MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_010117	CAAG	2	8	530261	530268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11502	NC_010117	ATA	2	6	530409	530414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_010117	C	7	7	530469	530475	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11504	NC_010117	GTTT	2	8	530479	530486	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_010117	CAG	2	6	530513	530518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_010117	GA	3	6	530574	530579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_010117	A	8	8	530579	530586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_010117	A	6	6	530646	530651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_010117	AGA	2	6	530711	530716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_010117	A	7	7	530741	530747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_010117	CAAATC	2	12	530749	530760	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_010117	CGA	2	6	530788	530793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_010117	CA	3	6	530794	530799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11514	NC_010117	ATA	2	6	530817	530822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_010117	TAA	2	6	530886	530891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_010117	TGA	2	6	530945	530950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_010117	A	7	7	530993	530999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_010117	AGC	2	6	531001	531006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_010117	A	6	6	531029	531034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_010117	TTC	2	6	531100	531105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11521	NC_010117	CGC	2	6	531148	531153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11522	NC_010117	ATT	2	6	531217	531222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_010117	CTT	2	6	531240	531245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_010117	ATA	2	6	531300	531305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_010117	AATTTA	2	12	531332	531343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_010117	CG	3	6	531367	531372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11527	NC_010117	A	7	7	531394	531400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_010117	CGG	2	6	531425	531430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_010117	TTTTC	2	10	531552	531561	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11530	NC_010117	TTTTCA	2	12	531644	531655	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11531	NC_010117	AGC	2	6	531765	531770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_010117	AATTC	2	10	531808	531817	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11533	NC_010117	AAT	2	6	531827	531832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_010117	TCA	2	6	531860	531865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_010117	TAA	2	6	531915	531920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_010117	GCT	2	6	531964	531969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_010117	TTTTC	2	10	531991	532000	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11538	NC_010117	AAT	2	6	532042	532047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_010117	ATA	2	6	532126	532131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_010117	AAG	2	6	532137	532142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_010117	CGG	2	6	532298	532303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830537
11542	NC_010117	ATT	2	6	532373	532378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830537
11543	NC_010117	GAT	2	6	532407	532412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830537
11544	NC_010117	ATT	2	6	532419	532424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830537
11545	NC_010117	AAT	2	6	532446	532451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830537
11546	NC_010117	GCA	2	6	532491	532496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830537
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11548	NC_010117	T	6	6	532708	532713	0 %	100 %	0 %	0 %	161830537
11549	NC_010117	TTA	2	6	532740	532745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830537
11550	NC_010117	TGAT	2	8	532780	532787	25 %	50 %	25 %	0 %	161830537
11551	NC_010117	TAT	2	6	532817	532822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830537
11552	NC_010117	GTT	2	6	532862	532867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830537
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11554	NC_010117	GTTTCT	2	12	532932	532943	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	161830537
11555	NC_010117	GAT	2	6	532986	532991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830537
11556	NC_010117	TAT	2	6	533000	533005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830537
11557	NC_010117	ATT	2	6	533040	533045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830537
11558	NC_010117	GCG	2	6	533077	533082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830537
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11560	NC_010117	T	7	7	533222	533228	0 %	100 %	0 %	0 %	161830537
11561	NC_010117	CG	3	6	533249	533254	0 %	0 %	50 %	50 %	161830537
11562	NC_010117	GGC	2	6	533287	533292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830537
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11565	NC_010117	A	6	6	533390	533395	100 %	0 %	0 %	0 %	161830537
11566	NC_010117	CTT	2	6	533420	533425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830005
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11570	NC_010117	T	7	7	533562	533568	0 %	100 %	0 %	0 %	161830005
11571	NC_010117	CAAA	2	8	533605	533612	75 %	0 %	0 %	25 %	161830005
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11574	NC_010117	A	6	6	533646	533651	100 %	0 %	0 %	0 %	161830005
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11583	NC_010117	TTGGGG	2	12	534208	534219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_010117	GAG	2	6	534282	534287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_010117	GTA	2	6	534298	534303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11592	NC_010117	ATT	2	6	534756	534761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_010117	CGTT	2	8	534776	534783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11594	NC_010117	AGCAA	2	10	534812	534821	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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11597	NC_010117	TGA	2	6	535006	535011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831547
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11599	NC_010117	TTG	2	6	535218	535223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831547
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11601	NC_010117	TTGGC	2	10	535374	535383	0 %	40 %	40 %	20 %	161831547
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11619	NC_010117	AAAG	2	8	536214	536221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_010117	GATT	2	8	536324	536331	25 %	50 %	25 %	0 %	161831115
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11622	NC_010117	GCC	2	6	536353	536358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831115
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11624	NC_010117	A	6	6	536472	536477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_010117	TATAA	2	10	536520	536529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_010117	A	8	8	536528	536535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11996	NC_010117	TG	3	6	554536	554541	0 %	50 %	50 %	0 %	161830717
11997	NC_010117	GAA	2	6	554689	554694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830717
11998	NC_010117	ACA	2	6	554775	554780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830717
11999	NC_010117	CAA	2	6	554818	554823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830717
12000	NC_010117	GCCA	2	8	554831	554838	25 %	0 %	25 %	50 %	161830717

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