MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 110326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
101001	NC_010001	AAAG	2	8	4440239	4440246	75 %	0 %	25 %	0 %	160881713
101002	NC_010001	TTCTT	2	10	4440279	4440288	0 %	80 %	0 %	20 %	160881713
101003	NC_010001	T	8	8	4440297	4440304	0 %	100 %	0 %	0 %	160881713
101004	NC_010001	TCC	2	6	4440314	4440319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160881714
101005	NC_010001	TTTC	2	8	4440341	4440348	0 %	75 %	0 %	25 %	160881714
101006	NC_010001	TCA	2	6	4440421	4440426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881714
101007	NC_010001	AC	3	6	4440431	4440436	50 %	0 %	0 %	50 %	160881714
101008	NC_010001	AACGG	2	10	4440444	4440453	40 %	0 %	40 %	20 %	160881714
101009	NC_010001	CCT	2	6	4440479	4440484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160881714
101010	NC_010001	GTAT	2	8	4440490	4440497	25 %	50 %	25 %	0 %	160881714
101011	NC_010001	TTC	2	6	4440501	4440506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881714
101012	NC_010001	ACTC	2	8	4440524	4440531	25 %	25 %	0 %	50 %	160881714
101013	NC_010001	CTC	2	6	4440558	4440563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160881714
101014	NC_010001	TA	3	6	4440597	4440602	50 %	50 %	0 %	0 %	160881714
101015	NC_010001	ATTG	2	8	4440615	4440622	25 %	50 %	25 %	0 %	160881714
101016	NC_010001	ATGT	2	8	4440665	4440672	25 %	50 %	25 %	0 %	160881714
101017	NC_010001	GAT	2	6	4440674	4440679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160881714
101018	NC_010001	TACA	2	8	4440735	4440742	50 %	25 %	0 %	25 %	160881714
101019	NC_010001	TCT	2	6	4440787	4440792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881714
101020	NC_010001	TA	3	6	4440832	4440837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101021	NC_010001	TCTAT	2	10	4440864	4440873	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101022	NC_010001	AAG	2	6	4440886	4440891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101023	NC_010001	CTT	2	6	4440903	4440908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101024	NC_010001	ATT	2	6	4440941	4440946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101025	NC_010001	T	6	6	4440956	4440961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101026	NC_010001	AAT	2	6	4440967	4440972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101027	NC_010001	AAG	2	6	4440982	4440987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101028	NC_010001	CTT	2	6	4440999	4441004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101029	NC_010001	TG	3	6	4441129	4441134	0 %	50 %	50 %	0 %	160881715
101030	NC_010001	CAA	2	6	4441136	4441141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160881715
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101032	NC_010001	ACT	2	6	4441197	4441202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881715
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101035	NC_010001	ATAAA	2	10	4441327	4441336	80 %	20 %	0 %	0 %	160881715
101036	NC_010001	ATA	2	6	4441452	4441457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160881715
101037	NC_010001	ATC	2	6	4441458	4441463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881715
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101040	NC_010001	AAAT	2	8	4441599	4441606	75 %	25 %	0 %	0 %	160881715
101041	NC_010001	CTT	2	6	4441628	4441633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881715
101042	NC_010001	T	6	6	4441700	4441705	0 %	100 %	0 %	0 %	160881715
101043	NC_010001	ACA	2	6	4441711	4441716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160881715
101044	NC_010001	T	6	6	4441725	4441730	0 %	100 %	0 %	0 %	160881715
101045	NC_010001	TCA	2	6	4441778	4441783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881715
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101050	NC_010001	T	7	7	4441902	4441908	0 %	100 %	0 %	0 %	160881715
101051	NC_010001	ATG	2	6	4441963	4441968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160881715
101052	NC_010001	T	6	6	4441971	4441976	0 %	100 %	0 %	0 %	160881715
101053	NC_010001	TCC	2	6	4441990	4441995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101054	NC_010001	ATT	2	6	4441996	4442001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101055	NC_010001	T	6	6	4442000	4442005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101056	NC_010001	ATA	2	6	4442027	4442032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101057	NC_010001	ATC	2	6	4442053	4442058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101058	NC_010001	ATT	2	6	4442068	4442073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101059	NC_010001	AAT	2	6	4442115	4442120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101060	NC_010001	TA	3	6	4442130	4442135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101061	NC_010001	AGAC	2	8	4442137	4442144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101062	NC_010001	GTA	2	6	4442184	4442189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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101093	NC_010001	T	6	6	4443878	4443883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101095	NC_010001	CTTA	2	8	4443990	4443997	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101096	NC_010001	ATT	2	6	4444003	4444008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101099	NC_010001	CTTA	2	8	4444058	4444065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101100	NC_010001	ATC	2	6	4444096	4444101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881717
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101103	NC_010001	AT	3	6	4444235	4444240	50 %	50 %	0 %	0 %	160881717
101104	NC_010001	AGCG	2	8	4444273	4444280	25 %	0 %	50 %	25 %	160881717
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101111	NC_010001	CAT	2	6	4444534	4444539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881717
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101122	NC_010001	GAT	2	6	4444907	4444912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160881718
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101225	NC_010001	GT	3	6	4449004	4449009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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101231	NC_010001	T	6	6	4449409	4449414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101232	NC_010001	TAA	2	6	4449423	4449428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101233	NC_010001	TCT	3	9	4449499	4449507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101234	NC_010001	AT	3	6	4449600	4449605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101235	NC_010001	TG	3	6	4449672	4449677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101236	NC_010001	TAC	2	6	4449795	4449800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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101475	NC_010001	TCAT	2	8	4460067	4460074	25 %	50 %	0 %	25 %	160881729
101476	NC_010001	ATG	2	6	4460175	4460180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160881729
101477	NC_010001	TCT	2	6	4460190	4460195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160881729
101478	NC_010001	ATT	2	6	4460274	4460279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160881729
101479	NC_010001	TCC	2	6	4460283	4460288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101480	NC_010001	AT	3	6	4460344	4460349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101481	NC_010001	AAC	2	6	4460363	4460368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101482	NC_010001	TAC	2	6	4460392	4460397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101483	NC_010001	TGA	2	6	4460442	4460447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101484	NC_010001	CT	3	6	4460554	4460559	0 %	50 %	0 %	50 %	160881730
101485	NC_010001	TCAC	2	8	4460564	4460571	25 %	25 %	0 %	50 %	160881730
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101487	NC_010001	ATT	2	6	4460665	4460670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160881730
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101498	NC_010001	AT	3	6	4461088	4461093	50 %	50 %	0 %	0 %	160881730
101499	NC_010001	TGC	2	6	4461109	4461114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160881730
101500	NC_010001	CTA	2	6	4461117	4461122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160881730

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