095
14028	NC_010117	ATC	2	6	648517	648522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831095
14029	NC_010117	CTT	2	6	648525	648530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831095
14030	NC_010117	CGT	2	6	648535	648540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831095
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14032	NC_010117	A	8	8	648581	648588	100 %	0 %	0 %	0 %	161831095
14033	NC_010117	TGA	2	6	648716	648721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831095
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14035	NC_010117	T	6	6	648819	648824	0 %	100 %	0 %	0 %	161831095
14036	NC_010117	TGG	2	6	648869	648874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_010117	T	6	6	648877	648882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_010117	TGA	2	6	648939	648944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_010117	TAA	2	6	648945	648950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_010117	ATT	2	6	649031	649036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830554
14041	NC_010117	AGCTTT	2	12	649046	649057	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161830554
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14043	NC_010117	AAT	2	6	649077	649082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830554
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14052	NC_010117	TCA	2	6	649646	649651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_010117	ACT	2	6	649675	649680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_010117	TAA	2	6	649809	649814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_010117	TAA	2	6	649882	649887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_010117	ATGA	2	8	649888	649895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_010117	AAT	2	6	649936	649941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831376
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14062	NC_010117	GAAA	2	8	650158	650165	75 %	0 %	25 %	0 %	161830364
14063	NC_010117	TGGC	2	8	650189	650196	0 %	25 %	50 %	25 %	161830364
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14070	NC_010117	AAG	2	6	650665	650670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_010117	AG	3	6	650669	650674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_010117	TTCT	2	8	650677	650684	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14093	NC_010117	CTA	2	6	651469	651474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829945
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14099	NC_010117	CTA	2	6	651669	651674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829945
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14106	NC_010117	AG	3	6	652148	652153	50 %	0 %	50 %	0 %	161829945
14107	NC_010117	AGA	2	6	652199	652204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829945
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14110	NC_010117	A	7	7	652328	652334	100 %	0 %	0 %	0 %	161829945
14111	NC_010117	TTTGC	2	10	652374	652383	0 %	60 %	20 %	20 %	161829945
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14119	NC_010117	ACTTA	2	10	652626	652635	40 %	40 %	0 %	20 %	161829945
14120	NC_010117	TGA	2	6	652687	652692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14123	NC_010117	A	6	6	652833	652838	100 %	0 %	0 %	0 %	161831166
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14245	NC_010117	GCC	2	6	659534	659539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831054
14246	NC_010117	T	6	6	659563	659568	0 %	100 %	0 %	0 %	161831054
14247	NC_010117	AATT	2	8	659597	659604	50 %	50 %	0 %	0 %	161831054
14248	NC_010117	CGTG	2	8	659638	659645	0 %	25 %	50 %	25 %	161831054
14249	NC_010117	T	6	6	659657	659662	0 %	100 %	0 %	0 %	161831054
14250	NC_010117	TGG	2	6	659695	659700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831054
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14252	NC_010117	TGG	2	6	659713	659718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831054
14253	NC_010117	CTG	2	6	659830	659835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831054
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14257	NC_010117	TACCGC	2	12	660101	660112	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161831054
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14495	NC_010117	AATC	2	8	671269	671276	50 %	25 %	0 %	25 %	161829736
14496	NC_010117	ATT	2	6	671359	671364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829736
14497	NC_010117	AAT	2	6	671377	671382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829736
14498	NC_010117	CGC	2	6	671421	671426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161829736
14499	NC_010117	A	6	6	671442	671447	100 %	0 %	0 %	0 %	161829736
14500	NC_010117	CGT	2	6	671460	671465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161829736

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