MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010117	ATA	2	6	507203	507208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830821
11002	NC_010117	TCAA	2	8	507245	507252	50 %	25 %	0 %	25 %	161830821
11003	NC_010117	GGAA	2	8	507309	507316	50 %	0 %	50 %	0 %	161830821
11004	NC_010117	AG	3	6	507376	507381	50 %	0 %	50 %	0 %	161830821
11005	NC_010117	AAC	2	6	507409	507414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830821
11006	NC_010117	CCGT	2	8	507415	507422	0 %	25 %	25 %	50 %	161830821
11007	NC_010117	CTT	2	6	507554	507559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830821
11008	NC_010117	CCG	2	6	507569	507574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830821
11009	NC_010117	AAT	2	6	507641	507646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830821
11010	NC_010117	A	6	6	507670	507675	100 %	0 %	0 %	0 %	161830821
11011	NC_010117	AG	3	6	507703	507708	50 %	0 %	50 %	0 %	161830821
11012	NC_010117	AT	3	6	507720	507725	50 %	50 %	0 %	0 %	161830821
11013	NC_010117	TAC	2	6	507738	507743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830821
11014	NC_010117	TGA	2	6	507797	507802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830821
11015	NC_010117	TTG	2	6	507808	507813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830821
11016	NC_010117	ATAG	2	8	507835	507842	50 %	25 %	25 %	0 %	161830821
11017	NC_010117	TAA	3	9	507863	507871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830821
11018	NC_010117	GAG	2	6	507952	507957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830821
11019	NC_010117	TTG	2	6	507961	507966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830821
11020	NC_010117	GGT	2	6	508016	508021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830821
11021	NC_010117	GGA	2	6	508022	508027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830821
11022	NC_010117	ACA	3	9	508043	508051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830821
11023	NC_010117	GTA	2	6	508054	508059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830821
11024	NC_010117	T	7	7	508068	508074	0 %	100 %	0 %	0 %	161830821
11025	NC_010117	T	6	6	508112	508117	0 %	100 %	0 %	0 %	161830821
11026	NC_010117	AGT	2	6	508126	508131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830821
11027	NC_010117	AGTATG	2	12	508135	508146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830821
11028	NC_010117	AAT	2	6	508190	508195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830821
11029	NC_010117	TTC	2	6	508240	508245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_010117	ACT	2	6	508276	508281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830379
11031	NC_010117	GCG	2	6	508283	508288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830379
11032	NC_010117	AAT	2	6	508290	508295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830379
11033	NC_010117	T	6	6	508295	508300	0 %	100 %	0 %	0 %	161830379
11034	NC_010117	T	8	8	508334	508341	0 %	100 %	0 %	0 %	161830379
11035	NC_010117	CGG	2	6	508353	508358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830379
11036	NC_010117	ACC	2	6	508419	508424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830379
11037	NC_010117	ATC	2	6	508463	508468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830379
11038	NC_010117	CGC	2	6	508566	508571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830379
11039	NC_010117	GTC	2	6	508579	508584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830379
11040	NC_010117	GAA	2	6	508630	508635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830379
11041	NC_010117	T	6	6	508651	508656	0 %	100 %	0 %	0 %	161830379
11042	NC_010117	AG	3	6	508658	508663	50 %	0 %	50 %	0 %	161830379
11043	NC_010117	ATTTA	2	10	508796	508805	40 %	60 %	0 %	0 %	161830379
11044	NC_010117	T	6	6	508835	508840	0 %	100 %	0 %	0 %	161830379
11045	NC_010117	TA	3	6	509069	509074	50 %	50 %	0 %	0 %	161830379
11046	NC_010117	TTCT	2	8	509099	509106	0 %	75 %	0 %	25 %	161830379
11047	NC_010117	AAT	2	6	509221	509226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830379
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11050	NC_010117	CAC	2	6	509255	509260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830379
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11052	NC_010117	GTA	2	6	509307	509312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830379
11053	NC_010117	GA	3	6	509317	509322	50 %	0 %	50 %	0 %	161830379
11054	NC_010117	CCT	2	6	509335	509340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830379
11055	NC_010117	TGG	2	6	509377	509382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830379
11056	NC_010117	AT	3	6	509392	509397	50 %	50 %	0 %	0 %	161830379
11057	NC_010117	CGA	2	6	509424	509429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830379
11058	NC_010117	T	6	6	509450	509455	0 %	100 %	0 %	0 %	161830379
11059	NC_010117	T	6	6	509468	509473	0 %	100 %	0 %	0 %	161830379
11060	NC_010117	T	7	7	509627	509633	0 %	100 %	0 %	0 %	161830379
11061	NC_010117	ATC	2	6	509636	509641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830379
11062	NC_010117	T	6	6	509646	509651	0 %	100 %	0 %	0 %	161830379
11063	NC_010117	TAA	2	6	509708	509713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830379
11064	NC_010117	T	7	7	509734	509740	0 %	100 %	0 %	0 %	161830379
11065	NC_010117	T	6	6	509791	509796	0 %	100 %	0 %	0 %	161830379
11066	NC_010117	CAGC	2	8	509797	509804	25 %	0 %	25 %	50 %	161830379
11067	NC_010117	GCT	2	6	509805	509810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830379
11068	NC_010117	CTTC	2	8	509842	509849	0 %	50 %	0 %	50 %	161830379
11069	NC_010117	TA	3	6	509959	509964	50 %	50 %	0 %	0 %	161830379
