MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 110326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_010001	A	7	7	641370	641376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_010001	TAA	2	6	641401	641406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_010001	TAT	2	6	641463	641468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_010001	TCAA	2	8	641566	641573	50 %	25 %	0 %	25 %	160878657
14505	NC_010001	A	6	6	641587	641592	100 %	0 %	0 %	0 %	160878657
14506	NC_010001	ATA	2	6	641595	641600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878657
14507	NC_010001	TCC	2	6	641614	641619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878657
14508	NC_010001	T	7	7	641651	641657	0 %	100 %	0 %	0 %	160878657
14509	NC_010001	GGA	2	6	641680	641685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878657
14510	NC_010001	ATA	2	6	641726	641731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878657
14511	NC_010001	TAA	2	6	641825	641830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878657
14512	NC_010001	CTT	2	6	641846	641851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878657
14513	NC_010001	GCA	2	6	641854	641859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878657
14514	NC_010001	GCAC	2	8	641869	641876	25 %	0 %	25 %	50 %	160878657
14515	NC_010001	CAAG	2	8	641891	641898	50 %	0 %	25 %	25 %	160878657
14516	NC_010001	ACC	2	6	641901	641906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160878657
14517	NC_010001	AAC	2	6	641919	641924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878657
14518	NC_010001	CTG	2	6	641927	641932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878657
14519	NC_010001	TAT	2	6	641933	641938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878657
14520	NC_010001	TAA	2	6	641952	641957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878657
14521	NC_010001	T	8	8	642073	642080	0 %	100 %	0 %	0 %	160878657
14522	NC_010001	TTTCT	2	10	642153	642162	0 %	80 %	0 %	20 %	160878657
14523	NC_010001	CCG	2	6	642178	642183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160878657
14524	NC_010001	TTA	2	6	642246	642251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_010001	ACAA	2	8	642298	642305	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14526	NC_010001	AAT	2	6	642314	642319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_010001	CAT	2	6	642320	642325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14528	NC_010001	TTA	2	6	642427	642432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_010001	TAT	2	6	642440	642445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_010001	TTAAA	2	10	642446	642455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_010001	AAG	2	6	642458	642463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_010001	AT	3	6	642479	642484	50 %	50 %	0 %	0 %	160878658
14533	NC_010001	TTA	2	6	642489	642494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878658
14534	NC_010001	ATGA	2	8	642495	642502	50 %	25 %	25 %	0 %	160878658
14535	NC_010001	ATG	2	6	642552	642557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878658
14536	NC_010001	T	7	7	642565	642571	0 %	100 %	0 %	0 %	160878658
14537	NC_010001	TTA	2	6	642630	642635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878658
14538	NC_010001	ATG	2	6	642679	642684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878658
14539	NC_010001	TAT	2	6	642765	642770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878658
14540	NC_010001	AT	3	6	642769	642774	50 %	50 %	0 %	0 %	160878658
14541	NC_010001	TTC	3	9	642801	642809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878658
14542	NC_010001	CAT	2	6	642920	642925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878658
14543	NC_010001	ATT	2	6	642932	642937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878658
14544	NC_010001	CTT	2	6	642938	642943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878658
14545	NC_010001	A	6	6	642962	642967	100 %	0 %	0 %	0 %	160878658
14546	NC_010001	A	7	7	642977	642983	100 %	0 %	0 %	0 %	160878658
14547	NC_010001	TAA	2	6	643000	643005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878658
14548	NC_010001	AGT	2	6	643006	643011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878658
14549	NC_010001	AGT	2	6	643085	643090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878659
14550	NC_010001	TATCT	2	10	643098	643107	20 %	60 %	0 %	20 %	160878659
14551	NC_010001	ATT	2	6	643210	643215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878659
14552	NC_010001	GAAA	2	8	643308	643315	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_010001	CA	3	6	643358	643363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14554	NC_010001	ACT	2	6	643365	643370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14555	NC_010001	GAAA	2	8	643393	643400	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_010001	TTA	2	6	643423	643428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878660
14557	NC_010001	AT	3	6	643442	643447	50 %	50 %	0 %	0 %	160878660
14558	NC_010001	GA	3	6	643448	643453	50 %	0 %	50 %	0 %	160878660
14559	NC_010001	GAAAGA	2	12	643460	643471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878660
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14561	NC_010001	TTA	2	6	643551	643556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878660
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14565	NC_010001	AAAC	2	8	643728	643735	75 %	0 %	0 %	25 %	160878660
14566	NC_010001	GTAT	2	8	643741	643748	25 %	50 %	25 %	0 %	160878660
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14583	NC_010001	AGTT	2	8	644509	644516	25 %	50 %	25 %	0 %	160878660
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14587	NC_010001	ATA	3	9	644790	644798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14589	NC_010001	GAA	2	6	644836	644841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_010001	TATG	2	8	644848	644855	25 %	50 %	25 %	0 %	160878661
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14595	NC_010001	TAG	2	6	644983	644988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878661
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14599	NC_010001	TGA	2	6	645082	645087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878661
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14601	NC_010001	CATG	2	8	645122	645129	25 %	25 %	25 %	25 %	160878661
14602	NC_010001	GAA	2	6	645143	645148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878661
14603	NC_010001	ATTAG	2	10	645190	645199	40 %	40 %	20 %	0 %	160878661
14604	NC_010001	AAT	2	6	645293	645298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_010001	T	6	6	645335	645340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_010001	TG	3	6	645380	645385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_010001	CTTA	2	8	645393	645400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14608	NC_010001	CTC	2	6	645415	645420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14609	NC_010001	TTC	2	6	645427	645432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14610	NC_010001	TTA	2	6	645458	645463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_010001	T	6	6	645491	645496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_010001	TTAA	2	8	645568	645575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_010001	TAC	2	6	645583	645588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14614	NC_010001	GGA	2	6	645675	645680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_010001	CTT	2	6	645694	645699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14616	NC_010001	TTG	2	6	645705	645710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_010001	AC	3	6	645857	645862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14618	NC_010001	AC	4	8	645876	645883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14619	NC_010001	TTA	2	6	645911	645916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878662
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