MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 110326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_010001	TAA	2	6	4525493	4525498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160881803
103002	NC_010001	ATA	2	6	4525523	4525528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160881803
103003	NC_010001	A	6	6	4525534	4525539	100 %	0 %	0 %	0 %	160881803
103004	NC_010001	CTT	2	6	4525589	4525594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881803
103005	NC_010001	TAC	2	6	4525632	4525637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881803
103006	NC_010001	CT	3	6	4525658	4525663	0 %	50 %	0 %	50 %	160881803
103007	NC_010001	GCT	3	9	4525720	4525728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160881803
103008	NC_010001	CTG	2	6	4525742	4525747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160881803
103009	NC_010001	AT	3	6	4525791	4525796	50 %	50 %	0 %	0 %	160881803
103010	NC_010001	CTT	2	6	4525842	4525847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881803
103011	NC_010001	ATA	2	6	4525875	4525880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160881803
103012	NC_010001	TAA	2	6	4525904	4525909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160881803
103013	NC_010001	AAG	2	6	4525913	4525918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160881803
103014	NC_010001	CTG	2	6	4525928	4525933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160881803
103015	NC_010001	TGC	2	6	4526049	4526054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160881803
103016	NC_010001	GCA	2	6	4526089	4526094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160881803
103017	NC_010001	AGAA	3	12	4526187	4526198	75 %	0 %	25 %	0 %	160881803
103018	NC_010001	TAT	2	6	4526228	4526233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160881803
103019	NC_010001	A	7	7	4526243	4526249	100 %	0 %	0 %	0 %	160881803
103020	NC_010001	ATA	2	6	4526252	4526257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160881803
103021	NC_010001	TAC	2	6	4526265	4526270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881803
103022	NC_010001	CT	3	6	4526332	4526337	0 %	50 %	0 %	50 %	160881803
103023	NC_010001	C	6	6	4526362	4526367	0 %	0 %	0 %	100 %	160881803
103024	NC_010001	CATT	2	8	4526472	4526479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103025	NC_010001	TA	3	6	4526510	4526515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103026	NC_010001	ACT	2	6	4526516	4526521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103027	NC_010001	CTT	2	6	4526631	4526636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881804
103028	NC_010001	ATC	2	6	4526653	4526658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881804
103029	NC_010001	TTC	2	6	4526683	4526688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881804
103030	NC_010001	CTT	2	6	4526721	4526726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881804
103031	NC_010001	CTG	2	6	4526889	4526894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160881804
103032	NC_010001	GCT	2	6	4526960	4526965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160881804
103033	NC_010001	GTT	2	6	4526981	4526986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160881804
103034	NC_010001	TGC	2	6	4526998	4527003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160881804
103035	NC_010001	GGAAA	2	10	4527004	4527013	60 %	0 %	40 %	0 %	160881804
103036	NC_010001	TTG	2	6	4527018	4527023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160881804
103037	NC_010001	GCT	2	6	4527086	4527091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160881804
103038	NC_010001	ATT	2	6	4527160	4527165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160881804
103039	NC_010001	CTT	2	6	4527178	4527183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881804
103040	NC_010001	TCA	2	6	4527341	4527346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881804
103041	NC_010001	CTT	3	9	4527457	4527465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881804
103042	NC_010001	ACC	2	6	4527487	4527492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160881804
103043	NC_010001	ATC	2	6	4527571	4527576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881804
103044	NC_010001	ACC	2	6	4527586	4527591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160881804
103045	NC_010001	AAT	2	6	4527649	4527654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160881804
103046	NC_010001	TG	3	6	4527729	4527734	0 %	50 %	50 %	0 %	160881804
103047	NC_010001	AAGA	2	8	4527741	4527748	75 %	0 %	25 %	0 %	160881804
103048	NC_010001	TGCTT	2	10	4527787	4527796	0 %	60 %	20 %	20 %	160881804
103049	NC_010001	TACGA	2	10	4527799	4527808	40 %	20 %	20 %	20 %	160881804
103050	NC_010001	GCA	2	6	4527809	4527814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160881804
103051	NC_010001	TGA	2	6	4527825	4527830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160881804
103052	NC_010001	TTC	2	6	4527839	4527844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881804
103053	NC_010001	ATC	2	6	4527862	4527867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881804
103054	NC_010001	GCAT	2	8	4527880	4527887	25 %	25 %	25 %	25 %	160881804
103055	NC_010001	TCT	2	6	4527905	4527910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881804
103056	NC_010001	CTT	2	6	4527924	4527929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881804
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103061	NC_010001	CAT	2	6	4528252	4528257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881804
103062	NC_010001	TTA	2	6	4528265	4528270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160881804
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103064	NC_010001	TCA	2	6	4528307	4528312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881804
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103066	NC_010001	TCA	2	6	4528362	4528367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881804
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103070	NC_010001	GAGTA	2	10	4528482	4528491	40 %	20 %	40 %	0 %	160881804
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103097	NC_010001	CT	3	6	4529760	4529765	0 %	50 %	0 %	50 %	160881804
103098	NC_010001	CT	3	6	4529790	4529795	0 %	50 %	0 %	50 %	160881804
103099	NC_010001	TTCT	2	8	4529809	4529816	0 %	75 %	0 %	25 %	160881804
103100	NC_010001	ACG	2	6	4530103	4530108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160881804
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103103	NC_010001	TTTG	2	8	4530202	4530209	0 %	75 %	25 %	0 %	160881804
103104	NC_010001	ATTG	2	8	4530265	4530272	25 %	50 %	25 %	0 %	160881804
103105	NC_010001	CT	3	6	4530304	4530309	0 %	50 %	0 %	50 %	160881804
103106	NC_010001	TCT	2	6	4530312	4530317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881804
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103109	NC_010001	ATC	2	6	4530427	4530432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881805
103110	NC_010001	TCG	2	6	4530464	4530469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160881805
103111	NC_010001	TCC	2	6	4530494	4530499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160881805
103112	NC_010001	TTCAC	2	10	4530503	4530512	20 %	40 %	0 %	40 %	160881805
103113	NC_010001	CTT	2	6	4530522	4530527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881805
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103115	NC_010001	TCA	2	6	4530617	4530622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881805
103116	NC_010001	TCA	2	6	4530629	4530634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881805
103117	NC_010001	AT	3	6	4530711	4530716	50 %	50 %	0 %	0 %	160881805
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103122	NC_010001	ATC	2	6	4530931	4530936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881805
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103134	NC_010001	ATA	2	6	4531700	4531705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160881805
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103144	NC_010001	ACA	2	6	4532141	4532146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160881805
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103201	NC_010001	AT	3	6	4534583	4534588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103202	NC_010001	ATCC	2	8	4534635	4534642	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103203	NC_010001	A	8	8	4534647	4534654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103207	NC_010001	GTA	2	6	4534789	4534794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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103209	NC_010001	TGA	2	6	4534842	4534847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103210	NC_010001	A	6	6	4534937	4534942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103211	NC_010001	AC	3	6	4535050	4535055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103212	NC_010001	AAT	2	6	4535090	4535095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103222	NC_010001	TTCC	2	8	4535524	4535531	0 %	50 %	0 %	50 %	160881806
103223	NC_010001	TCA	2	6	4535554	4535559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881806
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103225	NC_010001	AGA	2	6	4535702	4535707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160881806
103226	NC_010001	CTT	2	6	4535755	4535760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881806
103227	NC_010001	TAG	2	6	4535776	4535781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160881806
103228	NC_010001	ATC	2	6	4535789	4535794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881806
103229	NC_010001	TTC	2	6	4535817	4535822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881806
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