11070	NC_010117	GGC	2	6	509969	509974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830379
11071	NC_010117	CAT	2	6	510011	510016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830379
11072	NC_010117	AG	3	6	510027	510032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_010117	CGG	2	6	510086	510091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_010117	ATTCCG	2	12	510126	510137	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_010117	TCC	2	6	510147	510152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11076	NC_010117	AAT	2	6	510171	510176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_010117	GAGAA	2	10	510196	510205	60 %	0 %	40 %	0 %	161830160
11078	NC_010117	A	6	6	510215	510220	100 %	0 %	0 %	0 %	161830160
11079	NC_010117	CGA	2	6	510296	510301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830160
11080	NC_010117	TCA	2	6	510321	510326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830160
11081	NC_010117	TAT	2	6	510343	510348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830160
11082	NC_010117	ACGAAG	2	12	510383	510394	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	161830160
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11088	NC_010117	GCC	2	6	510625	510630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831212
11089	NC_010117	A	8	8	510650	510657	100 %	0 %	0 %	0 %	161831212
11090	NC_010117	TCC	2	6	510659	510664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161831212
11091	NC_010117	AGGCC	2	10	510694	510703	20 %	0 %	40 %	40 %	161831212
11092	NC_010117	GACC	2	8	510782	510789	25 %	0 %	25 %	50 %	161831212
11093	NC_010117	ATT	2	6	510794	510799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831212
11094	NC_010117	GAA	2	6	510814	510819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831212
11095	NC_010117	GAA	3	9	510965	510973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831212
11096	NC_010117	A	6	6	510995	511000	100 %	0 %	0 %	0 %	161831212
11097	NC_010117	ATTA	2	8	511031	511038	50 %	50 %	0 %	0 %	161831212
11098	NC_010117	TAA	2	6	511069	511074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831212
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11101	NC_010117	AAG	2	6	511167	511172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831212
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11103	NC_010117	TCA	2	6	511236	511241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831212
11104	NC_010117	TTTG	2	8	511334	511341	0 %	75 %	25 %	0 %	161831212
11105	NC_010117	GAA	2	6	511349	511354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831212
11106	NC_010117	TTA	2	6	511389	511394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831212
11107	NC_010117	AAG	3	9	511395	511403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831212
11108	NC_010117	AAAT	2	8	511429	511436	75 %	25 %	0 %	0 %	161831212
11109	NC_010117	CG	3	6	511443	511448	0 %	0 %	50 %	50 %	161831071
11110	NC_010117	A	6	6	511505	511510	100 %	0 %	0 %	0 %	161831071
11111	NC_010117	GCGT	2	8	511550	511557	0 %	25 %	50 %	25 %	161831071
11112	NC_010117	GTCAT	2	10	511562	511571	20 %	40 %	20 %	20 %	161831071
11113	NC_010117	ATA	2	6	511586	511591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831071
11114	NC_010117	CCA	2	6	511592	511597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831071
11115	NC_010117	CCG	2	6	511649	511654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831071
11116	NC_010117	CAG	2	6	511685	511690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831071
11117	NC_010117	ATT	2	6	511694	511699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831071
11118	NC_010117	GCG	2	6	511771	511776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831071
11119	NC_010117	GCA	2	6	511895	511900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831071
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11121	NC_010117	ATT	2	6	512119	512124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831071
11122	NC_010117	TAT	2	6	512187	512192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831071
11123	NC_010117	GCT	2	6	512269	512274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831071
11124	NC_010117	GCG	2	6	512324	512329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831071
11125	NC_010117	GCT	2	6	512334	512339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831071
11126	NC_010117	GCGCT	2	10	512372	512381	0 %	20 %	40 %	40 %	161831071
11127	NC_010117	GAAGC	2	10	512402	512411	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11128	NC_010117	GCTTC	2	10	512444	512453	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11129	NC_010117	A	6	6	512488	512493	100 %	0 %	0 %	0 %	161830633
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11131	NC_010117	GTT	2	6	512690	512695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830633
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11492	NC_010117	GTT	2	6	529999	530004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11493	NC_010117	TAATCC	2	12	530005	530016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11494	NC_010117	GAG	2	6	530036	530041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11495	NC_010117	AAT	2	6	530050	530055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11496	NC_010117	AGC	2	6	530080	530085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11497	NC_010117	A	6	6	530098	530103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11498	NC_010117	TAA	2	6	530145	530150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11499	NC_010117	A	6	6	530181	530186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11500	NC_010117	TAA	2	6	530230	530235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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