MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_010117	GCC	3	9	390286	390294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8502	NC_010117	TTG	2	6	390324	390329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_010117	A	6	6	390424	390429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_010117	ATAA	2	8	390474	390481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_010117	AAGC	2	8	390565	390572	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8506	NC_010117	ACC	2	6	390579	390584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8507	NC_010117	CGC	2	6	390595	390600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8508	NC_010117	CGC	3	9	390783	390791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8509	NC_010117	CGG	2	6	390801	390806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8510	NC_010117	CGC	2	6	390996	391001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8511	NC_010117	AAT	2	6	391017	391022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_010117	T	7	7	391038	391044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_010117	T	6	6	391047	391052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_010117	AG	3	6	391056	391061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_010117	GC	3	6	391181	391186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8516	NC_010117	CGT	2	6	391188	391193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_010117	T	7	7	391282	391288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_010117	CCA	2	6	391341	391346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8519	NC_010117	TTG	2	6	391425	391430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_010117	ATT	2	6	391491	391496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831052
8521	NC_010117	TAA	3	9	391608	391616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831052
8522	NC_010117	AATA	2	8	391617	391624	75 %	25 %	0 %	0 %	161831052
8523	NC_010117	A	6	6	391624	391629	100 %	0 %	0 %	0 %	161831052
8524	NC_010117	TAAC	2	8	391677	391684	50 %	25 %	0 %	25 %	161831052
8525	NC_010117	GCTC	2	8	391717	391724	0 %	25 %	25 %	50 %	161831052
8526	NC_010117	TAA	2	6	391813	391818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831052
8527	NC_010117	AACT	2	8	391890	391897	50 %	25 %	0 %	25 %	161831052
8528	NC_010117	AAT	2	6	391919	391924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831052
8529	NC_010117	CGT	2	6	391931	391936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831052
8530	NC_010117	TCG	2	6	392001	392006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831052
8531	NC_010117	GTA	2	6	392062	392067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831052
8532	NC_010117	TTG	2	6	392092	392097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831052
8533	NC_010117	GAT	2	6	392137	392142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831052
8534	NC_010117	AAT	2	6	392150	392155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831052
8535	NC_010117	TGC	3	9	392174	392182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831052
8536	NC_010117	TTC	2	6	392263	392268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831052
8537	NC_010117	CGT	2	6	392373	392378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831052
8538	NC_010117	ATA	2	6	392389	392394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831052
8539	NC_010117	CTA	2	6	392397	392402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831052
8540	NC_010117	GAAA	2	8	392408	392415	75 %	0 %	25 %	0 %	161831052
8541	NC_010117	GA	3	6	392475	392480	50 %	0 %	50 %	0 %	161831052
8542	NC_010117	GCG	2	6	392496	392501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831052
8543	NC_010117	AAG	2	6	392508	392513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831052
8544	NC_010117	AAT	2	6	392536	392541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831052
8545	NC_010117	ACCA	2	8	392552	392559	50 %	0 %	0 %	50 %	161831052
8546	NC_010117	CAA	2	6	392595	392600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831052
8547	NC_010117	A	6	6	392678	392683	100 %	0 %	0 %	0 %	161831052
8548	NC_010117	ACA	2	6	392705	392710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831052
8549	NC_010117	CATT	2	8	392715	392722	25 %	50 %	0 %	25 %	161831052
8550	NC_010117	GA	3	6	392727	392732	50 %	0 %	50 %	0 %	161831052
8551	NC_010117	T	7	7	392844	392850	0 %	100 %	0 %	0 %	161831052
8552	NC_010117	TTC	2	6	392911	392916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8553	NC_010117	CAAT	2	8	392949	392956	50 %	25 %	0 %	25 %	161831467
8554	NC_010117	GCT	2	6	393066	393071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831467
8555	NC_010117	AAG	2	6	393143	393148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831467
8556	NC_010117	AAC	2	6	393196	393201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831467
8557	NC_010117	AAC	2	6	393266	393271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831467
8558	NC_010117	GTT	2	6	393333	393338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831467
8559	NC_010117	TTA	2	6	393339	393344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831467
8560	NC_010117	T	6	6	393661	393666	0 %	100 %	0 %	0 %	161829915
