MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_010117	CGG	2	6	413587	413592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_010117	GCC	2	6	413623	413628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9003	NC_010117	AATA	2	8	413689	413696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_010117	TGAT	2	8	413699	413706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_010117	GTAT	2	8	413723	413730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_010117	GCT	2	6	413846	413851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_010117	ATC	2	6	413855	413860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_010117	ACTT	2	8	413947	413954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9009	NC_010117	ACG	2	6	413975	413980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_010117	ATA	2	6	414005	414010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_010117	GAT	2	6	414024	414029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_010117	TAA	2	6	414037	414042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_010117	ATTT	2	8	414073	414080	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_010117	A	7	7	414086	414092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_010117	TTA	2	6	414161	414166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_010117	T	6	6	414190	414195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_010117	A	7	7	414201	414207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_010117	TTAA	2	8	414208	414215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_010117	TGCG	2	8	414221	414228	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9020	NC_010117	TCT	2	6	414256	414261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_010117	AATA	2	8	414334	414341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_010117	TGCG	2	8	414344	414351	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9023	NC_010117	GCATT	2	10	414371	414380	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9024	NC_010117	ACT	2	6	414497	414502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_010117	T	6	6	414514	414519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_010117	TTA	2	6	414526	414531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_010117	GAA	2	6	414581	414586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_010117	TAA	2	6	414638	414643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830858
9029	NC_010117	TAA	2	6	414650	414655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830858
9030	NC_010117	CAG	2	6	414694	414699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830858
9031	NC_010117	AGA	2	6	414752	414757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830858
9032	NC_010117	A	6	6	414819	414824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_010117	A	6	6	414856	414861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_010117	CTTTA	2	10	414888	414897	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9035	NC_010117	AC	3	6	414938	414943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9036	NC_010117	ATT	2	6	415060	415065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_010117	AAG	2	6	415107	415112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831503
9038	NC_010117	TCT	2	6	415113	415118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831503
9039	NC_010117	TCC	2	6	415145	415150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161831503
9040	NC_010117	GAA	2	6	415164	415169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831503
9041	NC_010117	CTC	2	6	415192	415197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161831503
9042	NC_010117	A	6	6	415228	415233	100 %	0 %	0 %	0 %	161831503
9043	NC_010117	GGA	2	6	415280	415285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831503
9044	NC_010117	GAT	2	6	415356	415361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831503
9045	NC_010117	TAA	2	6	415367	415372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831503
9046	NC_010117	GA	3	6	415421	415426	50 %	0 %	50 %	0 %	161831503
9047	NC_010117	A	7	7	415464	415470	100 %	0 %	0 %	0 %	161831503
9048	NC_010117	CGC	2	6	415477	415482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831503
9049	NC_010117	AGGGG	2	10	415498	415507	20 %	0 %	80 %	0 %	161831503
9050	NC_010117	AAC	2	6	415576	415581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830418
9051	NC_010117	TGAAA	2	10	415667	415676	60 %	20 %	20 %	0 %	161830418
9052	NC_010117	A	6	6	415674	415679	100 %	0 %	0 %	0 %	161830418
9053	NC_010117	ATTA	2	8	415909	415916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_010117	ATT	2	6	415926	415931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_010117	ATTA	2	8	415943	415950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_010117	TTC	2	6	415995	416000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830578
9057	NC_010117	GGA	2	6	416007	416012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830578
9058	NC_010117	CCTG	2	8	416017	416024	0 %	25 %	25 %	50 %	161830578
9059	NC_010117	A	7	7	416042	416048	100 %	0 %	0 %	0 %	161830578
9060	NC_010117	GAA	2	6	416077	416082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830578
9061	NC_010117	AGAT	2	8	416100	416107	50 %	25 %	25 %	0 %	161830578
9062	NC_010117	A	6	6	416146	416151	100 %	0 %	0 %	0 %	161830578
9063	NC_010117	GA	3	6	416157	416162	50 %	0 %	50 %	0 %	161830578
9064	NC_010117	GGA	2	6	416172	416177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830578
9065	NC_010117	TC	3	6	416265	416270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9066	NC_010117	AT	3	6	416358	416363	50 %	50 %	0 %	0 %	161831242
9067	NC_010117	AAT	2	6	416394	416399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831242
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9071	NC_010117	A	6	6	416596	416601	100 %	0 %	0 %	0 %	161831242
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9081	NC_010117	AG	3	6	417110	417115	50 %	0 %	50 %	0 %	161830043
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9097	NC_010117	AAGGG	2	10	417811	417820	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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9109	NC_010117	CAGG	2	8	418149	418156	25 %	0 %	50 %	25 %	161830890
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9112	NC_010117	AGG	2	6	418410	418415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_010117	GAG	2	6	418424	418429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_010117	GTT	2	6	418431	418436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_010117	GAA	2	6	418470	418475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_010117	ATG	2	6	418485	418490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_010117	ACT	2	6	418515	418520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9119	NC_010117	GCCC	2	8	418561	418568	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9120	NC_010117	ATT	2	6	418723	418728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_010117	T	7	7	418739	418745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_010117	ATAGG	2	10	418794	418803	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_010117	CAA	2	6	418881	418886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9124	NC_010117	CAGC	2	8	418971	418978	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9125	NC_010117	ATT	2	6	418992	418997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_010117	ATG	2	6	419095	419100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9130	NC_010117	TTG	2	6	419253	419258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831382
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