8561	NC_010117	GGT	2	6	393671	393676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161829915
8562	NC_010117	AAT	2	6	393697	393702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829915
8563	NC_010117	ACC	2	6	393708	393713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161829915
8564	NC_010117	TAAAT	2	10	393783	393792	60 %	40 %	0 %	0 %	161829915
8565	NC_010117	TGG	2	6	393845	393850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161829915
8566	NC_010117	A	7	7	393853	393859	100 %	0 %	0 %	0 %	161829915
8567	NC_010117	GCC	2	6	393864	393869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161829915
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8570	NC_010117	ATC	2	6	393898	393903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829915
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8572	NC_010117	TGT	2	6	394018	394023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161829915
8573	NC_010117	T	6	6	394033	394038	0 %	100 %	0 %	0 %	161829915
8574	NC_010117	TAA	2	6	394110	394115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829915
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8579	NC_010117	CTT	2	6	394407	394412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830340
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8581	NC_010117	TTTC	2	8	394494	394501	0 %	75 %	0 %	25 %	161830340
8582	NC_010117	AGCA	2	8	394567	394574	50 %	0 %	25 %	25 %	161830340
8583	NC_010117	TTG	2	6	394598	394603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830340
8584	NC_010117	ATA	2	6	394643	394648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830340
8585	NC_010117	TTA	2	6	394687	394692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830624
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8587	NC_010117	TTG	2	6	394762	394767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830624
8588	NC_010117	TAA	2	6	394789	394794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830624
8589	NC_010117	CGT	2	6	394878	394883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830624
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8591	NC_010117	ATA	2	6	395003	395008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830624
8592	NC_010117	GAA	2	6	395062	395067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830624
8593	NC_010117	CAC	2	6	395116	395121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830624
8594	NC_010117	TAA	2	6	395191	395196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830624
8595	NC_010117	GAT	2	6	395290	395295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830624
8596	NC_010117	GC	3	6	395336	395341	0 %	0 %	50 %	50 %	161830624
8597	NC_010117	GGC	2	6	395398	395403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830624
8598	NC_010117	GTG	2	6	395548	395553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830624
8599	NC_010117	ATG	4	12	395557	395568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830624
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8601	NC_010117	AGA	2	6	395613	395618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_010117	TCC	2	6	395688	395693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8603	NC_010117	TGG	2	6	395745	395750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831162
8604	NC_010117	GGT	2	6	395790	395795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831162
8605	NC_010117	AGC	2	6	395837	395842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831162
8606	NC_010117	AAGT	2	8	395843	395850	50 %	25 %	25 %	0 %	161831162
8607	NC_010117	ATC	2	6	395852	395857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831162
8608	NC_010117	CCT	2	6	395944	395949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161831162
8609	NC_010117	TTC	2	6	395990	395995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831162
8610	NC_010117	AT	3	6	396093	396098	50 %	50 %	0 %	0 %	161831162
8611	NC_010117	T	6	6	396098	396103	0 %	100 %	0 %	0 %	161831162
8612	NC_010117	CGAT	2	8	396145	396152	25 %	25 %	25 %	25 %	161831162
8613	NC_010117	GAT	2	6	396176	396181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831162
8614	NC_010117	CA	3	6	396191	396196	50 %	0 %	0 %	50 %	161831162
8615	NC_010117	CCG	2	6	396210	396215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831162
8616	NC_010117	GCT	2	6	396219	396224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831162
8617	NC_010117	GGC	2	6	396284	396289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831162
8618	NC_010117	AAC	2	6	396305	396310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831162
8619	NC_010117	AGC	2	6	396333	396338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831162
8620	NC_010117	GTC	2	6	396344	396349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831162
8621	NC_010117	TTC	2	6	396380	396385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831162
8622	NC_010117	T	7	7	396446	396452	0 %	100 %	0 %	0 %	161831162
8623	NC_010117	GGT	2	6	396458	396463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831162
8624	NC_010117	TTTCTT	2	12	396470	396481	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	161831162
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